Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
fix bug waiting to happen and destroy some simulations or their results randomly...
[simgrid.git] / src / smpi / smpi_base.c
1 /* Copyright (c) 2007-2014. The SimGrid Team.
2  * All rights reserved.                                                     */
3
4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
6
7 #include "private.h"
8 #include "xbt/virtu.h"
9 #include "mc/mc.h"
10 #include "xbt/replay.h"
11 #include <errno.h>
12 #include "simix/smx_private.h"
13 #include "surf/surf.h"
14 #include "simgrid/sg_config.h"
15 #include "colls/colls.h"
16
17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
18
19
20 static int match_recv(void* a, void* b, smx_action_t ignored) {
21    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
22    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
23    XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
24
25   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
26   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
27   if((ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
28     && ((ref->tag == MPI_ANY_TAG && req->tag >=0) || req->tag == ref->tag)){
29     //we match, we can transfer some values
30     // FIXME : move this to the copy function ?
31     if(ref->src == MPI_ANY_SOURCE)ref->real_src = req->src;
32     if(ref->tag == MPI_ANY_TAG)ref->real_tag = req->tag;
33     if(ref->real_size < req->real_size) ref->truncated = 1;
34     if(req->detached==1){
35         ref->detached_sender=req; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
36     }
37     XBT_DEBUG("match succeeded");
38     return 1;
39   }else return 0;
40 }
41
42 static int match_send(void* a, void* b,smx_action_t ignored) {
43    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
44    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
45    XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
46    xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
47    xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
48
49    if((req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
50              && ((req->tag == MPI_ANY_TAG && ref->tag >=0)|| req->tag == ref->tag))
51    {
52      if(req->src == MPI_ANY_SOURCE)req->real_src = ref->src;
53      if(req->tag == MPI_ANY_TAG)req->real_tag = ref->tag;
54      if(req->real_size < ref->real_size) req->truncated = 1;
55      if(ref->detached==1){
56          req->detached_sender=ref; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
57      }
58     XBT_DEBUG("match succeeded");
59      return 1;
60    } else return 0;
61 }
62
63
64 typedef struct s_smpi_factor *smpi_factor_t;
65 typedef struct s_smpi_factor {
66   long factor;
67   int nb_values;
68   double values[4];//arbitrary set to 4
69 } s_smpi_factor_t;
70 xbt_dynar_t smpi_os_values = NULL;
71 xbt_dynar_t smpi_or_values = NULL;
72 xbt_dynar_t smpi_ois_values = NULL;
73
74 // Methods used to parse and store the values for timing injections in smpi
75 // These are taken from surf/network.c and generalized to have more factors
76 // These methods should be merged with those in surf/network.c (moved somewhere in xbt ?)
77
78 static int factor_cmp(const void *pa, const void *pb)
79 {
80   return (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor > ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? 1 :
81          (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor < ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? -1 : 0;
82 }
83
84
85 static xbt_dynar_t parse_factor(const char *smpi_coef_string)
86 {
87   char *value = NULL;
88   unsigned int iter = 0;
89   s_smpi_factor_t fact;
90   fact.nb_values=0;
91   int i=0;
92   xbt_dynar_t smpi_factor, radical_elements, radical_elements2 = NULL;
93
94   smpi_factor = xbt_dynar_new(sizeof(s_smpi_factor_t), NULL);
95   radical_elements = xbt_str_split(smpi_coef_string, ";");
96   xbt_dynar_foreach(radical_elements, iter, value) {
97     memset(&fact, 0, sizeof(s_smpi_factor_t));
98     radical_elements2 = xbt_str_split(value, ":");
99     if (xbt_dynar_length(radical_elements2) <2 || xbt_dynar_length(radical_elements2) > 5)
100       xbt_die("Malformed radical for smpi factor!");
101     for(i =0; i<xbt_dynar_length(radical_elements2);i++ ){
102         if (i==0){
103            fact.factor = atol(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
104         }else{
105            fact.values[fact.nb_values] = atof(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
106            fact.nb_values++;
107         }
108     }
109
110     xbt_dynar_push_as(smpi_factor, s_smpi_factor_t, fact);
111     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
112     xbt_dynar_free(&radical_elements2);
113   }
114   xbt_dynar_free(&radical_elements);
115   iter=0;
116   xbt_dynar_sort(smpi_factor, &factor_cmp);
117   xbt_dynar_foreach(smpi_factor, iter, fact) {
118     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
119   }
120   return smpi_factor;
121 }
122
123 static double smpi_os(double size)
124 {
125   if (!smpi_os_values) {
126     smpi_os_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/os"));
127     smpi_register_static(smpi_os_values, xbt_dynar_free_voidp);
128   }
129   unsigned int iter = 0;
130   s_smpi_factor_t fact;
131   double current=0.0;
132   xbt_dynar_foreach(smpi_os_values, iter, fact) {
133     if (size <= fact.factor) {
134         XBT_DEBUG("os : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
135       return current;
136     }else{
137       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
138     }
139   }
140   XBT_DEBUG("os : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
141
142   return current;
143 }
144
145 static double smpi_ois(double size)
146 {
147   if (!smpi_ois_values) {
148     smpi_ois_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/ois"));
149     smpi_register_static(smpi_ois_values, xbt_dynar_free_voidp);
150   }
151   unsigned int iter = 0;
152   s_smpi_factor_t fact;
153   double current=0.0;
154   xbt_dynar_foreach(smpi_ois_values, iter, fact) {
155     if (size <= fact.factor) {
156         XBT_DEBUG("ois : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
157       return current;
158     }else{
159       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
160     }
161   }
162   XBT_DEBUG("ois : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
163
164   return current;
165 }
166
167 static double smpi_or(double size)
168 {
169   if (!smpi_or_values) {
170     smpi_or_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/or"));
171     smpi_register_static(smpi_or_values, xbt_dynar_free_voidp);
172   }
173   unsigned int iter = 0;
174   s_smpi_factor_t fact;
175   double current=0.0;
176   xbt_dynar_foreach(smpi_or_values, iter, fact) {
177     if (size <= fact.factor) {
178         XBT_DEBUG("or : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
179       return current;
180     }else
181       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
182   }
183   XBT_DEBUG("or : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
184
185   return current;
186 }
187
188 static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
189                                  MPI_Datatype datatype, int src, int dst,
190                                  int tag, MPI_Comm comm, unsigned flags)
191 {
192   MPI_Request request = NULL;
193
194   void *old_buf = NULL;
195
196   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
197
198   s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
199
200   if(datatype->has_subtype == 1){
201     // This part handles the problem of non-contiguous memory
202     old_buf = buf;
203     buf = count==0 ? NULL : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
204     if (flags & SEND) {
205       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
206     }
207   }
208
209   request->buf = buf;
210   // This part handles the problem of non-contiguous memory (for the
211   // unserialisation at the reception)
212   request->old_buf = old_buf;
213   request->old_type = datatype;
214
215   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
216   request->src = src;
217   request->dst = dst;
218   request->tag = tag;
219   request->comm = comm;
220   request->action = NULL;
221   request->flags = flags;
222   request->detached = 0;
223   request->detached_sender = NULL;
224   request->real_src = 0;
225
226   request->truncated = 0;
227   request->real_size = 0;
228   request->real_tag = 0;
229
230   request->refcount=1;
231 #ifdef HAVE_TRACING
232   request->send = 0;
233   request->recv = 0;
234 #endif
235   if (flags & SEND) smpi_datatype_unuse(datatype);
236
237   return request;
238 }
239
240
241 void smpi_empty_status(MPI_Status * status)
242 {
243   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
244     status->MPI_SOURCE = MPI_ANY_SOURCE;
245     status->MPI_TAG = MPI_ANY_TAG;
246     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
247     status->count=0;
248   }
249 }
250
251 void smpi_action_trace_run(char *path)
252 {
253   char *name;
254   xbt_dynar_t todo;
255   xbt_dict_cursor_t cursor;
256
257   action_fp=NULL;
258   if (path) {
259     action_fp = fopen(path, "r");
260     xbt_assert(action_fp != NULL, "Cannot open %s: %s", path,
261                strerror(errno));
262   }
263
264   if (!xbt_dict_is_empty(action_queues)) {
265     XBT_WARN
266       ("Not all actions got consumed. If the simulation ended successfully (without deadlock), you may want to add new processes to your deployment file.");
267
268
269     xbt_dict_foreach(action_queues, cursor, name, todo) {
270       XBT_WARN("Still %lu actions for %s", xbt_dynar_length(todo), name);
271     }
272   }
273
274   if (path)
275     fclose(action_fp);
276   xbt_dict_free(&action_queues);
277   action_queues = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
278 }
279
280 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
281 {
282   MPI_Request req = request;
283   smpi_mpi_request_free(&req);
284 }
285
286 /* MPI Low level calls */
287 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
288                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
289 {
290   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
291   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
292                           comm, PERSISTENT | SEND | PREPARED);
293   request->refcount++;
294   return request;
295 }
296
297 MPI_Request smpi_mpi_ssend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
298                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
299 {
300   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
301   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
302                           comm, PERSISTENT | SSEND | SEND | PREPARED);
303   request->refcount++;
304   return request;
305 }
306
307 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
308                                int src, int tag, MPI_Comm comm)
309 {
310   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
311   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
312                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
313   request->refcount++;
314   return request;
315 }
316
317 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
318 {
319   smx_rdv_t mailbox;
320
321   xbt_assert(!request->action, "Cannot (re)start a non-finished communication");
322   request->flags &= ~PREPARED;
323   if (request->flags & RECV) {
324     print_request("New recv", request);
325     //FIXME: if receive is posted with a large size, but send is smaller, mailboxes may not match !
326     if (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres"))
327       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
328     else
329       mailbox = smpi_process_mailbox();
330     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
331     request->real_size=request->size;
332     smpi_datatype_use(request->old_type);
333     smpi_comm_use(request->comm);
334     request->action = simcall_comm_irecv(mailbox, request->buf,
335                                          &request->real_size, &match_recv,
336                                          request, -1.0);
337
338     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
339     double sleeptime = request->detached ? smpi_or(request->size) : 0.0;
340     if(sleeptime!=0.0){
341         simcall_process_sleep(sleeptime);
342         XBT_DEBUG("receiving size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_or(request->size));
343     }
344
345   } else {
346
347
348     int receiver = request->dst;//smpi_group_index(smpi_comm_group(request->comm), request->dst);
349
350     #ifdef HAVE_TRACING
351       int rank = smpi_process_index();
352       if (TRACE_smpi_view_internals()) {
353         TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver,request->size);
354       }
355     #endif
356 /*    if(receiver == MPI_UNDEFINED) {*/
357 /*      XBT_WARN("Trying to send a message to a wrong rank");*/
358 /*      return;*/
359 /*    }*/
360     print_request("New send", request);
361     if (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
362       mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
363     }else{
364       XBT_DEBUG("Send request %p is not in the permanent receive mailbox (buf: %p)",request,request->buf);
365       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
366     }
367     if ( (! (request->flags & SSEND)) && (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/send_is_detached_thres"))) {
368       void *oldbuf = NULL;
369       request->detached = 1;
370       request->refcount++;
371       if(request->old_type->has_subtype == 0){
372         oldbuf = request->buf;
373         if (oldbuf && request->size!=0){
374           request->buf = xbt_malloc(request->size);
375           memcpy(request->buf,oldbuf,request->size);
376         }
377       }
378       XBT_DEBUG("Send request %p is detached; buf %p copied into %p",request,oldbuf,request->buf);
379     }
380
381     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
382     request->real_size=request->size;
383     smpi_datatype_use(request->old_type);
384     smpi_comm_use(request->comm);
385
386     //if we are giving back the control to the user without waiting for completion, we have to inject timings
387     double sleeptime =0.0;
388     if(request->detached || (request->flags & (ISEND|SSEND))){// issend should be treated as isend
389       //isend and send timings may be different
390       sleeptime = (request->flags & ISEND)? smpi_ois(request->size) : smpi_os(request->size);
391     }
392
393     if(sleeptime!=0.0){
394         simcall_process_sleep(sleeptime);
395         XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_os(request->size));
396     }
397
398     request->action =
399       simcall_comm_isend(mailbox, request->size, -1.0,
400                          request->buf, request->real_size,
401                          &match_send,
402                          &xbt_free, // how to free the userdata if a detached send fails
403                          request,
404                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
405                          request->detached);
406
407 #ifdef HAVE_TRACING
408     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == NULL) */
409     if (request->action)
410       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
411
412 #endif
413
414   }
415
416 }
417
418 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
419 {
420   int i;
421   if(requests==NULL) return;
422
423   for(i = 0; i < count; i++) {
424     smpi_mpi_start(requests[i]);
425   }
426 }
427
428 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
429 {
430   if((*request) != MPI_REQUEST_NULL){
431     (*request)->refcount--;
432     if((*request)->refcount<0) xbt_die("wrong refcount");
433
434     if((*request)->refcount==0){
435         print_request("Destroying", (*request));
436         xbt_free(*request);
437         *request = MPI_REQUEST_NULL;
438     }else{
439         print_request("Decrementing", (*request));
440
441     }
442   }else{
443       xbt_die("freeing an already free request");
444   }
445 }
446
447 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
448                             int dst, int tag, MPI_Comm comm)
449 {
450   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
451   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
452                           comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
453   return request;
454 }
455
456 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
457                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
458 {
459   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
460   request =  build_request(buf==MPI_BOTTOM?(void*)0:buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
461                            comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND);
462   smpi_mpi_start(request);
463   return request;
464 }
465
466 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
467                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
468 {
469   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
470   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
471                           comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SSEND | SEND);
472   smpi_mpi_start(request);
473   return request;
474 }
475
476
477
478 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
479                             int src, int tag, MPI_Comm comm)
480 {
481   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
482   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
483                           comm, NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED);
484   return request;
485 }
486
487 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
488                            int src, int tag, MPI_Comm comm)
489 {
490   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
491   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
492                           comm, NON_PERSISTENT | RECV);
493   smpi_mpi_start(request);
494   return request;
495 }
496
497 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src,
498                    int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
499 {
500   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
501   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
502   smpi_mpi_wait(&request, status);
503   request = NULL;
504 }
505
506
507
508 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst,
509                    int tag, MPI_Comm comm)
510 {
511   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
512   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
513                           comm, NON_PERSISTENT | SEND);
514
515   smpi_mpi_start(request);
516   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
517   request = NULL;
518 }
519
520 void smpi_mpi_ssend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
521                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
522 {
523   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
524   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
525                 comm, NON_PERSISTENT | SSEND | SEND);
526
527   smpi_mpi_start(request);
528   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
529   request = NULL;
530 }
531
532 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
533                        int dst, int sendtag, void *recvbuf, int recvcount,
534                        MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
535                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
536 {
537   MPI_Request requests[2];
538   MPI_Status stats[2];
539   int myid=smpi_process_index();
540   if ((smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst) == myid) && (smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src) == myid)) {
541       smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
542                                      recvbuf, recvcount, recvtype);
543       return;
544   }
545   requests[0] =
546     smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
547   requests[1] =
548     smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
549   smpi_mpi_startall(2, requests);
550   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
551   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
552     // Copy receive status
553     *status = stats[1];
554   }
555 }
556
557 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
558 {
559   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
560 }
561
562 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
563 {
564   MPI_Request req = *request;
565   smpi_empty_status(status);
566
567   if(!(req->detached && req->flags & SEND) && !(req->flags & PREPARED)){
568     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
569       int src = req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src;
570       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(req->comm), src);
571       status->MPI_TAG = req->tag == MPI_ANY_TAG ? req->real_tag : req->tag;
572       status->MPI_ERROR = req->truncated ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
573       // this handles the case were size in receive differs from size in send
574       // FIXME: really this should just contain the count of receive-type blocks,
575       // right?
576       status->count = req->real_size;
577     }
578
579     print_request("Finishing", req);
580     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
581
582     if(datatype->has_subtype == 1){
583       // This part handles the problem of non-contignous memory
584       // the unserialization at the reception
585       s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
586       if(req->flags & RECV) {
587         subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct);
588       }
589       if(req->detached == 0) free(req->buf);
590     }
591     smpi_comm_unuse(req->comm);
592     smpi_datatype_unuse(datatype);
593
594   }
595
596 #ifdef HAVE_TRACING
597   if (TRACE_smpi_view_internals()) {
598     if(req->flags & RECV){
599       int rank = smpi_process_index();
600       int src_traced = (req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src);
601       TRACE_smpi_recv(rank, src_traced, rank);
602     }
603   }
604 #endif
605
606   if(req->detached_sender!=NULL){
607     smpi_mpi_request_free(&(req->detached_sender));
608   }
609
610   if(req->flags & NON_PERSISTENT) {
611     smpi_mpi_request_free(request);
612   } else {
613     req->action = NULL;
614   }
615 }
616
617 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
618   int flag;
619
620   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
621   smpi_empty_status(status);
622   flag = 1;
623   if (!((*request)->flags & PREPARED)) {
624     if ((*request)->action != NULL)
625       flag = simcall_comm_test((*request)->action);
626     if (flag) {
627       finish_wait(request, status);
628       *request = MPI_REQUEST_NULL;
629     }
630   }
631   return flag;
632 }
633
634 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
635                      MPI_Status * status)
636 {
637   xbt_dynar_t comms;
638   int i, flag, size;
639   int* map;
640
641   *index = MPI_UNDEFINED;
642   flag = 0;
643   comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
644   map = xbt_new(int, count);
645   size = 0;
646   for(i = 0; i < count; i++) {
647     if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action &&
648         !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
649        xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
650        map[size] = i;
651        size++;
652     }
653   }
654   if(size > 0) {
655     i = simcall_comm_testany(comms);
656     // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
657     if(i != -1) {
658       *index = map[i];
659       finish_wait(&requests[*index], status);
660       requests[*index] = MPI_REQUEST_NULL;
661       flag = 1;
662     }
663   }else{
664       //all requests are null or inactive, return true
665       flag=1;
666       smpi_empty_status(status);
667   }
668   xbt_free(map);
669   xbt_dynar_free(&comms);
670
671   return flag;
672 }
673
674
675 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[],
676                      MPI_Status status[])
677 {
678   MPI_Status stat;
679   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
680   int flag=1;
681   int i;
682   for(i=0; i<count; i++){
683     if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
684       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
685         flag=0;
686       }else{
687           requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
688       }
689     }else{
690       smpi_empty_status(pstat);
691     }
692     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
693       status[i] = *pstat;
694     }
695   }
696   return flag;
697 }
698
699 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
700   int flag=0;
701   //FIXME find another wait to avoid busy waiting ?
702   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
703   while(flag==0){
704     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
705     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
706   }
707 }
708
709 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
710
711   MPI_Request request =build_request(NULL, 0, MPI_CHAR, source == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), source), smpi_comm_rank(comm), tag,
712             comm, NON_PERSISTENT | RECV);
713
714   //to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
715   double sleeptime= sg_cfg_get_double("smpi/iprobe");
716   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
717   static int nsleeps = 1;
718
719   simcall_process_sleep(sleeptime);
720
721   // behave like a receive, but don't do it
722   smx_rdv_t mailbox;
723
724   print_request("New iprobe", request);
725   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
726     if (sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")>0){
727         mailbox = smpi_process_mailbox_small();
728         XBT_DEBUG("trying to probe the perm recv mailbox");
729         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
730     }
731     if (request->action==NULL){
732         mailbox = smpi_process_mailbox();
733         XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
734         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
735     }
736
737   if(request->action){
738     MPI_Request req = (MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data(request->action);
739     *flag = 1;
740     if(status != MPI_STATUS_IGNORE && !(req->flags & PREPARED)) {
741       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(comm), req->src);
742       status->MPI_TAG = req->tag;
743       status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
744       status->count = req->real_size;
745     }
746     nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
747   }
748   else {
749       *flag = 0;
750       nsleeps++;
751   }
752   smpi_mpi_request_free(&request);
753
754   return;
755 }
756
757 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
758 {
759   print_request("Waiting", *request);
760   if ((*request)->flags & PREPARED) {
761     smpi_empty_status(status);
762     return;
763   }
764
765   if ((*request)->action != NULL) { // this is not a detached send
766     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
767 #ifdef HAVE_MC
768   if(MC_is_active())
769     (*request)->action->comm.dst_data = NULL; // dangling pointer : dst_data is freed with a wait, need to set it to NULL for system state comparison
770 #endif
771   }
772
773   finish_wait(request, status);
774   *request = MPI_REQUEST_NULL;
775   // FIXME for a detached send, finish_wait is not called:
776 }
777
778 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[],
779                      MPI_Status * status)
780 {
781   xbt_dynar_t comms;
782   int i, size, index;
783   int *map;
784
785   index = MPI_UNDEFINED;
786   if(count > 0) {
787     // Wait for a request to complete
788     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
789     map = xbt_new(int, count);
790     size = 0;
791     XBT_DEBUG("Wait for one of %d", count);
792     for(i = 0; i < count; i++) {
793       if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
794         if (requests[i]->action != NULL) {
795           XBT_DEBUG("Waiting any %p ", requests[i]);
796           xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
797           map[size] = i;
798           size++;
799         }else{
800          //This is a finished detached request, let's return this one
801          size=0;//so we free the dynar but don't do the waitany call
802          index=i;
803          finish_wait(&requests[i], status);//cleanup if refcount = 0
804          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;//set to null
805          break;
806          }
807       }
808     }
809     if(size > 0) {
810       i = simcall_comm_waitany(comms);
811
812       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
813       if (i != -1) {
814         index = map[i];
815         finish_wait(&requests[index], status);
816         requests[index] = MPI_REQUEST_NULL;
817       }
818     }
819     xbt_free(map);
820     xbt_dynar_free(&comms);
821   }
822
823   if (index==MPI_UNDEFINED)
824     smpi_empty_status(status);
825
826   return index;
827 }
828
829 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[],
830                       MPI_Status status[])
831 {
832   int  index, c;
833   MPI_Status stat;
834   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
835   int retvalue = MPI_SUCCESS;
836   //tag invalid requests in the set
837   if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
838     for (c = 0; c < count; c++) {
839       if (requests[c] == MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL ||
840           (requests[c]->flags & PREPARED)) {
841         smpi_empty_status(&status[c]);
842       } else if (requests[c]->src == MPI_PROC_NULL) {
843         smpi_empty_status(&status[c]);
844         status[c].MPI_SOURCE = MPI_PROC_NULL;
845       }
846     }
847   }
848   for(c = 0; c < count; c++) {
849     if (MC_is_active()) {
850       smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
851       index = c;
852     } else {
853       index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
854       if (index == MPI_UNDEFINED)
855         break;
856       requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
857     }
858     if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
859       status[index] = *pstat;
860       if (status[index].MPI_ERROR == MPI_ERR_TRUNCATE)
861         retvalue = MPI_ERR_IN_STATUS;
862     }
863   }
864
865   return retvalue;
866 }
867
868 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
869                       MPI_Status status[])
870 {
871   int i, count, index;
872   MPI_Status stat;
873   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
874
875   count = 0;
876   for(i = 0; i < incount; i++)
877   {
878     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
879     if(index!=MPI_UNDEFINED){
880       indices[count] = index;
881       count++;
882       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
883         status[index] = *pstat;
884       }
885      requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
886     }else{
887       return MPI_UNDEFINED;
888     }
889   }
890   return count;
891 }
892
893 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
894                       MPI_Status status[])
895 {
896   int i, count, count_dead;
897   MPI_Status stat;
898   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
899
900   count = 0;
901   count_dead = 0;
902   for(i = 0; i < incount; i++) {
903     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
904       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
905          indices[i] = 1;
906          count++;
907          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
908            status[i] = *pstat;
909          }
910          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
911
912       }
913     }else{
914       count_dead++;
915     }
916   }
917   if(count_dead==incount)return MPI_UNDEFINED;
918   else return count;
919 }
920
921 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root,
922                     MPI_Comm comm)
923 {
924   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
925   nary_tree_bcast(buf, count, datatype, root, comm, 4);
926 }
927
928 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
929 {
930   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
931   nary_tree_barrier(comm, 4);
932 }
933
934 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
935                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
936                      int root, MPI_Comm comm)
937 {
938   int system_tag = COLL_TAG_GATHER;
939   int rank, size, src, index;
940   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
941   MPI_Request *requests;
942
943   rank = smpi_comm_rank(comm);
944   size = smpi_comm_size(comm);
945   if(rank != root) {
946     // Send buffer to root
947     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
948   } else {
949     // FIXME: check for errors
950     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
951     // Local copy from root
952     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
953                        (char *)recvbuf + root * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
954     // Receive buffers from senders
955     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
956     index = 0;
957     for(src = 0; src < size; src++) {
958       if(src != root) {
959         requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + src * recvcount * recvext,
960                                           recvcount, recvtype,
961                                           src, system_tag, comm);
962         index++;
963       }
964     }
965     // Wait for completion of irecv's.
966     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
967     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
968     xbt_free(requests);
969   }
970 }
971
972
973 void smpi_mpi_reduce_scatter(void *sendbuf, void *recvbuf, int *recvcounts,
974                        MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
975 {
976     int i, size, count;
977     int *displs;
978     int rank = smpi_process_index();
979     void *tmpbuf;
980
981     /* arbitrarily choose root as rank 0 */
982     size = smpi_comm_size(comm);
983     count = 0;
984     displs = xbt_new(int, size);
985     for (i = 0; i < size; i++) {
986       displs[i] = count;
987       count += recvcounts[i];
988     }
989     tmpbuf=(void*)xbt_malloc(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
990     mpi_coll_reduce_fun(sendbuf, tmpbuf, count, datatype, op, 0, comm);
991     smpi_mpi_scatterv(tmpbuf, recvcounts, displs, datatype, recvbuf,
992                       recvcounts[rank], datatype, 0, comm);
993     xbt_free(displs);
994     xbt_free(tmpbuf);
995 }
996
997 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
998                       void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
999                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1000 {
1001   int system_tag = COLL_TAG_GATHERV;
1002   int rank, size, src, index;
1003   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1004   MPI_Request *requests;
1005
1006   rank = smpi_comm_rank(comm);
1007   size = smpi_comm_size(comm);
1008   if(rank != root) {
1009     // Send buffer to root
1010     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1011   } else {
1012     // FIXME: check for errors
1013     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1014     // Local copy from root
1015     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1016                        (char *)recvbuf + displs[root] * recvext,
1017                        recvcounts[root], recvtype);
1018     // Receive buffers from senders
1019     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1020     index = 0;
1021     for(src = 0; src < size; src++) {
1022       if(src != root) {
1023         requests[index] =
1024           smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[src] * recvext,
1025                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
1026         index++;
1027       }
1028     }
1029     // Wait for completion of irecv's.
1030     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1031     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1032     xbt_free(requests);
1033   }
1034 }
1035
1036 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount,
1037                         MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1038                         int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1039                         MPI_Comm comm)
1040 {
1041   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHER;
1042   int rank, size, other, index;
1043   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1044   MPI_Request *requests;
1045
1046   rank = smpi_comm_rank(comm);
1047   size = smpi_comm_size(comm);
1048   // FIXME: check for errors
1049   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1050   // Local copy from self
1051   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1052                      (char *)recvbuf + rank * recvcount * recvext, recvcount,
1053                      recvtype);
1054   // Send/Recv buffers to/from others;
1055   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1056   index = 0;
1057   for(other = 0; other < size; other++) {
1058     if(other != rank) {
1059       requests[index] =
1060         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1061                         comm);
1062       index++;
1063       requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + other * recvcount * recvext,
1064                                         recvcount, recvtype, other,
1065                                         system_tag, comm);
1066       index++;
1067     }
1068   }
1069   // Wait for completion of all comms.
1070   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1071   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1072   xbt_free(requests);
1073 }
1074
1075 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount,
1076                          MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1077                          int *recvcounts, int *displs,
1078                          MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1079 {
1080   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHERV;
1081   int rank, size, other, index;
1082   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1083   MPI_Request *requests;
1084
1085   rank = smpi_comm_rank(comm);
1086   size = smpi_comm_size(comm);
1087   // FIXME: check for errors
1088   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1089   // Local copy from self
1090   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1091                      (char *)recvbuf + displs[rank] * recvext,
1092                      recvcounts[rank], recvtype);
1093   // Send buffers to others;
1094   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1095   index = 0;
1096   for(other = 0; other < size; other++) {
1097     if(other != rank) {
1098       requests[index] =
1099         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1100                         comm);
1101       index++;
1102       requests[index] =
1103         smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
1104                         recvtype, other, system_tag, comm);
1105       index++;
1106     }
1107   }
1108   // Wait for completion of all comms.
1109   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1110   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1111   xbt_free(requests);
1112 }
1113
1114 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1115                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1116                       int root, MPI_Comm comm)
1117 {
1118   int system_tag = COLL_TAG_SCATTER;
1119   int rank, size, dst, index;
1120   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1121   MPI_Request *requests;
1122
1123   rank = smpi_comm_rank(comm);
1124   size = smpi_comm_size(comm);
1125   if(rank != root) {
1126     // Recv buffer from root
1127     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1128                   MPI_STATUS_IGNORE);
1129   } else {
1130     // FIXME: check for errors
1131     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1132     // Local copy from root
1133     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1134         smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + root * sendcount * sendext,
1135                            sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1136     }
1137     // Send buffers to receivers
1138     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1139     index = 0;
1140     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1141       if(dst != root) {
1142         requests[index] = smpi_isend_init((char *)sendbuf + dst * sendcount * sendext,
1143                                           sendcount, sendtype, dst,
1144                                           system_tag, comm);
1145         index++;
1146       }
1147     }
1148     // Wait for completion of isend's.
1149     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1150     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1151     xbt_free(requests);
1152   }
1153 }
1154
1155 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs,
1156                        MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
1157                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1158 {
1159   int system_tag = COLL_TAG_SCATTERV;
1160   int rank, size, dst, index;
1161   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1162   MPI_Request *requests;
1163
1164   rank = smpi_comm_rank(comm);
1165   size = smpi_comm_size(comm);
1166   if(rank != root) {
1167     // Recv buffer from root
1168     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1169                   MPI_STATUS_IGNORE);
1170   } else {
1171     // FIXME: check for errors
1172     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1173     // Local copy from root
1174     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1175       smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
1176                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1177     }
1178     // Send buffers to receivers
1179     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1180     index = 0;
1181     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1182       if(dst != root) {
1183         requests[index] =
1184           smpi_isend_init((char *)sendbuf + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
1185                           sendtype, dst, system_tag, comm);
1186         index++;
1187       }
1188     }
1189     // Wait for completion of isend's.
1190     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1191     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1192     xbt_free(requests);
1193   }
1194 }
1195
1196 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1197                      MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
1198                      MPI_Comm comm)
1199 {
1200   int system_tag = COLL_TAG_REDUCE;
1201   int rank, size, src, index;
1202   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1203   MPI_Request *requests;
1204   void **tmpbufs;
1205
1206
1207   char* sendtmpbuf = (char*) sendbuf;
1208   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1209     sendtmpbuf = (char *)xbt_malloc(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1210     smpi_datatype_copy(recvbuf, count, datatype,sendtmpbuf, count, datatype);
1211   }
1212
1213   rank = smpi_comm_rank(comm);
1214   size = smpi_comm_size(comm);
1215   //non commutative case, use a working algo from openmpi
1216   if(!smpi_op_is_commute(op)){
1217     smpi_coll_tuned_reduce_ompi_basic_linear(sendtmpbuf, recvbuf, count,
1218                      datatype, op, root, comm);
1219     return;
1220   }
1221   
1222   if(rank != root) {
1223     // Send buffer to root
1224     smpi_mpi_send(sendtmpbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
1225   } else {
1226     // FIXME: check for errors
1227     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1228     // Local copy from root
1229     if (sendtmpbuf && recvbuf)
1230       smpi_datatype_copy(sendtmpbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1231     // Receive buffers from senders
1232     //TODO: make a MPI_barrier here ?
1233     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1234     tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
1235     index = 0;
1236     for(src = 0; src < size; src++) {
1237       if(src != root) {
1238         // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1239         //  mapping...
1240         tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1241         requests[index] =
1242           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src,
1243                           system_tag, comm);
1244         index++;
1245       }
1246     }
1247     // Wait for completion of irecv's.
1248     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1249     for(src = 0; src < size - 1; src++) {
1250       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1251       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
1252       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1253         break;
1254       }
1255       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
1256         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1257     }
1258     for(index = 0; index < size - 1; index++) {
1259       xbt_free(tmpbufs[index]);
1260     }
1261     xbt_free(tmpbufs);
1262     xbt_free(requests);
1263
1264     if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1265       xbt_free(sendtmpbuf);
1266     }
1267   }
1268 }
1269
1270 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1271                         MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1272 {
1273   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1274   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
1275 }
1276
1277 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1278                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1279 {
1280   int system_tag = -888;
1281   int rank, size, other, index;
1282   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1283   MPI_Request *requests;
1284   void **tmpbufs;
1285
1286   rank = smpi_comm_rank(comm);
1287   size = smpi_comm_size(comm);
1288
1289   // FIXME: check for errors
1290   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1291
1292   // Local copy from self
1293   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1294
1295   // Send/Recv buffers to/from others;
1296   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1297   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1298   index = 0;
1299   for(other = 0; other < rank; other++) {
1300     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1301     // mapping...
1302     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1303     requests[index] =
1304       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1305                       comm);
1306     index++;
1307   }
1308   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1309     requests[index] =
1310       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1311     index++;
1312   }
1313   // Wait for completion of all comms.
1314   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1315
1316   if(smpi_op_is_commute(op)){
1317     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1318       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1319       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1320         break;
1321       }
1322       if(index < rank) {
1323         // #Request is below rank: it's a irecv
1324         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1325       }
1326     }
1327   }else{
1328     //non commutative case, wait in order
1329     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1330       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1331       if(index < rank) {
1332         smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1333       }
1334     }
1335   }
1336   for(index = 0; index < rank; index++) {
1337     xbt_free(tmpbufs[index]);
1338   }
1339   xbt_free(tmpbufs);
1340   xbt_free(requests);
1341 }
1342
1343 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1344                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1345 {
1346   int system_tag = -888;
1347   int rank, size, other, index;
1348   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1349   MPI_Request *requests;
1350   void **tmpbufs;
1351   int recvbuf_is_empty=1;
1352   rank = smpi_comm_rank(comm);
1353   size = smpi_comm_size(comm);
1354
1355   // FIXME: check for errors
1356   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1357
1358   // Send/Recv buffers to/from others;
1359   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1360   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1361   index = 0;
1362   for(other = 0; other < rank; other++) {
1363     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1364     // mapping...
1365     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1366     requests[index] =
1367       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1368                       comm);
1369     index++;
1370   }
1371   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1372     requests[index] =
1373       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1374     index++;
1375   }
1376   // Wait for completion of all comms.
1377   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1378   if(smpi_op_is_commute(op)){
1379     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1380       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1381       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1382         break;
1383       }
1384       if(index < rank) {
1385         if(recvbuf_is_empty){
1386           smpi_datatype_copy(tmpbufs[index], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1387           recvbuf_is_empty=0;
1388         }else
1389         // #Request is below rank: it's a irecv
1390         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1391       }
1392     }
1393   }else{
1394     //non commutative case, wait in order
1395     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1396       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1397       if(index < rank) {
1398           if(recvbuf_is_empty){
1399             smpi_datatype_copy(tmpbufs[other], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1400             recvbuf_is_empty=0;
1401           }else smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1402       }
1403     }
1404   }
1405   for(index = 0; index < rank; index++) {
1406     xbt_free(tmpbufs[index]);
1407   }
1408   xbt_free(tmpbufs);
1409   xbt_free(requests);
1410 }