src/xbt/graph.c

   1 /* a generic graph library.                                                 */
   2
   3 /* Copyright (c) 2006, 2007, 2008, 2009, 2010. The SimGrid Team.
   4  * All rights reserved.                                                     */
   5
   6 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   7  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   8
   9 #include "simgrid_config.h" /* getline */
  10 #include <stdlib.h>
  11 #include "xbt/sysdep.h"
  12 #include "xbt/log.h"
  13 #include "xbt/graph.h"
  14 #include "graph_private.h"
  15 #include "xbt/graphxml_parse.h"
  16 #include "xbt/dict.h"
  17 #include "xbt/heap.h"
  18 #include "xbt/str.h"
  19
  20
  21
  22
  23 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(xbt_graph, xbt, "Graph");
  24
  25
  26
  27 /** @brief Constructor
  28  *  @return a new graph
  29  */
  30 xbt_graph_t xbt_graph_new_graph(unsigned short int directed, void *data)
  31 {
  32   xbt_graph_t graph = NULL;
  33   graph = xbt_new0(struct xbt_graph, 1);
  34   graph->directed = directed;
  35   graph->data = data;
  36   graph->nodes = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_node_t), NULL);
  37   graph->edges = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  38
  39   return graph;
  40 }
  41
  42 /** @brief add a node to the given graph */
  43 xbt_node_t xbt_graph_new_node(xbt_graph_t g, void *data)
  44 {
  45   xbt_node_t node = NULL;
  46   node = xbt_new0(struct xbt_node, 1);
  47   node->data = data;
  48   if (g->directed)
  49     /* only the "out" field is used */
  50     node->in = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  51
  52   node->out = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  53   node->position_x = -1.0;
  54   node->position_y = -1.0;
  55
  56   xbt_dynar_push(g->nodes, &node);
  57
  58   return node;
  59 }
  60
  61 /** @brief add an edge to the given graph */
  62 xbt_edge_t xbt_graph_new_edge(xbt_graph_t g,
  63                               xbt_node_t src, xbt_node_t dst, void *data)
  64 {
  65   xbt_edge_t edge = NULL;
  66
  67   edge = xbt_new0(struct xbt_edge, 1);
  68   xbt_dynar_push(src->out, &edge);
  69   if (g->directed)
  70     xbt_dynar_push(dst->in, &edge);
  71   else                          /* only the "out" field is used */
  72     xbt_dynar_push(dst->out, &edge);
  73
  74   edge->data = data;
  75   edge->src = src;
  76   edge->dst = dst;
  77
  78   xbt_dynar_push(g->edges, &edge);
  79
  80   return edge;
  81 }
  82
  83 xbt_edge_t xbt_graph_get_edge(xbt_graph_t g, xbt_node_t src,
  84                               xbt_node_t dst)
  85 {
  86   xbt_edge_t edge;
  87   unsigned int cursor;
  88
  89   xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  90     XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  91     if ((edge->src == src) && (edge->dst == dst))
  92       return edge;
  93   }
  94   if (!g->directed) {
  95     xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  96       XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  97       if ((edge->dst == src) && (edge->src == dst))
  98         return edge;
  99     }
 100   }
 101   return NULL;
 102 }
 103
 104 void *xbt_graph_node_get_data(xbt_node_t node)
 105 {
 106   return node->data;
 107 }
 108
 109 void xbt_graph_node_set_data(xbt_node_t node, void *data)
 110 {
 111   node->data = data;
 112 }
 113
 114 void *xbt_graph_edge_get_data(xbt_edge_t edge)
 115 {
 116   return edge->data;
 117 }
 118
 119 void xbt_graph_edge_set_data(xbt_edge_t edge, void *data)
 120 {
 121   edge->data = data;
 122 }
 123
 124 /** @brief Destructor
 125  *  @param g: poor victim
 126  *  @param node_free_function: function to use to free data associated to each node
 127  *  @param edge_free_function: function to use to free data associated to each edge
 128  *  @param graph_free_function: function to use to free data associated to g
 129  *
 130  * Free the graph structure.
 131  */
 132 void xbt_graph_free_graph(xbt_graph_t g,
 133                           void_f_pvoid_t node_free_function,
 134                           void_f_pvoid_t edge_free_function,
 135                           void_f_pvoid_t graph_free_function)
 136 {
 137   unsigned int cursor = 0;
 138   xbt_node_t node = NULL;
 139   xbt_edge_t edge = NULL;
 140
 141
 142   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 143     xbt_dynar_free(&(node->out));
 144     xbt_dynar_free(&(node->in));
 145     if (node_free_function)
 146       (*node_free_function) (node->data);
 147   }
 148
 149   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 150     if (edge_free_function)
 151       (*edge_free_function) (edge->data);
 152   }
 153
 154   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 155       free(node);
 156   xbt_dynar_free(&(g->nodes));
 157
 158   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge)
 159       free(edge);
 160   xbt_dynar_free(&(g->edges));
 161   if (graph_free_function)
 162     (*graph_free_function) (g->data);
 163   free(g);
 164   xbt_graph_parse_lex_destroy();
 165   return;
 166 }
 167
 168
 169 /** @brief remove the given node from the given graph */
 170 void xbt_graph_free_node(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 171                          void_f_pvoid_t node_free_function,
 172                          void_f_pvoid_t edge_free_function)
 173 {
 174   unsigned long nbr;
 175   unsigned long i;
 176   unsigned int cursor = 0;
 177   xbt_node_t node = NULL;
 178   xbt_edge_t edge = NULL;
 179
 180   nbr = xbt_dynar_length(g->edges);
 181   cursor = 0;
 182   for (i = 0; i < nbr; i++) {
 183     xbt_dynar_get_cpy(g->edges, cursor, &edge);
 184
 185     if ((edge->dst == n) || (edge->src == n)) {
 186       xbt_graph_free_edge(g, edge, edge_free_function);
 187     } else
 188       cursor++;
 189   }
 190
 191   if ((node_free_function) && (n->data))
 192     (*node_free_function) (n->data);
 193
 194   cursor = 0;
 195   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 196       if (node == n)
 197     xbt_dynar_cursor_rm(g->nodes, &cursor);
 198
 199   xbt_dynar_free(&(n->in));
 200   xbt_dynar_free(&(n->out));
 201
 202   free(n);
 203
 204   return;
 205 }
 206
 207 /** @brief remove the given edge from the given graph */
 208 void xbt_graph_free_edge(xbt_graph_t g, xbt_edge_t e,
 209                          void_f_pvoid_t free_function)
 210 {
 211   int idx;
 212   unsigned int cursor = 0;
 213   xbt_edge_t edge = NULL;
 214
 215   if ((free_function) && (e->data))
 216     (*free_function) (e->data);
 217
 218   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 219     if (edge == e) {
 220       if (g->directed) {
 221         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->in, edge);
 222         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->in, idx, NULL);
 223       } else {                  /* only the out field is used */
 224         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->out, edge);
 225         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->out, idx, NULL);
 226       }
 227
 228       idx = __xbt_find_in_dynar(edge->src->out, edge);
 229       xbt_dynar_remove_at(edge->src->out, idx, NULL);
 230
 231       xbt_dynar_cursor_rm(g->edges, &cursor);
 232       free(edge);
 233       break;
 234     }
 235   }
 236 }
 237
 238 int __xbt_find_in_dynar(xbt_dynar_t dynar, void *p)
 239 {
 240
 241   unsigned int cursor = 0;
 242   void *tmp = NULL;
 243
 244   xbt_dynar_foreach(dynar, cursor, tmp) {
 245     if (tmp == p)
 246       return cursor;
 247   }
 248   return -1;
 249 }
 250
 251 /** @brief Retrieve the graph's nodes as a dynar */
 252 xbt_dynar_t xbt_graph_get_nodes(xbt_graph_t g)
 253 {
 254   return g->nodes;
 255 }
 256
 257 /** @brief Retrieve the graph's edges as a dynar */
 258 xbt_dynar_t xbt_graph_get_edges(xbt_graph_t g)
 259 {
 260   return g->edges;
 261 }
 262
 263 /** @brief Retrieve the node at the source of the given edge */
 264 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_source(xbt_edge_t e)
 265 {
 266   return e->src;
 267 }
 268
 269 /** @brief Retrieve the node being the target of the given edge */
 270 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_target(xbt_edge_t e)
 271 {
 272   return e->dst;
 273 }
 274
 275 /** @brief Retrieve the outgoing edges of the given node */
 276 xbt_dynar_t xbt_graph_node_get_outedges(xbt_node_t n)
 277 {
 278   return n->out;
 279 }
 280
 281 /** @brief Set the weight of the given edge */
 282 void xbt_graph_edge_set_length(xbt_edge_t e, double length)
 283 {
 284   e->length = length;
 285
 286 }
 287
 288 double xbt_graph_edge_get_length(xbt_edge_t e)
 289 {
 290   return e->length;
 291 }
 292
 293
 294 /** @brief construct the adjacency matrix corresponding to the given graph
 295  *
 296  * The weights are the distances between nodes
 297  */
 298 double *xbt_graph_get_length_matrix(xbt_graph_t g)
 299 {
 300   unsigned int cursor = 0;
 301   unsigned int in_cursor = 0;
 302   unsigned long idx, i;
 303   unsigned long n;
 304   xbt_edge_t edge = NULL;
 305   xbt_node_t node = NULL;
 306   double *d = NULL;
 307
 308 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 309   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 310
 311   d = (double *) xbt_new0(double, n * n);
 312
 313   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 314     d[i] = -1.0;
 315   }
 316
 317   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 318     in_cursor = 0;
 319     D(cursor, cursor) = 0;
 320
 321     xbt_dynar_foreach(node->out, in_cursor, edge) {
 322       if (edge->dst == node)
 323         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->src);
 324       else                      /*case of  undirected graphs */
 325         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->dst);
 326       D(cursor, idx) = edge->length;
 327     }
 328   }
 329
 330 # undef D
 331
 332   return d;
 333 }
 334
 335 /** @brief Floyd-Warshall algorithm for shortest path finding
 336  *
 337  * From wikipedia:
 338  *
 339  * The Floyd–Warshall algorithm takes as input an adjacency matrix
 340  * representation of a weighted, directed graph (V, E). The weight of a
 341  * path between two vertices is the sum of the weights of the edges along
 342  * that path. The edges E of the graph may have negative weights, but the
 343  * graph must not have any negative weight cycles. The algorithm computes,
 344  * for each pair of vertices, the minimum weight among all paths between
 345  * the two vertices. The running time complexity is Θ(|V|3).
 346  */
 347 void xbt_floyd_algorithm(xbt_graph_t g, double *adj, double *d,
 348                          xbt_node_t * p)
 349 {
 350   unsigned long i, j, k;
 351   unsigned long n;
 352   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 353
 354 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 355 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 356
 357   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 358     d[i] = adj[i];
 359   }
 360
 361
 362   for (i = 0; i < n; i++) {
 363     for (j = 0; j < n; j++) {
 364       if (D(i, j) != -1) {
 365         P(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, i));
 366       }
 367     }
 368   }
 369
 370   for (k = 0; k < n; k++) {
 371     for (i = 0; i < n; i++) {
 372       for (j = 0; j < n; j++) {
 373         if ((D(i, k) != -1) && (D(k, j) != -1)) {
 374           if ((D(i, j) == -1) || (D(i, j) > D(i, k) + D(k, j))) {
 375             D(i, j) = D(i, k) + D(k, j);
 376             P(i, j) = P(k, j);
 377           }
 378         }
 379       }
 380     }
 381   }
 382
 383
 384
 385 # undef P
 386 # undef D
 387 }
 388
 389 /** @brief computes all-pairs shortest paths */
 390 xbt_node_t *xbt_graph_shortest_paths(xbt_graph_t g)
 391 {
 392   xbt_node_t *p;
 393   xbt_node_t *r;
 394   unsigned long i, j, k;
 395   unsigned long n;
 396
 397   double *adj = NULL;
 398   double *d = NULL;
 399
 400 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 401 # define R(u,v) r[(u)*n+(v)]
 402
 403   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 404   adj = xbt_graph_get_length_matrix(g);
 405   d = xbt_new0(double, n * n);
 406   p = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 407   r = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 408
 409   xbt_floyd_algorithm(g, adj, d, p);
 410
 411   for (i = 0; i < n; i++) {
 412     for (j = 0; j < n; j++) {
 413       k = j;
 414
 415       while ((P(i, k)) && (__xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k)) != i)) {
 416         k = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k));
 417       }
 418
 419       if (P(i, j)) {
 420         R(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, k));
 421       }
 422     }
 423   }
 424 # undef R
 425 # undef P
 426
 427   free(d);
 428   free(p);
 429   free(adj);
 430   return r;
 431 }
 432
 433 /** @brief Extract a spanning tree of the given graph */
 434 xbt_edge_t *xbt_graph_spanning_tree_prim(xbt_graph_t g)
 435 {
 436   int tree_size = 0;
 437   int tree_size_max = xbt_dynar_length(g->nodes) - 1;
 438   xbt_edge_t *tree = xbt_new0(xbt_edge_t, tree_size_max);
 439   xbt_edge_t e, edge;
 440   xbt_node_t node = NULL;
 441   xbt_dynar_t edge_list = NULL;
 442   xbt_heap_t heap = xbt_heap_new(10, NULL);
 443   unsigned int cursor;
 444
 445   xbt_assert(!(g->directed),
 446               "Spanning trees do not make sense on directed graphs");
 447
 448   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 449     node->xbtdata = NULL;
 450   }
 451
 452   node = xbt_dynar_getfirst_as(g->nodes, xbt_node_t);
 453   node->xbtdata = (void *) 1;
 454   edge_list = node->out;
 455   xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e)
 456       xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 457
 458   while ((edge = xbt_heap_pop(heap))) {
 459     if ((edge->src->xbtdata) && (edge->dst->xbtdata))
 460       continue;
 461     tree[tree_size++] = edge;
 462     if (!(edge->src->xbtdata)) {
 463       edge->src->xbtdata = (void *) 1;
 464       edge_list = edge->src->out;
 465       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 466         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 467       }
 468     } else {
 469       edge->dst->xbtdata = (void *) 1;
 470       edge_list = edge->dst->out;
 471       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 472         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 473       }
 474     }
 475     if (tree_size == tree_size_max)
 476       break;
 477   }
 478
 479   xbt_heap_free(heap);
 480
 481   return tree;
 482 }
 483
 484 /** @brief Topological sort on the given graph
 485  *
 486  *  From wikipedia:
 487  *
 488  * In graph theory, a topological sort of a directed acyclic graph (DAG) is
 489  * a linear ordering of its nodes which is compatible with the partial
 490  * order R induced on the nodes where x comes before y (xRy) if there's a
 491  * directed path from x to y in the DAG. An equivalent definition is that
 492  * each node comes before all nodes to which it has edges. Every DAG has at
 493  * least one topological sort, and may have many.
 494  */
 495 xbt_node_t *xbt_graph_topo_sort(xbt_graph_t g)
 496 {
 497
 498   xbt_node_t *sorted;
 499   unsigned int cursor;
 500   int idx;
 501   xbt_node_t node;
 502   unsigned long n;
 503
 504   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 505   idx = n - 1;
 506
 507   sorted = xbt_malloc(n * sizeof(xbt_node_t));
 508
 509   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 510       node->xbtdata = xbt_new0(int, 1);
 511
 512   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 513       xbt_graph_depth_visit(g, node, sorted, &idx);
 514
 515   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 516     free(node->xbtdata);
 517     node->xbtdata = NULL;
 518   }
 519
 520   return sorted;
 521 }
 522
 523 /** @brief First-depth graph traversal */
 524 void xbt_graph_depth_visit(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 525                            xbt_node_t * sorted, int *idx)
 526 {
 527   unsigned int cursor;
 528   xbt_edge_t edge;
 529
 530   if (*((int *) (n->xbtdata)) == ALREADY_EXPLORED)
 531     return;
 532   else if (*((int *) (n->xbtdata)) == CURRENTLY_EXPLORING)
 533     THROWF(0, 0, "There is a cycle");
 534   else {
 535     *((int *) (n->xbtdata)) = CURRENTLY_EXPLORING;
 536
 537     xbt_dynar_foreach(n->out, cursor, edge) {
 538       xbt_graph_depth_visit(g, edge->dst, sorted, idx);
 539     }
 540
 541     *((int *) (n->xbtdata)) = ALREADY_EXPLORED;
 542     sorted[(*idx)--] = n;
 543   }
 544 }
 545
 546 /********************* Import and Export ******************/
 547 static xbt_graph_t parsed_graph = NULL;
 548 static xbt_dict_t parsed_nodes = NULL;
 549
 550 static void *(*__parse_node_label_and_data) (xbt_node_t, const char *,
 551                                              const char *) = NULL;
 552 static void *(*__parse_edge_label_and_data) (xbt_edge_t, const char *,
 553                                              const char *) = NULL;
 554
 555 static void __parse_graph_begin(void)
 556 {
 557   XBT_DEBUG("<graph>");
 558   if (A_graphxml_graph_isDirected == A_graphxml_graph_isDirected_true)
 559     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(1, NULL);
 560   else
 561     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(0, NULL);
 562
 563   parsed_nodes = xbt_dict_new();
 564 }
 565
 566 static void __parse_graph_end(void)
 567 {
 568   xbt_dict_free(&parsed_nodes);
 569   XBT_DEBUG("</graph>");
 570 }
 571
 572 static void __parse_node(void)
 573 {
 574   xbt_node_t node = xbt_graph_new_node(parsed_graph, NULL);
 575
 576   XBT_DEBUG("<node name=\"%s\"/>", A_graphxml_node_name);
 577   if (__parse_node_label_and_data)
 578     node->data = __parse_node_label_and_data(node, A_graphxml_node_label,
 579                                              A_graphxml_node_data);
 580   xbt_graph_parse_get_double(&(node->position_x),
 581                              A_graphxml_node_position_x);
 582   xbt_graph_parse_get_double(&(node->position_y),
 583                              A_graphxml_node_position_y);
 584
 585   xbt_dict_set(parsed_nodes, A_graphxml_node_name, (void *) node, NULL);
 586 }
 587
 588 static void __parse_edge(void)
 589 {
 590   xbt_edge_t edge = xbt_graph_new_edge(parsed_graph,
 591                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 592                                                     A_graphxml_edge_source),
 593                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 594                                                     A_graphxml_edge_target),
 595                                        NULL);
 596
 597   if (__parse_edge_label_and_data)
 598     edge->data = __parse_edge_label_and_data(edge, A_graphxml_edge_label,
 599                                              A_graphxml_edge_data);
 600
 601   xbt_graph_parse_get_double(&(edge->length), A_graphxml_edge_length);
 602
 603   XBT_DEBUG("<edge  source=\"%s\" target=\"%s\" length=\"%f\"/>",
 604          (char *) (edge->src)->data,
 605          (char *) (edge->dst)->data, xbt_graph_edge_get_length(edge));
 606 }
 607
 608 /** @brief Import a graph from a file following the GraphXML format */
 609 xbt_graph_t xbt_graph_read(const char *filename,
 610                            void *(*node_label_and_data) (xbt_node_t,
 611                                                          const char *,
 612                                                          const char *),
 613                            void *(*edge_label_and_data) (xbt_edge_t,
 614                                                          const char *,
 615                                                          const char *))
 616 {
 617
 618   xbt_graph_t graph = NULL;
 619
 620   __parse_node_label_and_data = node_label_and_data;
 621   __parse_edge_label_and_data = edge_label_and_data;
 622
 623   xbt_graph_parse_reset_parser();
 624
 625   STag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_begin;
 626   ETag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_end;
 627   ETag_graphxml_node_fun = __parse_node;
 628   ETag_graphxml_edge_fun = __parse_edge;
 629
 630   xbt_graph_parse_open(filename);
 631   int res;
 632   res = (*xbt_graph_parse) ();
 633   xbt_assert(!res, "Parse error in %s", filename);
 634   xbt_graph_parse_close();
 635
 636   graph = parsed_graph;
 637   parsed_graph = NULL;
 638
 639   return graph;
 640 }
 641
 642 /** @brief Export the given graph in the GraphViz formatting for visualization */
 643 void xbt_graph_export_graphviz(xbt_graph_t g, const char *filename,
 644                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 645                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t))
 646 {
 647   unsigned int cursor = 0;
 648   xbt_node_t node = NULL;
 649   xbt_edge_t edge = NULL;
 650   FILE *file = NULL;
 651   const char *name = NULL;
 652
 653   file = fopen(filename, "w");
 654   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 655
 656   if (g->directed)
 657     fprintf(file, "digraph test {\n");
 658   else
 659     fprintf(file, "graph test {\n");
 660
 661   fprintf(file, "  graph [overlap=scale]\n");
 662
 663   fprintf(file, "  node [shape=box, style=filled]\n");
 664   fprintf(file,
 665           "  node [width=.3, height=.3, style=filled, color=skyblue]\n\n");
 666
 667   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 668     fprintf(file, "  \"%p\" ", node);
 669     if ((node_name) && ((name = node_name(node))))
 670       fprintf(file, "[label=\"%s\"]", name);
 671     fprintf(file, ";\n");
 672   }
 673   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 674     if (g->directed)
 675       fprintf(file, "  \"%p\" -> \"%p\"", edge->src, edge->dst);
 676     else
 677       fprintf(file, "  \"%p\" -- \"%p\"", edge->src, edge->dst);
 678     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 679       fprintf(file, "[label=\"%s\"]", name);
 680     fprintf(file, ";\n");
 681   }
 682   fprintf(file, "}\n");
 683   fclose(file);
 684 }
 685
 686 /** @brief Export the given graph in the GraphXML format */
 687 void xbt_graph_export_graphxml(xbt_graph_t g, const char *filename,
 688                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 689                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t),
 690                                const char *(node_data_print) (void *),
 691                                const char *(edge_data_print) (void *))
 692 {
 693   unsigned int cursor = 0;
 694   xbt_node_t node = NULL;
 695   xbt_edge_t edge = NULL;
 696   FILE *file = NULL;
 697   const char *name = NULL;
 698
 699   file = fopen(filename, "w");
 700   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 701
 702   fprintf(file, "<?xml version='1.0'?>\n");
 703   fprintf(file, "<!DOCTYPE graph SYSTEM \"graphxml.dtd\">\n");
 704   if (g->directed)
 705     fprintf(file, "<graph isDirected=\"true\">\n");
 706   else
 707     fprintf(file, "<graph isDirected=\"false\">\n");
 708   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 709     fprintf(file, "  <node name=\"%p\" ", node);
 710     if ((node_name) && ((name = node_name(node))))
 711       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 712     if ((node_data_print) && ((name = node_data_print(node->data))))
 713       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 714     fprintf(file, ">\n");
 715   }
 716   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 717     fprintf(file, "  <edge source=\"%p\" target =\"%p\" ",
 718             edge->src, edge->dst);
 719     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 720       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 721     if (edge->length >= 0.0)
 722       fprintf(file, "length=\"%g\" ", edge->length);
 723     if ((edge_data_print) && ((name = edge_data_print(edge->data))))
 724       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 725     fprintf(file, ">\n");
 726   }
 727   fprintf(file, "</graph>\n");
 728   fclose(file);
 729 }
 730
 731 /** @brief Load a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 732 xbt_graph_t xbt_graph_load (const char *filename)
 733 {
 734   FILE *file = NULL;
 735   ssize_t read;
 736   file = fopen (filename, "r");
 737   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 738
 739   xbt_dict_t nodes_dict = xbt_dict_new ();
 740   xbt_graph_t ret = xbt_graph_new_graph (0, NULL);
 741
 742   //read the number of nodes
 743   size_t size;
 744   char *nnodes_str = NULL;
 745   read = getline (&nnodes_str, &size, file);
 746   int i, nnodes = atoi (nnodes_str);
 747   free (nnodes_str);
 748
 749   //read all nodes
 750   for (i = 0; i < nnodes; i++){
 751     char *node_str = NULL;
 752     read = getline (&node_str, &size, file);
 753     xbt_node_t n;
 754     char *name = xbt_strdup (node_str);
 755     xbt_str_subst (name, '\n', '\0', 0);
 756     n = xbt_graph_new_node (ret, name);
 757     xbt_dict_set (nodes_dict, name, n, NULL);
 758     free (node_str);
 759   }
 760
 761   //read the number of edges
 762   char *nedges_str = NULL;
 763   read = getline (&nedges_str, &size, file);
 764   int nedges = atoi (nedges_str);
 765   free (nedges_str);
 766
 767   //read all edges
 768   for (i = 0; i < nedges; i++){
 769     char *edge_str = NULL, edge_id[200], node_source[200], node_target[200];
 770     read = getline (&edge_str, &size, file);
 771     sscanf (edge_str, "%s %s %s", edge_id, node_source, node_target);
 772     free (edge_str);
 773     xbt_str_subst (edge_id, '\n', '\0', 0);
 774     xbt_str_subst (node_source, '\n', '\0', 0);
 775     xbt_str_subst (node_target, '\n', '\0', 0);
 776
 777     xbt_node_t source = xbt_dict_get (nodes_dict, node_source);
 778     xbt_node_t target = xbt_dict_get (nodes_dict, node_target);
 779     xbt_edge_t e;
 780     e = xbt_graph_new_edge (ret, source, target, xbt_strdup(edge_id));
 781   }
 782   xbt_dict_free (&nodes_dict);
 783   return ret;
 784 }
 785
 786 /** @brief Save a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 787 void xbt_graph_save (xbt_graph_t span,
 788                      const char *filename,
 789                      const char *(nname) (xbt_node_t),
 790                      const char *(ename) (xbt_edge_t))
 791 {
 792   FILE *file = NULL;
 793   file = fopen(filename, "w");
 794   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 795
 796   xbt_dynar_t nodes = xbt_graph_get_nodes (span);
 797   xbt_dynar_t edges = xbt_graph_get_edges (span);
 798   unsigned int cpt;
 799   xbt_node_t node;
 800   fprintf (file, "%ld\n", xbt_dynar_length (nodes));
 801   xbt_dynar_foreach (nodes, cpt, node) {
 802     if (nname){
 803       fprintf (file, "%s\n", nname(node));
 804     }else{
 805       fprintf (file, "%p\n", node);
 806     }
 807   }
 808   fprintf (file, "%ld\n", xbt_dynar_length (edges));
 809   xbt_edge_t edge;
 810   xbt_dynar_foreach (edges, cpt, edge) {
 811     xbt_node_t source = xbt_graph_edge_get_source (edge);
 812     xbt_node_t target = xbt_graph_edge_get_target (edge);
 813     if (ename){
 814       if (nname){
 815         fprintf (file, "%s %s %s\n", ename(edge), nname(source), nname(target));
 816       }else{
 817         fprintf (file, "%s %p %p\n", ename(edge), source, target);
 818       }
 819     }else{
 820       if (nname){
 821         fprintf (file, "%p %s %s\n", edge, nname(source), nname(target));
 822       }else{
 823         fprintf (file, "%p %p %p\n", edge, source, target);
 824       }
 825     }
 826   }
 827   fclose (file);
 828 }