src/smpi/smpi_comm.cpp

   1 /* Copyright (c) 2010-2017. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
   2
   3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   5
   6 #include "simgrid/s4u/Host.hpp"
   7 #include <climits>
   8
   9 #include "src/simix/smx_private.h"
  10 #include "src/smpi/private.h"
  11 #include "src/smpi/private.hpp"
  12 #include "src/smpi/smpi_comm.hpp"
  13 #include "src/smpi/smpi_coll.hpp"
  14 #include "src/smpi/smpi_datatype.hpp"
  15 #include "src/smpi/smpi_process.hpp"
  16 #include "src/smpi/smpi_request.hpp"
  17 #include "src/smpi/smpi_status.hpp"
  18 #include "src/smpi/smpi_win.hpp"
  19
  20 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_comm, smpi, "Logging specific to SMPI (comm)");
  21
  22  simgrid::smpi::Comm mpi_MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  23 MPI_Comm MPI_COMM_UNINITIALIZED=&mpi_MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  24
  25 /* Support for cartesian topology was added, but there are 2 other types of topology, graph et dist graph. In order to
  26  * support them, we have to add a field SMPI_Topo_type, and replace the MPI_Topology field by an union. */
  27
  28 static int smpi_compare_rankmap(const void *a, const void *b)
  29 {
  30   const int* x = static_cast<const int*>(a);
  31   const int* y = static_cast<const int*>(b);
  32
  33   if (x[1] < y[1]) {
  34     return -1;
  35   }
  36   if (x[1] == y[1]) {
  37     if (x[0] < y[0]) {
  38       return -1;
  39     }
  40     if (x[0] == y[0]) {
  41       return 0;
  42     }
  43     return 1;
  44   }
  45   return 1;
  46 }
  47
  48 namespace simgrid{
  49 namespace smpi{
  50
  51 std::unordered_map<int, smpi_key_elem> Comm::keyvals_;
  52 int Comm::keyval_id_=0;
  53
  54 Comm::Comm(MPI_Group group, MPI_Topology topo) : group_(group), topo_(topo)
  55 {
  56   refcount_=1;
  57   topoType_ = MPI_INVALID_TOPO;
  58   intra_comm_ = MPI_COMM_NULL;
  59   leaders_comm_ = MPI_COMM_NULL;
  60   is_uniform_=1;
  61   non_uniform_map_ = nullptr;
  62   leaders_map_ = nullptr;
  63   is_blocked_=0;
  64 }
  65
  66 void Comm::destroy(Comm* comm)
  67 {
  68   if (comm == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
  69     Comm::destroy(smpi_process()->comm_world());
  70     return;
  71   }
  72   delete comm->topo_; // there's no use count on topos
  73   Comm::unref(comm);
  74 }
  75
  76 int Comm::dup(MPI_Comm* newcomm){
  77   if(smpi_privatize_global_variables == SMPI_PRIVATIZE_MMAP){ //we need to switch as the called function may silently touch global variables
  78      smpi_switch_data_segment(smpi_process()->index());
  79    }
  80   MPI_Group cp = new  Group(this->group());
  81   (*newcomm) = new  Comm(cp, this->topo());
  82   int ret = MPI_SUCCESS;
  83
  84   if (not attributes()->empty()) {
  85     int flag;
  86     void* value_out;
  87     for(auto it : *attributes()){
  88       smpi_key_elem elem = keyvals_.at(it.first);
  89       if (elem != nullptr && elem->copy_fn.comm_copy_fn != MPI_NULL_COPY_FN) {
  90         ret = elem->copy_fn.comm_copy_fn(this, it.first, nullptr, it.second, &value_out, &flag);
  91         if (ret != MPI_SUCCESS) {
  92           Comm::destroy(*newcomm);
  93           *newcomm = MPI_COMM_NULL;
  94           return ret;
  95         }
  96         if (flag){
  97           elem->refcount++;
  98           (*newcomm)->attributes()->insert({it.first, value_out});
  99         }
 100       }
 101       }
 102     }
 103   return ret;
 104 }
 105
 106 MPI_Group Comm::group()
 107 {
 108   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 109     return smpi_process()->comm_world()->group();
 110   return group_;
 111 }
 112
 113 MPI_Topology Comm::topo() {
 114   return topo_;
 115 }
 116
 117 int Comm::size()
 118 {
 119   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 120     return smpi_process()->comm_world()->size();
 121   return group_->size();
 122 }
 123
 124 int Comm::rank()
 125 {
 126   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 127     return smpi_process()->comm_world()->rank();
 128   return group_->rank(smpi_process()->index());
 129 }
 130
 131 void Comm::get_name (char* name, int* len)
 132 {
 133   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 134     smpi_process()->comm_world()->get_name(name, len);
 135     return;
 136   }
 137   if(this == MPI_COMM_WORLD) {
 138     strncpy(name, "WORLD",5);
 139     *len = 5;
 140   } else {
 141     *len = snprintf(name, MPI_MAX_NAME_STRING, "%p", this);
 142   }
 143 }
 144
 145 void Comm::set_leaders_comm(MPI_Comm leaders){
 146   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 147     smpi_process()->comm_world()->set_leaders_comm(leaders);
 148     return;
 149   }
 150   leaders_comm_=leaders;
 151 }
 152
 153 void Comm::set_intra_comm(MPI_Comm leaders){
 154   intra_comm_=leaders;
 155 }
 156
 157 int* Comm::get_non_uniform_map(){
 158   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 159     return smpi_process()->comm_world()->get_non_uniform_map();
 160   return non_uniform_map_;
 161 }
 162
 163 int* Comm::get_leaders_map(){
 164   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 165     return smpi_process()->comm_world()->get_leaders_map();
 166   return leaders_map_;
 167 }
 168
 169 MPI_Comm Comm::get_leaders_comm(){
 170   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 171     return smpi_process()->comm_world()->get_leaders_comm();
 172   return leaders_comm_;
 173 }
 174
 175 MPI_Comm Comm::get_intra_comm(){
 176   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED || this==MPI_COMM_WORLD)
 177     return smpi_process()->comm_intra();
 178   else return intra_comm_;
 179 }
 180
 181 int Comm::is_uniform(){
 182   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 183     return smpi_process()->comm_world()->is_uniform();
 184   return is_uniform_;
 185 }
 186
 187 int Comm::is_blocked(){
 188   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 189     return smpi_process()->comm_world()->is_blocked();
 190   return is_blocked_;
 191 }
 192
 193 MPI_Comm Comm::split(int color, int key)
 194 {
 195   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 196     return smpi_process()->comm_world()->split(color, key);
 197   int system_tag = 123;
 198   int* recvbuf;
 199
 200   MPI_Group group_root = nullptr;
 201   MPI_Group group_out  = nullptr;
 202   MPI_Group group      = this->group();
 203   int rank             = this->rank();
 204   int size             = this->size();
 205   /* Gather all colors and keys on rank 0 */
 206   int* sendbuf = xbt_new(int, 2);
 207   sendbuf[0] = color;
 208   sendbuf[1] = key;
 209   if(rank == 0) {
 210     recvbuf = xbt_new(int, 2 * size);
 211   } else {
 212     recvbuf = nullptr;
 213   }
 214   Coll_gather_default::gather(sendbuf, 2, MPI_INT, recvbuf, 2, MPI_INT, 0, this);
 215   xbt_free(sendbuf);
 216   /* Do the actual job */
 217   if(rank == 0) {
 218     MPI_Group* group_snd = xbt_new(MPI_Group, size);
 219     int* rankmap         = xbt_new(int, 2 * size);
 220     for (int i = 0; i < size; i++) {
 221       if (recvbuf[2 * i] != MPI_UNDEFINED) {
 222         int count = 0;
 223         for (int j = i + 1; j < size; j++) {
 224           if(recvbuf[2 * i] == recvbuf[2 * j]) {
 225             recvbuf[2 * j] = MPI_UNDEFINED;
 226             rankmap[2 * count] = j;
 227             rankmap[2 * count + 1] = recvbuf[2 * j + 1];
 228             count++;
 229           }
 230         }
 231         /* Add self in the group */
 232         recvbuf[2 * i] = MPI_UNDEFINED;
 233         rankmap[2 * count] = i;
 234         rankmap[2 * count + 1] = recvbuf[2 * i + 1];
 235         count++;
 236         qsort(rankmap, count, 2 * sizeof(int), &smpi_compare_rankmap);
 237         group_out = new  Group(count);
 238         if (i == 0) {
 239           group_root = group_out; /* Save root's group */
 240         }
 241         for (int j = 0; j < count; j++) {
 242           int index = group->index(rankmap[2 * j]);
 243           group_out->set_mapping(index, j);
 244         }
 245         MPI_Request* requests = xbt_new(MPI_Request, count);
 246         int reqs              = 0;
 247         for (int j = 0; j < count; j++) {
 248           if(rankmap[2 * j] != 0) {
 249             group_snd[reqs]=new  Group(group_out);
 250             requests[reqs] = Request::isend(&(group_snd[reqs]), 1, MPI_PTR, rankmap[2 * j], system_tag, this);
 251             reqs++;
 252           }
 253         }
 254         if(i != 0 && group_out != MPI_COMM_WORLD->group() && group_out != MPI_GROUP_EMPTY)
 255           Group::unref(group_out);
 256
 257         Request::waitall(reqs, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 258         xbt_free(requests);
 259       }
 260     }
 261     xbt_free(recvbuf);
 262     xbt_free(rankmap);
 263     xbt_free(group_snd);
 264     group_out = group_root; /* exit with root's group */
 265   } else {
 266     if(color != MPI_UNDEFINED) {
 267       Request::recv(&group_out, 1, MPI_PTR, 0, system_tag, this, MPI_STATUS_IGNORE);
 268     } /* otherwise, exit with group_out == nullptr */
 269   }
 270   return group_out!=nullptr ? new  Comm(group_out, nullptr) : MPI_COMM_NULL;
 271 }
 272
 273 void Comm::ref(){
 274   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 275     smpi_process()->comm_world()->ref();
 276     return;
 277   }
 278   group_->ref();
 279   refcount_++;
 280 }
 281
 282 void Comm::cleanup_smp(){
 283   if (intra_comm_ != MPI_COMM_NULL)
 284     Comm::unref(intra_comm_);
 285   if (leaders_comm_ != MPI_COMM_NULL)
 286     Comm::unref(leaders_comm_);
 287   if (non_uniform_map_ != nullptr)
 288     xbt_free(non_uniform_map_);
 289   if (leaders_map_ != nullptr)
 290     xbt_free(leaders_map_);
 291 }
 292
 293 void Comm::unref(Comm* comm){
 294   if (comm == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 295     Comm::unref(smpi_process()->comm_world());
 296     return;
 297   }
 298   comm->refcount_--;
 299   Group::unref(comm->group_);
 300
 301   if(comm->refcount_==0){
 302     comm->cleanup_smp();
 303     comm->cleanup_attr<Comm>();
 304     delete comm;
 305   }
 306 }
 307
 308 static int compare_ints (const void *a, const void *b)
 309 {
 310   const int *da = static_cast<const int *>(a);
 311   const int *db = static_cast<const int *>(b);
 312
 313   return static_cast<int>(*da > *db) - static_cast<int>(*da < *db);
 314 }
 315
 316 void Comm::init_smp(){
 317   int leader = -1;
 318
 319   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 320     smpi_process()->comm_world()->init_smp();
 321
 322   int comm_size = this->size();
 323
 324   // If we are in replay - perform an ugly hack
 325   // tell SimGrid we are not in replay for a while, because we need the buffers to be copied for the following calls
 326   bool replaying = false; //cache data to set it back again after
 327   if(smpi_process()->replaying()){
 328    replaying=true;
 329    smpi_process()->set_replaying(false);
 330   }
 331
 332   if(smpi_privatize_global_variables == SMPI_PRIVATIZE_MMAP){ //we need to switch as the called function may silently touch global variables
 333      smpi_switch_data_segment(smpi_process()->index());
 334    }
 335   //identify neighbours in comm
 336   //get the indexes of all processes sharing the same simix host
 337    xbt_swag_t process_list = sg_host_self()->extension<simgrid::simix::Host>()->process_list;
 338    int intra_comm_size     = 0;
 339    int min_index           = INT_MAX; // the minimum index will be the leader
 340    smx_actor_t actor       = nullptr;
 341    xbt_swag_foreach(actor, process_list)
 342    {
 343      int index = actor->pid - 1;
 344
 345      if (this->group()->rank(index) != MPI_UNDEFINED) {
 346        intra_comm_size++;
 347        // the process is in the comm
 348        if (index < min_index)
 349          min_index = index;
 350      }
 351   }
 352   XBT_DEBUG("number of processes deployed on my node : %d", intra_comm_size);
 353   MPI_Group group_intra = new  Group(intra_comm_size);
 354   int i = 0;
 355   actor = nullptr;
 356   xbt_swag_foreach(actor, process_list) {
 357     int index = actor->pid -1;
 358     if(this->group()->rank(index)!=MPI_UNDEFINED){
 359       group_intra->set_mapping(index, i);
 360       i++;
 361     }
 362   }
 363
 364   MPI_Comm comm_intra = new  Comm(group_intra, nullptr);
 365   leader=min_index;
 366
 367   int * leaders_map= static_cast<int*>(xbt_malloc0(sizeof(int)*comm_size));
 368   int * leader_list= static_cast<int*>(xbt_malloc0(sizeof(int)*comm_size));
 369   for(i=0; i<comm_size; i++){
 370       leader_list[i]=-1;
 371   }
 372
 373   Coll_allgather_mpich::allgather(&leader, 1, MPI_INT , leaders_map, 1, MPI_INT, this);
 374
 375   if(smpi_privatize_global_variables == SMPI_PRIVATIZE_MMAP){ //we need to switch as the called function may silently touch global variables
 376      smpi_switch_data_segment(smpi_process()->index());
 377    }
 378
 379   if(leaders_map_==nullptr){
 380     leaders_map_= leaders_map;
 381   }else{
 382     xbt_free(leaders_map);
 383   }
 384   int j=0;
 385   int leader_group_size = 0;
 386   for(i=0; i<comm_size; i++){
 387       int already_done=0;
 388       for(j=0;j<leader_group_size; j++){
 389         if(leaders_map_[i]==leader_list[j]){
 390             already_done=1;
 391         }
 392       }
 393       if(already_done==0){
 394         leader_list[leader_group_size]=leaders_map_[i];
 395         leader_group_size++;
 396       }
 397   }
 398   qsort(leader_list, leader_group_size, sizeof(int),compare_ints);
 399
 400   MPI_Group leaders_group = new  Group(leader_group_size);
 401
 402   MPI_Comm leader_comm = MPI_COMM_NULL;
 403   if(MPI_COMM_WORLD!=MPI_COMM_UNINITIALIZED && this!=MPI_COMM_WORLD){
 404     //create leader_communicator
 405     for (i=0; i< leader_group_size;i++)
 406       leaders_group->set_mapping(leader_list[i], i);
 407     leader_comm = new  Comm(leaders_group, nullptr);
 408     this->set_leaders_comm(leader_comm);
 409     this->set_intra_comm(comm_intra);
 410
 411    //create intracommunicator
 412   }else{
 413     for (i=0; i< leader_group_size;i++)
 414       leaders_group->set_mapping(leader_list[i], i);
 415
 416     if(this->get_leaders_comm()==MPI_COMM_NULL){
 417       leader_comm = new  Comm(leaders_group, nullptr);
 418       this->set_leaders_comm(leader_comm);
 419     }else{
 420       leader_comm=this->get_leaders_comm();
 421       Group::unref(leaders_group);
 422     }
 423     smpi_process()->set_comm_intra(comm_intra);
 424   }
 425
 426   int is_uniform = 1;
 427
 428   // Are the nodes uniform ? = same number of process/node
 429   int my_local_size=comm_intra->size();
 430   if(comm_intra->rank()==0) {
 431     int* non_uniform_map = xbt_new0(int,leader_group_size);
 432     Coll_allgather_mpich::allgather(&my_local_size, 1, MPI_INT,
 433         non_uniform_map, 1, MPI_INT, leader_comm);
 434     for(i=0; i < leader_group_size; i++) {
 435       if(non_uniform_map[0] != non_uniform_map[i]) {
 436         is_uniform = 0;
 437         break;
 438       }
 439     }
 440     if(is_uniform==0 && this->is_uniform()!=0){
 441         non_uniform_map_= non_uniform_map;
 442     }else{
 443         xbt_free(non_uniform_map);
 444     }
 445     is_uniform_=is_uniform;
 446   }
 447   Coll_bcast_mpich::bcast(&(is_uniform_),1, MPI_INT, 0, comm_intra );
 448
 449   if(smpi_privatize_global_variables == SMPI_PRIVATIZE_MMAP){ //we need to switch as the called function may silently touch global variables
 450      smpi_switch_data_segment(smpi_process()->index());
 451    }
 452   // Are the ranks blocked ? = allocated contiguously on the SMP nodes
 453   int is_blocked=1;
 454   int prev=this->group()->rank(comm_intra->group()->index(0));
 455     for (i=1; i<my_local_size; i++){
 456       int that=this->group()->rank(comm_intra->group()->index(i));
 457       if(that!=prev+1){
 458         is_blocked=0;
 459         break;
 460       }
 461       prev = that;
 462   }
 463
 464   int global_blocked;
 465   Coll_allreduce_default::allreduce(&is_blocked, &(global_blocked), 1, MPI_INT, MPI_LAND, this);
 466
 467   if(MPI_COMM_WORLD==MPI_COMM_UNINITIALIZED || this==MPI_COMM_WORLD){
 468     if(this->rank()==0){
 469         is_blocked_=global_blocked;
 470     }
 471   }else{
 472     is_blocked_=global_blocked;
 473   }
 474   xbt_free(leader_list);
 475
 476   if(replaying)
 477     smpi_process()->set_replaying(true);
 478 }
 479
 480 MPI_Comm Comm::f2c(int id) {
 481   if(id == -2) {
 482     return MPI_COMM_SELF;
 483   } else if(id==0){
 484     return MPI_COMM_WORLD;
 485   } else if(F2C::f2c_lookup() != nullptr && id >= 0) {
 486       char key[KEY_SIZE];
 487       MPI_Comm tmp =  static_cast<MPI_Comm>(xbt_dict_get_or_null(F2C::f2c_lookup(),get_key_id(key, id)));
 488       return tmp != nullptr ? tmp : MPI_COMM_NULL ;
 489   } else {
 490     return MPI_COMM_NULL;
 491   }
 492 }
 493
 494 void Comm::free_f(int id) {
 495   char key[KEY_SIZE];
 496   xbt_dict_remove(F2C::f2c_lookup(), id==0? get_key(key, id) : get_key_id(key, id));
 497 }
 498
 499 int Comm::add_f() {
 500   if(F2C::f2c_lookup()==nullptr){
 501     F2C::set_f2c_lookup(xbt_dict_new_homogeneous(nullptr));
 502   }
 503   char key[KEY_SIZE];
 504   xbt_dict_set(F2C::f2c_lookup(), this==MPI_COMM_WORLD? get_key(key, F2C::f2c_id()) : get_key_id(key,F2C::f2c_id()), this, nullptr);
 505   f2c_id_increment();
 506   return F2C::f2c_id()-1;
 507 }
 508
 509
 510 void Comm::add_rma_win(MPI_Win win){
 511   rma_wins_.push_back(win);
 512 }
 513
 514 void Comm::remove_rma_win(MPI_Win win){
 515   rma_wins_.remove(win);
 516 }
 517
 518 void Comm::finish_rma_calls(){
 519   for(auto it : rma_wins_){
 520     if(it->rank()==this->rank()){//is it ours (for MPI_COMM_WORLD)?
 521       int finished = it->finish_comms();
 522       XBT_DEBUG("Barrier for rank %d - Finished %d RMA calls",this->rank(), finished);
 523     }
 524   }
 525 }
 526
 527
 528 }
 529 }
 530
 531