src/smpi/smpi_base.c

   1 /* Copyright (c) 2007-2014. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "xbt/virtu.h"
   9 #include "mc/mc.h"
  10 #include "xbt/replay.h"
  11 #include <errno.h>
  12 #include "simix/smx_private.h"
  13 #include "surf/surf.h"
  14 #include "simgrid/sg_config.h"
  15 #include "colls/colls.h"
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
  18
  19
  20 static int match_recv(void* a, void* b, smx_action_t ignored) {
  21    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  22    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  23    XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  24
  25   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
  26   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
  27   if((ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  28     && ((ref->tag == MPI_ANY_TAG && req->tag >=0) || req->tag == ref->tag)){
  29     //we match, we can transfer some values
  30     // FIXME : move this to the copy function ?
  31     if(ref->src == MPI_ANY_SOURCE)ref->real_src = req->src;
  32     if(ref->tag == MPI_ANY_TAG)ref->real_tag = req->tag;
  33     if(ref->real_size < req->real_size) ref->truncated = 1;
  34     if(req->detached==1){
  35         ref->detached_sender=req; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  36     }
  37     XBT_DEBUG("match succeeded");
  38     return 1;
  39   }else return 0;
  40 }
  41
  42 static int match_send(void* a, void* b,smx_action_t ignored) {
  43    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  44    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  45    XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  46    xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
  47    xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
  48
  49    if((req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  50              && ((req->tag == MPI_ANY_TAG && ref->tag >=0)|| req->tag == ref->tag))
  51    {
  52      if(req->src == MPI_ANY_SOURCE)req->real_src = ref->src;
  53      if(req->tag == MPI_ANY_TAG)req->real_tag = ref->tag;
  54      if(req->real_size < ref->real_size) req->truncated = 1;
  55      if(ref->detached==1){
  56          req->detached_sender=ref; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  57      }
  58     XBT_DEBUG("match succeeded");
  59      return 1;
  60    } else return 0;
  61 }
  62
  63
  64 typedef struct s_smpi_factor *smpi_factor_t;
  65 typedef struct s_smpi_factor {
  66   long factor;
  67   int nb_values;
  68   double values[4];//arbitrary set to 4
  69 } s_smpi_factor_t;
  70 xbt_dynar_t smpi_os_values = NULL;
  71 xbt_dynar_t smpi_or_values = NULL;
  72 xbt_dynar_t smpi_ois_values = NULL;
  73
  74 double smpi_wtime_sleep = 0.0;
  75 double smpi_iprobe_sleep = 1e-4;
  76 double smpi_test_sleep = 1e-4;
  77
  78
  79 // Methods used to parse and store the values for timing injections in smpi
  80 // These are taken from surf/network.c and generalized to have more factors
  81 // These methods should be merged with those in surf/network.c (moved somewhere in xbt ?)
  82
  83 static int factor_cmp(const void *pa, const void *pb)
  84 {
  85   return (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor > ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? 1 :
  86          (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor < ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor) ? -1 : 0;
  87 }
  88
  89
  90 static xbt_dynar_t parse_factor(const char *smpi_coef_string)
  91 {
  92   char *value = NULL;
  93   unsigned int iter = 0;
  94   s_smpi_factor_t fact;
  95   fact.nb_values=0;
  96   int i=0;
  97   xbt_dynar_t smpi_factor, radical_elements, radical_elements2 = NULL;
  98
  99   smpi_factor = xbt_dynar_new(sizeof(s_smpi_factor_t), NULL);
 100   radical_elements = xbt_str_split(smpi_coef_string, ";");
 101   xbt_dynar_foreach(radical_elements, iter, value) {
 102     memset(&fact, 0, sizeof(s_smpi_factor_t));
 103     radical_elements2 = xbt_str_split(value, ":");
 104     if (xbt_dynar_length(radical_elements2) <2 || xbt_dynar_length(radical_elements2) > 5)
 105       xbt_die("Malformed radical for smpi factor!");
 106     for(i =0; i<xbt_dynar_length(radical_elements2);i++ ){
 107         if (i==0){
 108            fact.factor = atol(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 109         }else{
 110            fact.values[fact.nb_values] = atof(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 111            fact.nb_values++;
 112         }
 113     }
 114
 115     xbt_dynar_push_as(smpi_factor, s_smpi_factor_t, fact);
 116     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 117     xbt_dynar_free(&radical_elements2);
 118   }
 119   xbt_dynar_free(&radical_elements);
 120   iter=0;
 121   xbt_dynar_sort(smpi_factor, &factor_cmp);
 122   xbt_dynar_foreach(smpi_factor, iter, fact) {
 123     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 124   }
 125   return smpi_factor;
 126 }
 127
 128 static double smpi_os(double size)
 129 {
 130   if (!smpi_os_values) {
 131     smpi_os_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/os"));
 132     smpi_register_static(smpi_os_values, xbt_dynar_free_voidp);
 133   }
 134   unsigned int iter = 0;
 135   s_smpi_factor_t fact;
 136   double current=0.0;
 137   xbt_dynar_foreach(smpi_os_values, iter, fact) {
 138     if (size <= fact.factor) {
 139         XBT_DEBUG("os : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 140       return current;
 141     }else{
 142       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 143     }
 144   }
 145   XBT_DEBUG("os : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 146
 147   return current;
 148 }
 149
 150 static double smpi_ois(double size)
 151 {
 152   if (!smpi_ois_values) {
 153     smpi_ois_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/ois"));
 154     smpi_register_static(smpi_ois_values, xbt_dynar_free_voidp);
 155   }
 156   unsigned int iter = 0;
 157   s_smpi_factor_t fact;
 158   double current=0.0;
 159   xbt_dynar_foreach(smpi_ois_values, iter, fact) {
 160     if (size <= fact.factor) {
 161         XBT_DEBUG("ois : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 162       return current;
 163     }else{
 164       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 165     }
 166   }
 167   XBT_DEBUG("ois : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 168
 169   return current;
 170 }
 171
 172 static double smpi_or(double size)
 173 {
 174   if (!smpi_or_values) {
 175     smpi_or_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/or"));
 176     smpi_register_static(smpi_or_values, xbt_dynar_free_voidp);
 177   }
 178   unsigned int iter = 0;
 179   s_smpi_factor_t fact;
 180   double current=0.0;
 181   xbt_dynar_foreach(smpi_or_values, iter, fact) {
 182     if (size <= fact.factor) {
 183         XBT_DEBUG("or : %f <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 184       return current;
 185     }else
 186       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 187   }
 188   XBT_DEBUG("or : %f > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 189
 190   return current;
 191 }
 192
 193 double smpi_mpi_wtime(){
 194   double time;
 195   if (smpi_process_initialized() && !smpi_process_finalized() && !smpi_process_get_sampling()) {
 196     smpi_bench_end();
 197     time = SIMIX_get_clock();
 198     //to avoid deadlocks if called too many times
 199     if(smpi_wtime_sleep > 0) simcall_process_sleep(smpi_wtime_sleep);
 200     smpi_bench_begin();
 201   } else {
 202     time = SIMIX_get_clock();
 203   }
 204   return time;
 205 }
 206
 207 static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
 208                                  MPI_Datatype datatype, int src, int dst,
 209                                  int tag, MPI_Comm comm, unsigned flags)
 210 {
 211   MPI_Request request = NULL;
 212
 213   void *old_buf = NULL;
 214
 215   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
 216
 217   s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 218
 219   if(((flags & RECV) && (flags & ACCUMULATE)) || (datatype->has_subtype == 1)){
 220     // This part handles the problem of non-contiguous memory
 221     old_buf = buf;
 222     buf = count==0 ? NULL : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
 223     if ((datatype->has_subtype == 1) && (flags & SEND)) {
 224       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
 225     }
 226   }
 227
 228   request->buf = buf;
 229   // This part handles the problem of non-contiguous memory (for the
 230   // unserialisation at the reception)
 231   request->old_buf = old_buf;
 232   request->old_type = datatype;
 233
 234   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
 235   request->src = src;
 236   request->dst = dst;
 237   request->tag = tag;
 238   request->comm = comm;
 239   request->action = NULL;
 240   request->flags = flags;
 241   request->detached = 0;
 242   request->detached_sender = NULL;
 243   request->real_src = 0;
 244
 245   request->truncated = 0;
 246   request->real_size = 0;
 247   request->real_tag = 0;
 248   if(flags & PERSISTENT)
 249     request->refcount = 1;
 250   else
 251     request->refcount = 0;
 252   request->op = MPI_REPLACE;
 253 #ifdef HAVE_TRACING
 254   request->send = 0;
 255   request->recv = 0;
 256 #endif
 257   if (flags & SEND) smpi_datatype_unuse(datatype);
 258
 259   return request;
 260 }
 261
 262
 263 void smpi_empty_status(MPI_Status * status)
 264 {
 265   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 266     status->MPI_SOURCE = MPI_ANY_SOURCE;
 267     status->MPI_TAG = MPI_ANY_TAG;
 268     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 269     status->count=0;
 270   }
 271 }
 272
 273 void smpi_action_trace_run(char *path)
 274 {
 275   char *name;
 276   xbt_dynar_t todo;
 277   xbt_dict_cursor_t cursor;
 278
 279   action_fp=NULL;
 280   if (path) {
 281     action_fp = fopen(path, "r");
 282     if (action_fp == NULL)
 283       xbt_die("Cannot open %s: %s", path, strerror(errno));
 284   }
 285
 286   if (!xbt_dict_is_empty(action_queues)) {
 287     XBT_WARN
 288       ("Not all actions got consumed. If the simulation ended successfully (without deadlock), you may want to add new processes to your deployment file.");
 289
 290
 291     xbt_dict_foreach(action_queues, cursor, name, todo) {
 292       XBT_WARN("Still %lu actions for %s", xbt_dynar_length(todo), name);
 293     }
 294   }
 295
 296   if (path)
 297     fclose(action_fp);
 298   xbt_dict_free(&action_queues);
 299   action_queues = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 300 }
 301
 302 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
 303 {
 304   MPI_Request req = request;
 305   smpi_mpi_request_free(&req);
 306 }
 307
 308 /* MPI Low level calls */
 309 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 310                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 311 {
 312   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 313   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 314                           comm, PERSISTENT | SEND | PREPARED);
 315   return request;
 316 }
 317
 318 MPI_Request smpi_mpi_ssend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 319                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 320 {
 321   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 322   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 323                           comm, PERSISTENT | SSEND | SEND | PREPARED);
 324   return request;
 325 }
 326
 327 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 328                                int src, int tag, MPI_Comm comm)
 329 {
 330   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 331   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 332                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 333   return request;
 334 }
 335
 336 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 337 {
 338   smx_rdv_t mailbox;
 339
 340   xbt_assert(!request->action, "Cannot (re)start a non-finished communication");
 341   request->flags &= ~PREPARED;
 342   request->flags &= ~FINISHED;
 343   request->refcount++;
 344
 345   if (request->flags & RECV) {
 346     print_request("New recv", request);
 347
 348     if (request->flags & RMA || request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")){
 349     //We have to check both mailboxes (because SSEND messages are sent to the large mbox). begin with the more appropriate one : the small one.
 350       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 351       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted the small mailbox %p (in case of SSEND)?", mailbox);
 352       smx_action_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 353
 354       if(action ==NULL){
 355         mailbox = smpi_process_mailbox();
 356         XBT_DEBUG("No, nothing in the small mailbox test the other one : %p", mailbox);
 357         action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 358         if(action ==NULL){
 359           XBT_DEBUG("Still notching, switch back to the small mailbox : %p", mailbox);
 360           mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 361           }
 362       }else{
 363         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the large mailbox");
 364       }
 365     }else{
 366       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 367       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted the small mailbox?");
 368     smx_action_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 369
 370       if(action ==NULL){
 371         XBT_DEBUG("No, nothing in the permanent receive mailbox");
 372         mailbox = smpi_process_mailbox();
 373       }else{
 374         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the small mailbox");
 375       }
 376     }
 377
 378     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
 379     double sleeptime = request->detached ? smpi_or(request->size) : 0.0;
 380     if(sleeptime!=0.0){
 381         simcall_process_sleep(sleeptime);
 382         XBT_DEBUG("receiving size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_or(request->size));
 383     }
 384
 385     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 386     request->real_size=request->size;
 387     smpi_datatype_use(request->old_type);
 388     smpi_comm_use(request->comm);
 389     request->action = simcall_comm_irecv(mailbox, request->buf,
 390                                          &request->real_size, &match_recv,
 391                                          &smpi_comm_copy_buffer_callback,
 392                                          request, -1.0);
 393         XBT_DEBUG("recv simcall posted");
 394
 395
 396   } else {
 397
 398
 399     int receiver = request->dst;
 400
 401     #ifdef HAVE_TRACING
 402       int rank = request->src;
 403       if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 404         TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver,request->size);
 405       }
 406     #endif
 407     print_request("New send", request);
 408
 409         //if we are giving back the control to the user without waiting for completion, we have to inject timings
 410     double sleeptime = 0.0;
 411     if(request->detached || (request->flags & (ISEND|SSEND))){// issend should be treated as isend
 412       //isend and send timings may be different
 413       sleeptime = (request->flags & ISEND)? smpi_ois(request->size) : smpi_os(request->size);
 414     }
 415
 416     if(sleeptime != 0.0){
 417         simcall_process_sleep(sleeptime);
 418         XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %f ", request->size, smpi_os(request->size));
 419     }
 420
 421     if (request->flags & RMA || request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
 422       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 423       XBT_DEBUG("Is there a corresponding recv already posted in the large mailbox %p?", mailbox);
 424       smx_action_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, (void*)request);
 425       if(action ==NULL){
 426        if (! (request->flags & SSEND)){
 427          mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 428          XBT_DEBUG("No, nothing in the large mailbox, message is to be sent on the small one %p", mailbox);
 429        } else{
 430          mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 431          XBT_DEBUG("SSEND : Is there a corresponding recv already posted in the small mailbox %p?", mailbox);
 432          action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, (void*)request);
 433          if(action ==NULL){
 434            XBT_DEBUG("No, we are first, send to large mailbox");
 435            mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 436          }
 437        }
 438       }else{
 439         XBT_DEBUG("Yes there was something for us in the large mailbox");
 440       }
 441     }else{
 442       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 443       XBT_DEBUG("Send request %p is in the large mailbox %p (buf: %p)",mailbox, request,request->buf);
 444     }
 445
 446     void* buf = request->buf;
 447     if ( (! (request->flags & SSEND)) && (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/send_is_detached_thres"))) {
 448       void *oldbuf = NULL;
 449       request->detached = 1;
 450       XBT_DEBUG("Send request %p is detached", request);
 451       request->refcount++;
 452       if(request->old_type->has_subtype == 0){
 453         oldbuf = request->buf;
 454         if (!_xbt_replay_is_active() && oldbuf && request->size!=0){
 455           if((smpi_privatize_global_variables)
 456               && ((char*)request->buf >= start_data_exe)
 457               && ((char*)request->buf < start_data_exe + size_data_exe )){
 458             XBT_DEBUG("Privatization : We are sending from a zone inside global memory. Switch data segment ");
 459             smpi_switch_data_segment(request->src);
 460           }
 461           buf = xbt_malloc(request->size);
 462           memcpy(buf,oldbuf,request->size);
 463           XBT_DEBUG("buf %p copied into %p",oldbuf,buf);
 464         }
 465       }
 466     }
 467
 468     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 469     request->real_size=request->size;
 470     smpi_datatype_use(request->old_type);
 471     smpi_comm_use(request->comm);
 472     request->action =
 473       simcall_comm_isend(SIMIX_process_from_PID(request->src+1), mailbox, request->size, -1.0,
 474                          buf, request->real_size,
 475                          &match_send,
 476                          &xbt_free_f, // how to free the userdata if a detached send fails
 477                          &smpi_comm_copy_buffer_callback,
 478                          request,
 479                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
 480                          request->detached);
 481     XBT_DEBUG("send simcall posted");
 482
 483
 484
 485 #ifdef HAVE_TRACING
 486     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == NULL) */
 487     if (request->action)
 488       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
 489
 490 #endif
 491
 492   }
 493
 494 }
 495
 496 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
 497 {
 498   int i;
 499   if(requests==NULL) return;
 500
 501   for(i = 0; i < count; i++) {
 502     smpi_mpi_start(requests[i]);
 503   }
 504 }
 505
 506 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
 507 {
 508   if((*request) != MPI_REQUEST_NULL){
 509     (*request)->refcount--;
 510     if((*request)->refcount<0) xbt_die("wrong refcount");
 511
 512     if((*request)->refcount==0){
 513         print_request("Destroying", (*request));
 514         xbt_free(*request);
 515         *request = MPI_REQUEST_NULL;
 516     }else{
 517         print_request("Decrementing", (*request));
 518     }
 519   }else{
 520       xbt_die("freeing an already free request");
 521   }
 522 }
 523
 524
 525 MPI_Request smpi_rma_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 526                             int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op)
 527 {
 528   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 529   if(op==MPI_OP_NULL){
 530     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, src, dst, tag,
 531                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 532   }else{
 533     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 534                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED | ACCUMULATE);
 535     request->op = op;
 536   }
 537   return request;
 538 }
 539
 540 MPI_Request smpi_rma_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 541                             int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Op op)
 542 {
 543   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 544   if(op==MPI_OP_NULL){
 545     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 546                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 547   }else{
 548     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 549                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED | ACCUMULATE);
 550     request->op = op;
 551   }
 552   return request;
 553 }
 554
 555
 556 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 557                             int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 558 {
 559   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 560   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 561                           comm, PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 562   return request;
 563 }
 564
 565 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 566                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 567 {
 568   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 569   request =  build_request(buf==MPI_BOTTOM?(void*)0:buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 570                            comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND);
 571   smpi_mpi_start(request);
 572   return request;
 573 }
 574
 575 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 576                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 577 {
 578   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 579   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 580                           comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SSEND | SEND);
 581   smpi_mpi_start(request);
 582   return request;
 583 }
 584
 585 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 586                             int src, int tag, MPI_Comm comm)
 587 {
 588   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 589   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 590                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 591   return request;
 592 }
 593
 594 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 595                            int src, int tag, MPI_Comm comm)
 596 {
 597   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 598   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 599                           comm, NON_PERSISTENT | RECV);
 600   smpi_mpi_start(request);
 601   return request;
 602 }
 603
 604 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src,
 605                    int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 606 {
 607   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 608   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 609   smpi_mpi_wait(&request, status);
 610   request = NULL;
 611 }
 612
 613
 614
 615 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst,
 616                    int tag, MPI_Comm comm)
 617 {
 618   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 619   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 620                           comm, NON_PERSISTENT | SEND);
 621
 622   smpi_mpi_start(request);
 623   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 624   request = NULL;
 625 }
 626
 627 void smpi_mpi_ssend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 628                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 629 {
 630   MPI_Request request = NULL; /* MC needs the comm to be set to NULL during the call */
 631   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 632                 comm, NON_PERSISTENT | SSEND | SEND);
 633
 634   smpi_mpi_start(request);
 635   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 636   request = NULL;
 637 }
 638
 639 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 640                        int dst, int sendtag, void *recvbuf, int recvcount,
 641                        MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
 642                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 643 {
 644   MPI_Request requests[2];
 645   MPI_Status stats[2];
 646   int myid=smpi_process_index();
 647   if ((smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst) == myid) && (smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src) == myid)) {
 648       smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 649                                      recvbuf, recvcount, recvtype);
 650       return;
 651   }
 652   requests[0] =
 653     smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
 654   requests[1] =
 655     smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
 656   smpi_mpi_startall(2, requests);
 657   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
 658   smpi_mpi_request_free(&requests[0]);
 659   smpi_mpi_request_free(&requests[1]);
 660   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 661     // Copy receive status
 662     *status = stats[1];
 663   }
 664 }
 665
 666 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
 667 {
 668   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
 669 }
 670
 671 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 672 {
 673   MPI_Request req = *request;
 674   smpi_empty_status(status);
 675
 676   if(!(req->detached && req->flags & SEND)
 677       && !(req->flags & PREPARED)){
 678     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 679       int src = req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src;
 680       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(req->comm), src);
 681       status->MPI_TAG = req->tag == MPI_ANY_TAG ? req->real_tag : req->tag;
 682       status->MPI_ERROR = req->truncated ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
 683       // this handles the case were size in receive differs from size in send
 684       // FIXME: really this should just contain the count of receive-type blocks,
 685       // right?
 686       status->count = req->real_size;
 687     }
 688
 689     print_request("Finishing", req);
 690     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 691
 692     if((req->flags & ACCUMULATE) || (datatype->has_subtype == 1)){
 693       if (!_xbt_replay_is_active()){
 694         if( smpi_privatize_global_variables
 695             && ((char*)req->old_buf >= start_data_exe)
 696             && ((char*)req->old_buf < start_data_exe + size_data_exe )
 697         ){
 698             XBT_VERB("Privatization : We are unserializing to a zone in global memory - Switch data segment ");
 699             smpi_switch_data_segment(smpi_process_index());
 700         }
 701       }
 702
 703       if(datatype->has_subtype == 1){
 704         // This part handles the problem of non-contignous memory
 705         // the unserialization at the reception
 706         s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 707         if(req->flags & RECV)
 708           subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct, req->op);
 709         if(req->detached == 0) free(req->buf);
 710       }else if(req->flags & RECV){//apply op on contiguous buffer for accumulate
 711           int n =req->real_size/smpi_datatype_size(datatype);
 712           smpi_op_apply(req->op, req->buf, req->old_buf, &n, &datatype);
 713       }
 714     }
 715     smpi_comm_unuse(req->comm);
 716     smpi_datatype_unuse(datatype);
 717
 718   }
 719
 720 #ifdef HAVE_TRACING
 721   if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 722     if(req->flags & RECV){
 723       int rank = smpi_process_index();
 724       int src_traced = (req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src);
 725       TRACE_smpi_recv(rank, src_traced, rank);
 726     }
 727   }
 728 #endif
 729
 730   if(req->detached_sender!=NULL){
 731     smpi_mpi_request_free(&(req->detached_sender));
 732   }
 733   if(req->flags & PERSISTENT)
 734     req->action = NULL;
 735   req->flags |= FINISHED;
 736
 737   smpi_mpi_request_free(request);
 738
 739 }
 740
 741 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
 742   int flag;
 743
 744   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
 745
 746   //to avoid deadlocks
 747   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed test will increase it
 748   static int nsleeps = 1;
 749   if(smpi_test_sleep > 0)  simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 750
 751   smpi_empty_status(status);
 752   flag = 1;
 753   if (!((*request)->flags & PREPARED)) {
 754     if ((*request)->action != NULL)
 755       flag = simcall_comm_test((*request)->action);
 756     if (flag) {
 757       finish_wait(request, status);
 758       nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 759       if (*request != MPI_REQUEST_NULL && !((*request)->flags & PERSISTENT))
 760       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 761     }else{
 762       nsleeps++;
 763     }
 764   }
 765   return flag;
 766 }
 767
 768 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
 769                      MPI_Status * status)
 770 {
 771   xbt_dynar_t comms;
 772   int i, flag, size;
 773   int* map;
 774
 775   *index = MPI_UNDEFINED;
 776   flag = 0;
 777   comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
 778   map = xbt_new(int, count);
 779   size = 0;
 780   for(i = 0; i < count; i++) {
 781     if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action &&
 782         !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 783        xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 784        map[size] = i;
 785        size++;
 786     }
 787   }
 788   if(size > 0) {
 789     //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed testany will increase it
 790     static int nsleeps = 1;
 791     if(smpi_test_sleep > 0) simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 792
 793     i = simcall_comm_testany(comms);
 794     // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 795     if(i != -1) {
 796       *index = map[i];
 797       finish_wait(&requests[*index], status);
 798       if (requests[*index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[*index]->flags & NON_PERSISTENT))
 799       requests[*index] = MPI_REQUEST_NULL;
 800       flag = 1;
 801       nsleeps=1;
 802     }else{
 803       nsleeps++;
 804     }
 805   }else{
 806       //all requests are null or inactive, return true
 807       flag=1;
 808       smpi_empty_status(status);
 809   }
 810   xbt_free(map);
 811   xbt_dynar_free(&comms);
 812
 813   return flag;
 814 }
 815
 816
 817 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[],
 818                      MPI_Status status[])
 819 {
 820   MPI_Status stat;
 821   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 822   int flag=1;
 823   int i;
 824   for(i=0; i<count; i++){
 825     if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 826       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
 827         flag=0;
 828       }else{
 829           requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 830       }
 831     }else{
 832       smpi_empty_status(pstat);
 833     }
 834     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 835       status[i] = *pstat;
 836     }
 837   }
 838   return flag;
 839 }
 840
 841 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
 842   int flag=0;
 843   //FIXME find another wait to avoid busy waiting ?
 844   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
 845   while(flag==0){
 846     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
 847     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
 848   }
 849 }
 850
 851 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
 852
 853   MPI_Request request =build_request(NULL, 0, MPI_CHAR, source == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), source), smpi_comm_rank(comm), tag,
 854             comm, PERSISTENT | RECV);
 855
 856   //to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
 857   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
 858   static int nsleeps = 1;
 859   if(smpi_iprobe_sleep > 0)  simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_iprobe_sleep);
 860   // behave like a receive, but don't do it
 861   smx_rdv_t mailbox;
 862
 863   print_request("New iprobe", request);
 864   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
 865     if (sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")>0){
 866         mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 867         XBT_DEBUG("trying to probe the perm recv mailbox");
 868         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 869     }
 870     if (request->action==NULL){
 871         mailbox = smpi_process_mailbox();
 872         XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
 873         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 874     }
 875
 876   if(request->action){
 877     MPI_Request req = (MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data(request->action);
 878     *flag = 1;
 879     if(status != MPI_STATUS_IGNORE && !(req->flags & PREPARED)) {
 880       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(comm), req->src);
 881       status->MPI_TAG = req->tag;
 882       status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 883       status->count = req->real_size;
 884     }
 885     nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 886   }
 887   else {
 888       *flag = 0;
 889       nsleeps++;
 890   }
 891   smpi_mpi_request_free(&request);
 892
 893   return;
 894 }
 895
 896 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 897 {
 898   print_request("Waiting", *request);
 899   if ((*request)->flags & PREPARED) {
 900     smpi_empty_status(status);
 901     return;
 902   }
 903
 904   if ((*request)->action != NULL) { // this is not a detached send
 905     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
 906 #ifdef HAVE_MC
 907   if(MC_is_active() && (*request)->action)
 908     (*request)->action->comm.dst_data = NULL; // dangling pointer : dst_data is freed with a wait, need to set it to NULL for system state comparison
 909 #endif
 910   }
 911
 912   finish_wait(request, status);
 913   if (*request != MPI_REQUEST_NULL && ((*request)->flags & NON_PERSISTENT))
 914       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 915   // FIXME for a detached send, finish_wait is not called:
 916 }
 917
 918 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[],
 919                      MPI_Status * status)
 920 {
 921   xbt_dynar_t comms;
 922   int i, size, index;
 923   int *map;
 924
 925   index = MPI_UNDEFINED;
 926   if(count > 0) {
 927     // Wait for a request to complete
 928     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
 929     map = xbt_new(int, count);
 930     size = 0;
 931     XBT_DEBUG("Wait for one of %d", count);
 932     for(i = 0; i < count; i++) {
 933       if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL
 934           && !(requests[i]->flags & PREPARED)
 935           && !(requests[i]->flags & FINISHED)) {
 936         if (requests[i]->action != NULL) {
 937           XBT_DEBUG("Waiting any %p ", requests[i]);
 938           xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 939           map[size] = i;
 940           size++;
 941         }else{
 942          //This is a finished detached request, let's return this one
 943          size=0;//so we free the dynar but don't do the waitany call
 944          index=i;
 945          finish_wait(&requests[i], status);//cleanup if refcount = 0
 946          if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 947          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;//set to null
 948          break;
 949          }
 950       }
 951     }
 952     if(size > 0) {
 953       i = simcall_comm_waitany(comms);
 954
 955       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 956       if (i != -1) {
 957         index = map[i];
 958         finish_wait(&requests[index], status);
 959         if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 960         requests[index] = MPI_REQUEST_NULL;
 961       }
 962     }
 963     xbt_free(map);
 964     xbt_dynar_free(&comms);
 965   }
 966
 967   if (index==MPI_UNDEFINED)
 968     smpi_empty_status(status);
 969
 970   return index;
 971 }
 972
 973 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[],
 974                       MPI_Status status[])
 975 {
 976   int  index, c;
 977   MPI_Status stat;
 978   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 979   int retvalue = MPI_SUCCESS;
 980   //tag invalid requests in the set
 981   if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 982     for (c = 0; c < count; c++) {
 983       if (requests[c] == MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL ||
 984           (requests[c]->flags & PREPARED)) {
 985         smpi_empty_status(&status[c]);
 986       } else if (requests[c]->src == MPI_PROC_NULL) {
 987         smpi_empty_status(&status[c]);
 988         status[c].MPI_SOURCE = MPI_PROC_NULL;
 989       }
 990     }
 991   }
 992   for(c = 0; c < count; c++) {
 993
 994     if (MC_is_active()) {
 995       smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
 996       index = c;
 997     } else {
 998       index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
 999       if (index == MPI_UNDEFINED)
1000         break;
1001       if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
1002       requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
1003     }
1004     if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1005       status[index] = *pstat;
1006       if (status[index].MPI_ERROR == MPI_ERR_TRUNCATE)
1007         retvalue = MPI_ERR_IN_STATUS;
1008     }
1009   }
1010
1011   return retvalue;
1012 }
1013
1014 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
1015                       MPI_Status status[])
1016 {
1017   int i, count, index;
1018   MPI_Status stat;
1019   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
1020
1021   count = 0;
1022   for(i = 0; i < incount; i++)
1023   {
1024     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
1025     if(index!=MPI_UNDEFINED){
1026       indices[count] = index;
1027       count++;
1028       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1029         status[index] = *pstat;
1030       }
1031      if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
1032      requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
1033     }else{
1034       return MPI_UNDEFINED;
1035     }
1036   }
1037   return count;
1038 }
1039
1040 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
1041                       MPI_Status status[])
1042 {
1043   int i, count, count_dead;
1044   MPI_Status stat;
1045   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
1046
1047   count = 0;
1048   count_dead = 0;
1049   for(i = 0; i < incount; i++) {
1050     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
1051       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
1052          indices[i] = 1;
1053          count++;
1054          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1055            status[i] = *pstat;
1056          }
1057          if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->flags & NON_PERSISTENT)
1058          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
1059       }
1060     }else{
1061       count_dead++;
1062     }
1063   }
1064   if(count_dead==incount)return MPI_UNDEFINED;
1065   else return count;
1066 }
1067
1068 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root,
1069                     MPI_Comm comm)
1070 {
1071   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
1072   nary_tree_bcast(buf, count, datatype, root, comm, 4);
1073 }
1074
1075 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
1076 {
1077   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
1078   nary_tree_barrier(comm, 4);
1079 }
1080
1081 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1082                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1083                      int root, MPI_Comm comm)
1084 {
1085   int system_tag = COLL_TAG_GATHER;
1086   int rank, size, src, index;
1087   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1088   MPI_Request *requests;
1089
1090   rank = smpi_comm_rank(comm);
1091   size = smpi_comm_size(comm);
1092   if(rank != root) {
1093     // Send buffer to root
1094     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1095   } else {
1096     // FIXME: check for errors
1097     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1098     // Local copy from root
1099     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1100                        (char *)recvbuf + root * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
1101     // Receive buffers from senders
1102     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1103     index = 0;
1104     for(src = 0; src < size; src++) {
1105       if(src != root) {
1106         requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + src * recvcount * recvext,
1107                                           recvcount, recvtype,
1108                                           src, system_tag, comm);
1109         index++;
1110       }
1111     }
1112     // Wait for completion of irecv's.
1113     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1114     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1115     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1116       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1117     }
1118     xbt_free(requests);
1119   }
1120 }
1121
1122
1123 void smpi_mpi_reduce_scatter(void *sendbuf, void *recvbuf, int *recvcounts,
1124                        MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1125 {
1126     int i, size, count;
1127     int *displs;
1128     int rank = smpi_process_index();
1129     void *tmpbuf;
1130
1131     /* arbitrarily choose root as rank 0 */
1132     size = smpi_comm_size(comm);
1133     count = 0;
1134     displs = xbt_new(int, size);
1135     for (i = 0; i < size; i++) {
1136       displs[i] = count;
1137       count += recvcounts[i];
1138     }
1139     tmpbuf=(void*)xbt_malloc(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1140     mpi_coll_reduce_fun(sendbuf, tmpbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1141     smpi_mpi_scatterv(tmpbuf, recvcounts, displs, datatype, recvbuf,
1142                       recvcounts[rank], datatype, 0, comm);
1143     xbt_free(displs);
1144     xbt_free(tmpbuf);
1145 }
1146
1147 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1148                       void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
1149                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1150 {
1151   int system_tag = COLL_TAG_GATHERV;
1152   int rank, size, src, index;
1153   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1154   MPI_Request *requests;
1155
1156   rank = smpi_comm_rank(comm);
1157   size = smpi_comm_size(comm);
1158   if(rank != root) {
1159     // Send buffer to root
1160     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1161   } else {
1162     // FIXME: check for errors
1163     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1164     // Local copy from root
1165     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1166                        (char *)recvbuf + displs[root] * recvext,
1167                        recvcounts[root], recvtype);
1168     // Receive buffers from senders
1169     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1170     index = 0;
1171     for(src = 0; src < size; src++) {
1172       if(src != root) {
1173         requests[index] =
1174           smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[src] * recvext,
1175                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
1176         index++;
1177       }
1178     }
1179     // Wait for completion of irecv's.
1180     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1181     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1182     for(src = 0; src < size-1; src++) {
1183       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1184     }
1185     xbt_free(requests);
1186   }
1187 }
1188
1189 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount,
1190                         MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1191                         int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1192                         MPI_Comm comm)
1193 {
1194   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHER;
1195   int rank, size, other, index;
1196   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1197   MPI_Request *requests;
1198
1199   rank = smpi_comm_rank(comm);
1200   size = smpi_comm_size(comm);
1201   // FIXME: check for errors
1202   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1203   // Local copy from self
1204   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1205                      (char *)recvbuf + rank * recvcount * recvext, recvcount,
1206                      recvtype);
1207   // Send/Recv buffers to/from others;
1208   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1209   index = 0;
1210   for(other = 0; other < size; other++) {
1211     if(other != rank) {
1212       requests[index] =
1213         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1214                         comm);
1215       index++;
1216       requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + other * recvcount * recvext,
1217                                         recvcount, recvtype, other,
1218                                         system_tag, comm);
1219       index++;
1220     }
1221   }
1222   // Wait for completion of all comms.
1223   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1224   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1225   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1226     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1227   }
1228   xbt_free(requests);
1229 }
1230
1231 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount,
1232                          MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1233                          int *recvcounts, int *displs,
1234                          MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1235 {
1236   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHERV;
1237   int rank, size, other, index;
1238   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1239   MPI_Request *requests;
1240
1241   rank = smpi_comm_rank(comm);
1242   size = smpi_comm_size(comm);
1243   // FIXME: check for errors
1244   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1245   // Local copy from self
1246   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1247                      (char *)recvbuf + displs[rank] * recvext,
1248                      recvcounts[rank], recvtype);
1249   // Send buffers to others;
1250   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1251   index = 0;
1252   for(other = 0; other < size; other++) {
1253     if(other != rank) {
1254       requests[index] =
1255         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1256                         comm);
1257       index++;
1258       requests[index] =
1259         smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
1260                         recvtype, other, system_tag, comm);
1261       index++;
1262     }
1263   }
1264   // Wait for completion of all comms.
1265   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1266   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1267   for(other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1268     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1269   }
1270   xbt_free(requests);
1271 }
1272
1273 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1274                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1275                       int root, MPI_Comm comm)
1276 {
1277   int system_tag = COLL_TAG_SCATTER;
1278   int rank, size, dst, index;
1279   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1280   MPI_Request *requests;
1281
1282   rank = smpi_comm_rank(comm);
1283   size = smpi_comm_size(comm);
1284   if(rank != root) {
1285     // Recv buffer from root
1286     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1287                   MPI_STATUS_IGNORE);
1288   } else {
1289     // FIXME: check for errors
1290     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1291     // Local copy from root
1292     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1293         smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + root * sendcount * sendext,
1294                            sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1295     }
1296     // Send buffers to receivers
1297     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1298     index = 0;
1299     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1300       if(dst != root) {
1301         requests[index] = smpi_isend_init((char *)sendbuf + dst * sendcount * sendext,
1302                                           sendcount, sendtype, dst,
1303                                           system_tag, comm);
1304         index++;
1305       }
1306     }
1307     // Wait for completion of isend's.
1308     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1309     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1310     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1311       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1312     }
1313     xbt_free(requests);
1314   }
1315 }
1316
1317 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs,
1318                        MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
1319                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1320 {
1321   int system_tag = COLL_TAG_SCATTERV;
1322   int rank, size, dst, index;
1323   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1324   MPI_Request *requests;
1325
1326   rank = smpi_comm_rank(comm);
1327   size = smpi_comm_size(comm);
1328   if(rank != root) {
1329     // Recv buffer from root
1330     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1331                   MPI_STATUS_IGNORE);
1332   } else {
1333     // FIXME: check for errors
1334     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1335     // Local copy from root
1336     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1337       smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
1338                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1339     }
1340     // Send buffers to receivers
1341     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1342     index = 0;
1343     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1344       if(dst != root) {
1345         requests[index] =
1346           smpi_isend_init((char *)sendbuf + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
1347                           sendtype, dst, system_tag, comm);
1348         index++;
1349       }
1350     }
1351     // Wait for completion of isend's.
1352     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1353     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1354     for(dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1355       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1356     }
1357     xbt_free(requests);
1358   }
1359 }
1360
1361 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1362                      MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
1363                      MPI_Comm comm)
1364 {
1365   int system_tag = COLL_TAG_REDUCE;
1366   int rank, size, src, index;
1367   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1368   MPI_Request *requests;
1369   void **tmpbufs;
1370
1371
1372   char* sendtmpbuf = (char*) sendbuf;
1373   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1374     sendtmpbuf = (char *)xbt_malloc(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1375     smpi_datatype_copy(recvbuf, count, datatype,sendtmpbuf, count, datatype);
1376   }
1377
1378   rank = smpi_comm_rank(comm);
1379   size = smpi_comm_size(comm);
1380   //non commutative case, use a working algo from openmpi
1381   if(!smpi_op_is_commute(op)){
1382     smpi_coll_tuned_reduce_ompi_basic_linear(sendtmpbuf, recvbuf, count,
1383                      datatype, op, root, comm);
1384     return;
1385   }
1386
1387   if(rank != root) {
1388     // Send buffer to root
1389     smpi_mpi_send(sendtmpbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
1390   } else {
1391     // FIXME: check for errors
1392     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1393     // Local copy from root
1394     if (sendtmpbuf && recvbuf)
1395       smpi_datatype_copy(sendtmpbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1396     // Receive buffers from senders
1397     //TODO: make a MPI_barrier here ?
1398     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1399     tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
1400     index = 0;
1401     for(src = 0; src < size; src++) {
1402       if(src != root) {
1403         // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1404         //  mapping...
1405         tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1406         requests[index] =
1407           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src,
1408                           system_tag, comm);
1409         index++;
1410       }
1411     }
1412     // Wait for completion of irecv's.
1413     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1414     for(src = 0; src < size - 1; src++) {
1415       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1416       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
1417       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1418         break;
1419       }else{
1420         smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1421       }
1422       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
1423         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1424     }
1425     for(index = 0; index < size - 1; index++) {
1426       xbt_free(tmpbufs[index]);
1427     }
1428     xbt_free(tmpbufs);
1429     xbt_free(requests);
1430
1431     if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1432       xbt_free(sendtmpbuf);
1433     }
1434   }
1435 }
1436
1437 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1438                         MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1439 {
1440   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1441   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
1442 }
1443
1444 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1445                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1446 {
1447   int system_tag = -888;
1448   int rank, size, other, index;
1449   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1450   MPI_Request *requests;
1451   void **tmpbufs;
1452
1453   rank = smpi_comm_rank(comm);
1454   size = smpi_comm_size(comm);
1455
1456   // FIXME: check for errors
1457   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1458
1459   // Local copy from self
1460   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1461
1462   // Send/Recv buffers to/from others;
1463   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1464   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1465   index = 0;
1466   for(other = 0; other < rank; other++) {
1467     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1468     // mapping...
1469     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1470     requests[index] =
1471       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1472                       comm);
1473     index++;
1474   }
1475   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1476     requests[index] =
1477       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1478     index++;
1479   }
1480   // Wait for completion of all comms.
1481   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1482
1483   if(smpi_op_is_commute(op)){
1484     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1485       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1486       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1487         break;
1488       }
1489       if(index < rank) {
1490         // #Request is below rank: it's a irecv
1491         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1492       }
1493     }
1494   }else{
1495     //non commutative case, wait in order
1496     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1497       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1498       if(index < rank) {
1499         smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1500       }
1501     }
1502   }
1503   for(index = 0; index < rank; index++) {
1504     xbt_free(tmpbufs[index]);
1505   }
1506   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1507     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1508   }
1509   xbt_free(tmpbufs);
1510   xbt_free(requests);
1511 }
1512
1513 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1514                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1515 {
1516   int system_tag = -888;
1517   int rank, size, other, index;
1518   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1519   MPI_Request *requests;
1520   void **tmpbufs;
1521   int recvbuf_is_empty=1;
1522   rank = smpi_comm_rank(comm);
1523   size = smpi_comm_size(comm);
1524
1525   // FIXME: check for errors
1526   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1527
1528   // Send/Recv buffers to/from others;
1529   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1530   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1531   index = 0;
1532   for(other = 0; other < rank; other++) {
1533     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1534     // mapping...
1535     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1536     requests[index] =
1537       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1538                       comm);
1539     index++;
1540   }
1541   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1542     requests[index] =
1543       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1544     index++;
1545   }
1546   // Wait for completion of all comms.
1547   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1548   if(smpi_op_is_commute(op)){
1549     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1550       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1551       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1552         break;
1553       }
1554       if(index < rank) {
1555         if(recvbuf_is_empty){
1556           smpi_datatype_copy(tmpbufs[index], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1557           recvbuf_is_empty=0;
1558         }else
1559         // #Request is below rank: it's a irecv
1560         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1561       }
1562     }
1563   }else{
1564     //non commutative case, wait in order
1565     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1566       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1567       if(index < rank) {
1568           if(recvbuf_is_empty){
1569             smpi_datatype_copy(tmpbufs[other], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1570             recvbuf_is_empty=0;
1571           }else smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1572       }
1573     }
1574   }
1575   for(index = 0; index < rank; index++) {
1576     xbt_free(tmpbufs[index]);
1577   }
1578   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1579     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1580   }
1581   xbt_free(tmpbufs);
1582   xbt_free(requests);
1583 }