examples/smpi/NAS/dt.c

   1 /*************************************************************************
   2  *                                                                       *
   3  *    N  A  S   P A R A L L E L   B E N C H M A R K S  3.3     *
   4  *                                     *
   5  *                  D T       *
   6  *                                     *
   7  *************************************************************************
   8  *                                     *
   9  *   This benchmark is part of the NAS Parallel Benchmark 3.3 suite.   *
  10  *                                     *
  11  *   Permission to use, copy, distribute and modify this software    *
  12  *   for any purpose with or without fee is hereby granted.  We      *
  13  *   request, however, that all derived work reference the NAS       *
  14  *   Parallel Benchmarks 3.3. This software is provided "as is"      *
  15  *   without express or implied warranty.                *
  16  *                                     *
  17  *   Information on NPB 3.3, including the technical report, the     *
  18  *   original specifications, source code, results and information     *
  19  *   on how to submit new results, is available at:            *
  20  *                                     *
  21  *      http:  www.nas.nasa.gov/Software/NPB             *
  22  *                                     *
  23  *   Send comments or suggestions to  npb@nas.nasa.gov           *
  24  *   Send bug reports to        npb-bugs@nas.nasa.gov        *
  25  *                                     *
  26  *     NAS Parallel Benchmarks Group                 *
  27  *     NASA Ames Research Center                   *
  28  *     Mail Stop: T27A-1                       *
  29  *     Moffett Field, CA   94035-1000                *
  30  *                                     *
  31  *     E-mail:  npb@nas.nasa.gov                   *
  32  *     Fax:   (650) 604-3957                     *
  33  *                                     *
  34  *************************************************************************
  35  *                                     *
  36  *   Author: M. Frumkin         *       *
  37  *                                     *
  38  *************************************************************************/
  39
  40 #include <stdlib.h>
  41 #include <stdio.h>
  42 #include <string.h>
  43
  44 #include "DGraph.h"
  45 #include "smpi/mpi.h"
  46 #include "nas_common.h"
  47 #include "simgrid/instr.h" //TRACE_
  48
  49 int timer_on=0,timers_tot=64;
  50 double start[64], elapsed[64];
  51
  52 char class;
  53 int nprocs;
  54 int num_samples;
  55 int deviation;
  56 int num_sources;
  57
  58 static int verify(char *bmname,double rnm2){
  59   double verify_value=0.0;
  60   double epsilon=1.0E-8;
  61   int verified=-1;
  62   if (class != 'U') {
  63     if(class=='S') {
  64      if(strstr(bmname,"BH")){
  65        verify_value=30892725.0;
  66      }else if(strstr(bmname,"WH")){
  67        verify_value=67349758.0;
  68      }else if(strstr(bmname,"SH")){
  69        verify_value=58875767.0;
  70      }else{
  71        fprintf(stderr,"No such benchmark as %s.\n",bmname);
  72      }
  73      verified = 0;
  74     }else if(class=='W') {
  75       if(strstr(bmname,"BH")){
  76         verify_value = 4102461.0;
  77       }else if(strstr(bmname,"WH")){
  78         verify_value = 204280762.0;
  79       }else if(strstr(bmname,"SH")){
  80         verify_value = 186944764.0;
  81       }else{
  82         fprintf(stderr,"No such benchmark as %s.\n",bmname);
  83       }
  84       verified = 0;
  85     }else if(class=='A') {
  86       if(strstr(bmname,"BH")){
  87         verify_value = 17809491.0;
  88       }else if(strstr(bmname,"WH")){
  89         verify_value = 1289925229.0;
  90       }else if(strstr(bmname,"SH")){
  91         verify_value = 610856482.0;
  92       }else{
  93         fprintf(stderr,"No such benchmark as %s.\n",bmname);
  94       }
  95       verified = 0;
  96     }else if(class=='B') {
  97       if(strstr(bmname,"BH")){
  98         verify_value = 4317114.0;
  99       }else if(strstr(bmname,"WH")){
 100         verify_value = 7877279917.0;
 101       }else if(strstr(bmname,"SH")){
 102         verify_value = 1836863082.0;
 103       }else{
 104         fprintf(stderr,"No such benchmark as %s.\n",bmname);
 105         verified = 0;
 106       }
 107     }else if(class=='C' || class == 'D') {
 108         verify_value = 0.0;
 109     }else{
 110       fprintf(stderr,"No such class as %c.\n",class);
 111     }
 112     fprintf(stderr," %s L2 Norm = %f\n",bmname,rnm2);
 113     if(verified==-1){
 114       fprintf(stderr," No verification was performed.\n");
 115     }else if( rnm2 - verify_value < epsilon && rnm2 - verify_value > -epsilon) {  /* abs here does not work on ALTIX */
 116       verified = 1;
 117       fprintf(stderr," Deviation = %f\n",(rnm2 - verify_value));
 118     }else{
 119       verified = 0;
 120       fprintf(stderr," The correct verification value = %f\n",verify_value);
 121       fprintf(stderr," Got value = %f\n",rnm2);
 122     }
 123   }else{
 124     verified = -1;
 125   }
 126   return  verified;
 127 }
 128
 129 static int ipowMod(int a,long long int n,int md){
 130   int seed=1,q=a,r=1;
 131   int exp = n;
 132   if(n<0){
 133     fprintf(stderr,"ipowMod: exponent must be nonnegative exp=%lld\n",n);
 134     exp=-n; /* temp fix */
 135     /*  return 1; */
 136   }
 137   if(md<=0){
 138     fprintf(stderr,"ipowMod: module must be positive mod=%d",md);
 139     return 1;
 140   }
 141   if(n==0)
 142     return 1;
 143   while(exp>1){
 144     int n2 = exp/2;
 145     if (n2*2==n){
 146       seed = (q*q)%md;
 147       q=seed;
 148       exp = n2;
 149     }else{
 150       seed = (r*q)%md;
 151       r=seed;
 152       exp = exp -1;
 153     }
 154   }
 155   seed = (r*q)%md;
 156   return seed;
 157 }
 158
 159 static DGraph *buildSH(const char cls){
 160 /* Nodes of the graph must be topologically sorted to avoid MPI deadlock. */
 161   DGraph *dg;
 162   unsigned int numSources=num_sources; /* must be power of 2 */
 163   int numOfLayers=0;
 164   unsigned int tmpS=numSources>>1;
 165   int firstLayerNode=0;
 166   DGArc *ar=NULL;
 167   DGNode *nd=NULL;
 168   unsigned int mask=0x0;
 169   int ndid=0,ndoff=0;
 170   unsigned int i=0,j=0;
 171   char nm[BLOCK_SIZE];
 172
 173   snprintf(nm,BLOCK_SIZE -1,"DT_SH.%c",cls);
 174   dg=newDGraph(nm);
 175
 176   while(tmpS>1){
 177   numOfLayers++;
 178   tmpS>>=1;
 179   }
 180   for(i=0;i<numSources;i++){
 181   snprintf(nm,BLOCK_SIZE -1,"Source.%d",i);
 182   nd=newNode(nm);
 183   AttachNode(dg,nd);
 184   }
 185   for(j=0;j<numOfLayers;j++){
 186     mask=0x00000001<<j;
 187     for(i=0;i<numSources;i++){
 188       snprintf(nm,BLOCK_SIZE -1,"Comparator.%d",(i+j*firstLayerNode));
 189       nd=newNode(nm);
 190       AttachNode(dg,nd);
 191       ndoff=i&(~mask);
 192       ndid=firstLayerNode+ndoff;
 193       ar=newArc(dg->node[ndid],nd);
 194       AttachArc(dg,ar);
 195       ndoff+=mask;
 196       ndid=firstLayerNode+ndoff;
 197       ar=newArc(dg->node[ndid],nd);
 198       AttachArc(dg,ar);
 199     }
 200     firstLayerNode+=numSources;
 201   }
 202   mask=0x00000001<<numOfLayers;
 203   for(i=0;i<numSources;i++){
 204     snprintf(nm,BLOCK_SIZE -1,"Sink.%d",i);
 205     nd=newNode(nm);
 206     AttachNode(dg,nd);
 207     ndoff=i&(~mask);
 208     ndid=firstLayerNode+ndoff;
 209     ar=newArc(dg->node[ndid],nd);
 210     AttachArc(dg,ar);
 211     ndoff+=mask;
 212     ndid=firstLayerNode+ndoff;
 213     ar=newArc(dg->node[ndid],nd);
 214     AttachArc(dg,ar);
 215   }
 216   return dg;
 217 }
 218
 219 static DGraph *buildWH(const char cls){
 220 /*  Nodes of the graph must be topologically sorted to avoid MPI deadlock. */
 221   int i=0,j=0;
 222   int numSources=num_sources,maxInDeg=4;
 223   int numLayerNodes=numSources,firstLayerNode=0;
 224   int totComparators=0;
 225   int numPrevLayerNodes=numLayerNodes;
 226   int id=0,sid=0;
 227   DGraph *dg;
 228   DGNode *nd=NULL,*source=NULL,*tmp=NULL,*snd=NULL;
 229   DGArc *ar=NULL;
 230   char nm[BLOCK_SIZE];
 231
 232   sprintf(nm,"DT_WH.%c",cls);
 233   dg=newDGraph(nm);
 234
 235   for(i=0;i<numSources;i++){
 236     sprintf(nm,"Sink.%d",i);
 237     nd=newNode(nm);
 238     AttachNode(dg,nd);
 239   }
 240   totComparators=0;
 241   numPrevLayerNodes=numLayerNodes;
 242   while(numLayerNodes>maxInDeg){
 243     numLayerNodes=numLayerNodes/maxInDeg;
 244     if(numLayerNodes*maxInDeg<numPrevLayerNodes)numLayerNodes++;
 245     for(i=0;i<numLayerNodes;i++){
 246       sprintf(nm,"Comparator.%d",totComparators);
 247       totComparators++;
 248       nd=newNode(nm);
 249       id=AttachNode(dg,nd);
 250       for(j=0;j<maxInDeg;j++){
 251         sid=i*maxInDeg+j;
 252         if(sid>=numPrevLayerNodes) break;
 253         snd=dg->node[firstLayerNode+sid];
 254         ar=newArc(dg->node[id],snd);
 255         AttachArc(dg,ar);
 256       }
 257     }
 258     firstLayerNode+=numPrevLayerNodes;
 259     numPrevLayerNodes=numLayerNodes;
 260   }
 261   source=newNode((char*)"Source");
 262   AttachNode(dg,source);
 263   for(i=0;i<numPrevLayerNodes;i++){
 264     nd=dg->node[firstLayerNode+i];
 265     ar=newArc(source,nd);
 266     AttachArc(dg,ar);
 267   }
 268
 269   for(i=0;i<dg->numNodes/2;i++){  /* Topological sorting */
 270     tmp=dg->node[i];
 271     dg->node[i]=dg->node[dg->numNodes-1-i];
 272     dg->node[i]->id=i;
 273     dg->node[dg->numNodes-1-i]=tmp;
 274     dg->node[dg->numNodes-1-i]->id=dg->numNodes-1-i;
 275   }
 276 return dg;
 277 }
 278
 279 static DGraph *buildBH(const char cls){
 280 /* Nodes of the graph must be topologically sorted to avoid MPI deadlock.*/
 281   int i=0,j=0;
 282   int numSources=num_sources,maxInDeg=4;
 283   int numLayerNodes=numSources,firstLayerNode=0;
 284   DGraph *dg;
 285   DGNode *nd=NULL, *snd=NULL, *sink=NULL;
 286   DGArc *ar=NULL;
 287   int totComparators=0;
 288   int numPrevLayerNodes=numLayerNodes;
 289   int id=0, sid=0;
 290   char nm[BLOCK_SIZE];
 291
 292   sprintf(nm,"DT_BH.%c",cls);
 293   dg=newDGraph(nm);
 294
 295   for(i=0;i<numSources;i++){
 296     sprintf(nm,"Source.%d",i);
 297     nd=newNode(nm);
 298     AttachNode(dg,nd);
 299   }
 300   while(numLayerNodes>maxInDeg){
 301     numLayerNodes=numLayerNodes/maxInDeg;
 302     if(numLayerNodes*maxInDeg<numPrevLayerNodes)numLayerNodes++;
 303     for(i=0;i<numLayerNodes;i++){
 304       sprintf(nm,"Comparator.%d",totComparators);
 305       totComparators++;
 306       nd=newNode(nm);
 307       id=AttachNode(dg,nd);
 308       for(j=0;j<maxInDeg;j++){
 309         sid=i*maxInDeg+j;
 310         if(sid>=numPrevLayerNodes) break;
 311         snd=dg->node[firstLayerNode+sid];
 312         ar=newArc(snd,dg->node[id]);
 313         AttachArc(dg,ar);
 314       }
 315     }
 316     firstLayerNode+=numPrevLayerNodes;
 317     numPrevLayerNodes=numLayerNodes;
 318   }
 319   sink=newNode((char*)"Sink");
 320   AttachNode(dg,sink);
 321   for(i=0;i<numPrevLayerNodes;i++){
 322     nd=dg->node[firstLayerNode+i];
 323     ar=newArc(nd,sink);
 324     AttachArc(dg,ar);
 325   }
 326   return dg;
 327 }
 328
 329 typedef struct{
 330   int len;
 331   double* val;
 332 } Arr;
 333
 334 static Arr *newArr(int len){
 335   Arr *arr=(Arr *)malloc(sizeof(Arr)); //Arr *arr=(Arr *)SMPI_SHARED_MALLOC(sizeof(Arr));
 336   arr->len=len;
 337   arr->val=(double *)malloc(len*sizeof(double)); //arr->val=(double *)SMPI_SHARED_MALLOC(len*sizeof(double));
 338   return arr;
 339 }
 340
 341 static double CheckVal(Arr *feat){
 342   double csum=0.0;
 343   for(int i=0;i<feat->len;i++){
 344     csum+=feat->val[i]*feat->val[i]/feat->len; /* The truncation does not work since result will be 0 for large len  */
 345   }
 346   return csum;
 347 }
 348
 349 static int GetFNumDPar(int* mean, int* stdev){
 350   *mean=num_samples;
 351   *stdev=deviation;
 352   return 0;
 353 }
 354
 355 static int GetFeatureNum(char *mbname,int id){
 356   double tran=314159265.0;
 357   double A=2*id+1;
 358   double denom=randlc(&tran,&A);
 359   char cval='S';
 360   int mean=num_samples,stdev=128;
 361   int rtfs=0,len=0;
 362   GetFNumDPar(&mean,&stdev);
 363   rtfs=ipowMod((int)(1/denom)*(int)cval,(long long int) (2*id+1),2*stdev);
 364   if(rtfs<0) rtfs=-rtfs;
 365   len=mean-stdev+rtfs;
 366   return len;
 367 }
 368
 369 static Arr* RandomFeatures(char *bmname,int fdim,int id){
 370   int len=GetFeatureNum(bmname,id)*fdim;
 371   Arr* feat=newArr(len);
 372   int nxg=2,nyg=2,nzg=2,nfg=5;
 373   int nx=421,ny=419,nz=1427,nf=3527;
 374   long long int expon=(len*(id+1))%3141592;
 375   int seedx=ipowMod(nxg,expon,nx), seedy=ipowMod(nyg,expon,ny), seedz=ipowMod(nzg,expon,nz),seedf=ipowMod(nfg,expon,nf);
 376
 377   if(timer_on){
 378     timer_clear(id+1);
 379     timer_start(id+1);
 380   }
 381   for(int i=0;i<len;i+=fdim){
 382     seedx=(seedx*nxg)%nx;
 383     seedy=(seedy*nyg)%ny;
 384     seedz=(seedz*nzg)%nz;
 385     seedf=(seedf*nfg)%nf;
 386     feat->val[i]=seedx;
 387     feat->val[i+1]=seedy;
 388     feat->val[i+2]=seedz;
 389     feat->val[i+3]=seedf;
 390   }
 391   if(timer_on){
 392   timer_stop(id+1);
 393   fprintf(stderr,"** RandomFeatures time in node %d = %f\n",id,timer_read(id+1));
 394   }
 395   return feat;
 396 }
 397
 398 static void Resample(Arr *a,int blen){
 399   long long int i=0,j=0,jlo=0,jhi=0;
 400   double avval=0.0;
 401   double *nval=(double *)malloc(blen*sizeof(double));
 402   //double *nval=(double *)SMPI_SHARED_MALLOC(blen*sizeof(double));
 403   for(i=0;i<blen;i++) nval[i]=0.0;
 404   for(i=1;i<a->len-1;i++){
 405     jlo=(int)(0.5*(2*i-1)*(blen/a->len));
 406     jhi=(int)(0.5*(2*i+1)*(blen/a->len));
 407
 408     avval=a->val[i]/(jhi-jlo+1);
 409     for(j=jlo;j<=jhi;j++){
 410     nval[j]+=avval;
 411     }
 412   }
 413   nval[0]=a->val[0];
 414   nval[blen-1]=a->val[a->len-1];
 415   free(a->val); //SMPI_SHARED_FREE(a->val);
 416   a->val=nval;
 417   a->len=blen;
 418 }
 419
 420 #define fielddim 4
 421 static Arr* WindowFilter(Arr *a, Arr* b,int w){
 422   int i=0,j=0,k=0;
 423   double rms0=0.0,rms1=0.0,rmsm1=0.0;
 424   double weight=((double) (w+1))/(w+2);
 425
 426   w+=1;
 427   if(timer_on){
 428     timer_clear(w);
 429     timer_start(w);
 430   }
 431   if(a->len<b->len) Resample(a,b->len);
 432   if(a->len>b->len) Resample(b,a->len);
 433   for(i=fielddim;i<a->len-fielddim;i+=fielddim){
 434     rms0=(a->val[i]-b->val[i])*(a->val[i]-b->val[i]) +(a->val[i+1]-b->val[i+1])*(a->val[i+1]-b->val[i+1])
 435           +(a->val[i+2]-b->val[i+2])*(a->val[i+2]-b->val[i+2]) +(a->val[i+3]-b->val[i+3])*(a->val[i+3]-b->val[i+3]);
 436     j=i+fielddim;
 437     rms1=(a->val[j]-b->val[j])*(a->val[j]-b->val[j]) +(a->val[j+1]-b->val[j+1])*(a->val[j+1]-b->val[j+1])
 438           +(a->val[j+2]-b->val[j+2])*(a->val[j+2]-b->val[j+2]) +(a->val[j+3]-b->val[j+3])*(a->val[j+3]-b->val[j+3]);
 439     j=i-fielddim;
 440     rmsm1=(a->val[j]-b->val[j])*(a->val[j]-b->val[j]) +(a->val[j+1]-b->val[j+1])*(a->val[j+1]-b->val[j+1])
 441            +(a->val[j+2]-b->val[j+2])*(a->val[j+2]-b->val[j+2]) +(a->val[j+3]-b->val[j+3])*(a->val[j+3]-b->val[j+3]);
 442     k=0;
 443     if(rms1<rms0){
 444       k=1;
 445       rms0=rms1;
 446     }
 447     if(rmsm1<rms0) k=-1;
 448     if(k==0){
 449       j=i+fielddim;
 450       a->val[i]=weight*b->val[i];
 451       a->val[i+1]=weight*b->val[i+1];
 452       a->val[i+2]=weight*b->val[i+2];
 453       a->val[i+3]=weight*b->val[i+3];
 454     }else if(k==1){
 455       j=i+fielddim;
 456       a->val[i]=weight*b->val[j];
 457       a->val[i+1]=weight*b->val[j+1];
 458       a->val[i+2]=weight*b->val[j+2];
 459       a->val[i+3]=weight*b->val[j+3];
 460     }else { /*if(k==-1)*/
 461       j=i-fielddim;
 462       a->val[i]=weight*b->val[j];
 463       a->val[i+1]=weight*b->val[j+1];
 464       a->val[i+2]=weight*b->val[j+2];
 465       a->val[i+3]=weight*b->val[j+3];
 466     }
 467   }
 468   if(timer_on){
 469     timer_stop(w);
 470     fprintf(stderr,"** WindowFilter time in node %d = %f\n",(w-1),timer_read(w));
 471   }
 472   return a;
 473 }
 474
 475 static int SendResults(DGraph *dg,DGNode *nd,Arr *feat){
 476   int i=0,tag=0;
 477   DGArc *ar=NULL;
 478   DGNode *head=NULL;
 479   if(!feat) return 0;
 480   TRACE_smpi_set_category ("SendResults");
 481   for(i=0;i<nd->outDegree;i++){
 482     ar=nd->outArc[i];
 483     if(ar->tail!=nd) continue;
 484     head=ar->head;
 485     tag=ar->id;
 486     if(head->address!=nd->address){
 487       MPI_Send(&feat->len,1,MPI_INT,head->address,tag,MPI_COMM_WORLD);
 488       MPI_Send(feat->val,feat->len,MPI_DOUBLE,head->address,tag,MPI_COMM_WORLD);
 489     }
 490   }
 491   TRACE_smpi_set_category (NULL);
 492   return 1;
 493 }
 494
 495 static Arr* CombineStreams(DGraph *dg,DGNode *nd){
 496   Arr *resfeat=newArr(num_samples*fielddim);
 497   int i=0,len=0,tag=0;
 498   DGArc *ar=NULL;
 499   DGNode *tail=NULL;
 500   MPI_Status status;
 501   Arr *feat=NULL,*featp=NULL;
 502
 503   if(nd->inDegree==0) return NULL;
 504   for(i=0;i<nd->inDegree;i++){
 505     ar=nd->inArc[i];
 506     if(ar->head!=nd) continue;
 507     tail=ar->tail;
 508     if(tail->address!=nd->address){
 509       len=0;
 510       tag=ar->id;
 511       MPI_Recv(&len,1,MPI_INT,tail->address,tag,MPI_COMM_WORLD,&status);
 512       feat=newArr(len);
 513       MPI_Recv(feat->val,feat->len,MPI_DOUBLE,tail->address,tag,MPI_COMM_WORLD,&status);
 514       resfeat=WindowFilter(resfeat,feat,nd->id);
 515       free(feat);//SMPI_SHARED_FREE(feat);
 516     }else{
 517       featp=(Arr *)tail->feat;
 518       feat=newArr(featp->len);
 519       memcpy(feat->val,featp->val,featp->len*sizeof(double));
 520       resfeat=WindowFilter(resfeat,feat,nd->id);
 521       free(feat);//SMPI_SHARED_FREE(feat);
 522     }
 523   }
 524   for(i=0;i<resfeat->len;i++) resfeat->val[i]=((int)resfeat->val[i])/nd->inDegree;
 525   nd->feat=resfeat;
 526   return nd->feat;
 527 }
 528
 529 static double Reduce(Arr *a,int w){
 530   double retv=0.0;
 531   if(timer_on){
 532     timer_clear(w);
 533     timer_start(w);
 534   }
 535   retv=(int)(w*CheckVal(a));/* The casting needed for node and array dependent verifcation */
 536   if(timer_on){
 537     timer_stop(w);
 538     fprintf(stderr,"** Reduce time in node %d = %f\n",(w-1),timer_read(w));
 539   }
 540   return retv;
 541 }
 542
 543 static double ReduceStreams(DGraph *dg,DGNode *nd){
 544   double csum=0.0;
 545   int i=0,len=0,tag=0;
 546   DGArc *ar=NULL;
 547   DGNode *tail=NULL;
 548   Arr *feat=NULL;
 549   double retv=0.0;
 550
 551   TRACE_smpi_set_category ("ReduceStreams");
 552
 553   for(i=0;i<nd->inDegree;i++){
 554     ar=nd->inArc[i];
 555     if(ar->head!=nd) continue;
 556     tail=ar->tail;
 557     if(tail->address!=nd->address){
 558       MPI_Status status;
 559       len=0;
 560       tag=ar->id;
 561       MPI_Recv(&len,1,MPI_INT,tail->address,tag,MPI_COMM_WORLD,&status);
 562       feat=newArr(len);
 563       MPI_Recv(feat->val,feat->len,MPI_DOUBLE,tail->address,tag,MPI_COMM_WORLD,&status);
 564       csum+=Reduce(feat,(nd->id+1));
 565       free(feat);//SMPI_SHARED_FREE(feat);
 566     }else{
 567       csum+=Reduce(tail->feat,(nd->id+1));
 568     }
 569   }
 570   if(nd->inDegree>0)csum=(((long long int)csum)/nd->inDegree);
 571   retv=(nd->id+1)*csum;
 572   return retv;
 573 }
 574
 575 static int ProcessNodes(DGraph *dg,int me){
 576   double chksum=0.0;
 577   Arr *feat=NULL;
 578   int i=0,verified=0,tag;
 579   DGNode *nd=NULL;
 580   double rchksum=0.0;
 581   MPI_Status status;
 582
 583   TRACE_smpi_set_category ("ProcessNodes");
 584
 585   for(i=0;i<dg->numNodes;i++){
 586     nd=dg->node[i];
 587     if(nd->address!=me) continue;
 588     if(strstr(nd->name,"Source")){
 589       nd->feat=RandomFeatures(dg->name,fielddim,nd->id);
 590       SendResults(dg,nd,nd->feat);
 591     }else if(strstr(nd->name,"Sink")){
 592       chksum=ReduceStreams(dg,nd);
 593       tag=dg->numArcs+nd->id; /* make these to avoid clash with arc tags */
 594       MPI_Send(&chksum,1,MPI_DOUBLE,0,tag,MPI_COMM_WORLD);
 595     }else{
 596       feat=CombineStreams(dg,nd);
 597       SendResults(dg,nd,feat);
 598     }
 599   }
 600
 601   TRACE_smpi_set_category ("ProcessNodes");
 602
 603   if(me==0){ /* Report node */
 604     rchksum=0.0;
 605     chksum=0.0;
 606     for(i=0;i<dg->numNodes;i++){
 607       nd=dg->node[i];
 608       if(!strstr(nd->name,"Sink")) continue;
 609       tag=dg->numArcs+nd->id; /* make these to avoid clash with arc tags */
 610       MPI_Recv(&rchksum,1,MPI_DOUBLE,nd->address,tag,MPI_COMM_WORLD,&status);
 611       chksum+=rchksum;
 612     }
 613     verified=verify(dg->name,chksum);
 614   }
 615   return verified;
 616 }
 617
 618 int main(int argc,char **argv ){
 619   int my_rank,comm_size;
 620   int i;
 621   DGraph *dg=NULL;
 622   int verified=0, featnum=0;
 623   double bytes_sent=2.0,tot_time=0.0;
 624
 625   MPI_Init( &argc, &argv );
 626   MPI_Comm_rank( MPI_COMM_WORLD, &my_rank );
 627   MPI_Comm_size( MPI_COMM_WORLD, &comm_size );
 628
 629   TRACE_smpi_set_category ("begin");
 630   get_info(argc, argv, &nprocs, &class);
 631   check_info(DT, nprocs, class);
 632
 633   if    (class == 'S') { num_samples=1728; deviation=128; num_sources=4; }
 634   else if (class == 'W') { num_samples=1728*8; deviation=128*2; num_sources=4*2; }
 635   else if (class == 'A') { num_samples=1728*64; deviation=128*4; num_sources=4*4; }
 636   else if (class == 'B') { num_samples=1728*512; deviation=128*8; num_sources=4*8; }
 637   else if (class == 'C') { num_samples=1728*4096; deviation=128*16; num_sources=4*16; }
 638   else if (class == 'D') { num_samples=1728*4096*8; deviation=128*32; num_sources=4*32; }
 639   else {
 640     printf("setparams: Internal error: invalid class type %c\n", class);
 641     exit(1);
 642   }
 643
 644   if(argc!=4 || (strncmp(argv[3],"BH",2)!=0 && strncmp(argv[3],"WH",2)!=0 && strncmp(argv[3],"SH",2)!=0)){
 645     if(my_rank==0){
 646     fprintf(stderr,"** Usage: mpirun -np N ../bin/dt.S GraphName\n");
 647     fprintf(stderr,"** Where \n   - N is integer number of MPI processes\n");
 648     fprintf(stderr,"   - S is the class S, W, or A \n");
 649     fprintf(stderr,"   - GraphName is the communication graph name BH, WH, or SH.\n");
 650     fprintf(stderr,"   - the number of MPI processes N should not be be less than \n");
 651     fprintf(stderr,"   the number of nodes in the graph\n");
 652     }
 653     MPI_Finalize();
 654     exit(0);
 655   }
 656
 657   if(strncmp(argv[3],"BH",2)==0){
 658     dg=buildBH(class);
 659   }else if(strncmp(argv[3],"WH",2)==0){
 660     dg=buildWH(class);
 661   }else if(strncmp(argv[3],"SH",2)==0){
 662     dg=buildSH(class);
 663   }
 664
 665   if(timer_on && dg->numNodes+1>timers_tot){
 666     timer_on=0;
 667     if(my_rank==0)
 668     fprintf(stderr,"Not enough timers. Node timeing is off. \n");
 669   }
 670   if(dg->numNodes>comm_size){
 671     if(my_rank==0){
 672     fprintf(stderr,"**  The number of MPI processes should not be less than \n");
 673     fprintf(stderr,"**  the number of nodes in the graph\n");
 674     fprintf(stderr,"**  Number of MPI processes = %d\n",comm_size);
 675     fprintf(stderr,"**  Number nodes in the graph = %d\n",dg->numNodes);
 676     }
 677     MPI_Finalize();
 678     exit(0);
 679   }
 680   for(i=0;i<dg->numNodes;i++){
 681     dg->node[i]->address=i;
 682   }
 683   if( my_rank == 0 ){
 684     printf( "\n\n NAS Parallel Benchmarks 3.3 -- DT Benchmark\n\n" );
 685     graphShow(dg,0);
 686     timer_clear(0);
 687     timer_start(0);
 688   }
 689   verified=ProcessNodes(dg,my_rank);
 690   TRACE_smpi_set_category ("end");
 691
 692   featnum=num_samples*fielddim;
 693   bytes_sent=featnum*dg->numArcs;
 694   bytes_sent/=1048576;
 695   if(my_rank==0){
 696     timer_stop(0);
 697     tot_time=timer_read(0);
 698     c_print_results( dg->name, class, featnum, 0, 0, dg->numNodes, 0, comm_size, tot_time, bytes_sent/tot_time,
 699          "bytes transmitted", verified);
 700   }
 701   MPI_Finalize();
 702   return 1;
 703 }