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Various doc fixups
[simgrid.git] / docs / source / Configuring_SimGrid.rst
index 7a59994..1eb7edb 100644 (file)
@@ -79,9 +79,10 @@ Existing Configuration Items
 
 .. note::
   The full list can be retrieved by passing ``--help`` and
-  ``--help-cfg`` to an executable that uses SimGrid.
-
-- **clean-atexit:** :ref:`cfg=clean-atexit`
+  ``--help-cfg`` to an executable that uses SimGrid. Try passing
+  ``help`` as a value to get the list of values accepted by a given
+   option. For example, ``--cfg=plugin:help`` will give you the list
+   of plugins available in your installation of SimGrid.
 
 - **contexts/factory:** :ref:`cfg=contexts/factory`
 - **contexts/guard-size:** :ref:`cfg=contexts/guard-size`
@@ -94,6 +95,10 @@ Existing Configuration Items
 - **cpu/model:** :ref:`options_model_select`
 - **cpu/optim:** :ref:`Cpu Optimization Level <options_model_optim>`
 
+- **debug/breakpoint:** :ref:`cfg=debug/breakpoint`
+- **debug/clean-atexit:** :ref:`cfg=debug/clean-atexit`
+- **debug/verbose-exit:** :ref:`cfg=debug/verbose-exit`
+
 - **exception/cutpath:** :ref:`cfg=exception/cutpath`
 
 - **host/model:** :ref:`options_model_select`
@@ -110,11 +115,9 @@ Existing Configuration Items
 - **model-check/hash:** :ref:`cfg=model-checker/hash`
 - **model-check/max-depth:** :ref:`cfg=model-check/max-depth`
 - **model-check/property:** :ref:`cfg=model-check/property`
-- **model-check/record:** :ref:`cfg=model-check/record`
 - **model-check/reduction:** :ref:`cfg=model-check/reduction`
 - **model-check/replay:** :ref:`cfg=model-check/replay`
 - **model-check/send-determinism:** :ref:`cfg=model-check/send-determinism`
-- **model-check/sparse-checkpoint:** :ref:`cfg=model-check/sparse-checkpoint`
 - **model-check/termination:** :ref:`cfg=model-check/termination`
 - **model-check/timeout:** :ref:`cfg=model-check/timeout`
 - **model-check/visited:** :ref:`cfg=model-check/visited`
@@ -132,8 +135,6 @@ Existing Configuration Items
 - **path:** :ref:`cfg=path`
 - **plugin:** :ref:`cfg=plugin`
 
-- **simix/breakpoint:** :ref:`cfg=simix/breakpoint`
-
 - **storage/max_file_descriptors:** :ref:`cfg=storage/max_file_descriptors`
 
 - **surf/precision:** :ref:`cfg=surf/precision`
@@ -169,7 +170,6 @@ Existing Configuration Items
 - **Tracing configuration options** can be found in Section :ref:`tracing_tracing_options`
 
 - **storage/model:** :ref:`options_model_select`
-- **verbose-exit:** :ref:`cfg=verbose-exit`
 
 - **vm/model:** :ref:`options_model_select`
 
@@ -216,12 +216,10 @@ models for all existing resources.
     without corrective factors. The timings of small messages are thus
     poorly modeled. This model is described in `A Network Model for
     Simulation of Grid Application
-    <ftp://ftp.ens-lyon.fr/pub/LIP/Rapports/RR/RR2002/RR2002-40.ps.gz>`_.
-  - **Reno/Reno2/Vegas:** Models from Steven H. Low using lagrange_solve instead of
-    lmm_solve (experts only; check the code for more info).
-  - **NS3** (only available if you compiled SimGrid accordingly):
+    <https://hal.inria.fr/inria-00071989/document>`_.
+  - **ns-3** (only available if you compiled SimGrid accordingly):
     Use the packet-level network
-    simulators as network models (see :ref:`pls_ns3`).
+    simulators as network models (see :ref:`model_ns3`).
     This model can be :ref:`further configured <options_pls>`.
 
 - ``cpu/model``: specify the used CPU model.  We have only one model
@@ -419,15 +417,15 @@ meant to be detached as well.
 
 .. _options_pls:
 
-Configuring NS3
-^^^^^^^^^^^^^^^
+Configuring ns-3
+^^^^^^^^^^^^^^^^
 
-**Option** ``ns3/TcpModel`` **Default:** "default" (NS3 default)
+**Option** ``ns3/TcpModel`` **Default:** "default" (ns-3 default)
 
-When using NS3, there is an extra item ``ns3/TcpModel``, corresponding
+When using ns-3, there is an extra item ``ns3/TcpModel``, corresponding
 to the ``ns3::TcpL4Protocol::SocketType`` configuration item in
-NS3. The only valid values (enforced on the SimGrid side) are
-'default' (no change to the NS3 configuration), 'NewReno' or 'Reno' or
+ns-3. The only valid values (enforced on the SimGrid side) are
+'default' (no change to the ns-3 configuration), 'NewReno' or 'Reno' or
 'Tahoe'.
 
 Configuring the Storage model
@@ -617,35 +615,6 @@ The ``model-check/communications-determinism`` and
 communication determinism mode of the model-checker which checks
 determinism properties of the communications of an application.
 
-.. _cfg=model-check/sparse-checkpoint:
-
-Incremental Checkpoints
-.......................
-
-When the model-checker is configured to take a snapshot of each
-explored state (with the ``model-checker/visited`` item), the memory
-consumption can rapidly reach GiB ou Tib of memory. However, for many
-workloads, the memory does not change much between different snapshots
-and taking a complete copy of each snapshot is a waste of memory.
-
-The ``model-check/sparse-checkpoint`` option item can be set to
-**yes** to avoid making a complete copy of each snapshot. Instead,
-each snapshot will be decomposed in blocks which will be stored
-separately.  If multiple snapshots share the same block (or if the
-same block is used in the same snapshot), the same copy of the block
-will be shared leading to a reduction of the memory footprint.
-
-For many applications, this option considerably reduces the memory
-consumption.  In somes cases, the model-checker might be slightly
-slower because of the time taken to manage the metadata about the
-blocks. In other cases however, this snapshotting strategy will be
-much faster by reducing the cache consumption.  When the memory
-consumption is important, by avoiding to hit the swap or reducing the
-swap usage, this option might be much faster than the basic
-snapshotting strategy.
-
-This option is currently disabled by default.
-
 Verification Performance Considerations
 .......................................
 
@@ -656,9 +625,6 @@ really meaningful: you should expect the contribution of the memory
 consumption of the snapshots to be @f$ @mbox{number of processes}
 @times @mbox{stack size} @times @mbox{number of states} @f$.
 
-The ``model-check/sparse-checkpoint`` can be used to reduce the memory
-consumption by trying to share memory between the different snapshots.
-
 When compiled against the model checker, the stacks are not
 protected with guards: if the stack size is too small for your
 application, the stack will silently overflow on other parts of the
@@ -681,11 +647,10 @@ Currently most of the state is not included in the hash because the
 implementation was found to be buggy and this options is not as useful as
 it could be. For this reason, it is currently disabled by default.
 
-.. _cfg=model-check/record:
 .. _cfg=model-check/replay:
 
-Recording and replaying verifications
-.....................................
+Replaying buggy execution paths out of the model-checker
+........................................................
 
 Debugging the problems reported by the model-checker is challenging: First, the
 application under verification cannot be debugged with gdb because the
@@ -697,11 +662,7 @@ enabling the usage of classical debugging tools.
 
 When the model-checker finds an interesting path in the application
 execution graph (where a safety or liveness property is violated), it
-can generate an identifier for this path. To enable this behavious the
-``model-check/record`` must be set to **yes**, which is the case
-by default.
-
-Here is an example of output:
+generates an identifier for this path. Here is an example of output:
 
 .. code-block:: shell
 
@@ -717,11 +678,11 @@ Here is an example of output:
    [  0.000000] (0:@) Visited states = 68
    [  0.000000] (0:@) Executed transitions = 46
 
-This path can then be replayed outside of the model-checker (and even
-in non-MC build of simgrid) by setting the ``model-check/replay`` item
-to the given path. The other options should be the same (but the
-model-checker should be disabled). Note that format and meaning of the
-path may change between different releases.
+The interesting line is ``Path = 1/3;1/4``, which means that you should use
+`--cfg=model-check/replay:1/3;1/4`` to replay your application on the buggy
+execution path. The other options should be the same (but the model-checker
+should be disabled). Note that format and meaning of the path may change between
+different releases.
 
 Configuring the User Code Virtualization
 ----------------------------------------
@@ -1066,8 +1027,8 @@ MAX_BANDWIDTH*0.697866 and so on (where MAX_BANDWIDTH denotes the
 bandwidth of the link).
 
 An experimental script to compute these factors is available online. See
-http://simgrid.gforge.inria.fr/contrib/smpi-calibration-doc.html
-http://simgrid.gforge.inria.fr/contrib/smpi-saturation-doc.html
+https://framagit.org/simgrid/platform-calibration/
+https://simgrid.org/contrib/smpi-saturation-doc.html
 
 .. _cfg=smpi/display-timing:
 
@@ -1463,12 +1424,12 @@ extra delay by setting smpi/wtime to 0.
 Other Configurations
 --------------------
 
-.. _cfg=clean-atexit:
+.. _cfg=debug/clean-atexit:
 
 Cleanup at Termination
 ......................
 
-**Option** ``clean-atexit`` **default:** on
+**Option** ``debug/clean-atexit`` **default:** on
 
 If your code is segfaulting during its finalization, it may help to
 disable this option to request SimGrid to not attempt any cleanups at
@@ -1487,12 +1448,12 @@ trace files (see :ref:`pf_trace`) by using this configuration
 item. To add several directory to the path, set the configuration
 item several times, as in ``--cfg=path:toto --cfg=path:tutu``
 
-.. _cfg=simix/breakpoint:
+.. _cfg=debug/breakpoint:
 
 Set a Breakpoint
 ................
 
-**Option** ``simix/breakpoint`` **default:** unset
+**Option** ``debug/breakpoint`` **default:** unset
 
 This configuration option sets a breakpoint: when the simulated clock
 reaches the given time, a SIGTRAP is raised.  This can be used to stop
@@ -1506,12 +1467,12 @@ with gdb:
 
    set variable simgrid::simix::breakpoint = 3.1416
 
-.. _cfg=verbose-exit:
+.. _cfg=debug/verbose-exit:
 
 Behavior on Ctrl-C
 ..................
 
-**Option** ``verbose-exit`` **default:** on
+**Option** ``debug/verbose-exit`` **default:** on
 
 By default, when Ctrl-C is pressed, the status of all existing actors
 is displayed before exiting the simulation. This is very useful to