src/simdag/sd_daxloader.c

   1 /* Copyright (c) 2009, 2010. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "simdag/simdag.h"
   9 #include "xbt/misc.h"
  10 #include "xbt/log.h"
  11 #include <libgen.h>
  12
  13 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(sd_daxparse, sd, "Parsing DAX files");
  14
  15 #undef CLEANUP
  16 #include "dax_dtd.h"
  17 #include "dax_dtd.c"
  18
  19 bool children_are_marked(SD_task_t task);
  20 bool parents_are_marked(SD_task_t task);
  21
  22 /* Parsing helpers */
  23 static void dax_parse_error(char *msg)
  24 {
  25   fprintf(stderr, "Parse error on line %d: %s\n", dax_lineno, msg);
  26   xbt_abort();
  27 }
  28
  29 static double dax_parse_double(const char *string)
  30 {
  31   int ret = 0;
  32   double value;
  33
  34   ret = sscanf(string, "%lg", &value);
  35   if (ret != 1)
  36     dax_parse_error(bprintf("%s is not a double", string));
  37   return value;
  38 }
  39
  40 static int dax_parse_int(const char *string)
  41 {
  42   int ret = 0;
  43   int value;
  44
  45   ret = sscanf(string, "%d", &value);
  46   if (ret != 1)
  47     dax_parse_error(bprintf("%s is not an integer", string));
  48   return value;
  49 }
  50
  51 /* Ensure that transfer tasks have unique names even though a file is used
  52  * several times */
  53
  54 void uniq_transfer_task_name(SD_task_t task)
  55 {
  56   SD_task_t child, parent;
  57   xbt_dynar_t children, parents;
  58   char *new_name;
  59
  60   children = SD_task_get_children(task);
  61   parents = SD_task_get_parents(task);
  62
  63   xbt_dynar_get_cpy(children, 0, &child);
  64   xbt_dynar_get_cpy(parents, 0, &parent);
  65
  66   new_name = bprintf("%s_%s_%s",
  67                      SD_task_get_name(parent),
  68                      SD_task_get_name(task), SD_task_get_name(child));
  69
  70   SD_task_set_name(task, new_name);
  71
  72   xbt_dynar_free_container(&children);
  73   xbt_dynar_free_container(&parents);
  74   free(new_name);
  75 }
  76
  77 bool children_are_marked(SD_task_t task){
  78   SD_task_t child_task = NULL;
  79   bool all_marked = true;
  80   SD_dependency_t depafter = NULL;
  81   unsigned int count;
  82   xbt_dynar_foreach(task->tasks_after,count,depafter){
  83     child_task = depafter->dst;
  84     //test marked
  85     if(child_task->marked == 0) {
  86       all_marked = false;
  87       break;
  88     }
  89     child_task = NULL;
  90   }
  91   return all_marked;
  92 }
  93
  94 bool parents_are_marked(SD_task_t task){
  95   SD_task_t parent_task = NULL;
  96   bool all_marked = true;
  97   SD_dependency_t depbefore = NULL;
  98   unsigned int count;
  99   xbt_dynar_foreach(task->tasks_before,count,depbefore){
 100     parent_task = depbefore->src;
 101     //test marked
 102     if(parent_task->marked == 0) {
 103       all_marked = false;
 104       break;
 105     }
 106     parent_task = NULL;
 107   }
 108   return all_marked;
 109 }
 110
 111 bool acyclic_graph_detail(xbt_dynar_t dag){
 112   unsigned int count=0, count_current=0;
 113   bool all_marked = true;
 114   SD_task_t task = NULL, parent_task = NULL, child_task = NULL;
 115   SD_dependency_t depbefore = NULL, depafter = NULL;
 116   xbt_dynar_t next = NULL, current = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 117
 118   xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 119     if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 120     task->marked = 0;
 121     if(xbt_dynar_is_empty(task->tasks_after)){
 122       xbt_dynar_push(current, &task);
 123     }
 124   }
 125   task = NULL;
 126   count = 0;
 127   //test if something has to be done for the next iteration
 128   while(!xbt_dynar_is_empty(current)){
 129     next = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 130     //test if the current iteration is done
 131     count_current=0;
 132     xbt_dynar_foreach(current,count_current,task){
 133       if (task == NULL) continue;
 134       count = 0;
 135       //push task in next
 136       task->marked = 1;
 137       count = 0;
 138       xbt_dynar_foreach(task->tasks_before,count,depbefore){
 139         parent_task = depbefore->src;
 140         if(parent_task->kind == SD_TASK_COMM_E2E){
 141           unsigned int j=0;
 142           parent_task->marked = 1;
 143           SD_task_t parent_task_2 = NULL;
 144           xbt_dynar_foreach(parent_task->tasks_before,j,depbefore){
 145             parent_task_2 = depbefore->src;
 146             if(children_are_marked(parent_task_2))
 147               xbt_dynar_push(next, &parent_task_2);
 148           }
 149         } else{
 150           if(children_are_marked(parent_task))
 151             xbt_dynar_push(next, &parent_task);
 152         }
 153         parent_task = NULL;
 154       }
 155       task = NULL;
 156       count = 0;
 157     }
 158     xbt_dynar_free(&current);
 159     current = next;
 160     next = NULL;
 161   }
 162   xbt_dynar_free(&current);
 163   current = NULL;
 164   all_marked = true;
 165   xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 166     if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 167     //test if all tasks are marked
 168     if(task->marked == 0){
 169       XBT_WARN("the task %s is not marked",task->name);
 170       all_marked = false;
 171       break;
 172     }
 173   }
 174   task = NULL;
 175   if(!all_marked){
 176     XBT_VERB("there is at least one cycle in your task graph");
 177
 178     current = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 179     xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 180       if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 181       if(xbt_dynar_is_empty(task->tasks_before)){
 182         xbt_dynar_push(current, &task);
 183       }
 184     }
 185
 186     count = 0;
 187     task = NULL;
 188     xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 189       if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 190       if(xbt_dynar_is_empty(task->tasks_before)){
 191         task->marked = 1;
 192         xbt_dynar_push(current, &task);
 193       }
 194     }
 195     task = NULL;
 196     count = 0;
 197     //test if something has to be done for the next iteration
 198     while(!xbt_dynar_is_empty(current)){
 199       next = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t),NULL);
 200       //test if the current iteration is done
 201       count_current=0;
 202       xbt_dynar_foreach(current,count_current,task){
 203         if (task == NULL) continue;
 204         count = 0;
 205         //push task in next
 206         task->marked = 1;
 207         count = 0;
 208         xbt_dynar_foreach(task->tasks_after,count,depafter){
 209           child_task = depbefore->dst;
 210           if(child_task->kind == SD_TASK_COMM_E2E){
 211             unsigned int j=0;
 212             child_task->marked = 1;
 213             SD_task_t child_task_2 = NULL;
 214             xbt_dynar_foreach(child_task->tasks_after,j,depafter){
 215               child_task_2 = depbefore->dst;
 216               if(parents_are_marked(child_task_2))
 217                 xbt_dynar_push(next, &child_task_2);
 218             }
 219           } else{
 220             if(parents_are_marked(child_task))
 221               xbt_dynar_push(next, &child_task);
 222           }
 223           child_task = NULL;
 224         }
 225         task = NULL;
 226         count = 0;
 227       }
 228       xbt_dynar_free(&current);
 229       current = next;
 230       next = NULL;
 231     }
 232     xbt_dynar_free(&current);
 233     current = NULL;
 234     all_marked = true;
 235     xbt_dynar_foreach(dag,count,task){
 236       if(task->kind == SD_TASK_COMM_E2E) continue;
 237       //test if all tasks are marked
 238       if(task->marked == 0){
 239         XBT_WARN("the task %s is in a cycle",task->name);
 240         all_marked = false;
 241       }
 242     }
 243   }
 244   return all_marked;
 245 }
 246
 247
 248
 249 static YY_BUFFER_STATE input_buffer;
 250
 251 static xbt_dynar_t result;
 252 static xbt_dict_t jobs;
 253 static xbt_dict_t files;
 254 static SD_task_t current_job;
 255 static SD_task_t root_task, end_task;
 256
 257 static void dump_res()
 258 {
 259   unsigned int cursor;
 260   SD_task_t task;
 261   xbt_dynar_foreach(result, cursor, task) {
 262     XBT_INFO("Task %u", cursor);
 263     SD_task_dump(task);
 264   }
 265 }
 266
 267 static void dax_task_free(void *task)
 268 {
 269   SD_task_t t = task;
 270   SD_task_destroy(t);
 271 }
 272
 273 /** @brief loads a DAX file describing a DAG
 274  *
 275  * See https://confluence.pegasus.isi.edu/display/pegasus/WorkflowGenerator
 276  * for more details.
 277  */
 278 xbt_dynar_t SD_daxload(const char *filename)
 279 {
 280   xbt_dict_cursor_t cursor;
 281   SD_task_t file;
 282   char *name;
 283   FILE *in_file = fopen(filename, "r");
 284   xbt_assert(in_file, "Unable to open \"%s\"\n", filename);
 285   input_buffer = dax__create_buffer(in_file, 10);
 286   dax__switch_to_buffer(input_buffer);
 287   dax_lineno = 1;
 288
 289   result = xbt_dynar_new(sizeof(SD_task_t), dax_task_free);
 290   files = xbt_dict_new_homogeneous(&dax_task_free);
 291   jobs = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 292   root_task = SD_task_create_comp_seq("root", NULL, 0);
 293   /* by design the root task is always SCHEDULABLE */
 294   __SD_task_set_state(root_task, SD_SCHEDULABLE);
 295
 296   xbt_dynar_push(result, &root_task);
 297   end_task = SD_task_create_comp_seq("end", NULL, 0);
 298
 299   _XBT_GNUC_UNUSED int res;
 300   res = dax_lex();
 301   xbt_assert(!res, "Parse error in %s: %s", filename,
 302               dax__parse_err_msg());
 303   dax__delete_buffer(input_buffer);
 304   fclose(in_file);
 305   dax_lex_destroy();
 306   xbt_dict_free(&jobs);
 307
 308   /* And now, post-process the files.
 309    * We want a file task per pair of computation tasks exchanging the file. Duplicate on need
 310    * Files not produced in the system are said to be produced by root task (top of DAG).
 311    * Files not consumed in the system are said to be consumed by end task (bottom of DAG).
 312    */
 313
 314   xbt_dict_foreach(files, cursor, name, file) {
 315     unsigned int cpt1, cpt2;
 316     SD_task_t newfile;
 317     SD_dependency_t depbefore, depafter;
 318     if (xbt_dynar_is_empty(file->tasks_before)) {
 319       xbt_dynar_foreach(file->tasks_after, cpt2, depafter) {
 320         newfile = SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 321         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, root_task, newfile);
 322         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, depafter->dst);
 323 #ifdef HAVE_TRACING
 324         if (depafter->src){
 325           const char *category = depafter->src->category;
 326           if (category){
 327             TRACE_category (category);
 328             SD_task_set_category (newfile, category);
 329           }
 330         }
 331 #endif
 332         xbt_dynar_push(result, &newfile);
 333       }
 334     } else if (xbt_dynar_is_empty(file->tasks_after)) {
 335       xbt_dynar_foreach(file->tasks_before, cpt2, depbefore) {
 336         newfile = SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 337         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, depbefore->src, newfile);
 338         SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, end_task);
 339 #ifdef HAVE_TRACING
 340         if (depbefore->src){
 341           const char *category = depbefore->src->category;
 342           if (category){
 343             TRACE_category (category);
 344             SD_task_set_category (newfile, category);
 345           }
 346         }
 347 #endif
 348         xbt_dynar_push(result, &newfile);
 349       }
 350     } else {
 351       xbt_dynar_foreach(file->tasks_before, cpt1, depbefore) {
 352         xbt_dynar_foreach(file->tasks_after, cpt2, depafter) {
 353           if (depbefore->src == depafter->dst) {
 354             XBT_WARN
 355                 ("File %s is produced and consumed by task %s. This loop dependency will prevent the execution of the task.",
 356                  file->name, depbefore->src->name);
 357           }
 358           newfile = SD_task_create_comm_e2e(file->name, NULL, file->amount);
 359           SD_task_dependency_add(NULL, NULL, depbefore->src, newfile);
 360           SD_task_dependency_add(NULL, NULL, newfile, depafter->dst);
 361 #ifdef HAVE_TRACING
 362           if (depbefore->src){
 363             const char *category = depbefore->src->category;
 364             if (category){
 365               TRACE_category (category);
 366               SD_task_set_category (newfile, category);
 367             }
 368           }
 369 #endif
 370           xbt_dynar_push(result, &newfile);
 371         }
 372       }
 373     }
 374   }
 375
 376   /* Push end task last */
 377   xbt_dynar_push(result, &end_task);
 378
 379   /* Free previous copy of the files */
 380   xbt_dict_free(&files);
 381   unsigned int cpt;
 382   xbt_dynar_foreach(result, cpt, file) {
 383     if (SD_task_get_kind(file) == SD_TASK_COMM_E2E) {
 384       uniq_transfer_task_name(file);
 385     }
 386   }
 387
 388   if (!acyclic_graph_detail(result)){
 389     XBT_ERROR("The DAX described in %s is not a DAG. It contains a cycle.",
 390               basename((char*)filename));
 391     xbt_dynar_foreach(result, cpt, file)
 392       SD_task_destroy(file);
 393      xbt_dynar_free_container(&result);
 394     return NULL;
 395   } else {
 396     return result;
 397   }
 398 }
 399
 400 void STag_dax__adag(void)
 401 {
 402   _XBT_GNUC_UNUSED double version;
 403   version = dax_parse_double(A_dax__adag_version);
 404
 405   xbt_assert(version == 2.1,
 406               "Expected version 2.1 in <adag> tag, got %f. Fix the parser or your file",
 407               version);
 408 }
 409
 410 void STag_dax__job(void)
 411 {
 412   double runtime = dax_parse_double(A_dax__job_runtime);
 413   char *name = bprintf("%s@%s", A_dax__job_id, A_dax__job_name);
 414   runtime *= 4200000000.;       /* Assume that timings were done on a 4.2GFlops machine. I mean, why not? */
 415 //  XBT_INFO("See <job id=%s runtime=%s %.0f>",A_dax__job_id,A_dax__job_runtime,runtime);
 416   current_job = SD_task_create_comp_seq(name, NULL, runtime);
 417 #ifdef HAVE_TRACING
 418   char *category = A_dax__job_name;
 419   if (category){
 420     TRACE_category (category);
 421     SD_task_set_category(current_job, category);
 422   }
 423 #endif
 424   xbt_dict_set(jobs, A_dax__job_id, current_job, NULL);
 425   free(name);
 426   xbt_dynar_push(result, &current_job);
 427 }
 428
 429 void STag_dax__uses(void)
 430 {
 431   SD_task_t file;
 432   double size = dax_parse_double(A_dax__uses_size);
 433   int is_input = (A_dax__uses_link == A_dax__uses_link_input);
 434
 435 //  XBT_INFO("See <uses file=%s %s>",A_dax__uses_file,(is_input?"in":"out"));
 436   file = xbt_dict_get_or_null(files, A_dax__uses_file);
 437   if (file == NULL) {
 438     file = SD_task_create_comm_e2e(A_dax__uses_file, NULL, size);
 439     xbt_dict_set(files, A_dax__uses_file, file, NULL);
 440   } else {
 441     if (SD_task_get_amount(file) != size) {
 442       XBT_WARN("Ignoring file %s size redefinition from %.0f to %.0f",
 443             A_dax__uses_file, SD_task_get_amount(file), size);
 444     }
 445   }
 446   if (is_input) {
 447     SD_task_dependency_add(NULL, NULL, file, current_job);
 448   } else {
 449     SD_task_dependency_add(NULL, NULL, current_job, file);
 450     if (xbt_dynar_length(file->tasks_before) > 1) {
 451       XBT_WARN("File %s created at more than one location...", file->name);
 452     }
 453   }
 454 }
 455
 456 static SD_task_t current_child;
 457 void STag_dax__child(void)
 458 {
 459   current_child = xbt_dict_get_or_null(jobs, A_dax__child_ref);
 460   if (current_child == NULL)
 461     dax_parse_error(bprintf
 462                     ("Asked to add dependencies to the non-existent %s task",
 463                      A_dax__child_ref));
 464 }
 465
 466 void ETag_dax__child(void)
 467 {
 468   current_child = NULL;
 469 }
 470
 471 void STag_dax__parent(void)
 472 {
 473   SD_task_t parent = xbt_dict_get_or_null(jobs, A_dax__parent_ref);
 474   if (parent == NULL)
 475     dax_parse_error(bprintf
 476                     ("Asked to add a dependency from %s to %s, but %s does not exist",
 477                      current_child->name, A_dax__parent_ref,
 478                      A_dax__parent_ref));
 479   SD_task_dependency_add(NULL, NULL, parent, current_child);
 480   XBT_DEBUG("Control-flow dependency from %s to %s", current_child->name,
 481          parent->name);
 482 }
 483
 484 void ETag_dax__adag(void)
 485 {
 486 //  XBT_INFO("See </adag>");
 487 }
 488
 489 void ETag_dax__job(void)
 490 {
 491   current_job = NULL;
 492 //  XBT_INFO("See </job>");
 493 }
 494
 495 void ETag_dax__parent(void)
 496 {
 497 //  XBT_INFO("See </parent>");
 498 }
 499
 500 void ETag_dax__uses(void)
 501 {
 502 //  XBT_INFO("See </uses>");
 503 }