Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
[smpi] Change parallel arrays into array of structs
[simgrid.git] / src / smpi / private.h
index 3d5ded9..ac6811a 100644 (file)
@@ -1,21 +1,24 @@
-/* Copyright (c) 2007, 2009-2013. The SimGrid Team.
+/* Copyright (c) 2007, 2009-2014. The SimGrid Team.
  * All rights reserved.                                                     */
 
 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
 * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
+ * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
 
 #ifndef SMPI_PRIVATE_H
 #define SMPI_PRIVATE_H
 
+#include "internal_config.h"
 #include "xbt.h"
 #include "xbt/xbt_os_time.h"
+#include "xbt/synchro_core.h"
 #include "simgrid/simix.h"
 #include "smpi/smpi_interface.h"
 #include "smpi/smpi.h"
-#include "smpi/smpif.h"
 #include "smpi/smpi_cocci.h"
 #include "instr/instr_private.h"
 
+SG_BEGIN_DECL()
+
 struct s_smpi_process_data;
 typedef struct s_smpi_process_data *smpi_process_data_t;
 
@@ -27,16 +30,28 @@ typedef struct s_smpi_process_data *smpi_process_data_t;
 #define ISEND          0x20
 #define SSEND          0x40
 #define PREPARED       0x80
+#define FINISHED       0x100
+#define RMA            0x200
+#define ACCUMULATE     0x400
+
+
+enum smpi_process_state{
+  SMPI_UNINITIALIZED,
+  SMPI_INITIALIZED,
+  SMPI_FINALIZED
+};
+
 // this struct is here to handle the problem of non-contignous data
 // for each such structure these function should be implemented (vector
 // index hvector hindex struct)
 typedef struct s_smpi_subtype{
-  void (*serialize)(const void * input, void *output, size_t count, void* subtype);
-  void (*unserialize)(const void * input, void *output, size_t count, void* subtype);
+  void (*serialize)(const void * input, void *output, int count, void* subtype);
+  void (*unserialize)(const void * input, void *output, int count, void* subtype, MPI_Op op);
   void (*subtype_free)(MPI_Datatype* type);
 } s_smpi_subtype_t;
 
 typedef struct s_smpi_mpi_datatype{
+  char* name;
   size_t size;
   /* this let us know if a serialization is required*/
   size_t has_subtype;
@@ -62,6 +77,9 @@ typedef struct s_smpi_mpi_datatype{
 #define COLL_TAG_GATHERV -2223
 #define COLL_TAG_BCAST -3334
 #define COLL_TAG_ALLREDUCE -4445
+
+#define MPI_COMM_UNINITIALIZED ((MPI_Comm)-1)
+
 //*****************************************************************************************
 
 typedef struct s_smpi_mpi_request {
@@ -88,12 +106,14 @@ typedef struct s_smpi_mpi_request {
   int detached;
   MPI_Request detached_sender;
   int refcount;
+  MPI_Op op;
 #ifdef HAVE_TRACING
   int send;
   int recv;
 #endif
 } s_smpi_mpi_request_t;
 
+
 void smpi_process_destroy(void);
 void smpi_process_finalize(void);
 int smpi_process_finalized(void);
@@ -101,11 +121,43 @@ int smpi_process_initialized(void);
 void smpi_process_mark_as_initialized(void);
 
 
+struct s_smpi_mpi_cart_topology;
+typedef struct s_smpi_mpi_cart_topology *MPIR_Cart_Topology;
+
+struct s_smpi_mpi_graph_topology;
+typedef struct s_smpi_mpi_graph_topology *MPIR_Graph_Topology;
+
+struct s_smpi_dist_graph_topology;
+typedef struct s_smpi_dist_graph_topology *MPIR_Dist_Graph_Topology;
+
+// MPI_Topology defined in smpi.h, as it is public
+
+void smpi_topo_destroy(MPI_Topology topo);
+MPI_Topology smpi_topo_create(MPIR_Topo_type kind);
+void smpi_cart_topo_destroy(MPIR_Cart_Topology cart);
+MPI_Topology smpi_cart_topo_create(int ndims);
+int smpi_mpi_cart_create(MPI_Comm comm_old, int ndims, int dims[],
+                         int periods[], int reorder, MPI_Comm *comm_cart);
+int smpi_mpi_cart_sub(MPI_Comm comm, const int remain_dims[], MPI_Comm *newcomm);
+int smpi_mpi_cart_coords(MPI_Comm comm, int rank, int maxdims,
+                         int coords[]);
+int smpi_mpi_cart_get(MPI_Comm comm, int maxdims, int* dims, int* periods,
+                      int* coords);
+int smpi_mpi_cart_rank(MPI_Comm comm, int* coords, int* rank);
+int smpi_mpi_cart_shift(MPI_Comm comm, int direction, int disp,
+                        int *rank_source, int *rank_dest);
+int smpi_mpi_cartdim_get(MPI_Comm comm, int *ndims);
+int smpi_mpi_dims_create(int nnodes, int ndims, int dims[]);
+
+
 smpi_process_data_t smpi_process_data(void);
 smpi_process_data_t smpi_process_remote_data(int index);
 void smpi_process_set_user_data(void *);
 void* smpi_process_get_user_data(void);
 int smpi_process_count(void);
+MPI_Comm smpi_process_comm_world(void);
+MPI_Comm smpi_process_get_comm_intra(void);
+void smpi_process_set_comm_intra(MPI_Comm comm);
 smx_rdv_t smpi_process_mailbox(void);
 smx_rdv_t smpi_process_remote_mailbox(int index);
 smx_rdv_t smpi_process_mailbox_small(void);
@@ -113,18 +165,33 @@ smx_rdv_t smpi_process_remote_mailbox_small(int index);
 xbt_os_timer_t smpi_process_timer(void);
 void smpi_process_simulated_start(void);
 double smpi_process_simulated_elapsed(void);
+void smpi_process_set_sampling(int s);
+int smpi_process_get_sampling(void);
+
+void smpi_deployment_register_process(const char* instance_id, int rank, int index, MPI_Comm**, xbt_bar_t*);
+void smpi_deployment_cleanup_instances(void);
+
+void smpi_comm_copy_buffer_callback(smx_action_t comm,
+                                           void *buff, size_t buff_size);
 
 void print_request(const char *message, MPI_Request request);
 
+int smpi_enabled(void);
 void smpi_global_init(void);
 void smpi_global_destroy(void);
+double smpi_mpi_wtime(void);
+
+int is_datatype_valid(MPI_Datatype datatype);
 
 size_t smpi_datatype_size(MPI_Datatype datatype);
 MPI_Aint smpi_datatype_lb(MPI_Datatype datatype);
 MPI_Aint smpi_datatype_ub(MPI_Datatype datatype);
+MPI_Datatype smpi_datatype_dup(MPI_Datatype datatype);
 int smpi_datatype_extent(MPI_Datatype datatype, MPI_Aint * lb,
                          MPI_Aint * extent);
 MPI_Aint smpi_datatype_get_extent(MPI_Datatype datatype);
+void smpi_datatype_get_name(MPI_Datatype datatype, char* name, int* length);
+void smpi_datatype_set_name(MPI_Datatype datatype, char* name);
 int smpi_datatype_copy(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
                        void *recvbuf, int recvcount,
                        MPI_Datatype recvtype);
@@ -168,8 +235,11 @@ int smpi_group_use(MPI_Group group);
 int smpi_group_unuse(MPI_Group group);
 int smpi_group_size(MPI_Group group);
 int smpi_group_compare(MPI_Group group1, MPI_Group group2);
+int smpi_group_incl(MPI_Group group, int n, int* ranks, MPI_Group* newgroup);
+
 
-MPI_Comm smpi_comm_new(MPI_Group group);
+MPI_Topology smpi_comm_topo(MPI_Comm comm);
+MPI_Comm smpi_comm_new(MPI_Group group, MPI_Topology topo);
 void smpi_comm_destroy(MPI_Comm comm);
 MPI_Group smpi_comm_group(MPI_Comm comm);
 int smpi_comm_size(MPI_Comm comm);
@@ -178,6 +248,15 @@ int smpi_comm_rank(MPI_Comm comm);
 MPI_Comm smpi_comm_split(MPI_Comm comm, int color, int key);
 void smpi_comm_use(MPI_Comm comm);
 void smpi_comm_unuse(MPI_Comm comm);
+void smpi_comm_set_leaders_comm(MPI_Comm comm, MPI_Comm leaders);
+void smpi_comm_set_intra_comm(MPI_Comm comm, MPI_Comm leaders);
+int* smpi_comm_get_non_uniform_map(MPI_Comm comm);
+int* smpi_comm_get_leaders_map(MPI_Comm comm);
+MPI_Comm smpi_comm_get_leaders_comm(MPI_Comm comm);
+MPI_Comm smpi_comm_get_intra_comm(MPI_Comm comm);
+int smpi_comm_is_uniform(MPI_Comm comm);
+int smpi_comm_is_blocked(MPI_Comm comm);
+void smpi_comm_init_smp(MPI_Comm comm);
 
 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
                                int dst, int tag, MPI_Comm comm);
@@ -192,12 +271,18 @@ MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
                             int dst, int tag, MPI_Comm comm);
 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
                            int dst, int tag, MPI_Comm comm);
+MPI_Request smpi_issend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
+                            int dst, int tag, MPI_Comm comm);
 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
                            int dst, int tag, MPI_Comm comm);
 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
                             int src, int tag, MPI_Comm comm);
 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
                            int src, int tag, MPI_Comm comm);
+MPI_Request smpi_rma_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
+                            int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op);
+MPI_Request smpi_rma_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
+                            int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op);
 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src,
                    int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status);
 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst,
@@ -261,6 +346,22 @@ void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm);
 
+int smpi_mpi_win_free( MPI_Win* win);
+
+MPI_Win smpi_mpi_win_create( void *base, MPI_Aint size, int disp_unit, MPI_Info info, MPI_Comm comm);
+
+void smpi_mpi_win_get_name(MPI_Win win, char* name, int* length);
+void smpi_mpi_win_set_name(MPI_Win win, char* name);
+
+int smpi_mpi_win_fence( int assert,  MPI_Win win);
+
+int smpi_mpi_get( void *origin_addr, int origin_count, MPI_Datatype origin_datatype, int target_rank,
+              MPI_Aint target_disp, int target_count, MPI_Datatype target_datatype, MPI_Win win);
+int smpi_mpi_put( void *origin_addr, int origin_count, MPI_Datatype origin_datatype, int target_rank,
+              MPI_Aint target_disp, int target_count, MPI_Datatype target_datatype, MPI_Win win);
+int smpi_mpi_accumulate( void *origin_addr, int origin_count, MPI_Datatype origin_datatype, int target_rank,
+              MPI_Aint target_disp, int target_count, MPI_Datatype target_datatype, MPI_Op op, MPI_Win win);
+
 void nary_tree_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root,
                      MPI_Comm comm, int arity);
 void nary_tree_barrier(MPI_Comm comm, int arity);
@@ -285,10 +386,21 @@ int smpi_coll_basic_alltoallv(void *sendbuf, int *sendcounts,
                               MPI_Comm comm);
 
 // utilities
+extern double smpi_cpu_threshold;
+extern double smpi_running_power;
+extern int smpi_privatize_global_variables;
+extern char* start_data_exe; //start of the data+bss segment of the executable
+extern int size_data_exe; //size of the data+bss segment of the executable
+
+
+void smpi_switch_data_segment(int);
+void smpi_get_executable_global_size(void);
+void smpi_initialize_global_memory_segments(void);
+void smpi_destroy_global_memory_segments(void);
 void smpi_bench_destroy(void);
 void smpi_bench_begin(void);
 void smpi_bench_end(void);
-void smpi_execute_flops(double flops);
+
 
 // f77 wrappers
 void mpi_init_(int*);
@@ -379,11 +491,17 @@ void mpi_type_ub_(int* datatype, MPI_Aint * extent, int* ierr);
 void mpi_win_fence_( int* assert,  int* win, int* ierr);
 void mpi_win_free_( int* win, int* ierr);
 void mpi_win_create_( int *base, MPI_Aint* size, int* disp_unit, int* info, int* comm, int *win, int* ierr);
+void mpi_win_set_name_ (int*  win, char * name, int* ierr, int size);
+void mpi_win_get_name_ (int*  win, char * name, int* len, int* ierr);
 void mpi_info_create_( int *info, int* ierr);
 void mpi_info_set_( int *info, char *key, char *value, int* ierr);
 void mpi_info_free_(int* info, int* ierr);
 void mpi_get_( int *origin_addr, int* origin_count, int* origin_datatype, int* target_rank,
     MPI_Aint* target_disp, int* target_count, int* target_datatype, int* win, int* ierr);
+void mpi_put_( int *origin_addr, int* origin_count, int* origin_datatype, int* target_rank,
+    MPI_Aint* target_disp, int* target_count, int* target_datatype, int* win, int* ierr);
+void mpi_accumulate_( int *origin_addr, int* origin_count, int* origin_datatype, int* target_rank,
+    MPI_Aint* target_disp, int* target_count, int* target_datatype, int* op, int* win, int* ierr);
 void mpi_error_string_(int* errorcode, char* string, int* resultlen, int* ierr);
 void mpi_sendrecv_(void* sendbuf, int* sendcount, int* sendtype, int* dst,
                 int* sendtag, void *recvbuf, int* recvcount,
@@ -397,7 +515,7 @@ void mpi_is_thread_main_ (int *flag, int* ierr);
 void mpi_address_ (void *location, MPI_Aint * address, int* ierr);
 void mpi_get_address_ (void *location, MPI_Aint * address, int* ierr);
 void mpi_type_dup_ (int*  datatype, int* newdatatype, int* ierr);
-void mpi_type_set_name_ (int*  datatype, char * name, int* ierr);
+void mpi_type_set_name_ (int*  datatype, char * name, int* ierr, int size);
 void mpi_type_get_name_ (int*  datatype, char * name, int* len, int* ierr);
 void mpi_type_get_attr_ (int* type, int* type_keyval, void *attribute_val, int* flag, int* ierr);
 void mpi_type_set_attr_ (int* type, int* type_keyval, void *attribute_val, int* ierr);
@@ -507,7 +625,7 @@ void mpi_type_match_size_ (int* typeclass,int* size,int*datatype, int* ierr);
 void mpi_alltoallw_ ( void *sendbuf, int *sendcnts, int *sdispls, int*sendtypes, void *recvbuf, int *recvcnts, int *rdispls, int*recvtypes,
  int* comm, int* ierr);
 void mpi_exscan_ (void *sendbuf, void *recvbuf, int* count, int* datatype, int* op, int* comm, int* ierr);
-void mpi_comm_set_name_ (int* comm, char* name, int* ierr);
+void mpi_comm_set_name_ (int* comm, char* name, int* ierr, int size);
 void mpi_comm_dup_with_info_ (int* comm, int* info, int* newcomm, int* ierr);
 void mpi_comm_split_type_ (int* comm, int* split_type, int* key, int* info, int*newcomm, int* ierr);
 void mpi_comm_set_info_ (int* comm, int* info, int* ierr);
@@ -543,14 +661,52 @@ void mpi_comm_spawn_multiple_ ( int* count, char *array_of_commands, char** arra
  int* comm, int*intercomm, int* array_of_errcodes, int* ierr);
 void mpi_comm_get_parent_ ( int*parent, int* ierr);
 
+
+#ifdef HAVE_TRACING
 /********** Tracing **********/
 /* from smpi_instr.c */
 void TRACE_internal_smpi_set_category (const char *category);
 const char *TRACE_internal_smpi_get_category (void);
-void TRACE_smpi_collective_in(int rank, int root, const char *operation, int size);
+void TRACE_smpi_collective_in(int rank, int root, const char *operation, instr_extra_data extra);
 void TRACE_smpi_collective_out(int rank, int root, const char *operation);
 void TRACE_smpi_computing_init(int rank);
 void TRACE_smpi_computing_out(int rank);
-void TRACE_smpi_computing_in(int rank);
+void TRACE_smpi_computing_in(int rank, instr_extra_data extra);
+void TRACE_smpi_sleeping_init(int rank);
+void TRACE_smpi_sleeping_out(int rank);
+void TRACE_smpi_sleeping_in(int rank, instr_extra_data extra);
+void TRACE_smpi_testing_out(int rank);
+void TRACE_smpi_testing_in(int rank, instr_extra_data extra);
+void TRACE_smpi_alloc(void);
+void TRACE_smpi_release(void);
+void TRACE_smpi_ptp_in(int rank, int src, int dst, const char *operation,  instr_extra_data extra);
+void TRACE_smpi_ptp_out(int rank, int src, int dst, const char *operation);
+void TRACE_smpi_send(int rank, int src, int dst, int size);
+void TRACE_smpi_recv(int rank, int src, int dst);
+void TRACE_smpi_init(int rank);
+void TRACE_smpi_finalize(int rank);
+#endif
+
+const char* encode_datatype(MPI_Datatype datatype);
+
+// TODO, make this static and expose it more cleanly
+
+typedef struct s_smpi_privatisation_region {
+  void* address;
+  int file_descriptor;
+} *smpi_privatisation_region_t;
+
+extern smpi_privatisation_region_t smpi_privatisation_regions;
+
+extern int smpi_loaded_page;
+
+int SIMIX_process_get_PID(smx_process_t self);
+
+static inline __attribute__ ((always_inline))
+int smpi_process_index_of_smx_process(smx_process_t process) {
+  return SIMIX_process_get_PID(process) -1;
+}
+
+SG_END_DECL()
 
 #endif