src/smpi/smpi_coll.cpp

   1 /* smpi_coll.c -- various optimized routing for collectives                   */
   2
   3 /* Copyright (c) 2009-2015. The SimGrid Team.
   4  * All rights reserved.                                                     */
   5
   6 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   7  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   8
   9 #include <stdio.h>
  10 #include <string.h>
  11 #include <assert.h>
  12
  13 #include "private.h"
  14 #include "colls/colls.h"
  15 #include "simgrid/sg_config.h"
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_coll, smpi, "Logging specific to SMPI (coll)");
  18
  19 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_gather_description[] = {
  20   {"default", "gather default collective", reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_gather)},
  21    COLL_GATHERS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA), {nullptr, nullptr, nullptr}  /* this array must be nullptr terminated */
  22 };
  23
  24 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_allgather_description[] = { {"default",  "allgather default collective",
  25    reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_allgather)}, COLL_ALLGATHERS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA), {nullptr, nullptr, nullptr}};
  26
  27 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_allgatherv_description[] = {{"default", "allgatherv default collective",
  28    reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_allgatherv)}, COLL_ALLGATHERVS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA),
  29    {nullptr, nullptr, nullptr}      /* this array must be nullptr terminated */
  30 };
  31
  32 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_allreduce_description[] = { {"default", "allreduce default collective",
  33    reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_allreduce)}, COLL_ALLREDUCES(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA),
  34   {nullptr, nullptr, nullptr}      /* this array must be nullptr terminated */
  35 };
  36
  37 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_reduce_scatter_description[] = {{"default", "reduce_scatter default collective",
  38     reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_reduce_scatter)}, COLL_REDUCE_SCATTERS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA),
  39     {nullptr, nullptr, nullptr}      /* this array must be nullptr terminated */
  40 };
  41
  42 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_scatter_description[] = { {"default",  "scatter default collective",
  43    reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_scatter)}, COLL_SCATTERS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA), {nullptr, nullptr, nullptr}};
  44
  45 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_barrier_description[] = { {"default", "barrier default collective",
  46    reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_barrier)}, COLL_BARRIERS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA), {nullptr, nullptr, nullptr}};
  47
  48 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_alltoall_description[] = { {"default", "Ompi alltoall default collective",
  49    reinterpret_cast<void*>(&smpi_coll_tuned_alltoall_ompi2)}, COLL_ALLTOALLS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA),
  50   {"bruck", "Alltoall Bruck (SG) collective",
  51    reinterpret_cast<void*>(&smpi_coll_tuned_alltoall_bruck)},
  52   {"basic_linear", "Alltoall basic linear (SG) collective",
  53    reinterpret_cast<void*>(&smpi_coll_tuned_alltoall_basic_linear)}, {nullptr, nullptr, nullptr}};
  54
  55 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_alltoallv_description[] = { {"default", "Ompi alltoallv default collective",
  56    reinterpret_cast<void*>(&smpi_coll_basic_alltoallv)}, COLL_ALLTOALLVS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA),
  57    {nullptr, nullptr, nullptr}      /* this array must be nullptr terminated */
  58 };
  59
  60 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_bcast_description[] = { {"default", "bcast default collective ",
  61    reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_bcast)}, COLL_BCASTS(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA), {nullptr, nullptr, nullptr}};
  62
  63 s_mpi_coll_description_t mpi_coll_reduce_description[] = { {"default", "reduce default collective",
  64    reinterpret_cast<void*>(&smpi_mpi_reduce)}, COLL_REDUCES(COLL_DESCRIPTION, COLL_COMMA), {nullptr, nullptr, nullptr} };
  65
  66
  67
  68 /** Displays the long description of all registered models, and quit */
  69 void coll_help(const char *category, s_mpi_coll_description_t * table)
  70 {
  71   printf("Long description of the %s models accepted by this simulator:\n", category);
  72   for (int i = 0; table[i].name; i++)
  73     printf("  %s: %s\n", table[i].name, table[i].description);
  74 }
  75
  76 int find_coll_description(s_mpi_coll_description_t * table, char *name, const char *desc)
  77 {
  78   char *name_list = nullptr;
  79   int selector_on=0;
  80   if (name==nullptr || name[0] == '\0') {
  81     //no argument provided, use active selector's algorithm
  82     name=static_cast<char*>(xbt_cfg_get_string("smpi/coll-selector"));
  83     selector_on=1;
  84   }
  85   for (int i = 0; table[i].name; i++)
  86     if (!strcmp(name, table[i].name)) {
  87       if (strcmp(table[i].name,"default"))
  88         XBT_INFO("Switch to algorithm %s for collective %s",table[i].name,desc);
  89       return i;
  90     }
  91
  92   if(selector_on){
  93     // collective seems not handled by the active selector, try with default one
  94     name=const_cast<char*>("default");
  95     for (int i = 0; table[i].name; i++)
  96       if (!strcmp(name, table[i].name)) {
  97         return i;
  98     }
  99   }
 100   if (!table[0].name)
 101     xbt_die("No collective is valid for '%s'! This is a bug.",name);
 102   name_list = xbt_strdup(table[0].name);
 103   for (int i = 1; table[i].name; i++) {
 104     name_list = static_cast<char*>(xbt_realloc(name_list, strlen(name_list) + strlen(table[i].name) + 3));
 105     strncat(name_list, ", ",2);
 106     strncat(name_list, table[i].name, strlen(table[i].name));
 107   }
 108   xbt_die("Collective '%s' is invalid! Valid collectives are: %s.", name, name_list);
 109   return -1;
 110 }
 111
 112 int (*mpi_coll_gather_fun)(void *, int, MPI_Datatype, void*, int, MPI_Datatype, int root, MPI_Comm);
 113 int (*mpi_coll_allgather_fun)(void *, int, MPI_Datatype, void*, int, MPI_Datatype, MPI_Comm);
 114 int (*mpi_coll_allgatherv_fun)(void *, int, MPI_Datatype, void*, int*, int*, MPI_Datatype, MPI_Comm);
 115 int (*mpi_coll_allreduce_fun)(void *sbuf, void *rbuf, int rcount, MPI_Datatype dtype, MPI_Op op, MPI_Comm comm);
 116 int (*mpi_coll_alltoall_fun)(void *, int, MPI_Datatype, void*, int, MPI_Datatype, MPI_Comm);
 117 int (*mpi_coll_alltoallv_fun)(void *, int*, int*, MPI_Datatype, void*, int*, int*, MPI_Datatype, MPI_Comm);
 118 int (*mpi_coll_bcast_fun)(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root, MPI_Comm com);
 119 int (*mpi_coll_reduce_fun)(void *buf, void *rbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root, MPI_Comm comm);
 120 int (*mpi_coll_reduce_scatter_fun)(void *sbuf, void *rbuf, int *rcounts,MPI_Datatype dtype,MPI_Op  op,MPI_Comm  comm);
 121 int (*mpi_coll_scatter_fun)(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,int root, MPI_Comm comm);
 122 int (*mpi_coll_barrier_fun)(MPI_Comm comm);
 123 void (*smpi_coll_cleanup_callback)();
 124
 125
 126 int smpi_coll_tuned_alltoall_ompi2(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
 127                                    int recvcount, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
 128 {
 129   int size = smpi_comm_size(comm);
 130   int sendsize = smpi_datatype_size(sendtype) * sendcount;
 131   if (sendsize < 200 && size > 12) {
 132     return smpi_coll_tuned_alltoall_bruck(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype, comm);
 133   } else if (sendsize < 3000) {
 134     return smpi_coll_tuned_alltoall_basic_linear(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype, comm);
 135   } else {
 136     return smpi_coll_tuned_alltoall_ring(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype, comm);
 137   }
 138 }
 139
 140 /**
 141  * Alltoall Bruck
 142  *
 143  * Openmpi calls this routine when the message size sent to each rank < 2000 bytes and size < 12
 144  * FIXME: uh, check smpi_pmpi again, but this routine is called for > 12, not less...
 145  **/
 146 int smpi_coll_tuned_alltoall_bruck(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 147                                    void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
 148 {
 149   int system_tag = 777;
 150   int i;
 151   int count;
 152   MPI_Aint lb;
 153   MPI_Aint sendext = 0;
 154   MPI_Aint recvext = 0;
 155   MPI_Request *requests;
 156
 157   // FIXME: check implementation
 158   int rank = smpi_comm_rank(comm);
 159   int size = smpi_comm_size(comm);
 160   XBT_DEBUG("<%d> algorithm alltoall_bruck() called.", rank);
 161   smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
 162   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 163   /* Local copy from self */
 164   int err =  smpi_datatype_copy(static_cast<char *>(sendbuf) + rank * sendcount * sendext, sendcount, sendtype,
 165                                 static_cast<char *>(recvbuf) + rank * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
 166   if (err == MPI_SUCCESS && size > 1) {
 167     /* Initiate all send/recv to/from others. */
 168     requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
 169     count = 0;
 170     /* Create all receives that will be posted first */
 171     for (i = 0; i < size; ++i) {
 172       if (i != rank) {
 173         requests[count] = smpi_irecv_init(static_cast<char *>(recvbuf) + i * recvcount * recvext, recvcount,
 174                                           recvtype, i, system_tag, comm);
 175       count++;
 176       }else{
 177         XBT_DEBUG("<%d> skip request creation [src = %d, recvcount = %d]", rank, i, recvcount);
 178       }
 179     }
 180     /* Now create all sends  */
 181     for (i = 0; i < size; ++i) {
 182       if (i != rank) {
 183         requests[count] = smpi_isend_init(static_cast<char *>(sendbuf) + i * sendcount * sendext, sendcount,
 184                                           sendtype, i, system_tag, comm);
 185       count++;
 186       }else{
 187         XBT_DEBUG("<%d> skip request creation [dst = %d, sendcount = %d]", rank, i, sendcount);
 188       }
 189     }
 190     /* Wait for them all. */
 191     smpi_mpi_startall(count, requests);
 192     XBT_DEBUG("<%d> wait for %d requests", rank, count);
 193     smpi_mpi_waitall(count, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 194     for(i = 0; i < count; i++) {
 195       if(requests[i]!=MPI_REQUEST_NULL)
 196         smpi_mpi_request_free(&requests[i]);
 197     }
 198     xbt_free(requests);
 199   }
 200   return MPI_SUCCESS;
 201 }
 202
 203 /**
 204  * Alltoall basic_linear (STARMPI:alltoall-simple)
 205  **/
 206 int smpi_coll_tuned_alltoall_basic_linear(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 207                                           void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
 208 {
 209   int system_tag = 888;
 210   int i;
 211   int count;
 212   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0, recvext = 0;
 213   MPI_Request *requests;
 214
 215   /* Initialize. */
 216   int rank = smpi_comm_rank(comm);
 217   int size = smpi_comm_size(comm);
 218   XBT_DEBUG("<%d> algorithm alltoall_basic_linear() called.", rank);
 219   smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
 220   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 221   /* simple optimization */
 222   int err = smpi_datatype_copy(static_cast<char *>(sendbuf) + rank * sendcount * sendext, sendcount, sendtype,
 223                                static_cast<char *>(recvbuf) + rank * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
 224   if (err == MPI_SUCCESS && size > 1) {
 225     /* Initiate all send/recv to/from others. */
 226     requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
 227     /* Post all receives first -- a simple optimization */
 228     count = 0;
 229     for (i = (rank + 1) % size; i != rank; i = (i + 1) % size) {
 230       requests[count] = smpi_irecv_init(static_cast<char *>(recvbuf) + i * recvcount * recvext, recvcount,
 231                                         recvtype, i, system_tag, comm);
 232       count++;
 233     }
 234     /* Now post all sends in reverse order
 235      *   - We would like to minimize the search time through message queue
 236      *     when messages actually arrive in the order in which they were posted.
 237      * TODO: check the previous assertion
 238      */
 239     for (i = (rank + size - 1) % size; i != rank; i = (i + size - 1) % size) {
 240       requests[count] = smpi_isend_init(static_cast<char *>(sendbuf) + i * sendcount * sendext, sendcount,
 241                                         sendtype, i, system_tag, comm);
 242       count++;
 243     }
 244     /* Wait for them all. */
 245     smpi_mpi_startall(count, requests);
 246     XBT_DEBUG("<%d> wait for %d requests", rank, count);
 247     smpi_mpi_waitall(count, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 248     for(i = 0; i < count; i++) {
 249       if(requests[i]!=MPI_REQUEST_NULL)
 250         smpi_mpi_request_free(&requests[i]);
 251     }
 252     xbt_free(requests);
 253   }
 254   return err;
 255 }
 256
 257 int smpi_coll_basic_alltoallv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *senddisps, MPI_Datatype sendtype,
 258                               void *recvbuf, int *recvcounts, int *recvdisps, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
 259 {
 260   int system_tag = 889;
 261   int i;
 262   int count;
 263   MPI_Aint lb = 0;
 264   MPI_Aint sendext = 0;
 265   MPI_Aint recvext = 0;
 266   MPI_Request *requests;
 267
 268   /* Initialize. */
 269   int rank = smpi_comm_rank(comm);
 270   int size = smpi_comm_size(comm);
 271   XBT_DEBUG("<%d> algorithm basic_alltoallv() called.", rank);
 272   smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
 273   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 274   /* Local copy from self */
 275   int err = smpi_datatype_copy(static_cast<char *>(sendbuf) + senddisps[rank] * sendext, sendcounts[rank], sendtype,
 276                                static_cast<char *>(recvbuf) + recvdisps[rank] * recvext, recvcounts[rank], recvtype);
 277   if (err == MPI_SUCCESS && size > 1) {
 278     /* Initiate all send/recv to/from others. */
 279     requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
 280     count = 0;
 281     /* Create all receives that will be posted first */
 282     for (i = 0; i < size; ++i) {
 283       if (i != rank && recvcounts[i] != 0) {
 284         requests[count] = smpi_irecv_init(static_cast<char *>(recvbuf) + recvdisps[i] * recvext,
 285                                           recvcounts[i], recvtype, i, system_tag, comm);
 286         count++;
 287       }else{
 288         XBT_DEBUG("<%d> skip request creation [src = %d, recvcounts[src] = %d]", rank, i, recvcounts[i]);
 289       }
 290     }
 291     /* Now create all sends  */
 292     for (i = 0; i < size; ++i) {
 293       if (i != rank && sendcounts[i] != 0) {
 294       requests[count] = smpi_isend_init(static_cast<char *>(sendbuf) + senddisps[i] * sendext,
 295                                         sendcounts[i], sendtype, i, system_tag, comm);
 296       count++;
 297       }else{
 298         XBT_DEBUG("<%d> skip request creation [dst = %d, sendcounts[dst] = %d]", rank, i, sendcounts[i]);
 299       }
 300     }
 301     /* Wait for them all. */
 302     smpi_mpi_startall(count, requests);
 303     XBT_DEBUG("<%d> wait for %d requests", rank, count);
 304     smpi_mpi_waitall(count, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 305     for(i = 0; i < count; i++) {
 306       if(requests[i]!=MPI_REQUEST_NULL)
 307         smpi_mpi_request_free(&requests[i]);
 308     }
 309     xbt_free(requests);
 310   }
 311   return err;
 312 }