src/smpi/smpi_base.c

   1 /* Copyright (c) 2007-2014. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "xbt/virtu.h"
   9 #include "mc/mc.h"
  10 #include "xbt/replay.h"
  11 #include <errno.h>
  12 #include "simix/smx_private.h"
  13 #include "surf/surf.h"
  14 #include "simgrid/sg_config.h"
  15 #include "colls/colls.h"
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
  18
  19
  20 static int match_recv(void* a, void* b, smx_synchro_t ignored) {
  21    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  22    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  23    XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  24
  25   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
  26   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
  27   if((ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  28     && ((ref->tag == MPI_ANY_TAG && req->tag >=0) || req->tag == ref->tag)){
  29     //we match, we can transfer some values
  30     // FIXME : move this to the copy function ?
  31     if(ref->src == MPI_ANY_SOURCE)ref->real_src = req->src;
  32     if(ref->tag == MPI_ANY_TAG)ref->real_tag = req->tag;
  33     if(ref->real_size < req->real_size) ref->truncated = 1;
  34     if(req->detached==1){
  35         ref->detached_sender=req; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  36     }
  37     XBT_DEBUG("match succeeded");
  38     return 1;
  39   }else return 0;
  40 }
  41
  42 static int match_send(void* a, void* b,smx_synchro_t ignored) {
  43    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  44    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  45    XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  46    xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
  47    xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
  48
  49    if((req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  50              && ((req->tag == MPI_ANY_TAG && ref->tag >=0)|| req->tag == ref->tag))
  51    {
  52      if(req->src == MPI_ANY_SOURCE)req->real_src = ref->src;
  53      if(req->tag == MPI_ANY_TAG)req->real_tag = ref->tag;
  54      if(req->real_size < ref->real_size) req->truncated = 1;
  55      if(ref->detached==1){
  56          req->detached_sender=ref; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  57      }
  58     XBT_DEBUG("match succeeded");
  59      return 1;
  60    } else return 0;
  61 }
  62
  63
  64 typedef struct s_smpi_factor *smpi_factor_t;
  65 typedef struct s_smpi_factor {
  66   long factor;
  67   int nb_values;
  68   double values[4];//arbitrary set to 4
  69 } s_smpi_factor_t;
  70 xbt_dynar_t smpi_os_values = NULL;
  71 xbt_dynar_t smpi_or_values = NULL;
  72 xbt_dynar_t smpi_ois_values = NULL;
  73
  74 double smpi_wtime_sleep = 0.0;
  75 double smpi_iprobe_sleep = 1e-4;
  76 double smpi_test_sleep = 1e-4;
  77
  78
  79 // Methods used to parse and store the values for timing injections in smpi
  80 // These are taken from surf/network.c and generalized to have more factors
  81 // These methods should be merged with those in surf/network.c (moved somewhere in xbt ?)
  82
  83 static int factor_cmp(const void *pa, const void *pb)
  84 {
  85   return (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor > ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? 1 :
  86          (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor < ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? -1 : 0;
  87 }
  88
  89
  90 static xbt_dynar_t parse_factor(const char *smpi_coef_string)
  91 {
  92   char *value = NULL;
  93   unsigned int iter = 0;
  94   s_smpi_factor_t fact;
  95   fact.nb_values=0;
  96   int i=0;
  97   xbt_dynar_t smpi_factor, radical_elements, radical_elements2 = NULL;
  98
  99   smpi_factor = xbt_dynar_new(sizeof(s_smpi_factor_t), NULL);
 100   radical_elements = xbt_str_split(smpi_coef_string, ";");
 101   xbt_dynar_foreach(radical_elements, iter, value) {
 102     memset(&fact, 0, sizeof(s_smpi_factor_t));
 103     radical_elements2 = xbt_str_split(value, ":");
 104     if (xbt_dynar_length(radical_elements2) <2 || xbt_dynar_length(radical_elements2) > 5)
 105       xbt_die("Malformed radical for smpi factor!");
 106     for(i =0; i<xbt_dynar_length(radical_elements2);i++ ){
 107         if (i==0){
 108            fact.factor = atol(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 109         }else{
 110            fact.values[fact.nb_values] = atof(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 111            fact.nb_values++;
 112         }
 113     }
 114
 115     xbt_dynar_push_as(smpi_factor, s_smpi_factor_t, fact);
 116     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 117     xbt_dynar_free(&radical_elements2);
 118   }
 119   xbt_dynar_free(&radical_elements);
 120   iter=0;
 121   xbt_dynar_sort(smpi_factor, &factor_cmp);
 122   xbt_dynar_foreach(smpi_factor, iter, fact) {
 123     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 124   }
 125   return smpi_factor;
 126 }
 127
 128 static double smpi_os(double size)
 129 {
 130   if (!smpi_os_values) {
 131     smpi_os_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/os"));
 132     smpi_register_static(smpi_os_values, xbt_dynar_free_voidp);
 133   }
 134   unsigned int iter = 0;
 135   s_smpi_factor_t fact;
 136   double current=0.0;
 137   xbt_dynar_foreach(smpi_os_values, iter, fact) {
 138     if (size <= fact.factor) {
 139         XBT_DEBUG("os : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 140       return current;
 141     }else{
 142       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 143     }
 144   }
 145   XBT_DEBUG("os : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 146
 147   return current;
 148 }
 149
 150 static double smpi_ois(double size)
 151 {
 152   if (!smpi_ois_values) {
 153     smpi_ois_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/ois"));
 154     smpi_register_static(smpi_ois_values, xbt_dynar_free_voidp);
 155   }
 156   unsigned int iter = 0;
 157   s_smpi_factor_t fact;
 158   double current=0.0;
 159   xbt_dynar_foreach(smpi_ois_values, iter, fact) {
 160     if (size <= fact.factor) {
 161         XBT_DEBUG("ois : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 162       return current;
 163     }else{
 164       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 165     }
 166   }
 167   XBT_DEBUG("ois : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 168
 169   return current;
 170 }
 171
 172 static double smpi_or(double size)
 173 {
 174   if (!smpi_or_values) {
 175     smpi_or_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/or"));
 176     smpi_register_static(smpi_or_values, xbt_dynar_free_voidp);
 177   }
 178   unsigned int iter = 0;
 179   s_smpi_factor_t fact;
 180   double current=0.0;
 181   xbt_dynar_foreach(smpi_or_values, iter, fact) {
 182     if (size <= fact.factor) {
 183         XBT_DEBUG("or : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 184       return current;
 185     }else
 186       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 187   }
 188   XBT_DEBUG("or : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 189
 190   return current;
 191 }
 192
 193 double smpi_mpi_wtime(){
 194   double time;
 195   if (smpi_process_initialized() && !smpi_process_finalized() && !smpi_process_get_sampling()) {
 196     smpi_bench_end();
 197     time = SIMIX_get_clock();
 198     //to avoid deadlocks if called too many times
 199     if(smpi_wtime_sleep > 0) simcall_process_sleep(smpi_wtime_sleep);
 200     smpi_bench_begin();
 201   } else {
 202     time = SIMIX_get_clock();
 203   }
 204   return time;
 205 }
 206
 207 static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
 208                                  MPI_Datatype datatype, int src, int dst,
 209                                  int tag, MPI_Comm comm, unsigned flags)
 210 {
 211   MPI_Request request = NULL;
 212
 213   void *old_buf = NULL;
 214
 215   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
 216
 217   s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 218
 219   if(((flags & RECV) && (flags & ACCUMULATE)) || (datatype->has_subtype == 1)){
 220     // This part handles the problem of non-contiguous memory
 221     old_buf = buf;
 222     buf = count==0 ? NULL : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
 223     if ((datatype->has_subtype == 1) && (flags & SEND)) {
 224       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
 225     }
 226   }
 227
 228   request->buf = buf;
 229   // This part handles the problem of non-contiguous memory (for the
 230   // unserialisation at the reception)
 231   request->old_buf = old_buf;
 232   request->old_type = datatype;
 233
 234   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
 235   request->src = src;
 236   request->dst = dst;
 237   request->tag = tag;
 238   request->comm = comm;
 239   request->action = NULL;
 240   request->flags = flags;
 241   request->detached = 0;
 242   request->detached_sender = NULL;
 243   request->real_src = 0;
 244
 245   request->truncated = 0;
 246   request->real_size = 0;
 247   request->real_tag = 0;
 248   if(flags & PERSISTENT)
 249     request->refcount = 1;
 250   else
 251     request->refcount = 0;
 252   request->op = MPI_REPLACE;
 253 #ifdef HAVE_TRACING
 254   request->send = 0;
 255   request->recv = 0;
 256 #endif
 257   if (flags & SEND) smpi_datatype_unuse(datatype);
 258
 259   return request;
 260 }
 261
 262
 263 void smpi_empty_status(MPI_Status * status)
 264 {
 265   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 266     status->MPI_SOURCE = MPI_ANY_SOURCE;
 267     status->MPI_TAG = MPI_ANY_TAG;
 268     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 269     status->count=0;
 270   }
 271 }
 272
 273 void smpi_action_trace_run(char *path)
 274 {
 275   char *name;
 276   xbt_dynar_t todo;
 277   xbt_dict_cursor_t cursor;
 278
 279   action_fp=NULL;
 280   if (path) {
 281     action_fp = fopen(path, "r");
 282     if (action_fp == NULL)
 283       xbt_die("Cannot open %s: %s", path, strerror(errno));
 284   }
 285
 286   if (!xbt_dict_is_empty(action_queues)) {
 287     XBT_WARN
 288       ("Not all actions got consumed. If the simulation ended successfully (without deadlock), you may want to add new processes to your deployment file.");
 289
 290
 291     xbt_dict_foreach(action_queues, cursor, name, todo) {
 292       XBT_WARN("Still %lu actions for %s", xbt_dynar_length(todo), name);
 293     }
 294   }
 295
 296   if (path)
 297     fclose(action_fp);
 298   xbt_dict_free(&action_queues);
 299   action_queues = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 300 }
 301
 302 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
 303 {
 304   MPI_Request req = request;
 305   smpi_mpi_request_free(&req);
 306 }
 307
 308 /* MPI Low level calls */
 309 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 310                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 311 {
 312   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 313   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 314                           comm, PERSISTENT | SEND | PREPARED);
 315   return request;
 316 }
 317
 318 MPI_Request smpi_mpi_ssend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 319                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 320 {
 321   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 322   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 323                           comm, PERSISTENT | SSEND | SEND | PREPARED);
 324   return request;
 325 }
 326
 327 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 328                                int src, int tag, MPI_Comm comm)
 329 {
 330   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 331   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 332                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 333   return request;
 334 }
 335
 336 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 337 {
 338   smx_rdv_t mailbox;
 339
 340   xbt_assert(!request->action, "Cannot (re)start a non-finished communication");
 341   request->flags &= ~PREPARED;
 342   request->flags &= ~FINISHED;
 343   request->refcount++;
 344
 345   if (request->flags & RECV) {
 346     print_request("New recv", request);
 347
 348     if (request->flags & RMA || request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")){
 349     //We have to check both mailboxes (because SSEND messages are sent to the large mbox). begin with the more appropriate one : the small one.
 350       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 351       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted the small mailbox %p (in case of SSEND)?", mailbox);
 352       smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 353
 354       if(action ==NULL){
 355         mailbox = smpi_process_mailbox();
 356         XBT_DEBUG("No, nothing in the small mailbox test the other one : %p", mailbox);
 357         action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 358         if(action ==NULL){
 359           XBT_DEBUG("Still notching, switch back to the small mailbox : %p", mailbox);
 360           mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 361           }
 362       }else{
 363         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the large mailbox");
 364       }
 365     }else{
 366       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 367       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted the small mailbox?");
 368     smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 369
 370       if(action ==NULL){
 371         XBT_DEBUG("No, nothing in the permanent receive mailbox");
 372         mailbox = smpi_process_mailbox();
 373       }else{
 374         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the small mailbox");
 375       }
 376     }
 377
 378     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
 379     double sleeptime = request->detached ? smpi_or(request->size) : 0.0;
 380     if(sleeptime!=0.0){
 381         simcall_process_sleep(sleeptime);
 382         XBT_DEBUG("receiving size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_or(request->size));
 383     }
 384
 385     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 386     request->real_size=request->size;
 387     smpi_datatype_use(request->old_type);
 388     smpi_comm_use(request->comm);
 389     request->action = simcall_comm_irecv(mailbox, request->buf,
 390                                          &request->real_size, &match_recv,
 391                                          !smpi_process_get_replaying()? &smpi_comm_copy_buffer_callback
 392                                          : &smpi_comm_null_copy_buffer_callback,
 393                                          request, -1.0);
 394         XBT_DEBUG("recv simcall posted");
 395
 396
 397   } else {
 398
 399
 400     int receiver = request->dst;
 401
 402     #ifdef HAVE_TRACING
 403       int rank = request->src;
 404       if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 405         TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver,request->size);
 406       }
 407     #endif
 408     print_request("New send", request);
 409
 410         //if we are giving back the control to the user without waiting for completion, we have to inject timings
 411     double sleeptime = 0.0;
 412     if(request->detached || (request->flags & (ISEND|SSEND))){// issend should be treated as isend
 413       //isend and send timings may be different
 414       sleeptime = (request->flags & ISEND)? smpi_ois(request->size) : smpi_os(request->size);
 415     }
 416
 417     if(sleeptime != 0.0){
 418         simcall_process_sleep(sleeptime);
 419         XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_os(request->size));
 420     }
 421
 422     if (request->flags & RMA || request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
 423       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 424       XBT_DEBUG("Is there a corresponding recv already posted in the large mailbox %p?", mailbox);
 425       smx_synchro_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, (void*)request);
 426       if(action ==NULL){
 427        if (! (request->flags & SSEND)){
 428          mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 429          XBT_DEBUG("No, nothing in the large mailbox, message is to be sent on the small one %p", mailbox);
 430        } else{
 431          mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 432          XBT_DEBUG("SSEND : Is there a corresponding recv already posted in the small mailbox %p?", mailbox);
 433          action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, (void*)request);
 434          if(action ==NULL){
 435            XBT_DEBUG("No, we are first, send to large mailbox");
 436            mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 437          }
 438        }
 439       }else{
 440         XBT_DEBUG("Yes there was something for us in the large mailbox");
 441       }
 442     }else{
 443       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 444       XBT_DEBUG("Send request %p is in the large mailbox %p (buf: %p)",mailbox, request,request->buf);
 445     }
 446
 447     void* buf = request->buf;
 448     if ( (! (request->flags & SSEND)) && (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/send_is_detached_thres"))) {
 449       void *oldbuf = NULL;
 450       request->detached = 1;
 451       XBT_DEBUG("Send request %p is detached", request);
 452       request->refcount++;
 453       if(request->old_type->has_subtype == 0){
 454         oldbuf = request->buf;
 455         if (!smpi_process_get_replaying() && oldbuf && request->size!=0){
 456           if((smpi_privatize_global_variables)
 457               && ((char*)request->buf >= start_data_exe)
 458               && ((char*)request->buf < start_data_exe + size_data_exe )){
 459             XBT_DEBUG("Privatization : We are sending from a zone inside global memory. Switch data segment ");
 460             smpi_switch_data_segment(request->src);
 461           }
 462           buf = xbt_malloc(request->size);
 463           memcpy(buf,oldbuf,request->size);
 464           XBT_DEBUG("buf %p copied into %p",oldbuf,buf);
 465         }
 466       }
 467     }
 468
 469     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 470     request->real_size=request->size;
 471     smpi_datatype_use(request->old_type);
 472     smpi_comm_use(request->comm);
 473     request->action =
 474       simcall_comm_isend(SIMIX_process_from_PID(request->src+1), mailbox, request->size, -1.0,
 475                          buf, request->real_size,
 476                          &match_send,
 477                          &xbt_free_f, // how to free the userdata if a detached send fails
 478                          !smpi_process_get_replaying()? &smpi_comm_copy_buffer_callback
 479                          : &smpi_comm_null_copy_buffer_callback,
 480                          request,
 481                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
 482                          request->detached);
 483     XBT_DEBUG("send simcall posted");
 484
 485
 486
 487 #ifdef HAVE_TRACING
 488     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == NULL) */
 489     if (request->action)
 490       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
 491
 492 #endif
 493
 494   }
 495
 496 }
 497
 498 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
 499 {
 500   int i;
 501   if(requests==NULL) return;
 502
 503   for(i = 0; i < count; i++) {
 504     smpi_mpi_start(requests[i]);
 505   }
 506 }
 507
 508 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
 509 {
 510   if((*request) != MPI_REQUEST_NULL){
 511     (*request)->refcount--;
 512     if((*request)->refcount<0) xbt_die("wrong refcount");
 513
 514     if((*request)->refcount==0){
 515         print_request("Destroying", (*request));
 516         xbt_free(*request);
 517         *request = MPI_REQUEST_NULL;
 518     }else{
 519         print_request("Decrementing", (*request));
 520     }
 521   }else{
 522       xbt_die("freeing an already free request");
 523   }
 524 }
 525
 526
 527 MPI_Request smpi_rma_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 528                             int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op)
 529 {
 530   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 531   if(op==MPI_OP_NULL){
 532     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, src, dst, tag,
 533                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 534   }else{
 535     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 536                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED | ACCUMULATE);
 537     request->op = op;
 538   }
 539   return request;
 540 }
 541
 542 MPI_Request smpi_rma_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 543                             int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op)
 544 {
 545   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 546   if(op==MPI_OP_NULL){
 547     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 548                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 549   }else{
 550     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 551                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED | ACCUMULATE);
 552     request->op = op;
 553   }
 554   return request;
 555 }
 556
 557
 558 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 559                             int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 560 {
 561   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 562   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 563                           comm, PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 564   return request;
 565 }
 566
 567 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 568                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 569 {
 570   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 571   request =  build_request(buf==MPI_BOTTOM?(void*)0:buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 572                            comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND);
 573   smpi_mpi_start(request);
 574   return request;
 575 }
 576
 577 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 578                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 579 {
 580   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 581   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 582                           comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SSEND | SEND);
 583   smpi_mpi_start(request);
 584   return request;
 585 }
 586
 587 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 588                             int src, int tag, MPI_Comm comm)
 589 {
 590   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 591   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 592                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 593   return request;
 594 }
 595
 596 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 597                            int src, int tag, MPI_Comm comm)
 598 {
 599   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 600   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 601                           comm, NON_PERSISTENT | RECV);
 602   smpi_mpi_start(request);
 603   return request;
 604 }
 605
 606 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src,
 607                    int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 608 {
 609   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 610   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 611   smpi_mpi_wait(&request, status);
 612   request = NULL;
 613 }
 614
 615
 616
 617 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst,
 618                    int tag, MPI_Comm comm)
 619 {
 620   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 621   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 622                           comm, NON_PERSISTENT | SEND);
 623
 624   smpi_mpi_start(request);
 625   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 626   request = NULL;
 627 }
 628
 629 void smpi_mpi_ssend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 630                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 631 {
 632   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 633   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 634                 comm, NON_PERSISTENT | SSEND | SEND);
 635
 636   smpi_mpi_start(request);
 637   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 638   request = NULL;
 639 }
 640
 641 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 642                        int dst, int sendtag, void *recvbuf, int recvcount,
 643                        MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
 644                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 645 {
 646   MPI_Request requests[2];
 647   MPI_Status stats[2];
 648   int myid=smpi_process_index();
 649   if ((smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst) == myid) && (smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src) == myid)) {
 650       smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 651                                      recvbuf, recvcount, recvtype);
 652       return;
 653   }
 654   requests[0] =
 655     smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
 656   requests[1] =
 657     smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
 658   smpi_mpi_startall(2, requests);
 659   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
 660   smpi_mpi_request_free(&requests[0]);
 661   smpi_mpi_request_free(&requests[1]);
 662   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 663     // Copy receive status
 664     *status = stats[1];
 665   }
 666 }
 667
 668 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
 669 {
 670   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
 671 }
 672
 673 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 674 {
 675   MPI_Request req = *request;
 676   smpi_empty_status(status);
 677
 678   if(!(req->detached && req->flags & SEND)
 679       && !(req->flags & PREPARED)){
 680     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 681       int src = req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src;
 682       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(req->comm), src);
 683       status->MPI_TAG = req->tag == MPI_ANY_TAG ? req->real_tag : req->tag;
 684       status->MPI_ERROR = req->truncated ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
 685       // this handles the case were size in receive differs from size in send
 686       // FIXME: really this should just contain the count of receive-type blocks,
 687       // right?
 688       status->count = req->real_size;
 689     }
 690
 691     print_request("Finishing", req);
 692     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 693
 694     if((req->flags & ACCUMULATE) || (datatype->has_subtype == 1)){
 695       if (!smpi_process_get_replaying()){
 696         if( smpi_privatize_global_variables
 697             && ((char*)req->old_buf >= start_data_exe)
 698             && ((char*)req->old_buf < start_data_exe + size_data_exe )
 699         ){
 700             XBT_VERB("Privatization : We are unserializing to a zone in global memory - Switch data segment ");
 701             smpi_switch_data_segment(smpi_process_index());
 702         }
 703       }
 704
 705       if(datatype->has_subtype == 1){
 706         // This part handles the problem of non-contignous memory
 707         // the unserialization at the reception
 708         s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 709         if(req->flags & RECV)
 710           subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct, req->op);
 711         if(req->detached == 0) free(req->buf);
 712       }else if(req->flags & RECV){//apply op on contiguous buffer for accumulate
 713           int n =req->real_size/smpi_datatype_size(datatype);
 714           smpi_op_apply(req->op, req->buf, req->old_buf, &n, &datatype);
 715       }
 716     }
 717     smpi_comm_unuse(req->comm);
 718     smpi_datatype_unuse(datatype);
 719
 720   }
 721
 722 #ifdef HAVE_TRACING
 723   if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 724     if(req->flags & RECV){
 725       int rank = smpi_process_index();
 726       int src_traced = (req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src);
 727       TRACE_smpi_recv(rank, src_traced, rank);
 728     }
 729   }
 730 #endif
 731
 732   if(req->detached_sender!=NULL){
 733     smpi_mpi_request_free(&(req->detached_sender));
 734   }
 735   if(req->flags & PERSISTENT)
 736     req->action = NULL;
 737   req->flags |= FINISHED;
 738
 739   smpi_mpi_request_free(request);
 740
 741 }
 742
 743 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
 744   int flag;
 745
 746   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
 747
 748   //to avoid deadlocks
 749   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed test will increase it
 750   static int nsleeps = 1;
 751   if(smpi_test_sleep > 0)  simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 752
 753   smpi_empty_status(status);
 754   flag = 1;
 755   if (!((*request)->flags & PREPARED)) {
 756     if ((*request)->action != NULL)
 757       flag = simcall_comm_test((*request)->action);
 758     if (flag) {
 759       finish_wait(request, status);
 760       nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 761       if (*request != MPI_REQUEST_NULL && !((*request)->flags & PERSISTENT))
 762       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 763     }else{
 764       nsleeps++;
 765     }
 766   }
 767   return flag;
 768 }
 769
 770 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
 771                      MPI_Status * status)
 772 {
 773   xbt_dynar_t comms;
 774   int i, flag, size;
 775   int* map;
 776
 777   *index = MPI_UNDEFINED;
 778   flag = 0;
 779   comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_synchro_t), NULL);
 780   map = xbt_new(int, count);
 781   size = 0;
 782   for(i = 0; i < count; i++) {
 783     if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action &&
 784         !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 785        xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 786        map[size] = i;
 787        size++;
 788     }
 789   }
 790   if(size > 0) {
 791     //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed testany will increase it
 792     static int nsleeps = 1;
 793     if(smpi_test_sleep > 0) simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 794
 795     i = simcall_comm_testany(comms);
 796     // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 797     if(i != -1) {
 798       *index = map[i];
 799       finish_wait(&requests[*index], status);
 800       if (requests[*index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[*index]->flags & NON_PERSISTENT))
 801       requests[*index] = MPI_REQUEST_NULL;
 802       flag = 1;
 803       nsleeps=1;
 804     }else{
 805       nsleeps++;
 806     }
 807   }else{
 808       //all requests are null or inactive, return true
 809       flag=1;
 810       smpi_empty_status(status);
 811   }
 812   xbt_free(map);
 813   xbt_dynar_free(&comms);
 814
 815   return flag;
 816 }
 817
 818
 819 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[],
 820                      MPI_Status status[])
 821 {
 822   MPI_Status stat;
 823   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 824   int flag=1;
 825   int i;
 826   for(i=0; i<count; i++){
 827     if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 828       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
 829         flag=0;
 830       }else{
 831           requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 832       }
 833     }else{
 834       smpi_empty_status(pstat);
 835     }
 836     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 837       status[i] = *pstat;
 838     }
 839   }
 840   return flag;
 841 }
 842
 843 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
 844   int flag=0;
 845   //FIXME find another wait to avoid busy waiting ?
 846   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
 847   while(flag==0){
 848     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
 849     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
 850   }
 851 }
 852
 853 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
 854
 855   MPI_Request request =build_request(NULL, 0, MPI_CHAR, source == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), source), smpi_comm_rank(comm), tag,
 856             comm, PERSISTENT | RECV);
 857
 858   //to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
 859   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
 860   static int nsleeps = 1;
 861   if(smpi_iprobe_sleep > 0)  simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_iprobe_sleep);
 862   // behave like a receive, but don't do it
 863   smx_rdv_t mailbox;
 864
 865   print_request("New iprobe", request);
 866   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
 867     if (sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")>0){
 868         mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 869         XBT_DEBUG("trying to probe the perm recv mailbox");
 870         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 871     }
 872     if (request->action==NULL){
 873         mailbox = smpi_process_mailbox();
 874         XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
 875         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 876     }
 877
 878   if(request->action){
 879     MPI_Request req = (MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data(request->action);
 880     *flag = 1;
 881     if(status != MPI_STATUS_IGNORE && !(req->flags & PREPARED)) {
 882       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(comm), req->src);
 883       status->MPI_TAG = req->tag;
 884       status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 885       status->count = req->real_size;
 886     }
 887     nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 888   }
 889   else {
 890       *flag = 0;
 891       nsleeps++;
 892   }
 893   smpi_mpi_request_free(&request);
 894
 895   return;
 896 }
 897
 898 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 899 {
 900   print_request("Waiting", *request);
 901   if ((*request)->flags & PREPARED) {
 902     smpi_empty_status(status);
 903     return;
 904   }
 905
 906   if ((*request)->action != NULL) { // this is not a detached send
 907     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
 908 #ifdef HAVE_MC
 909   if(MC_is_active() && (*request)->action)
 910     (*request)->action->comm.dst_data = NULL; // dangling pointer : dst_data is freed with a wait, need to set it to NULL for system state comparison
 911 #endif
 912   }
 913
 914   finish_wait(request, status);
 915   if (*request != MPI_REQUEST_NULL && ((*request)->flags & NON_PERSISTENT))
 916       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 917   // FIXME for a detached send, finish_wait is not called:
 918 }
 919
 920 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[],
 921                      MPI_Status * status)
 922 {
 923   xbt_dynar_t comms;
 924   int i, size, index;
 925   int *map;
 926
 927   index = MPI_UNDEFINED;
 928   if(count > 0) {
 929     // Wait for a request to complete
 930     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_synchro_t), NULL);
 931     map = xbt_new(int, count);
 932     size = 0;
 933     XBT_DEBUG("Wait for one of %d", count);
 934     for(i = 0; i < count; i++) {
 935       if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL
 936           && !(requests[i]->flags & PREPARED)
 937           && !(requests[i]->flags & FINISHED)) {
 938         if (requests[i]->action != NULL) {
 939           XBT_DEBUG("Waiting any %p ", requests[i]);
 940           xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 941           map[size] = i;
 942           size++;
 943         }else{
 944          //This is a finished detached request, let's return this one
 945          size=0;//so we free the dynar but don't do the waitany call
 946          index=i;
 947          finish_wait(&requests[i], status);//cleanup if refcount = 0
 948          if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 949          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;//set to null
 950          break;
 951          }
 952       }
 953     }
 954     if(size > 0) {
 955       i = simcall_comm_waitany(comms);
 956
 957       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 958       if (i != -1) {
 959         index = map[i];
 960         finish_wait(&requests[index], status);
 961         if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 962         requests[index] = MPI_REQUEST_NULL;
 963       }
 964     }
 965     xbt_free(map);
 966     xbt_dynar_free(&comms);
 967   }
 968
 969   if (index==MPI_UNDEFINED)
 970     smpi_empty_status(status);
 971
 972   return index;
 973 }
 974
 975 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[],
 976                       MPI_Status status[])
 977 {
 978   int  index, c;
 979   MPI_Status stat;
 980   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 981   int retvalue = MPI_SUCCESS;
 982   //tag invalid requests in the set
 983   if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 984     for (c = 0; c < count; c++) {
 985       if (requests[c] == MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL ||
 986           (requests[c]->flags & PREPARED)) {
 987         smpi_empty_status(&status[c]);
 988       } else if (requests[c]->src == MPI_PROC_NULL) {
 989         smpi_empty_status(&status[c]);
 990         status[c].MPI_SOURCE = MPI_PROC_NULL;
 991       }
 992     }
 993   }
 994   for(c = 0; c < count; c++) {
 995
 996     if (MC_is_active()) {
 997       smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
 998       index = c;
 999     } else {
1000       index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
1001       if (index == MPI_UNDEFINED)
1002         break;
1003       if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
1004       requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
1005     }
1006     if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1007       status[index] = *pstat;
1008       if (status[index].MPI_ERROR == MPI_ERR_TRUNCATE)
1009         retvalue = MPI_ERR_IN_STATUS;
1010     }
1011   }
1012
1013   return retvalue;
1014 }
1015
1016 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
1017                       MPI_Status status[])
1018 {
1019   int i, count, index;
1020   MPI_Status stat;
1021   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
1022
1023   count = 0;
1024   for(i = 0; i < incount; i++)
1025   {
1026     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
1027     if(index!=MPI_UNDEFINED){
1028       indices[count] = index;
1029       count++;
1030       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1031         status[index] = *pstat;
1032       }
1033      if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
1034      requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
1035     }else{
1036       return MPI_UNDEFINED;
1037     }
1038   }
1039   return count;
1040 }
1041
1042 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
1043                       MPI_Status status[])
1044 {
1045   int i, count, count_dead;
1046   MPI_Status stat;
1047   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
1048
1049   count = 0;
1050   count_dead = 0;
1051   for(i = 0; i < incount; i++) {
1052     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
1053       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
1054          indices[i] = 1;
1055          count++;
1056          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1057            status[i] = *pstat;
1058          }
1059          if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->flags & NON_PERSISTENT)
1060          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
1061       }
1062     }else{
1063       count_dead++;
1064     }
1065   }
1066   if(count_dead==incount)return MPI_UNDEFINED;
1067   else return count;
1068 }
1069
1070 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root,
1071                     MPI_Comm comm)
1072 {
1073   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
1074   nary_tree_bcast(buf, count, datatype, root, comm, 4);
1075 }
1076
1077 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
1078 {
1079   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
1080   nary_tree_barrier(comm, 4);
1081 }
1082
1083 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1084                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1085                      int root, MPI_Comm comm)
1086 {
1087   int system_tag = COLL_TAG_GATHER;
1088   int rank, size, src, index;
1089   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1090   MPI_Request *requests;
1091
1092   rank = smpi_comm_rank(comm);
1093   size = smpi_comm_size(comm);
1094   if(rank != root) {
1095     // Send buffer to root
1096     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1097   } else {
1098     // FIXME: check for errors
1099     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1100     // Local copy from root
1101     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1102                        (char *)recvbuf + root * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
1103     // Receive buffers from senders
1104     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1105     index = 0;
1106     for(src = 0; src < size; src++) {
1107       if(src != root) {
1108         requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + src * recvcount * recvext,
1109                                           recvcount, recvtype,
1110                                           src, system_tag, comm);
1111         index++;
1112       }
1113     }
1114     // Wait for completion of irecv's.
1115     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1116     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1117     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1118       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1119     }
1120     xbt_free(requests);
1121   }
1122 }
1123
1124
1125 void smpi_mpi_reduce_scatter(void *sendbuf, void *recvbuf, int *recvcounts,
1126                        MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1127 {
1128     int i, size, count;
1129     int *displs;
1130     int rank = smpi_process_index();
1131     void *tmpbuf;
1132
1133     /* arbitrarily choose root as rank 0 */
1134     size = smpi_comm_size(comm);
1135     count = 0;
1136     displs = xbt_new(int, size);
1137     for (i = 0; i < size; i++) {
1138       displs[i] = count;
1139       count += recvcounts[i];
1140     }
1141     tmpbuf=(void*)smpi_get_tmp_sendbuffer(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1142
1143     mpi_coll_reduce_fun(sendbuf, tmpbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1144     smpi_mpi_scatterv(tmpbuf, recvcounts, displs, datatype, recvbuf,
1145                       recvcounts[rank], datatype, 0, comm);
1146     xbt_free(displs);
1147     smpi_free_tmp_buffer(tmpbuf);
1148 }
1149
1150 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1151                       void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
1152                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1153 {
1154   int system_tag = COLL_TAG_GATHERV;
1155   int rank, size, src, index;
1156   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1157   MPI_Request *requests;
1158
1159   rank = smpi_comm_rank(comm);
1160   size = smpi_comm_size(comm);
1161   if(rank != root) {
1162     // Send buffer to root
1163     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1164   } else {
1165     // FIXME: check for errors
1166     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1167     // Local copy from root
1168     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1169                        (char *)recvbuf + displs[root] * recvext,
1170                        recvcounts[root], recvtype);
1171     // Receive buffers from senders
1172     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1173     index = 0;
1174     for(src = 0; src < size; src++) {
1175       if(src != root) {
1176         requests[index] =
1177           smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[src] * recvext,
1178                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
1179         index++;
1180       }
1181     }
1182     // Wait for completion of irecv's.
1183     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1184     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1185     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1186       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1187     }
1188     xbt_free(requests);
1189   }
1190 }
1191
1192 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount,
1193                         MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1194                         int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1195                         MPI_Comm comm)
1196 {
1197   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHER;
1198   int rank, size, other, index;
1199   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1200   MPI_Request *requests;
1201
1202   rank = smpi_comm_rank(comm);
1203   size = smpi_comm_size(comm);
1204   // FIXME: check for errors
1205   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1206   // Local copy from self
1207   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1208                      (char *)recvbuf + rank * recvcount * recvext, recvcount,
1209                      recvtype);
1210   // Send/Recv buffers to/from others;
1211   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1212   index = 0;
1213   for(other = 0; other < size; other++) {
1214     if(other != rank) {
1215       requests[index] =
1216         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1217                         comm);
1218       index++;
1219       requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + other * recvcount * recvext,
1220                                         recvcount, recvtype, other,
1221                                         system_tag, comm);
1222       index++;
1223     }
1224   }
1225   // Wait for completion of all comms.
1226   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1227   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1228   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1229     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1230   }
1231   xbt_free(requests);
1232 }
1233
1234 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount,
1235                          MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1236                          int *recvcounts, int *displs,
1237                          MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1238 {
1239   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHERV;
1240   int rank, size, other, index;
1241   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1242   MPI_Request *requests;
1243
1244   rank = smpi_comm_rank(comm);
1245   size = smpi_comm_size(comm);
1246   // FIXME: check for errors
1247   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1248   // Local copy from self
1249   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1250                      (char *)recvbuf + displs[rank] * recvext,
1251                      recvcounts[rank], recvtype);
1252   // Send buffers to others;
1253   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1254   index = 0;
1255   for(other = 0; other < size; other++) {
1256     if(other != rank) {
1257       requests[index] =
1258         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1259                         comm);
1260       index++;
1261       requests[index] =
1262         smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
1263                         recvtype, other, system_tag, comm);
1264       index++;
1265     }
1266   }
1267   // Wait for completion of all comms.
1268   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1269   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1270   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1271     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1272   }
1273   xbt_free(requests);
1274 }
1275
1276 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1277                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1278                       int root, MPI_Comm comm)
1279 {
1280   int system_tag = COLL_TAG_SCATTER;
1281   int rank, size, dst, index;
1282   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1283   MPI_Request *requests;
1284
1285   rank = smpi_comm_rank(comm);
1286   size = smpi_comm_size(comm);
1287   if(rank != root) {
1288     // Recv buffer from root
1289     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1290                   MPI_STATUS_IGNORE);
1291   } else {
1292     // FIXME: check for errors
1293     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1294     // Local copy from root
1295     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1296         smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + root * sendcount * sendext,
1297                            sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1298     }
1299     // Send buffers to receivers
1300     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1301     index = 0;
1302     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1303       if(dst != root) {
1304         requests[index] = smpi_isend_init((char *)sendbuf + dst * sendcount * sendext,
1305                                           sendcount, sendtype, dst,
1306                                           system_tag, comm);
1307         index++;
1308       }
1309     }
1310     // Wait for completion of isend's.
1311     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1312     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1313     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1314       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1315     }
1316     xbt_free(requests);
1317   }
1318 }
1319
1320 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs,
1321                        MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
1322                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1323 {
1324   int system_tag = COLL_TAG_SCATTERV;
1325   int rank, size, dst, index;
1326   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1327   MPI_Request *requests;
1328
1329   rank = smpi_comm_rank(comm);
1330   size = smpi_comm_size(comm);
1331   if(rank != root) {
1332     // Recv buffer from root
1333     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1334                   MPI_STATUS_IGNORE);
1335   } else {
1336     // FIXME: check for errors
1337     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1338     // Local copy from root
1339     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1340       smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
1341                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1342     }
1343     // Send buffers to receivers
1344     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1345     index = 0;
1346     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1347       if(dst != root) {
1348         requests[index] =
1349           smpi_isend_init((char *)sendbuf + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
1350                           sendtype, dst, system_tag, comm);
1351         index++;
1352       }
1353     }
1354     // Wait for completion of isend's.
1355     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1356     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1357     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1358       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1359     }
1360     xbt_free(requests);
1361   }
1362 }
1363
1364 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1365                      MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
1366                      MPI_Comm comm)
1367 {
1368   int system_tag = COLL_TAG_REDUCE;
1369   int rank, size, src, index;
1370   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1371   MPI_Request *requests;
1372   void **tmpbufs;
1373
1374
1375   char* sendtmpbuf = (char*) sendbuf;
1376   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1377     sendtmpbuf = (char *)smpi_get_tmp_sendbuffer(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1378     smpi_datatype_copy(recvbuf, count, datatype,sendtmpbuf, count, datatype);
1379   }
1380
1381   rank = smpi_comm_rank(comm);
1382   size = smpi_comm_size(comm);
1383   //non commutative case, use a working algo from openmpi
1384   if(!smpi_op_is_commute(op)){
1385     smpi_coll_tuned_reduce_ompi_basic_linear(sendtmpbuf, recvbuf, count,
1386                      datatype, op, root, comm);
1387     return;
1388   }
1389
1390   if(rank != root) {
1391     // Send buffer to root
1392     smpi_mpi_send(sendtmpbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
1393   } else {
1394     // FIXME: check for errors
1395     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1396     // Local copy from root
1397     if (sendtmpbuf && recvbuf)
1398       smpi_datatype_copy(sendtmpbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1399     // Receive buffers from senders
1400     //TODO: make a MPI_barrier here ?
1401     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1402     tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
1403     index = 0;
1404     for(src = 0; src < size; src++) {
1405       if(src != root) {
1406         // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1407         //  mapping...
1408             if (!smpi_process_get_replaying())
1409           tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1410             else
1411               tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1412         requests[index] =
1413           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src,
1414                           system_tag, comm);
1415         index++;
1416       }
1417     }
1418     // Wait for completion of irecv's.
1419     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1420     for(src = 0; src < size - 1; src++) {
1421       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1422       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
1423       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1424         break;
1425       }else{
1426         smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1427       }
1428       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
1429         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1430     }
1431       for(index = 0; index < size - 1; index++) {
1432         smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1433       }
1434     xbt_free(tmpbufs);
1435     xbt_free(requests);
1436
1437     if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1438       smpi_free_tmp_buffer(sendtmpbuf);
1439     }
1440   }
1441 }
1442
1443 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1444                         MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1445 {
1446   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1447   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
1448 }
1449
1450 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1451                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1452 {
1453   int system_tag = -888;
1454   int rank, size, other, index;
1455   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1456   MPI_Request *requests;
1457   void **tmpbufs;
1458
1459   rank = smpi_comm_rank(comm);
1460   size = smpi_comm_size(comm);
1461
1462   // FIXME: check for errors
1463   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1464
1465   // Local copy from self
1466   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1467
1468   // Send/Recv buffers to/from others;
1469   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1470   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1471   index = 0;
1472   for(other = 0; other < rank; other++) {
1473     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1474     // mapping...
1475     tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1476     requests[index] =
1477       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1478                       comm);
1479     index++;
1480   }
1481   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1482     requests[index] =
1483       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1484     index++;
1485   }
1486   // Wait for completion of all comms.
1487   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1488
1489   if(smpi_op_is_commute(op)){
1490     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1491       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1492       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1493         break;
1494       }
1495       if(index < rank) {
1496         // #Request is below rank: it's a irecv
1497         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1498       }
1499     }
1500   }else{
1501     //non commutative case, wait in order
1502     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1503       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1504       if(index < rank) {
1505         smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1506       }
1507     }
1508   }
1509   for(index = 0; index < rank; index++) {
1510     smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1511   }
1512   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1513     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1514   }
1515   xbt_free(tmpbufs);
1516   xbt_free(requests);
1517 }
1518
1519 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1520                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1521 {
1522   int system_tag = -888;
1523   int rank, size, other, index;
1524   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1525   MPI_Request *requests;
1526   void **tmpbufs;
1527   int recvbuf_is_empty=1;
1528   rank = smpi_comm_rank(comm);
1529   size = smpi_comm_size(comm);
1530
1531   // FIXME: check for errors
1532   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1533
1534   // Send/Recv buffers to/from others;
1535   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1536   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1537   index = 0;
1538   for(other = 0; other < rank; other++) {
1539     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1540     // mapping...
1541     tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1542     requests[index] =
1543       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1544                       comm);
1545     index++;
1546   }
1547   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1548     requests[index] =
1549       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1550     index++;
1551   }
1552   // Wait for completion of all comms.
1553   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1554   if(smpi_op_is_commute(op)){
1555     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1556       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1557       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1558         break;
1559       }
1560       if(index < rank) {
1561         if(recvbuf_is_empty){
1562           smpi_datatype_copy(tmpbufs[index], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1563           recvbuf_is_empty=0;
1564         }else
1565         // #Request is below rank: it's a irecv
1566         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1567       }
1568     }
1569   }else{
1570     //non commutative case, wait in order
1571     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1572       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1573       if(index < rank) {
1574           if(recvbuf_is_empty){
1575             smpi_datatype_copy(tmpbufs[other], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1576             recvbuf_is_empty=0;
1577           }else smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1578       }
1579     }
1580   }
1581   for(index = 0; index < rank; index++) {
1582     smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1583   }
1584   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1585     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1586   }
1587   xbt_free(tmpbufs);
1588   xbt_free(requests);
1589 }
1590