src/simdag/sd_daxloader.c

   1 /* Copyright (c) 2009, 2010. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "simdag/simdag.h"
   9 #include "xbt/misc.h"
  10 #include "xbt/log.h"
  11
  12 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(sd_daxparse, sd, "Parsing DAX files");
  13
  14 #undef CLEANUP
  15 #include "dax_dtd.h"
  16 #include "dax_dtd.c"
  17
  18 bool children_are_marked(SD_task_t task);
  19 bool parents_are_marked(SD_task_t task);
  20
  21 /* Parsing helpers */
  22 static void dax_parse_error(char *msg)
  23 {
  24   fprintf(stderr, "Parse error on line %d: %s\n", dax_lineno, msg);
  25   abort();
  26 }
  27
  28 static double dax_parse_double(const char *string)
  29 {
  30   int ret = 0;
  31   double value;
  32
  33   ret = sscanf(string, "%lg", &value);
  34   if (ret != 1)
  35     dax_parse_error(bprintf("%s is not a double", string));
  36   return value;
  37 }
  38
  39 static int dax_parse_int(const char *string)
  40 {
  41   int ret = 0;
  42   int value;
  43
  44   ret = sscanf(string, "%d", &value);
  45   if (ret != 1)
  46     dax_parse_error(bprintf("%s is not an integer", string));
  47   return value;
  48 }
  49
  50 /* Ensure that transfer tasks have unique names even though a file is used
  51  * several times */
  52
  53 void uniq_transfer_task_name(SD_task_t task)
  54 {
  55   SD_task_t child, parent;
  56   xbt_dynar_t children, parents;
  57   char *new_name;
  58
  59   children = SD_task_get_children(task);
  60   parents = SD_task_get_parents(task);
  61
  62   xbt_dynar_get_cpy(children, 0, &child);
  63   xbt_dynar_get_cpy(parents, 0, &parent);
  64
  65   new_name = bprintf("%s_%s_%s",
  66                      SD_task_get_name(parent),
  67                      SD_task_get_name(task), SD_task_get_name(child));
  68
  69   SD_task_set_name(task, new_name);
  70
  71   xbt_dynar_free_container(&children);
  72   xbt_dynar_free_container(&parents);
  73   free(new_name);
  74 }
  75
  76 bool children_are_marked(SD_task_t task){
  77   SD_task_t child_task = NULL;
  78   bool all_marked = true;
  79   SD_dependency_t depafter = NULL;
  80   unsigned int count;
  81   xbt_dynar_foreach(task->tasks_after,count,depafter){
  82     child_task = depafter->dst;
  83     //test marked
  84     if(child_task->marked == 0) {
  85       all_marked = false;
  86       break;
  87     }
  88     child_task = NULL;
  89   }
  90   return all_marked;
  91 }
  92
  93 bool parents_are_marked(SD_task_t task){
  94   SD_task_t parent_task = NULL;
  95   bool all_marked = true;
  96   SD_dependency_t depbefore = NULL;
  97   unsigned int count;
  98   xbt_dynar_foreach(task->tasks_before,count,depbefore){
  99     parent_task = depbefore->src;
 100     //test marked
 101     if(parent_task->marked == 0) {
 102       all_marked = false;
 103       break;
 104     }
 105     parent_task = NULL;
 106   }
 107   return all_marked;
 108 }
 109
 110 bool acyclic_graph_detail(xbt_dynar_t dag){
 111   unsigned int count=0, count_current=0;
 112   bool all_marked = true;
 113   SD_task_t task = NULL, parent_task = NULL, child_task = NULL;
 114   SD_dependency_t depbefore = NULL, depafter = NULL;
 115   xbt_dynar_t next = NULL, current = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 116
 117   xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 118     if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 119     task->marked = 0;
 120     if(xbt_dynar_is_empty(task->tasks_after)){
 121       xbt_dynar_push(current, &task);
 122     }
 123   }
 124   task = NULL;
 125   count = 0;
 126   //test if something has to be done for the next iteration
 127   while(!xbt_dynar_is_empty(current)){
 128     next = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 129     //test if the current iteration is done
 130     count_current=0;
 131     xbt_dynar_foreach(current,count_current,task){
 132       if (task == NULL) continue;
 133       count = 0;
 134       //push task in next
 135       task->marked = 1;
 136       count = 0;
 137       xbt_dynar_foreach(task->tasks_before,count,depbefore){
 138         parent_task = depbefore->src;
 139         if(parent_task->kind == SD_TASK_COMM_E2E){
 140           unsigned int j=0;
 141           parent_task->marked = 1;
 142           SD_task_t parent_task_2 = NULL;
 143           xbt_dynar_foreach(parent_task->tasks_before,j,depbefore){
 144             parent_task_2 = depbefore->src;
 145             if(children_are_marked(parent_task_2))
 146               xbt_dynar_push(next, &parent_task_2);
 147           }
 148         } else{
 149           if(children_are_marked(parent_task))
 150             xbt_dynar_push(next, &parent_task);
 151         }
 152         parent_task = NULL;
 153       }
 154       task = NULL;
 155       count = 0;
 156     }
 157     xbt_dynar_free(&current);
 158     current = next;
 159     next = NULL;
 160   }
 161   xbt_dynar_free(&current);
 162   current = NULL;
 163   all_marked = true;
 164   xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 165     if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 166     //test if all tasks are marked
 167     if(task->marked == 0){
 168       XBT_WARN("the task %s is not marked",task->name);
 169       all_marked = false;
 170       break;
 171     }
 172   }
 173   task = NULL;
 174   if(!all_marked){
 175     XBT_VERB("there is at least one cycle in your task graph");
 176
 177     current = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 178     xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 179       if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 180       if(xbt_dynar_is_empty(task->tasks_before)){
 181         xbt_dynar_push(current, &task);
 182       }
 183     }
 184
 185     count = 0;
 186     task = NULL;
 187     xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 188       if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 189       if(xbt_dynar_is_empty(task->tasks_before)){
 190         task->marked = 1;
 191         xbt_dynar_push(current, &task);
 192       }
 193     }
 194     task = NULL;
 195     count = 0;
 196     //test if something has to be done for the next iteration
 197     while(!xbt_dynar_is_empty(current)){
 198       next = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 199       //test if the current iteration is done
 200       count_current=0;
 201       xbt_dynar_foreach(current,count_current,task){
 202         if (task == NULL) continue;
 203         count = 0;
 204         //push task in next
 205         task->marked = 1;
 206         count = 0;
 207         xbt_dynar_foreach(task->tasks_after,count,depafter){
 208           child_task = depbefore->dst;
 209           if(child_task->kind == SD_TASK_COMM_E2E){
 210             unsigned int j=0;
 211             child_task->marked = 1;
 212             SD_task_t child_task_2 = NULL;
 213             xbt_dynar_foreach(child_task->tasks_after,j,depafter){
 214               child_task_2 = depbefore->dst;
 215               if(parents_are_marked(child_task_2))
 216                 xbt_dynar_push(next, &child_task_2);
 217             }
 218           } else{
 219             if(parents_are_marked(child_task))
 220               xbt_dynar_push(next, &child_task);
 221           }
 222           child_task = NULL;
 223         }
 224         task = NULL;
 225         count = 0;
 226       }
 227       xbt_dynar_free(&current);
 228       current = next;
 229       next = NULL;
 230     }
 231     xbt_dynar_free(&current);
 232     current = NULL;
 233     all_marked = true;
 234     xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 235       if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 236       //test if all tasks are marked
 237       if(task->marked == 0){
 238         XBT_WARN("the task %s is in a cycle",task->name);
 239         all_marked = false;
 240       }
 241     }
 242   }
 243   return all_marked;
 244 }
 245
 246
 247
 248 static YY_BUFFER_STATE input_buffer;
 249
 250 static xbt_dynar_t result;
 251 static xbt_dict_t jobs;
 252 static xbt_dict_t files;
 253 static SD_task_t current_job;
 254 static SD_task_t root_task, end_task;
 255
 256 static void dump_res()
 257 {
 258   unsigned int cursor;
 259   SD_task_t task;
 260   xbt_dynar_foreach(result, cursor, task) {
 261     XBT_INFO("Task %d", cursor);
 262     SD_task_dump(task);
 263   }
 264 }
 265
 266 static void dax_task_free(void *task)
 267 {
 268   SD_task_t t = task;
 269   SD_task_destroy(t);
 270 }
 271
 272 /** @brief loads a DAX file describing a DAG
 273  *
 274  * See https://confluence.pegasus.isi.edu/display/pegasus/WorkflowGenerator
 275  * for more details.
 276  */
 277 xbt_dynar_t SD_daxload(const char *filename)
 278 {
 279   xbt_dict_cursor_t cursor;
 280   SD_task_t file;
 281   char *name;
 282   FILE *in_file = fopen(filename, "r");
 283   xbt_assert(in_file, "Unable to open \"%s\"\n", filename);
 284   input_buffer = dax__create_buffer(in_file, 10);
 285   dax__switch_to_buffer(input_buffer);
 286   dax_lineno = 1;
 287
 288   result = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t), dax_task_free);
 289   files = xbt_dict_new();
 290   jobs = xbt_dict_new();
 291   root_task = SD_task_create_comp_seq("root", NULL, 0);
 292   /* by design the root task is always SCHEDULABLE */
 293   __SD_task_set_state(root_task, SD_SCHEDULABLE);
 294
 295   xbt_dynar_push(result, &root_task);
 296   end_task = SD_task_create_comp_seq("end", NULL, 0);
 297
 298   _XBT_GNUC_UNUSED int res;
 299   res = dax_lex();
 300   xbt_assert(!res, "Parse error in %s: %s", filename,
 301               dax__parse_err_msg());
 302   dax__delete_buffer(input_buffer);
 303   fclose(in_file);
 304   dax_lex_destroy();
 305   xbt_dict_free(&jobs);
 306
 307   /* And now, post-process the files.
 308    * We want a file task per pair of computation tasks exchanging the file. Duplicate on need
 309    * Files not produced in the system are said to be produced by root task (top of DAG).
 310    * Files not consumed in the system are said to be consumed by end task (bottom of DAG).
 311    */
 312
 313   xbt_dict_foreach(files, cursor, name, file) {
 314     unsigned int cpt1, cpt2;
 315     SD_task_t newfile = NULL;
 316     SD_dependency_t depbefore, depafter;
 317     if (xbt_dynar_is_empty(file->tasks_before)) {
 318       xbt_dynar_foreach(file->tasks_after, cpt2, depafter) {
 319         SD_task_t newfile =
 320             SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 321         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, root_task, newfile);
 322         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, depafter->dst);
 323 #ifdef HAVE_TRACING
 324         if (depafter->src){
 325           const char *category = depafter->src->category;
 326           if (category){
 327             TRACE_category (category);
 328             TRACE_sd_set_task_category (newfile, category);
 329           }
 330         }
 331 #endif
 332         xbt_dynar_push(result, &newfile);
 333       }
 334     } else if (xbt_dynar_is_empty(file->tasks_after)) {
 335       xbt_dynar_foreach(file->tasks_before, cpt2, depbefore) {
 336         SD_task_t newfile =
 337             SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 338         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, depbefore->src, newfile);
 339         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, end_task);
 340 #ifdef HAVE_TRACING
 341         if (depbefore->src){
 342           const char *category = depbefore->src->category;
 343           if (category){
 344             TRACE_category (category);
 345             TRACE_sd_set_task_category (newfile, category);
 346           }
 347         }
 348 #endif
 349         xbt_dynar_push(result, &newfile);
 350       }
 351     } else {
 352       xbt_dynar_foreach(file->tasks_before, cpt1, depbefore) {
 353         xbt_dynar_foreach(file->tasks_after, cpt2, depafter) {
 354           if (depbefore->src == depafter->dst) {
 355             XBT_WARN
 356                 ("File %s is produced and consumed by task %s. This loop dependency will prevent the execution of the task.",
 357                  file->name, depbefore->src->name);
 358           }
 359           newfile =
 360               SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 361           SD_task_dependency_add(NULL, NULL, depbefore->src, newfile);
 362           SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, depafter->dst);
 363 #ifdef HAVE_TRACING
 364           if (depbefore->src){
 365             const char *category = depbefore->src->category;
 366             if (category){
 367               TRACE_category (category);
 368               TRACE_sd_set_task_category (newfile, category);
 369             }
 370           }
 371 #endif
 372           xbt_dynar_push(result, &newfile);
 373         }
 374       }
 375     }
 376   }
 377
 378   /* Push end task last */
 379   xbt_dynar_push(result, &end_task);
 380
 381   /* Free previous copy of the files */
 382   xbt_dict_free(&files);
 383   unsigned int cpt;
 384   xbt_dynar_foreach(result, cpt, file) {
 385     if (SD_task_get_kind(file) == SD_TASK_COMM_E2E) {
 386       uniq_transfer_task_name(file);
 387     }
 388   }
 389
 390   acyclic_graph_detail(result);
 391   return result;
 392 }
 393
 394 void STag_dax__adag(void)
 395 {
 396   _XBT_GNUC_UNUSED double version;
 397   version = dax_parse_double(A_dax__adag_version);
 398
 399   xbt_assert(version == 2.1,
 400               "Expected version 2.1 in <adag> tag, got %f. Fix the parser or your file",
 401               version);
 402 }
 403
 404 void STag_dax__job(void)
 405 {
 406   double runtime = dax_parse_double(A_dax__job_runtime);
 407   char *name = bprintf("%s@%s", A_dax__job_id, A_dax__job_name);
 408   runtime *= 4200000000.;       /* Assume that timings were done on a 4.2GFlops machine. I mean, why not? */
 409 //  XBT_INFO("See <job id=%s runtime=%s %.0f>",A_dax__job_id,A_dax__job_runtime,runtime);
 410   current_job = SD_task_create_comp_seq(name, NULL, runtime);
 411 #ifdef HAVE_TRACING
 412   char *category = A_dax__job_name;
 413   if (category){
 414     TRACE_category (category);
 415     TRACE_sd_set_task_category(current_job, category);
 416   }
 417 #endif
 418   xbt_dict_set(jobs, A_dax__job_id, current_job, NULL);
 419   free(name);
 420   xbt_dynar_push(result, &current_job);
 421 }
 422
 423 void STag_dax__uses(void)
 424 {
 425   SD_task_t file;
 426   double size = dax_parse_double(A_dax__uses_size);
 427   int is_input = (A_dax__uses_link == A_dax__uses_link_input);
 428
 429 //  XBT_INFO("See <uses file=%s %s>",A_dax__uses_file,(is_input?"in":"out"));
 430   file = xbt_dict_get_or_null(files, A_dax__uses_file);
 431   if (file == NULL) {
 432     file = SD_task_create_comm_e2e(A_dax__uses_file, NULL, size);
 433     xbt_dict_set(files, A_dax__uses_file, file, &dax_task_free);
 434   } else {
 435     if (SD_task_get_amount(file) != size) {
 436       XBT_WARN("Ignoring file %s size redefinition from %.0f to %.0f",
 437             A_dax__uses_file, SD_task_get_amount(file), size);
 438     }
 439   }
 440   if (is_input) {
 441     SD_task_dependency_add(NULL, NULL, file, current_job);
 442   } else {
 443     SD_task_dependency_add(NULL, NULL, current_job, file);
 444     if (xbt_dynar_length(file->tasks_before) > 1) {
 445       XBT_WARN("File %s created at more than one location...", file->name);
 446     }
 447   }
 448 }
 449
 450 static SD_task_t current_child;
 451 void STag_dax__child(void)
 452 {
 453   current_child = xbt_dict_get_or_null(jobs, A_dax__child_ref);
 454   if (current_child == NULL)
 455     dax_parse_error(bprintf
 456                     ("Asked to add dependencies to the non-existent %s task",
 457                      A_dax__child_ref));
 458 }
 459
 460 void ETag_dax__child(void)
 461 {
 462   current_child = NULL;
 463 }
 464
 465 void STag_dax__parent(void)
 466 {
 467   SD_task_t parent = xbt_dict_get_or_null(jobs, A_dax__parent_ref);
 468   if (parent == NULL)
 469     dax_parse_error(bprintf
 470                     ("Asked to add a dependency from %s to %s, but %s does not exist",
 471                      current_child->name, A_dax__parent_ref,
 472                      A_dax__parent_ref));
 473   SD_task_dependency_add(NULL, NULL, parent, current_child);
 474   XBT_DEBUG("Control-flow dependency from %s to %s", current_child->name,
 475          parent->name);
 476 }
 477
 478 void ETag_dax__adag(void)
 479 {
 480 //  XBT_INFO("See </adag>");
 481 }
 482
 483 void ETag_dax__job(void)
 484 {
 485   current_job = NULL;
 486 //  XBT_INFO("See </job>");
 487 }
 488
 489 void ETag_dax__parent(void)
 490 {
 491 //  XBT_INFO("See </parent>");
 492 }
 493
 494 void ETag_dax__uses(void)
 495 {
 496 //  XBT_INFO("See </uses>");
 497 }