src/smpi/smpi_base.c

   1 /* Copyright (c) 2007-2014. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "xbt/virtu.h"
   9 #include "mc/mc.h"
  10 #include "xbt/replay.h"
  11 #include <errno.h>
  12 #include "simix/smx_private.h"
  13 #include "surf/surf.h"
  14 #include "simgrid/sg_config.h"
  15 #include "colls/colls.h"
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
  18
  19
  20 static int match_recv(void* a, void* b, smx_action_t ignored) {
  21    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  22    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  23    XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  24
  25   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
  26   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
  27   if((ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  28     && ((ref->tag == MPI_ANY_TAG && req->tag >=0) || req->tag == ref->tag)){
  29     //we match, we can transfer some values
  30     // FIXME : move this to the copy function ?
  31     if(ref->src == MPI_ANY_SOURCE)ref->real_src = req->src;
  32     if(ref->tag == MPI_ANY_TAG)ref->real_tag = req->tag;
  33     if(ref->real_size < req->real_size) ref->truncated = 1;
  34     if(req->detached==1){
  35         ref->detached_sender=req; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  36     }
  37     XBT_DEBUG("match succeeded");
  38     return 1;
  39   }else return 0;
  40 }
  41
  42 static int match_send(void* a, void* b,smx_action_t ignored) {
  43    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  44    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  45    XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  46    xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
  47    xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
  48
  49    if((req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  50              && ((req->tag == MPI_ANY_TAG && ref->tag >=0)|| req->tag == ref->tag))
  51    {
  52      if(req->src == MPI_ANY_SOURCE)req->real_src = ref->src;
  53      if(req->tag == MPI_ANY_TAG)req->real_tag = ref->tag;
  54      if(req->real_size < ref->real_size) req->truncated = 1;
  55      if(ref->detached==1){
  56          req->detached_sender=ref; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  57      }
  58     XBT_DEBUG("match succeeded");
  59      return 1;
  60    } else return 0;
  61 }
  62
  63
  64 typedef struct s_smpi_factor *smpi_factor_t;
  65 typedef struct s_smpi_factor {
  66   long factor;
  67   int nb_values;
  68   double values[4];//arbitrary set to 4
  69 } s_smpi_factor_t;
  70 xbt_dynar_t smpi_os_values = NULL;
  71 xbt_dynar_t smpi_or_values = NULL;
  72 xbt_dynar_t smpi_ois_values = NULL;
  73
  74 // Methods used to parse and store the values for timing injections in smpi
  75 // These are taken from surf/network.c and generalized to have more factors
  76 // These methods should be merged with those in surf/network.c (moved somewhere in xbt ?)
  77
  78 static int factor_cmp(const void *pa, const void *pb)
  79 {
  80   return (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor > ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? 1 :
  81          (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor < ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? -1 : 0;
  82 }
  83
  84
  85 static xbt_dynar_t parse_factor(const char *smpi_coef_string)
  86 {
  87   char *value = NULL;
  88   unsigned int iter = 0;
  89   s_smpi_factor_t fact;
  90   fact.nb_values=0;
  91   int i=0;
  92   xbt_dynar_t smpi_factor, radical_elements, radical_elements2 = NULL;
  93
  94   smpi_factor = xbt_dynar_new(sizeof(s_smpi_factor_t), NULL);
  95   radical_elements = xbt_str_split(smpi_coef_string, ";");
  96   xbt_dynar_foreach(radical_elements, iter, value) {
  97     memset(&fact, 0, sizeof(s_smpi_factor_t));
  98     radical_elements2 = xbt_str_split(value, ":");
  99     if (xbt_dynar_length(radical_elements2) <2 || xbt_dynar_length(radical_elements2) > 5)
 100       xbt_die("Malformed radical for smpi factor!");
 101     for(i =0; i<xbt_dynar_length(radical_elements2);i++ ){
 102         if (i==0){
 103            fact.factor = atol(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 104         }else{
 105            fact.values[fact.nb_values] = atof(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 106            fact.nb_values++;
 107         }
 108     }
 109
 110     xbt_dynar_push_as(smpi_factor, s_smpi_factor_t, fact);
 111     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 112     xbt_dynar_free(&radical_elements2);
 113   }
 114   xbt_dynar_free(&radical_elements);
 115   iter=0;
 116   xbt_dynar_sort(smpi_factor, &factor_cmp);
 117   xbt_dynar_foreach(smpi_factor, iter, fact) {
 118     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 119   }
 120   return smpi_factor;
 121 }
 122
 123 static double smpi_os(double size)
 124 {
 125   if (!smpi_os_values) {
 126     smpi_os_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/os"));
 127     smpi_register_static(smpi_os_values, xbt_dynar_free_voidp);
 128   }
 129   unsigned int iter = 0;
 130   s_smpi_factor_t fact;
 131   double current=0.0;
 132   xbt_dynar_foreach(smpi_os_values, iter, fact) {
 133     if (size <= fact.factor) {
 134         XBT_DEBUG("os : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 135       return current;
 136     }else{
 137       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 138     }
 139   }
 140   XBT_DEBUG("os : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 141
 142   return current;
 143 }
 144
 145 static double smpi_ois(double size)
 146 {
 147   if (!smpi_ois_values) {
 148     smpi_ois_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/ois"));
 149     smpi_register_static(smpi_ois_values, xbt_dynar_free_voidp);
 150   }
 151   unsigned int iter = 0;
 152   s_smpi_factor_t fact;
 153   double current=0.0;
 154   xbt_dynar_foreach(smpi_ois_values, iter, fact) {
 155     if (size <= fact.factor) {
 156         XBT_DEBUG("ois : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 157       return current;
 158     }else{
 159       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 160     }
 161   }
 162   XBT_DEBUG("ois : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 163
 164   return current;
 165 }
 166
 167 static double smpi_or(double size)
 168 {
 169   if (!smpi_or_values) {
 170     smpi_or_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/or"));
 171     smpi_register_static(smpi_or_values, xbt_dynar_free_voidp);
 172   }
 173   unsigned int iter = 0;
 174   s_smpi_factor_t fact;
 175   double current=0.0;
 176   xbt_dynar_foreach(smpi_or_values, iter, fact) {
 177     if (size <= fact.factor) {
 178         XBT_DEBUG("or : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 179       return current;
 180     }else
 181       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 182   }
 183   XBT_DEBUG("or : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 184
 185   return current;
 186 }
 187
 188 static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
 189                                  MPI_Datatype datatype, int src, int dst,
 190                                  int tag, MPI_Comm comm, unsigned flags)
 191 {
 192   MPI_Request request = NULL;
 193
 194   void *old_buf = NULL;
 195
 196   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
 197
 198   s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 199
 200   if(datatype->has_subtype == 1){
 201     // This part handles the problem of non-contiguous memory
 202     old_buf = buf;
 203     buf = count==0 ? NULL : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
 204     if (flags & SEND) {
 205       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
 206     }
 207   }
 208
 209   request->buf = buf;
 210   // This part handles the problem of non-contiguous memory (for the
 211   // unserialisation at the reception)
 212   request->old_buf = old_buf;
 213   request->old_type = datatype;
 214
 215   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
 216   request->src = src;
 217   request->dst = dst;
 218   request->tag = tag;
 219   request->comm = comm;
 220   request->action = NULL;
 221   request->flags = flags;
 222   request->detached = 0;
 223   request->detached_sender = NULL;
 224   request->real_src = 0;
 225
 226   request->truncated = 0;
 227   request->real_size = 0;
 228   request->real_tag = 0;
 229   if(flags & PERSISTENT)
 230     request->refcount = 1;
 231   else
 232     request->refcount = 0;
 233
 234 #ifdef HAVE_TRACING
 235   request->send = 0;
 236   request->recv = 0;
 237 #endif
 238   if (flags & SEND) smpi_datatype_unuse(datatype);
 239
 240   return request;
 241 }
 242
 243
 244 void smpi_empty_status(MPI_Status * status)
 245 {
 246   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 247     status->MPI_SOURCE = MPI_ANY_SOURCE;
 248     status->MPI_TAG = MPI_ANY_TAG;
 249     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 250     status->count=0;
 251   }
 252 }
 253
 254 void smpi_action_trace_run(char *path)
 255 {
 256   char *name;
 257   xbt_dynar_t todo;
 258   xbt_dict_cursor_t cursor;
 259
 260   action_fp=NULL;
 261   if (path) {
 262     action_fp = fopen(path, "r");
 263     xbt_assert(action_fp != NULL, "Cannot open %s: %s", path,
 264                strerror(errno));
 265   }
 266
 267   if (!xbt_dict_is_empty(action_queues)) {
 268     XBT_WARN
 269       ("Not all actions got consumed. If the simulation ended successfully (without deadlock), you may want to add new processes to your deployment file.");
 270
 271
 272     xbt_dict_foreach(action_queues, cursor, name, todo) {
 273       XBT_WARN("Still %lu actions for %s", xbt_dynar_length(todo), name);
 274     }
 275   }
 276
 277   if (path)
 278     fclose(action_fp);
 279   xbt_dict_free(&action_queues);
 280   action_queues = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 281 }
 282
 283 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
 284 {
 285   MPI_Request req = request;
 286   smpi_mpi_request_free(&req);
 287 }
 288
 289 /* MPI Low level calls */
 290 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 291                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 292 {
 293   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 294   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 295                           comm, PERSISTENT | SEND | PREPARED);
 296   return request;
 297 }
 298
 299 MPI_Request smpi_mpi_ssend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 300                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 301 {
 302   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 303   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 304                           comm, PERSISTENT | SSEND | SEND | PREPARED);
 305   return request;
 306 }
 307
 308 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 309                                int src, int tag, MPI_Comm comm)
 310 {
 311   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 312   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 313                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 314   return request;
 315 }
 316
 317 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 318 {
 319   smx_rdv_t mailbox;
 320
 321   xbt_assert(!request->action, "Cannot (re)start a non-finished communication");
 322   request->flags &= ~PREPARED;
 323   request->flags &= ~FINISHED;
 324   request->refcount++;
 325
 326   if (request->flags & RECV) {
 327     print_request("New recv", request);
 328     //FIXME: if receive is posted with a large size, but send is smaller, mailboxes may not match !
 329     if (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres"))
 330       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 331     else
 332       mailbox = smpi_process_mailbox();
 333     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 334     request->real_size=request->size;
 335     smpi_datatype_use(request->old_type);
 336     smpi_comm_use(request->comm);
 337     request->action = simcall_comm_irecv(mailbox, request->buf,
 338                                          &request->real_size, &match_recv,
 339                                          request, -1.0);
 340
 341     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
 342     double sleeptime = request->detached ? smpi_or(request->size) : 0.0;
 343     if(sleeptime!=0.0){
 344         simcall_process_sleep(sleeptime);
 345         XBT_DEBUG("receiving size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_or(request->size));
 346     }
 347
 348   } else {
 349
 350
 351     int receiver = request->dst;//smpi_group_index(smpi_comm_group(request->comm), request->dst);
 352
 353     #ifdef HAVE_TRACING
 354       int rank = smpi_process_index();
 355       if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 356         TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver,request->size);
 357       }
 358     #endif
 359 /*    if(receiver == MPI_UNDEFINED) {*/
 360 /*      XBT_WARN("Trying to send a message to a wrong rank");*/
 361 /*      return;*/
 362 /*    }*/
 363     print_request("New send", request);
 364     if (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
 365       mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 366     }else{
 367       XBT_DEBUG("Send request %p is not in the permanent receive mailbox (buf: %p)",request,request->buf);
 368       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 369     }
 370
 371     void* buf = request->buf;
 372     if ( (! (request->flags & SSEND)) && (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/send_is_detached_thres"))) {
 373       void *oldbuf = NULL;
 374       request->detached = 1;
 375       request->refcount++;
 376       if(request->old_type->has_subtype == 0){
 377         oldbuf = request->buf;
 378         if (!_xbt_replay_is_active() && oldbuf && request->size!=0){
 379           buf = xbt_malloc(request->size);
 380           memcpy(buf,oldbuf,request->size);
 381         }
 382       }
 383       XBT_DEBUG("Send request %p is detached; buf %p copied into %p",request,oldbuf,request->buf);
 384     }
 385
 386     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 387     request->real_size=request->size;
 388     smpi_datatype_use(request->old_type);
 389     smpi_comm_use(request->comm);
 390
 391     //if we are giving back the control to the user without waiting for completion, we have to inject timings
 392     double sleeptime = 0.0;
 393     if(request->detached || (request->flags & (ISEND|SSEND))){// issend should be treated as isend
 394       //isend and send timings may be different
 395       sleeptime = (request->flags & ISEND)? smpi_ois(request->size) : smpi_os(request->size);
 396     }
 397
 398     if(sleeptime != 0.0){
 399         simcall_process_sleep(sleeptime);
 400         XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_os(request->size));
 401     }
 402
 403     request->action =
 404       simcall_comm_isend(mailbox, request->size, -1.0,
 405                          buf, request->real_size,
 406                          &match_send,
 407                          &xbt_free, // how to free the userdata if a detached send fails
 408                          request,
 409                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
 410                          request->detached);
 411
 412 #ifdef HAVE_TRACING
 413     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == NULL) */
 414     if (request->action)
 415       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
 416
 417 #endif
 418
 419   }
 420
 421 }
 422
 423 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
 424 {
 425   int i;
 426   if(requests==NULL) return;
 427
 428   for(i = 0; i < count; i++) {
 429     smpi_mpi_start(requests[i]);
 430   }
 431 }
 432
 433 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
 434 {
 435   if((*request) != MPI_REQUEST_NULL){
 436     (*request)->refcount--;
 437     if((*request)->refcount<0) xbt_die("wrong refcount");
 438
 439     if((*request)->refcount==0){
 440         print_request("Destroying", (*request));
 441         xbt_free(*request);
 442         *request = MPI_REQUEST_NULL;
 443     }else{
 444         print_request("Decrementing", (*request));
 445     }
 446   }else{
 447       xbt_die("freeing an already free request");
 448   }
 449 }
 450
 451 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 452                             int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 453 {
 454   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 455   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 456                           comm, PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 457   return request;
 458 }
 459
 460 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 461                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 462 {
 463   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 464   request =  build_request(buf==MPI_BOTTOM?(void*)0:buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 465                            comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND);
 466   smpi_mpi_start(request);
 467   return request;
 468 }
 469
 470 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 471                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 472 {
 473   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 474   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 475                           comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SSEND | SEND);
 476   smpi_mpi_start(request);
 477   return request;
 478 }
 479
 480
 481
 482 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 483                             int src, int tag, MPI_Comm comm)
 484 {
 485   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 486   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 487                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 488   return request;
 489 }
 490
 491 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 492                            int src, int tag, MPI_Comm comm)
 493 {
 494   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 495   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 496                           comm, NON_PERSISTENT | RECV);
 497   smpi_mpi_start(request);
 498   return request;
 499 }
 500
 501 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src,
 502                    int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 503 {
 504   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 505   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 506   smpi_mpi_wait(&request, status);
 507   request = NULL;
 508 }
 509
 510
 511
 512 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst,
 513                    int tag, MPI_Comm comm)
 514 {
 515   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 516   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 517                           comm, NON_PERSISTENT | SEND);
 518
 519   smpi_mpi_start(request);
 520   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 521   request = NULL;
 522 }
 523
 524 void smpi_mpi_ssend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 525                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 526 {
 527   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 528   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 529                 comm, NON_PERSISTENT | SSEND | SEND);
 530
 531   smpi_mpi_start(request);
 532   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 533   request = NULL;
 534 }
 535
 536 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 537                        int dst, int sendtag, void *recvbuf, int recvcount,
 538                        MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
 539                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 540 {
 541   MPI_Request requests[2];
 542   MPI_Status stats[2];
 543   int myid=smpi_process_index();
 544   if ((smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst) == myid) && (smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src) == myid)) {
 545       smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 546                                      recvbuf, recvcount, recvtype);
 547       return;
 548   }
 549   requests[0] =
 550     smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
 551   requests[1] =
 552     smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
 553   smpi_mpi_startall(2, requests);
 554   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
 555   smpi_mpi_request_free(&requests[0]);
 556   smpi_mpi_request_free(&requests[1]);
 557   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 558     // Copy receive status
 559     *status = stats[1];
 560   }
 561 }
 562
 563 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
 564 {
 565   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
 566 }
 567
 568 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 569 {
 570   MPI_Request req = *request;
 571   smpi_empty_status(status);
 572
 573   if(!(req->detached && req->flags & SEND)
 574       && !(req->flags & PREPARED)){
 575     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 576       int src = req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src;
 577       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(req->comm), src);
 578       status->MPI_TAG = req->tag == MPI_ANY_TAG ? req->real_tag : req->tag;
 579       status->MPI_ERROR = req->truncated ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
 580       // this handles the case were size in receive differs from size in send
 581       // FIXME: really this should just contain the count of receive-type blocks,
 582       // right?
 583       status->count = req->real_size;
 584     }
 585
 586     print_request("Finishing", req);
 587     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 588
 589     if(datatype->has_subtype == 1){
 590       // This part handles the problem of non-contignous memory
 591       // the unserialization at the reception
 592       s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 593       if(req->flags & RECV) {
 594         subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct);
 595       }
 596       if(req->detached == 0) free(req->buf);
 597     }
 598     smpi_comm_unuse(req->comm);
 599     smpi_datatype_unuse(datatype);
 600
 601   }
 602
 603 #ifdef HAVE_TRACING
 604   if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 605     if(req->flags & RECV){
 606       int rank = smpi_process_index();
 607       int src_traced = (req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src);
 608       TRACE_smpi_recv(rank, src_traced, rank);
 609     }
 610   }
 611 #endif
 612
 613   if(req->detached_sender!=NULL){
 614     smpi_mpi_request_free(&(req->detached_sender));
 615   }
 616   if(req->flags & PERSISTENT)
 617     req->action = NULL;
 618   req->flags |= FINISHED;
 619
 620   smpi_mpi_request_free(request);
 621
 622 }
 623
 624 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
 625   int flag;
 626
 627   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
 628   smpi_empty_status(status);
 629   flag = 1;
 630   if (!((*request)->flags & PREPARED)) {
 631     if ((*request)->action != NULL)
 632       flag = simcall_comm_test((*request)->action);
 633     if (flag) {
 634       finish_wait(request, status);
 635       if (*request != MPI_REQUEST_NULL && !((*request)->flags & PERSISTENT))
 636       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 637     }
 638   }
 639   return flag;
 640 }
 641
 642 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
 643                      MPI_Status * status)
 644 {
 645   xbt_dynar_t comms;
 646   int i, flag, size;
 647   int* map;
 648
 649   *index = MPI_UNDEFINED;
 650   flag = 0;
 651   comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
 652   map = xbt_new(int, count);
 653   size = 0;
 654   for(i = 0; i < count; i++) {
 655     if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action &&
 656         !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 657        xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 658        map[size] = i;
 659        size++;
 660     }
 661   }
 662   if(size > 0) {
 663     i = simcall_comm_testany(comms);
 664     // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 665     if(i != -1) {
 666       *index = map[i];
 667       finish_wait(&requests[*index], status);
 668       if (requests[*index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[*index]->flags & NON_PERSISTENT))
 669       requests[*index] = MPI_REQUEST_NULL;
 670       flag = 1;
 671     }
 672   }else{
 673       //all requests are null or inactive, return true
 674       flag=1;
 675       smpi_empty_status(status);
 676   }
 677   xbt_free(map);
 678   xbt_dynar_free(&comms);
 679
 680   return flag;
 681 }
 682
 683
 684 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[],
 685                      MPI_Status status[])
 686 {
 687   MPI_Status stat;
 688   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 689   int flag=1;
 690   int i;
 691   for(i=0; i<count; i++){
 692     if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 693       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
 694         flag=0;
 695       }else{
 696           requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 697       }
 698     }else{
 699       smpi_empty_status(pstat);
 700     }
 701     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 702       status[i] = *pstat;
 703     }
 704   }
 705   return flag;
 706 }
 707
 708 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
 709   int flag=0;
 710   //FIXME find another wait to avoid busy waiting ?
 711   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
 712   while(flag==0){
 713     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
 714     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
 715   }
 716 }
 717
 718 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
 719
 720   MPI_Request request =build_request(NULL, 0, MPI_CHAR, source == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), source), smpi_comm_rank(comm), tag,
 721             comm, PERSISTENT | RECV);
 722
 723   //to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
 724   double sleeptime= sg_cfg_get_double("smpi/iprobe");
 725   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
 726   static int nsleeps = 1;
 727
 728   simcall_process_sleep(sleeptime);
 729
 730   // behave like a receive, but don't do it
 731   smx_rdv_t mailbox;
 732
 733   print_request("New iprobe", request);
 734   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
 735     if (sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")>0){
 736         mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 737         XBT_DEBUG("trying to probe the perm recv mailbox");
 738         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 739     }
 740     if (request->action==NULL){
 741         mailbox = smpi_process_mailbox();
 742         XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
 743         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 744     }
 745
 746   if(request->action){
 747     MPI_Request req = (MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data(request->action);
 748     *flag = 1;
 749     if(status != MPI_STATUS_IGNORE && !(req->flags & PREPARED)) {
 750       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(comm), req->src);
 751       status->MPI_TAG = req->tag;
 752       status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 753       status->count = req->real_size;
 754     }
 755     nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 756   }
 757   else {
 758       *flag = 0;
 759       nsleeps++;
 760   }
 761   smpi_mpi_request_free(&request);
 762
 763   return;
 764 }
 765
 766 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 767 {
 768   print_request("Waiting", *request);
 769   if ((*request)->flags & PREPARED) {
 770     smpi_empty_status(status);
 771     return;
 772   }
 773
 774   if ((*request)->action != NULL) { // this is not a detached send
 775     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
 776 #ifdef HAVE_MC
 777   if(MC_is_active())
 778     (*request)->action->comm.dst_data = NULL; // dangling pointer : dst_data is freed with a wait, need to set it to NULL for system state comparison
 779 #endif
 780   }
 781
 782   finish_wait(request, status);
 783   if (*request != MPI_REQUEST_NULL && ((*request)->flags & NON_PERSISTENT))
 784       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 785   // FIXME for a detached send, finish_wait is not called:
 786 }
 787
 788 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[],
 789                      MPI_Status * status)
 790 {
 791   xbt_dynar_t comms;
 792   int i, size, index;
 793   int *map;
 794
 795   index = MPI_UNDEFINED;
 796   if(count > 0) {
 797     // Wait for a request to complete
 798     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
 799     map = xbt_new(int, count);
 800     size = 0;
 801     XBT_DEBUG("Wait for one of %d", count);
 802     for(i = 0; i < count; i++) {
 803       if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL
 804           && !(requests[i]->flags & PREPARED)
 805           && !(requests[i]->flags & FINISHED)) {
 806         if (requests[i]->action != NULL) {
 807           XBT_DEBUG("Waiting any %p ", requests[i]);
 808           xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 809           map[size] = i;
 810           size++;
 811         }else{
 812          //This is a finished detached request, let's return this one
 813          size=0;//so we free the dynar but don't do the waitany call
 814          index=i;
 815          finish_wait(&requests[i], status);//cleanup if refcount = 0
 816          if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 817          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;//set to null
 818          break;
 819          }
 820       }
 821     }
 822     if(size > 0) {
 823       i = simcall_comm_waitany(comms);
 824
 825       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 826       if (i != -1) {
 827         index = map[i];
 828         finish_wait(&requests[index], status);
 829         if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 830         requests[index] = MPI_REQUEST_NULL;
 831       }
 832     }
 833     xbt_free(map);
 834     xbt_dynar_free(&comms);
 835   }
 836
 837   if (index==MPI_UNDEFINED)
 838     smpi_empty_status(status);
 839
 840   return index;
 841 }
 842
 843 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[],
 844                       MPI_Status status[])
 845 {
 846   int  index, c;
 847   MPI_Status stat;
 848   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 849   int retvalue = MPI_SUCCESS;
 850   //tag invalid requests in the set
 851   if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 852     for (c = 0; c < count; c++) {
 853       if (requests[c] == MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL ||
 854           (requests[c]->flags & PREPARED)) {
 855         smpi_empty_status(&status[c]);
 856       } else if (requests[c]->src == MPI_PROC_NULL) {
 857         smpi_empty_status(&status[c]);
 858         status[c].MPI_SOURCE = MPI_PROC_NULL;
 859       }
 860     }
 861   }
 862   for(c = 0; c < count; c++) {
 863
 864     if (MC_is_active()) {
 865       smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
 866       index = c;
 867     } else {
 868       index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
 869       if (index == MPI_UNDEFINED)
 870         break;
 871       if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
 872       requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
 873     }
 874     if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 875       status[index] = *pstat;
 876       if (status[index].MPI_ERROR == MPI_ERR_TRUNCATE)
 877         retvalue = MPI_ERR_IN_STATUS;
 878     }
 879   }
 880
 881   return retvalue;
 882 }
 883
 884 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
 885                       MPI_Status status[])
 886 {
 887   int i, count, index;
 888   MPI_Status stat;
 889   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 890
 891   count = 0;
 892   for(i = 0; i < incount; i++)
 893   {
 894     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
 895     if(index!=MPI_UNDEFINED){
 896       indices[count] = index;
 897       count++;
 898       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 899         status[index] = *pstat;
 900       }
 901      if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
 902      requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
 903     }else{
 904       return MPI_UNDEFINED;
 905     }
 906   }
 907   return count;
 908 }
 909
 910 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
 911                       MPI_Status status[])
 912 {
 913   int i, count, count_dead;
 914   MPI_Status stat;
 915   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 916
 917   count = 0;
 918   count_dead = 0;
 919   for(i = 0; i < incount; i++) {
 920     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
 921       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
 922          indices[i] = 1;
 923          count++;
 924          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 925            status[i] = *pstat;
 926          }
 927          if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->flags & NON_PERSISTENT)
 928          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 929       }
 930     }else{
 931       count_dead++;
 932     }
 933   }
 934   if(count_dead==incount)return MPI_UNDEFINED;
 935   else return count;
 936 }
 937
 938 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root,
 939                     MPI_Comm comm)
 940 {
 941   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
 942   nary_tree_bcast(buf, count, datatype, root, comm, 4);
 943 }
 944
 945 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
 946 {
 947   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
 948   nary_tree_barrier(comm, 4);
 949 }
 950
 951 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 952                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 953                      int root, MPI_Comm comm)
 954 {
 955   int system_tag = COLL_TAG_GATHER;
 956   int rank, size, src, index;
 957   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
 958   MPI_Request *requests;
 959
 960   rank = smpi_comm_rank(comm);
 961   size = smpi_comm_size(comm);
 962   if(rank != root) {
 963     // Send buffer to root
 964     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
 965   } else {
 966     // FIXME: check for errors
 967     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 968     // Local copy from root
 969     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 970                        (char *)recvbuf + root * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
 971     // Receive buffers from senders
 972     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
 973     index = 0;
 974     for(src = 0; src < size; src++) {
 975       if(src != root) {
 976         requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + src * recvcount * recvext,
 977                                           recvcount, recvtype,
 978                                           src, system_tag, comm);
 979         index++;
 980       }
 981     }
 982     // Wait for completion of irecv's.
 983     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
 984     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 985     for(src = 0; src < size-1; src++) {
 986       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
 987     }
 988     xbt_free(requests);
 989   }
 990 }
 991
 992
 993 void smpi_mpi_reduce_scatter(void *sendbuf, void *recvbuf, int *recvcounts,
 994                        MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
 995 {
 996     int i, size, count;
 997     int *displs;
 998     int rank = smpi_process_index();
 999     void *tmpbuf;
1000
1001     /* arbitrarily choose root as rank 0 */
1002     size = smpi_comm_size(comm);
1003     count = 0;
1004     displs = xbt_new(int, size);
1005     for (i = 0; i < size; i++) {
1006       displs[i] = count;
1007       count += recvcounts[i];
1008     }
1009     tmpbuf=(void*)xbt_malloc(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1010     mpi_coll_reduce_fun(sendbuf, tmpbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1011     smpi_mpi_scatterv(tmpbuf, recvcounts, displs, datatype, recvbuf,
1012                       recvcounts[rank], datatype, 0, comm);
1013     xbt_free(displs);
1014     xbt_free(tmpbuf);
1015 }
1016
1017 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1018                       void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
1019                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1020 {
1021   int system_tag = COLL_TAG_GATHERV;
1022   int rank, size, src, index;
1023   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1024   MPI_Request *requests;
1025
1026   rank = smpi_comm_rank(comm);
1027   size = smpi_comm_size(comm);
1028   if(rank != root) {
1029     // Send buffer to root
1030     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1031   } else {
1032     // FIXME: check for errors
1033     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1034     // Local copy from root
1035     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1036                        (char *)recvbuf + displs[root] * recvext,
1037                        recvcounts[root], recvtype);
1038     // Receive buffers from senders
1039     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1040     index = 0;
1041     for(src = 0; src < size; src++) {
1042       if(src != root) {
1043         requests[index] =
1044           smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[src] * recvext,
1045                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
1046         index++;
1047       }
1048     }
1049     // Wait for completion of irecv's.
1050     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1051     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1052     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1053       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1054     }
1055     xbt_free(requests);
1056   }
1057 }
1058
1059 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount,
1060                         MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1061                         int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1062                         MPI_Comm comm)
1063 {
1064   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHER;
1065   int rank, size, other, index;
1066   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1067   MPI_Request *requests;
1068
1069   rank = smpi_comm_rank(comm);
1070   size = smpi_comm_size(comm);
1071   // FIXME: check for errors
1072   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1073   // Local copy from self
1074   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1075                      (char *)recvbuf + rank * recvcount * recvext, recvcount,
1076                      recvtype);
1077   // Send/Recv buffers to/from others;
1078   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1079   index = 0;
1080   for(other = 0; other < size; other++) {
1081     if(other != rank) {
1082       requests[index] =
1083         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1084                         comm);
1085       index++;
1086       requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + other * recvcount * recvext,
1087                                         recvcount, recvtype, other,
1088                                         system_tag, comm);
1089       index++;
1090     }
1091   }
1092   // Wait for completion of all comms.
1093   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1094   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1095   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1096     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1097   }
1098   xbt_free(requests);
1099 }
1100
1101 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount,
1102                          MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1103                          int *recvcounts, int *displs,
1104                          MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1105 {
1106   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHERV;
1107   int rank, size, other, index;
1108   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1109   MPI_Request *requests;
1110
1111   rank = smpi_comm_rank(comm);
1112   size = smpi_comm_size(comm);
1113   // FIXME: check for errors
1114   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1115   // Local copy from self
1116   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1117                      (char *)recvbuf + displs[rank] * recvext,
1118                      recvcounts[rank], recvtype);
1119   // Send buffers to others;
1120   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1121   index = 0;
1122   for(other = 0; other < size; other++) {
1123     if(other != rank) {
1124       requests[index] =
1125         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1126                         comm);
1127       index++;
1128       requests[index] =
1129         smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
1130                         recvtype, other, system_tag, comm);
1131       index++;
1132     }
1133   }
1134   // Wait for completion of all comms.
1135   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1136   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1137   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1138     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1139   }
1140   xbt_free(requests);
1141 }
1142
1143 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1144                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1145                       int root, MPI_Comm comm)
1146 {
1147   int system_tag = COLL_TAG_SCATTER;
1148   int rank, size, dst, index;
1149   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1150   MPI_Request *requests;
1151
1152   rank = smpi_comm_rank(comm);
1153   size = smpi_comm_size(comm);
1154   if(rank != root) {
1155     // Recv buffer from root
1156     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1157                   MPI_STATUS_IGNORE);
1158   } else {
1159     // FIXME: check for errors
1160     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1161     // Local copy from root
1162     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1163         smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + root * sendcount * sendext,
1164                            sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1165     }
1166     // Send buffers to receivers
1167     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1168     index = 0;
1169     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1170       if(dst != root) {
1171         requests[index] = smpi_isend_init((char *)sendbuf + dst * sendcount * sendext,
1172                                           sendcount, sendtype, dst,
1173                                           system_tag, comm);
1174         index++;
1175       }
1176     }
1177     // Wait for completion of isend's.
1178     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1179     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1180     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1181       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1182     }
1183     xbt_free(requests);
1184   }
1185 }
1186
1187 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs,
1188                        MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
1189                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1190 {
1191   int system_tag = COLL_TAG_SCATTERV;
1192   int rank, size, dst, index;
1193   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1194   MPI_Request *requests;
1195
1196   rank = smpi_comm_rank(comm);
1197   size = smpi_comm_size(comm);
1198   if(rank != root) {
1199     // Recv buffer from root
1200     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1201                   MPI_STATUS_IGNORE);
1202   } else {
1203     // FIXME: check for errors
1204     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1205     // Local copy from root
1206     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1207       smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
1208                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1209     }
1210     // Send buffers to receivers
1211     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1212     index = 0;
1213     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1214       if(dst != root) {
1215         requests[index] =
1216           smpi_isend_init((char *)sendbuf + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
1217                           sendtype, dst, system_tag, comm);
1218         index++;
1219       }
1220     }
1221     // Wait for completion of isend's.
1222     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1223     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1224     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1225       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1226     }
1227     xbt_free(requests);
1228   }
1229 }
1230
1231 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1232                      MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
1233                      MPI_Comm comm)
1234 {
1235   int system_tag = COLL_TAG_REDUCE;
1236   int rank, size, src, index;
1237   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1238   MPI_Request *requests;
1239   void **tmpbufs;
1240
1241
1242   char* sendtmpbuf = (char*) sendbuf;
1243   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1244     sendtmpbuf = (char *)xbt_malloc(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1245     smpi_datatype_copy(recvbuf, count, datatype,sendtmpbuf, count, datatype);
1246   }
1247
1248   rank = smpi_comm_rank(comm);
1249   size = smpi_comm_size(comm);
1250   //non commutative case, use a working algo from openmpi
1251   if(!smpi_op_is_commute(op)){
1252     smpi_coll_tuned_reduce_ompi_basic_linear(sendtmpbuf, recvbuf, count,
1253                      datatype, op, root, comm);
1254     return;
1255   }
1256
1257   if(rank != root) {
1258     // Send buffer to root
1259     smpi_mpi_send(sendtmpbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
1260   } else {
1261     // FIXME: check for errors
1262     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1263     // Local copy from root
1264     if (sendtmpbuf && recvbuf)
1265       smpi_datatype_copy(sendtmpbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1266     // Receive buffers from senders
1267     //TODO: make a MPI_barrier here ?
1268     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1269     tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
1270     index = 0;
1271     for(src = 0; src < size; src++) {
1272       if(src != root) {
1273         // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1274         //  mapping...
1275         tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1276         requests[index] =
1277           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src,
1278                           system_tag, comm);
1279         index++;
1280       }
1281     }
1282     // Wait for completion of irecv's.
1283     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1284     for(src = 0; src < size - 1; src++) {
1285       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1286       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
1287       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1288         break;
1289       }else{
1290         smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1291       }
1292       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
1293         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1294     }
1295     for(index = 0; index < size - 1; index++) {
1296       xbt_free(tmpbufs[index]);
1297     }
1298     xbt_free(tmpbufs);
1299     xbt_free(requests);
1300
1301     if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1302       xbt_free(sendtmpbuf);
1303     }
1304   }
1305 }
1306
1307 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1308                         MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1309 {
1310   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1311   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
1312 }
1313
1314 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1315                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1316 {
1317   int system_tag = -888;
1318   int rank, size, other, index;
1319   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1320   MPI_Request *requests;
1321   void **tmpbufs;
1322
1323   rank = smpi_comm_rank(comm);
1324   size = smpi_comm_size(comm);
1325
1326   // FIXME: check for errors
1327   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1328
1329   // Local copy from self
1330   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1331
1332   // Send/Recv buffers to/from others;
1333   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1334   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1335   index = 0;
1336   for(other = 0; other < rank; other++) {
1337     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1338     // mapping...
1339     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1340     requests[index] =
1341       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1342                       comm);
1343     index++;
1344   }
1345   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1346     requests[index] =
1347       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1348     index++;
1349   }
1350   // Wait for completion of all comms.
1351   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1352
1353   if(smpi_op_is_commute(op)){
1354     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1355       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1356       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1357         break;
1358       }
1359       if(index < rank) {
1360         // #Request is below rank: it's a irecv
1361         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1362       }
1363     }
1364   }else{
1365     //non commutative case, wait in order
1366     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1367       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1368       if(index < rank) {
1369         smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1370       }
1371     }
1372   }
1373   for(index = 0; index < rank; index++) {
1374     xbt_free(tmpbufs[index]);
1375   }
1376   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1377     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1378   }
1379   xbt_free(tmpbufs);
1380   xbt_free(requests);
1381 }
1382
1383 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1384                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1385 {
1386   int system_tag = -888;
1387   int rank, size, other, index;
1388   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1389   MPI_Request *requests;
1390   void **tmpbufs;
1391   int recvbuf_is_empty=1;
1392   rank = smpi_comm_rank(comm);
1393   size = smpi_comm_size(comm);
1394
1395   // FIXME: check for errors
1396   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1397
1398   // Send/Recv buffers to/from others;
1399   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1400   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1401   index = 0;
1402   for(other = 0; other < rank; other++) {
1403     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1404     // mapping...
1405     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1406     requests[index] =
1407       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1408                       comm);
1409     index++;
1410   }
1411   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1412     requests[index] =
1413       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1414     index++;
1415   }
1416   // Wait for completion of all comms.
1417   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1418   if(smpi_op_is_commute(op)){
1419     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1420       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1421       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1422         break;
1423       }
1424       if(index < rank) {
1425         if(recvbuf_is_empty){
1426           smpi_datatype_copy(tmpbufs[index], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1427           recvbuf_is_empty=0;
1428         }else
1429         // #Request is below rank: it's a irecv
1430         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1431       }
1432     }
1433   }else{
1434     //non commutative case, wait in order
1435     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1436       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1437       if(index < rank) {
1438           if(recvbuf_is_empty){
1439             smpi_datatype_copy(tmpbufs[other], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1440             recvbuf_is_empty=0;
1441           }else smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1442       }
1443     }
1444   }
1445   for(index = 0; index < rank; index++) {
1446     xbt_free(tmpbufs[index]);
1447   }
1448   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1449     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1450   }
1451   xbt_free(tmpbufs);
1452   xbt_free(requests);
1453 }