src/smpi/internals/smpi_global.cpp

   1 /* Copyright (c) 2007-2019. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
   2
   3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   5
   6 #include "mc/mc.h"
   7 #include "simgrid/s4u/Engine.hpp"
   8 #include "simgrid/plugins/file_system.h"
   9 #include "smpi_coll.hpp"
  10 #include "smpi_f2c.hpp"
  11 #include "smpi_host.hpp"
  12 #include "src/kernel/activity/CommImpl.hpp"
  13 #include "src/simix/smx_private.hpp"
  14 #include "src/smpi/include/smpi_actor.hpp"
  15 #include "xbt/config.hpp"
  16
  17 #include <algorithm>
  18 #include <cfloat> /* DBL_MAX */
  19 #include <cinttypes>
  20 #include <cstdint> /* intmax_t */
  21 #include <dlfcn.h>
  22 #include <fcntl.h>
  23 #include <fstream>
  24 #include <sys/stat.h>
  25
  26 #if not defined(__APPLE__)
  27 #include <link.h>
  28 #endif
  29
  30 #if defined(__APPLE__)
  31 # include <AvailabilityMacros.h>
  32 # ifndef MAC_OS_X_VERSION_10_12
  33 #   define MAC_OS_X_VERSION_10_12 101200
  34 # endif
  35 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = (MAC_OS_X_VERSION_MIN_REQUIRED >= MAC_OS_X_VERSION_10_12);
  36 #elif defined(__FreeBSD__) || defined(__FreeBSD_kernel__) || defined(__sun)
  37 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = false;
  38 #else
  39 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = true;
  40 #endif
  41
  42 #if SG_HAVE_SENDFILE
  43 #include <sys/sendfile.h>
  44 #endif
  45
  46 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_kernel, smpi, "Logging specific to SMPI (kernel)");
  47 #include <boost/tokenizer.hpp>
  48 #include <boost/algorithm/string.hpp> /* trim_right / trim_left */
  49
  50 #if SMPI_IFORT
  51   extern "C" void for_rtl_init_ (int *, char **);
  52   extern "C" void for_rtl_finish_ ();
  53 #elif SMPI_FLANG
  54   extern "C" void __io_set_argc(int);
  55   extern "C" void __io_set_argv(char **);
  56 #elif SMPI_GFORTRAN
  57   extern "C" void _gfortran_set_args(int, char **);
  58 #endif
  59
  60 /* RTLD_DEEPBIND is a bad idea of GNU ld that obviously does not exist on other platforms
  61  * See https://www.akkadia.org/drepper/dsohowto.pdf
  62  * and https://lists.freebsd.org/pipermail/freebsd-current/2016-March/060284.html
  63 */
  64 #if !RTLD_DEEPBIND || HAVE_SANITIZER_ADDRESS || HAVE_SANITIZER_THREAD
  65 #define WANT_RTLD_DEEPBIND 0
  66 #else
  67 #define WANT_RTLD_DEEPBIND RTLD_DEEPBIND
  68 #endif
  69
  70 #if HAVE_PAPI
  71 #include "papi.h"
  72 std::string papi_default_config_name = "default";
  73 std::map</* computation unit name */ std::string, papi_process_data> units2papi_setup;
  74 #endif
  75
  76 std::unordered_map<std::string, double> location2speedup;
  77
  78 static std::map</*process_id*/ simgrid::s4u::Actor const*, simgrid::smpi::ActorExt*> process_data;
  79 int process_count = 0;
  80 static int smpi_exit_status = 0;
  81 int smpi_universe_size = 0;
  82 extern double smpi_total_benched_time;
  83 xbt_os_timer_t global_timer;
  84 static std::vector<std::string> privatize_libs_paths;
  85 /**
  86  * Setting MPI_COMM_WORLD to MPI_COMM_UNINITIALIZED (it's a variable)
  87  * is important because the implementation of MPI_Comm checks
  88  * "this == MPI_COMM_UNINITIALIZED"? If yes, it uses smpi_process()->comm_world()
  89  * instead of "this".
  90  * This is basically how we only have one global variable but all processes have
  91  * different communicators (the one their SMPI instance uses).
  92  *
  93  * See smpi_comm.cpp and the functions therein for details.
  94  */
  95 MPI_Comm MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  96 MPI_Errhandler *MPI_ERRORS_RETURN = nullptr;
  97 MPI_Errhandler *MPI_ERRORS_ARE_FATAL = nullptr;
  98 MPI_Errhandler *MPI_ERRHANDLER_NULL = nullptr;
  99 // No instance gets manually created; check also the smpirun.in script as
 100 // this default name is used there as well (when the <actor> tag is generated).
 101 static const std::string smpi_default_instance_name("smpirun");
 102 static simgrid::config::Flag<double> smpi_init_sleep(
 103   "smpi/init", "Time to inject inside a call to MPI_Init", 0.0);
 104
 105 void (*smpi_comm_copy_data_callback)(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*,
 106                                      size_t) = &smpi_comm_copy_buffer_callback;
 107
 108 int smpi_process_count()
 109 {
 110   return process_count;
 111 }
 112
 113 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process()
 114 {
 115   simgrid::s4u::ActorPtr me = simgrid::s4u::Actor::self();
 116
 117   if (me == nullptr) // This happens sometimes (eg, when linking against NS3 because it pulls openMPI...)
 118     return nullptr;
 119
 120   return process_data.at(me.get());
 121 }
 122
 123 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process_remote(simgrid::s4u::ActorPtr actor)
 124 {
 125   return process_data.at(actor.get());
 126 }
 127
 128 MPI_Comm smpi_process_comm_self(){
 129   return smpi_process()->comm_self();
 130 }
 131
 132 MPI_Info smpi_process_info_env(){
 133   return smpi_process()->info_env();
 134 }
 135
 136 void smpi_process_init(int*, char***)
 137 {
 138   simgrid::smpi::ActorExt::init();
 139 }
 140
 141 void * smpi_process_get_user_data(){
 142   return simgrid::s4u::Actor::self()->get_impl()->get_user_data();
 143 }
 144
 145 void smpi_process_set_user_data(void *data){
 146   simgrid::s4u::Actor::self()->get_impl()->set_user_data(data);
 147 }
 148
 149 void smpi_comm_set_copy_data_callback(void (*callback) (smx_activity_t, void*, size_t))
 150 {
 151   static void (*saved_callback)(smx_activity_t, void*, size_t);
 152   saved_callback               = callback;
 153   smpi_comm_copy_data_callback = [](simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t size) {
 154     saved_callback(smx_activity_t(comm), buff, size);
 155   };
 156 }
 157
 158 static void memcpy_private(void* dest, const void* src, std::vector<std::pair<size_t, size_t>>& private_blocks)
 159 {
 160   for (auto const& block : private_blocks)
 161     memcpy((uint8_t*)dest+block.first, (uint8_t*)src+block.first, block.second-block.first);
 162 }
 163
 164 static void check_blocks(std::vector<std::pair<size_t, size_t>> &private_blocks, size_t buff_size) {
 165   for (auto const& block : private_blocks)
 166     xbt_assert(block.first <= block.second && block.second <= buff_size, "Oops, bug in shared malloc.");
 167 }
 168
 169 void smpi_comm_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t buff_size)
 170 {
 171   int src_shared                        = 0;
 172   int dst_shared                        = 0;
 173   size_t src_offset                     = 0;
 174   size_t dst_offset                     = 0;
 175   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> src_private_blocks;
 176   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> dst_private_blocks;
 177   XBT_DEBUG("Copy the data over");
 178   if((src_shared=smpi_is_shared(buff, src_private_blocks, &src_offset))) {
 179     XBT_DEBUG("Sender %p is shared. Let's ignore it.", buff);
 180     src_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(src_private_blocks, src_offset, buff_size);
 181   }
 182   else {
 183     src_private_blocks.clear();
 184     src_private_blocks.push_back(std::make_pair(0, buff_size));
 185   }
 186   if ((dst_shared = smpi_is_shared((char*)comm->dst_buff_, dst_private_blocks, &dst_offset))) {
 187     XBT_DEBUG("Receiver %p is shared. Let's ignore it.", (char*)comm->dst_buff_);
 188     dst_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(dst_private_blocks, dst_offset, buff_size);
 189   }
 190   else {
 191     dst_private_blocks.clear();
 192     dst_private_blocks.push_back(std::make_pair(0, buff_size));
 193   }
 194   check_blocks(src_private_blocks, buff_size);
 195   check_blocks(dst_private_blocks, buff_size);
 196   auto private_blocks = merge_private_blocks(src_private_blocks, dst_private_blocks);
 197   check_blocks(private_blocks, buff_size);
 198   void* tmpbuff=buff;
 199   if ((smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) &&
 200       (static_cast<char*>(buff) >= smpi_data_exe_start) &&
 201       (static_cast<char*>(buff) < smpi_data_exe_start + smpi_data_exe_size)) {
 202     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying from a zone inside global memory... Saving data to temp buffer !");
 203     smpi_switch_data_segment(comm->src_actor_->iface());
 204     tmpbuff = static_cast<void*>(xbt_malloc(buff_size));
 205     memcpy_private(tmpbuff, buff, private_blocks);
 206   }
 207
 208   if ((smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) &&
 209       ((char*)comm->dst_buff_ >= smpi_data_exe_start) &&
 210       ((char*)comm->dst_buff_ < smpi_data_exe_start + smpi_data_exe_size)) {
 211     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying to a zone inside global memory - Switch data segment");
 212     smpi_switch_data_segment(comm->dst_actor_->iface());
 213   }
 214   XBT_DEBUG("Copying %zu bytes from %p to %p", buff_size, tmpbuff, comm->dst_buff_);
 215   memcpy_private(comm->dst_buff_, tmpbuff, private_blocks);
 216
 217   if (comm->detached()) {
 218     // if this is a detached send, the source buffer was duplicated by SMPI
 219     // sender to make the original buffer available to the application ASAP
 220     xbt_free(buff);
 221     //It seems that the request is used after the call there this should be free somewhere else but where???
 222     //xbt_free(comm->comm.src_data);// inside SMPI the request is kept inside the user data and should be free
 223     comm->src_buff_ = nullptr;
 224   }
 225   if (tmpbuff != buff)
 226     xbt_free(tmpbuff);
 227 }
 228
 229 void smpi_comm_null_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*, size_t)
 230 {
 231   /* nothing done in this version */
 232 }
 233
 234 static void smpi_check_options()
 235 {
 236   //check correctness of MPI parameters
 237
 238   xbt_assert(simgrid::config::get_value<int>("smpi/async-small-thresh") <=
 239              simgrid::config::get_value<int>("smpi/send-is-detached-thresh"));
 240
 241   if (simgrid::config::is_default("smpi/host-speed")) {
 242     XBT_INFO("You did not set the power of the host running the simulation.  "
 243              "The timings will certainly not be accurate.  "
 244              "Use the option \"--cfg=smpi/host-speed:<flops>\" to set its value.  "
 245              "Check "
 246              "https://simgrid.org/doc/latest/Configuring_SimGrid.html#automatic-benchmarking-of-smpi-code for more "
 247              "information.");
 248   }
 249
 250   xbt_assert(simgrid::config::get_value<double>("smpi/cpu-threshold") >= 0,
 251              "The 'smpi/cpu-threshold' option cannot have negative values [anymore]. If you want to discard "
 252              "the simulation of any computation, please use 'smpi/simulate-computation:no' instead.");
 253 }
 254
 255 int smpi_enabled() {
 256   return not process_data.empty();
 257 }
 258
 259 void smpi_global_init()
 260 {
 261   if (not MC_is_active()) {
 262     global_timer = xbt_os_timer_new();
 263     xbt_os_walltimer_start(global_timer);
 264   }
 265
 266   std::string filename = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/comp-adjustment-file");
 267   if (not filename.empty()) {
 268     std::ifstream fstream(filename);
 269     if (not fstream.is_open()) {
 270       xbt_die("Could not open file %s. Does it exist?", filename.c_str());
 271     }
 272
 273     std::string line;
 274     typedef boost::tokenizer< boost::escaped_list_separator<char>> Tokenizer;
 275     std::getline(fstream, line); // Skip the header line
 276     while (std::getline(fstream, line)) {
 277       Tokenizer tok(line);
 278       Tokenizer::iterator it  = tok.begin();
 279       Tokenizer::iterator end = std::next(tok.begin());
 280
 281       std::string location = *it;
 282       boost::trim(location);
 283       location2speedup.insert(std::pair<std::string, double>(location, std::stod(*end)));
 284     }
 285   }
 286
 287 #if HAVE_PAPI
 288   // This map holds for each computation unit (such as "default" or "process1" etc.)
 289   // the configuration as given by the user (counter data as a pair of (counter_name, counter_counter))
 290   // and the (computed) event_set.
 291
 292   if (not simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/papi-events").empty()) {
 293     if (PAPI_library_init(PAPI_VER_CURRENT) != PAPI_VER_CURRENT)
 294       XBT_ERROR("Could not initialize PAPI library; is it correctly installed and linked?"
 295                 " Expected version is %u", PAPI_VER_CURRENT);
 296
 297     typedef boost::tokenizer<boost::char_separator<char>> Tokenizer;
 298     boost::char_separator<char> separator_units(";");
 299     std::string str = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/papi-events");
 300     Tokenizer tokens(str, separator_units);
 301
 302     // Iterate over all the computational units. This could be processes, hosts, threads, ranks... You name it.
 303     // I'm not exactly sure what we will support eventually, so I'll leave it at the general term "units".
 304     for (auto const& unit_it : tokens) {
 305       boost::char_separator<char> separator_events(":");
 306       Tokenizer event_tokens(unit_it, separator_events);
 307
 308       int event_set = PAPI_NULL;
 309       if (PAPI_create_eventset(&event_set) != PAPI_OK) {
 310         // TODO: Should this let the whole simulation die?
 311         XBT_CRITICAL("Could not create PAPI event set during init.");
 312       }
 313
 314       // NOTE: We cannot use a map here, as we must obey the order of the counters
 315       // This is important for PAPI: We need to map the values of counters back
 316       // to the event_names (so, when PAPI_read() has finished)!
 317       papi_counter_t counters2values;
 318
 319       // Iterate over all counters that were specified for this specific
 320       // unit.
 321       // Note that we need to remove the name of the unit
 322       // (that could also be the "default" value), which always comes first.
 323       // Hence, we start at ++(events.begin())!
 324       for (Tokenizer::iterator events_it = ++(event_tokens.begin()); events_it != event_tokens.end(); ++events_it) {
 325
 326         int event_code   = PAPI_NULL;
 327         char* event_name = const_cast<char*>((*events_it).c_str());
 328         if (PAPI_event_name_to_code(event_name, &event_code) != PAPI_OK) {
 329           XBT_CRITICAL("Could not find PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
 330           continue;
 331         }
 332         if (PAPI_add_event(event_set, event_code) != PAPI_OK) {
 333           XBT_ERROR("Could not add PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
 334           continue;
 335         }
 336         XBT_DEBUG("Successfully added PAPI event '%s' to the event set.", event_name);
 337
 338         counters2values.push_back(
 339             // We cannot just pass *events_it, as this is of type const basic_string
 340             std::make_pair<std::string, long long>(std::string(*events_it), 0));
 341       }
 342
 343       std::string unit_name    = *(event_tokens.begin());
 344       papi_process_data config = {.counter_data = std::move(counters2values), .event_set = event_set};
 345
 346       units2papi_setup.insert(std::make_pair(unit_name, std::move(config)));
 347     }
 348   }
 349 #endif
 350 }
 351
 352 void smpi_global_destroy()
 353 {
 354   smpi_bench_destroy();
 355   smpi_shared_destroy();
 356   smpi_deployment_cleanup_instances();
 357
 358   if (simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback != nullptr)
 359     simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback();
 360
 361   MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_NULL;
 362
 363   if (not MC_is_active()) {
 364     xbt_os_timer_free(global_timer);
 365   }
 366
 367   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 368     smpi_destroy_global_memory_segments();
 369   if(simgrid::smpi::F2C::lookup() != nullptr)
 370     simgrid::smpi::F2C::delete_lookup();
 371 }
 372
 373 static void smpi_init_options(){
 374   // return if already called
 375   if (smpi_cpu_threshold > -1)
 376     return;
 377   simgrid::smpi::Colls::set_collectives();
 378   simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback = nullptr;
 379   smpi_cpu_threshold                               = simgrid::config::get_value<double>("smpi/cpu-threshold");
 380   smpi_host_speed                                  = simgrid::config::get_value<double>("smpi/host-speed");
 381   xbt_assert(smpi_host_speed > 0.0, "You're trying to set the host_speed to a non-positive value (given: %f)", smpi_host_speed);
 382   std::string smpi_privatize_option = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatization");
 383   if (smpi_privatize_option == "no" || smpi_privatize_option == "0")
 384     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::NONE;
 385   else if (smpi_privatize_option == "yes" || smpi_privatize_option == "1")
 386     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DEFAULT;
 387   else if (smpi_privatize_option == "mmap")
 388     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::MMAP;
 389   else if (smpi_privatize_option == "dlopen")
 390     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DLOPEN;
 391   else
 392     xbt_die("Invalid value for smpi/privatization: '%s'", smpi_privatize_option.c_str());
 393
 394   if (not SMPI_switch_data_segment) {
 395     XBT_DEBUG("Running without smpi_main(); disable smpi/privatization.");
 396     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::NONE;
 397   }
 398   if (not HAVE_WORKING_MMAP && smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 399     XBT_INFO("mmap privatization is broken on this platform, switching to dlopen privatization instead.");
 400     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DLOPEN;
 401   }
 402
 403   if (smpi_cpu_threshold < 0)
 404     smpi_cpu_threshold = DBL_MAX;
 405
 406   std::string val = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/shared-malloc");
 407   if ((val == "yes") || (val == "1") || (val == "on") || (val == "global")) {
 408     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::GLOBAL;
 409   } else if (val == "local") {
 410     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::LOCAL;
 411   } else if ((val == "no") || (val == "0") || (val == "off")) {
 412     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::NONE;
 413   } else {
 414     xbt_die("Invalid value '%s' for option smpi/shared-malloc. Possible values: 'on' or 'global', 'local', 'off'",
 415             val.c_str());
 416   }
 417 }
 418
 419 typedef std::function<int(int argc, char *argv[])> smpi_entry_point_type;
 420 typedef int (* smpi_c_entry_point_type)(int argc, char **argv);
 421 typedef void (*smpi_fortran_entry_point_type)();
 422
 423 static int smpi_run_entry_point(const smpi_entry_point_type& entry_point, const std::string& executable_path,
 424                                 std::vector<std::string> args)
 425 {
 426   // copy C strings, we need them writable
 427   std::vector<char*>* args4argv = new std::vector<char*>(args.size());
 428   std::transform(begin(args), end(args), begin(*args4argv), [](const std::string& s) { return xbt_strdup(s.c_str()); });
 429
 430   // set argv[0] to executable_path
 431   xbt_free((*args4argv)[0]);
 432   (*args4argv)[0] = xbt_strdup(executable_path.c_str());
 433
 434 #if !SMPI_IFORT
 435   // take a copy of args4argv to keep reference of the allocated strings
 436   const std::vector<char*> args2str(*args4argv);
 437 #endif
 438   int argc = args4argv->size();
 439   args4argv->push_back(nullptr);
 440   char** argv = args4argv->data();
 441
 442   simgrid::smpi::ActorExt::init();
 443 #if SMPI_IFORT
 444   for_rtl_init_ (&argc, argv);
 445 #elif SMPI_FLANG
 446   __io_set_argc(argc);
 447   __io_set_argv(argv);
 448 #elif SMPI_GFORTRAN
 449   _gfortran_set_args(argc, argv);
 450 #endif
 451   int res = entry_point(argc, argv);
 452
 453 #if SMPI_IFORT
 454   for_rtl_finish_ ();
 455 #else
 456   for (char* s : args2str)
 457     xbt_free(s);
 458   delete args4argv;
 459 #endif
 460
 461   if (res != 0){
 462     XBT_WARN("SMPI process did not return 0. Return value : %d", res);
 463     if (smpi_exit_status == 0)
 464       smpi_exit_status = res;
 465   }
 466   return 0;
 467 }
 468
 469
 470 // TODO, remove the number of functions involved here
 471 static smpi_entry_point_type smpi_resolve_function(void* handle)
 472 {
 473   smpi_fortran_entry_point_type entry_point_fortran = (smpi_fortran_entry_point_type)dlsym(handle, "user_main_");
 474   if (entry_point_fortran != nullptr) {
 475     return [entry_point_fortran](int, char**) {
 476       entry_point_fortran();
 477       return 0;
 478     };
 479   }
 480
 481   smpi_c_entry_point_type entry_point = (smpi_c_entry_point_type)dlsym(handle, "main");
 482   if (entry_point != nullptr) {
 483     return entry_point;
 484   }
 485
 486   return smpi_entry_point_type();
 487 }
 488
 489 static void smpi_copy_file(const std::string& src, const std::string& target, off_t fdin_size)
 490 {
 491   int fdin = open(src.c_str(), O_RDONLY);
 492   xbt_assert(fdin >= 0, "Cannot read from %s. Please make sure that the file exists and is executable.", src.c_str());
 493   int fdout = open(target.c_str(), O_CREAT | O_RDWR, S_IRWXU);
 494   xbt_assert(fdout >= 0, "Cannot write into %s", target.c_str());
 495
 496   XBT_DEBUG("Copy %" PRIdMAX " bytes into %s", static_cast<intmax_t>(fdin_size), target.c_str());
 497 #if SG_HAVE_SENDFILE
 498   ssize_t sent_size = sendfile(fdout, fdin, NULL, fdin_size);
 499   if (sent_size == fdin_size) {
 500     close(fdin);
 501     close(fdout);
 502     return;
 503   } else if (sent_size != -1 || errno != ENOSYS) {
 504     xbt_die("Error while copying %s: only %zd bytes copied instead of %" PRIdMAX " (errno: %d -- %s)", target.c_str(),
 505             sent_size, static_cast<intmax_t>(fdin_size), errno, strerror(errno));
 506   }
 507 #endif
 508   // If this point is reached, sendfile() actually is not available.  Copy file by hand.
 509   const int bufsize = 1024 * 1024 * 4;
 510   char* buf         = new char[bufsize];
 511   while (int got = read(fdin, buf, bufsize)) {
 512     if (got == -1) {
 513       xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot read from %s", src.c_str());
 514     } else {
 515       char* p  = buf;
 516       int todo = got;
 517       while (int done = write(fdout, p, todo)) {
 518         if (done == -1) {
 519           xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot write into %s", target.c_str());
 520         } else {
 521           p += done;
 522           todo -= done;
 523         }
 524       }
 525     }
 526   }
 527   delete[] buf;
 528   close(fdin);
 529   close(fdout);
 530 }
 531
 532 #if not defined(__APPLE__)
 533 static int visit_libs(struct dl_phdr_info* info, size_t, void* data)
 534 {
 535   char* libname = (char*)(data);
 536   const char *path = info->dlpi_name;
 537   if(strstr(path, libname)){
 538     strncpy(libname, path, 512);
 539     return 1;
 540   }
 541
 542   return 0;
 543 }
 544 #endif
 545
 546 static void smpi_init_privatization_dlopen(const std::string& executable)
 547 {
 548   // Prepare the copy of the binary (get its size)
 549   struct stat fdin_stat;
 550   stat(executable.c_str(), &fdin_stat);
 551   off_t fdin_size         = fdin_stat.st_size;
 552
 553   std::string libnames = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatize-libs");
 554   if (not libnames.empty()) {
 555     // split option
 556     std::vector<std::string> privatize_libs;
 557     boost::split(privatize_libs, libnames, boost::is_any_of(";"));
 558
 559     for (auto const& libname : privatize_libs) {
 560       // load the library once to add it to the local libs, to get the absolute path
 561       void* libhandle = dlopen(libname.c_str(), RTLD_LAZY);
 562       // get library name from path
 563       char fullpath[512] = {'\0'};
 564       strncpy(fullpath, libname.c_str(), 511);
 565 #if not defined(__APPLE__)
 566       int ret = dl_iterate_phdr(visit_libs, fullpath);
 567       if (ret == 0)
 568         xbt_die("Can't find a linked %s - check the setting you gave to smpi/privatize-libs", fullpath);
 569       else
 570         XBT_DEBUG("Extra lib to privatize found : %s", fullpath);
 571 #else
 572       xbt_die("smpi/privatize-libs is not (yet) compatible with OSX");
 573 #endif
 574       privatize_libs_paths.push_back(fullpath);
 575       dlclose(libhandle);
 576     }
 577   }
 578
 579   simix_global->default_function = [executable, fdin_size](std::vector<std::string> args) {
 580     return std::function<void()>([executable, fdin_size, args] {
 581       static std::size_t rank = 0;
 582       // Copy the dynamic library:
 583       std::string target_executable =
 584           executable + "_" + std::to_string(getpid()) + "_" + std::to_string(rank) + ".so";
 585
 586       smpi_copy_file(executable, target_executable, fdin_size);
 587       // if smpi/privatize-libs is set, duplicate pointed lib and link each executable copy to a different one.
 588       std::vector<std::string> target_libs;
 589       for (auto const& libpath : privatize_libs_paths) {
 590         // if we were given a full path, strip it
 591         size_t index = libpath.find_last_of("/\\");
 592         std::string libname;
 593         if (index != std::string::npos)
 594           libname = libpath.substr(index + 1);
 595
 596         if (not libname.empty()) {
 597           // load the library to add it to the local libs, to get the absolute path
 598           struct stat fdin_stat2;
 599           stat(libpath.c_str(), &fdin_stat2);
 600           off_t fdin_size2 = fdin_stat2.st_size;
 601
 602           // Copy the dynamic library, the new name must be the same length as the old one
 603           // just replace the name with 7 digits for the rank and the rest of the name.
 604           unsigned int pad = 7;
 605           if (libname.length() < pad)
 606             pad = libname.length();
 607           std::string target_lib =
 608               std::string(pad - std::to_string(rank).length(), '0') + std::to_string(rank) + libname.substr(pad);
 609           target_libs.push_back(target_lib);
 610           XBT_DEBUG("copy lib %s to %s, with size %lld", libpath.c_str(), target_lib.c_str(), (long long)fdin_size2);
 611           smpi_copy_file(libpath, target_lib, fdin_size2);
 612
 613           std::string sedcommand = "sed -i -e 's/" + libname + "/" + target_lib + "/g' " + target_executable;
 614           int ret                = system(sedcommand.c_str());
 615           if (ret != 0)
 616             xbt_die("error while applying sed command %s \n", sedcommand.c_str());
 617         }
 618       }
 619
 620       rank++;
 621       // Load the copy and resolve the entry point:
 622       void* handle    = dlopen(target_executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL | WANT_RTLD_DEEPBIND);
 623       int saved_errno = errno;
 624       if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/keep-temps") == false) {
 625         unlink(target_executable.c_str());
 626         for (const std::string& target_lib : target_libs)
 627           unlink(target_lib.c_str());
 628       }
 629       if (handle == nullptr)
 630         xbt_die("dlopen failed: %s (errno: %d -- %s)", dlerror(), saved_errno, strerror(saved_errno));
 631       smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
 632       if (not entry_point)
 633         xbt_die("Could not resolve entry point");
 634       smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args);
 635     });
 636   };
 637 }
 638
 639 static void smpi_init_privatization_no_dlopen(const std::string& executable)
 640 {
 641   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 642     smpi_prepare_global_memory_segment();
 643   // Load the dynamic library and resolve the entry point:
 644   void* handle = dlopen(executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL);
 645   if (handle == nullptr)
 646     xbt_die("dlopen failed for %s: %s (errno: %d -- %s)", executable.c_str(), dlerror(), errno, strerror(errno));
 647   smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
 648   if (not entry_point)
 649     xbt_die("main not found in %s", executable.c_str());
 650   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 651     smpi_backup_global_memory_segment();
 652
 653   // Execute the same entry point for each simulated process:
 654   simix_global->default_function = [entry_point, executable](std::vector<std::string> args) {
 655     return std::function<void()>(
 656         [entry_point, executable, args] { smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args); });
 657   };
 658 }
 659
 660 int smpi_main(const char* executable, int argc, char* argv[])
 661 {
 662   if (getenv("SMPI_PRETEND_CC") != nullptr) {
 663     /* Hack to ensure that smpicc can pretend to be a simple compiler. Particularly handy to pass it to the
 664      * configuration tools */
 665     return 0;
 666   }
 667
 668   TRACE_global_init();
 669   SIMIX_global_init(&argc, argv);
 670
 671   SMPI_switch_data_segment = &smpi_switch_data_segment;
 672   sg_storage_file_system_init();
 673   // parse the platform file: get the host list
 674   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->load_platform(argv[1]);
 675   SIMIX_comm_set_copy_data_callback(smpi_comm_copy_buffer_callback);
 676
 677   smpi_init_options();
 678   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::DLOPEN)
 679     smpi_init_privatization_dlopen(executable);
 680   else
 681     smpi_init_privatization_no_dlopen(executable);
 682
 683   SMPI_init();
 684   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->load_deployment(argv[2]);
 685   SMPI_app_instance_register(smpi_default_instance_name.c_str(), nullptr,
 686                              process_data.size()); // This call has a side effect on process_count...
 687   MPI_COMM_WORLD = *smpi_deployment_comm_world(smpi_default_instance_name);
 688   smpi_universe_size = process_count;
 689
 690
 691   /* Clean IO before the run */
 692   fflush(stdout);
 693   fflush(stderr);
 694
 695   if (MC_is_active()) {
 696     MC_run();
 697   } else {
 698
 699     SIMIX_run();
 700
 701     xbt_os_walltimer_stop(global_timer);
 702     if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/display-timing")) {
 703       double global_time = xbt_os_timer_elapsed(global_timer);
 704       XBT_INFO("Simulated time: %g seconds. \n\n"
 705           "The simulation took %g seconds (after parsing and platform setup)\n"
 706           "%g seconds were actual computation of the application",
 707           SIMIX_get_clock(), global_time , smpi_total_benched_time);
 708
 709       if (smpi_total_benched_time/global_time>=0.75)
 710       XBT_INFO("More than 75%% of the time was spent inside the application code.\n"
 711       "You may want to use sampling functions or trace replay to reduce this.");
 712     }
 713   }
 714   smpi_global_destroy();
 715
 716   return smpi_exit_status;
 717 }
 718
 719 // Called either directly from the user code, or from the code called by smpirun
 720 void SMPI_init(){
 721   simgrid::s4u::Actor::on_creation.connect([](simgrid::s4u::Actor& actor) {
 722     if (not actor.is_daemon()) {
 723       process_data.insert({&actor, new simgrid::smpi::ActorExt(&actor, nullptr)});
 724     }
 725   });
 726   simgrid::s4u::Actor::on_destruction.connect([](simgrid::s4u::Actor const& actor) {
 727     auto it = process_data.find(&actor);
 728     if (it != process_data.end()) {
 729       delete it->second;
 730       process_data.erase(it);
 731     }
 732   });
 733   simgrid::s4u::Host::on_creation.connect(
 734       [](simgrid::s4u::Host& host) { host.extension_set(new simgrid::smpi::Host(&host)); });
 735
 736   smpi_init_options();
 737   smpi_global_init();
 738   smpi_check_options();
 739 }
 740
 741 void SMPI_finalize(){
 742   smpi_global_destroy();
 743 }
 744
 745 void smpi_mpi_init() {
 746   smpi_init_fortran_types();
 747   if(smpi_init_sleep > 0)
 748     simcall_process_sleep(smpi_init_sleep);
 749 }