src/smpi/colls/gather/gather-ompi.cpp

   1 /* Copyright (c) 2013-2017. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 /*
   8  * Copyright (c) 2004-2005 The Trustees of Indiana University and Indiana
   9  *                         University Research and Technology
  10  *                         Corporation.  All rights reserved.
  11  * Copyright (c) 2004-2009 The University of Tennessee and The University
  12  *                         of Tennessee Research Foundation.  All rights
  13  *                         reserved.
  14  * Copyright (c) 2004-2005 High Performance Computing Center Stuttgart,
  15  *                         University of Stuttgart.  All rights reserved.
  16  * Copyright (c) 2004-2005 The Regents of the University of California.
  17  *                         All rights reserved.
  18  *
  19  * Additional copyrights may follow
  20  */
  21
  22 #include "../colls_private.h"
  23 #include "../coll_tuned_topo.h"
  24
  25 namespace simgrid{
  26 namespace smpi{
  27
  28
  29 int Coll_gather_ompi_binomial::gather(void *sbuf, int scount,
  30                                       MPI_Datatype sdtype,
  31                                       void *rbuf, int rcount,
  32                                       MPI_Datatype rdtype,
  33                                       int root,
  34                                       MPI_Comm comm)
  35 {
  36     int line = -1;
  37     int i;
  38     int rank;
  39     int vrank;
  40     int size;
  41     int total_recv = 0;
  42     char *ptmp     = NULL;
  43     char *tempbuf  = NULL;
  44     int err;
  45     ompi_coll_tree_t* bmtree;
  46     MPI_Status status;
  47     MPI_Aint sextent, slb, strue_lb, strue_extent;
  48     MPI_Aint rextent, rlb, rtrue_lb, rtrue_extent;
  49
  50
  51     size = comm->size();
  52     rank = comm->rank();
  53
  54     XBT_DEBUG(
  55                  "smpi_coll_tuned_gather_ompi_binomial rank %d", rank);
  56
  57     /* create the binomial tree */
  58    // COLL_TUNED_UPDATE_IN_ORDER_BMTREE( comm, tuned_module, root );
  59     bmtree = ompi_coll_tuned_topo_build_in_order_bmtree(comm, root);
  60     // data->cached_in_order_bmtree;
  61
  62     sdtype->extent(&slb, &sextent);
  63     sdtype->extent(&strue_lb, &strue_extent);
  64
  65     vrank = (rank - root + size) % size;
  66
  67     if (rank == root) {
  68         rdtype->extent(&rlb, &rextent);
  69         rdtype->extent(&rtrue_lb, &rtrue_extent);
  70         if (0 == root){
  71             /* root on 0, just use the recv buffer */
  72             ptmp = (char *) rbuf;
  73             if (sbuf != MPI_IN_PLACE) {
  74                 err = Datatype::copy(sbuf, scount, sdtype,
  75                                       ptmp, rcount, rdtype);
  76                 if (MPI_SUCCESS != err) { line = __LINE__; goto err_hndl; }
  77             }
  78         } else {
  79             /* root is not on 0, allocate temp buffer for recv,
  80              * rotate data at the end */
  81             tempbuf = (char *) smpi_get_tmp_recvbuffer(rtrue_extent + (rcount*size - 1) * rextent);
  82             if (NULL == tempbuf) {
  83                 err= MPI_ERR_OTHER; line = __LINE__; goto err_hndl;
  84             }
  85
  86             ptmp = tempbuf - rlb;
  87             if (sbuf != MPI_IN_PLACE) {
  88                 /* copy from sbuf to temp buffer */
  89                 err = Datatype::copy(sbuf, scount, sdtype,
  90                                       ptmp, rcount, rdtype);
  91                 if (MPI_SUCCESS != err) { line = __LINE__; goto err_hndl; }
  92             } else {
  93                 /* copy from rbuf to temp buffer  */
  94                 err = Datatype::copy((char *) rbuf + rank*rextent*rcount, rcount, rdtype, ptmp, rcount, rdtype );
  95                 if (MPI_SUCCESS != err) { line = __LINE__; goto err_hndl; }
  96             }
  97         }
  98         total_recv = rcount;
  99     } else if (!(vrank % 2)) {
 100         /* other non-leaf nodes, allocate temp buffer for data received from
 101          * children, the most we need is half of the total data elements due
 102          * to the property of binimoal tree */
 103         tempbuf = (char *) smpi_get_tmp_sendbuffer(strue_extent + (scount*size - 1) * sextent);
 104         if (NULL == tempbuf) {
 105             err= MPI_ERR_OTHER; line = __LINE__; goto err_hndl;
 106         }
 107
 108         ptmp = tempbuf - slb;
 109         /* local copy to tempbuf */
 110         err = Datatype::copy(sbuf, scount, sdtype,
 111                                    ptmp, scount, sdtype);
 112         if (MPI_SUCCESS != err) { line = __LINE__; goto err_hndl; }
 113
 114         /* use sdtype,scount as rdtype,rdcount since they are ignored on
 115          * non-root procs */
 116         rdtype = sdtype;
 117         rcount = scount;
 118         rextent = sextent;
 119         total_recv = rcount;
 120     } else {
 121         /* leaf nodes, no temp buffer needed, use sdtype,scount as
 122          * rdtype,rdcount since they are ignored on non-root procs */
 123         ptmp = (char *) sbuf;
 124         total_recv = scount;
 125     }
 126
 127     if (!(vrank % 2)) {
 128         /* all non-leaf nodes recv from children */
 129         for (i = 0; i < bmtree->tree_nextsize; i++) {
 130             int mycount = 0, vkid;
 131             /* figure out how much data I have to send to this child */
 132             vkid = (bmtree->tree_next[i] - root + size) % size;
 133             mycount = vkid - vrank;
 134             if (mycount > (size - vkid))
 135                 mycount = size - vkid;
 136             mycount *= rcount;
 137
 138             XBT_DEBUG(
 139                          "smpi_coll_tuned_gather_ompi_binomial rank %d recv %d mycount = %d",
 140                          rank, bmtree->tree_next[i], mycount);
 141
 142             Request::recv(ptmp + total_recv*rextent, mycount, rdtype,
 143                                     bmtree->tree_next[i], COLL_TAG_GATHER,
 144                                     comm, &status);
 145
 146             total_recv += mycount;
 147         }
 148     }
 149
 150     if (rank != root) {
 151         /* all nodes except root send to parents */
 152         XBT_DEBUG(
 153                      "smpi_coll_tuned_gather_ompi_binomial rank %d send %d count %d\n",
 154                      rank, bmtree->tree_prev, total_recv);
 155
 156         Request::send(ptmp, total_recv, sdtype,
 157                                 bmtree->tree_prev,
 158                                 COLL_TAG_GATHER,
 159                                  comm);
 160   }
 161     if (rank == root) {
 162         if (root != 0) {
 163             /* rotate received data on root if root != 0 */
 164             err = Datatype::copy(ptmp, rcount*(size - root), rdtype,
 165                                                  (char *) rbuf + rextent*root*rcount, rcount*(size - root), rdtype );
 166             if (MPI_SUCCESS != err) { line = __LINE__; goto err_hndl; }
 167
 168
 169             err = Datatype::copy( ptmp + rextent*rcount*(size-root), rcount*root,rdtype,
 170                                                  (char *) rbuf,rcount*root,rdtype);
 171             if (MPI_SUCCESS != err) { line = __LINE__; goto err_hndl; }
 172
 173             smpi_free_tmp_buffer(tempbuf);
 174         }
 175     } else if (!(vrank % 2)) {
 176         /* other non-leaf nodes */
 177         smpi_free_tmp_buffer(tempbuf);
 178     }
 179     xbt_free(bmtree);
 180     return MPI_SUCCESS;
 181
 182  err_hndl:
 183     if (NULL != tempbuf)
 184         smpi_free_tmp_buffer(tempbuf);
 185
 186     XBT_DEBUG(  "%s:%4d\tError occurred %d, rank %2d",
 187                  __FILE__, line, err, rank);
 188     return err;
 189 }
 190
 191 /*
 192  *      gather_intra_linear_sync
 193  *
 194  *      Function:       - synchronized gather operation with
 195  *      Accepts:        - same arguments as MPI_Gather(), first segment size
 196  *      Returns:        - MPI_SUCCESS or error code
 197  */
 198 int Coll_gather_ompi_linear_sync::gather(void *sbuf, int scount,
 199                                          MPI_Datatype sdtype,
 200                                          void *rbuf, int rcount,
 201                                          MPI_Datatype rdtype,
 202                                          int root,
 203                                          MPI_Comm comm)
 204 {
 205     int i;
 206     int ret, line;
 207     int rank, size;
 208     int first_segment_count;
 209     size_t typelng;
 210     MPI_Aint extent;
 211     MPI_Aint lb;
 212
 213     int first_segment_size=0;
 214     size = comm->size();
 215     rank = comm->rank();
 216
 217     size_t dsize, block_size;
 218     if (rank == root) {
 219         dsize= rdtype->size();
 220         block_size = dsize * rcount;
 221     } else {
 222         dsize=sdtype->size();
 223         block_size = dsize * scount;
 224     }
 225
 226      if (block_size > 92160){
 227      first_segment_size = 32768;
 228      }else{
 229      first_segment_size = 1024;
 230      }
 231
 232     XBT_DEBUG(
 233                  "smpi_coll_tuned_gather_ompi_linear_sync rank %d, segment %d", rank, first_segment_size);
 234
 235     if (rank != root) {
 236         /* Non-root processes:
 237            - receive zero byte message from the root,
 238            - send the first segment of the data synchronously,
 239            - send the second segment of the data.
 240         */
 241
 242         typelng= sdtype->size();
 243         sdtype->extent(&lb, &extent);
 244         first_segment_count = scount;
 245         COLL_TUNED_COMPUTED_SEGCOUNT( (size_t) first_segment_size, typelng,
 246                                       first_segment_count );
 247
 248         Request::recv(sbuf, 0, MPI_BYTE, root,
 249                                 COLL_TAG_GATHER,
 250                                 comm, MPI_STATUS_IGNORE);
 251
 252         Request::send(sbuf, first_segment_count, sdtype, root,
 253                                 COLL_TAG_GATHER,
 254                                  comm);
 255
 256         Request::send((char*)sbuf + extent * first_segment_count,
 257                                 (scount - first_segment_count), sdtype,
 258                                 root, COLL_TAG_GATHER,
 259                                  comm);
 260     }
 261
 262     else {
 263         /* Root process,
 264            - For every non-root node:
 265            - post irecv for the first segment of the message
 266            - send zero byte message to signal node to send the message
 267            - post irecv for the second segment of the message
 268            - wait for the first segment to complete
 269            - Copy local data if necessary
 270            - Waitall for all the second segments to complete.
 271         */
 272         char *ptmp;
 273         MPI_Request *reqs = NULL, first_segment_req;
 274         reqs = (MPI_Request *) calloc(size, sizeof(MPI_Request ));
 275         if (NULL == reqs) { ret = -1; line = __LINE__; goto error_hndl; }
 276
 277         typelng=rdtype->size();
 278         rdtype->extent(&lb, &extent);
 279         first_segment_count = rcount;
 280         COLL_TUNED_COMPUTED_SEGCOUNT( (size_t)first_segment_size, typelng,
 281                                       first_segment_count );
 282
 283         for (i = 0; i < size; ++i) {
 284             if (i == rank) {
 285                 /* skip myself */
 286                 reqs[i] = MPI_REQUEST_NULL;
 287                 continue;
 288             }
 289
 290             /* irecv for the first segment from i */
 291             ptmp = (char*)rbuf + i * rcount * extent;
 292             first_segment_req = Request::irecv(ptmp, first_segment_count, rdtype, i,
 293                                      COLL_TAG_GATHER, comm
 294                                      );
 295
 296             /* send sync message */
 297             Request::send(rbuf, 0, MPI_BYTE, i,
 298                                     COLL_TAG_GATHER,
 299                                      comm);
 300
 301             /* irecv for the second segment */
 302             ptmp = (char*)rbuf + (i * rcount + first_segment_count) * extent;
 303             reqs[i]=Request::irecv(ptmp, (rcount - first_segment_count),
 304                                      rdtype, i, COLL_TAG_GATHER, comm
 305                                      );
 306
 307             /* wait on the first segment to complete */
 308             Request::wait(&first_segment_req, MPI_STATUS_IGNORE);
 309         }
 310
 311         /* copy local data if necessary */
 312         if (MPI_IN_PLACE != sbuf) {
 313             ret = Datatype::copy(sbuf, scount, sdtype,
 314                                   (char*)rbuf + rank * rcount * extent,
 315                                   rcount, rdtype);
 316             if (ret != MPI_SUCCESS) { line = __LINE__; goto error_hndl; }
 317         }
 318
 319         /* wait all second segments to complete */
 320         ret = Request::waitall(size, reqs, MPI_STATUSES_IGNORE);
 321         if (ret != MPI_SUCCESS) { line = __LINE__; goto error_hndl; }
 322
 323         free(reqs);
 324     }
 325
 326     /* All done */
 327
 328     return MPI_SUCCESS;
 329  error_hndl:
 330     XBT_DEBUG(
 331                    "ERROR_HNDL: node %d file %s line %d error %d\n",
 332                    rank, __FILE__, line, ret );
 333     return ret;
 334 }
 335
 336 /*
 337  * Linear functions are copied from the BASIC coll module
 338  * they do not segment the message and are simple implementations
 339  * but for some small number of nodes and/or small data sizes they
 340  * are just as fast as tuned/tree based segmenting operations
 341  * and as such may be selected by the decision functions
 342  * These are copied into this module due to the way we select modules
 343  * in V1. i.e. in V2 we will handle this differently and so will not
 344  * have to duplicate code.
 345  * JPG following the examples from other coll_tuned implementations. Dec06.
 346  */
 347
 348 /* copied function (with appropriate renaming) starts here */
 349 /*
 350  *      gather_intra
 351  *
 352  *      Function:       - basic gather operation
 353  *      Accepts:        - same arguments as MPI_Gather()
 354  *      Returns:        - MPI_SUCCESS or error code
 355  */
 356 int Coll_gather_ompi_basic_linear::gather(void *sbuf, int scount,
 357                                           MPI_Datatype sdtype,
 358                                           void *rbuf, int rcount,
 359                                           MPI_Datatype rdtype,
 360                                           int root,
 361                                           MPI_Comm comm)
 362 {
 363     int i;
 364     int err;
 365     int rank;
 366     int size;
 367     char *ptmp;
 368     MPI_Aint incr;
 369     MPI_Aint extent;
 370     MPI_Aint lb;
 371
 372     size = comm->size();
 373     rank = comm->rank();
 374
 375     /* Everyone but root sends data and returns. */
 376     XBT_DEBUG(
 377                  "ompi_coll_tuned_gather_intra_basic_linear rank %d", rank);
 378
 379     if (rank != root) {
 380         Request::send(sbuf, scount, sdtype, root,
 381                                  COLL_TAG_GATHER,
 382                                   comm);
 383         return MPI_SUCCESS;
 384     }
 385
 386     /* I am the root, loop receiving the data. */
 387
 388     rdtype->extent(&lb, &extent);
 389     incr = extent * rcount;
 390     for (i = 0, ptmp = (char *) rbuf; i < size; ++i, ptmp += incr) {
 391         if (i == rank) {
 392             if (MPI_IN_PLACE != sbuf) {
 393                 err = Datatype::copy(sbuf, scount, sdtype,
 394                                       ptmp, rcount, rdtype);
 395             } else {
 396                 err = MPI_SUCCESS;
 397             }
 398         } else {
 399             Request::recv(ptmp, rcount, rdtype, i,
 400                                     COLL_TAG_GATHER,
 401                                     comm, MPI_STATUS_IGNORE);
 402             err = MPI_SUCCESS;
 403         }
 404         if (MPI_SUCCESS != err) {
 405             return err;
 406         }
 407     }
 408
 409     /* All done */
 410
 411     return MPI_SUCCESS;
 412 }
 413
 414 }
 415 }