src/xbt/graph.c

   1 /* a generic graph library.                                                 */
   2
   3 /* Copyright (c) 2006-2014. The SimGrid Team.
   4  * All rights reserved.                                                     */
   5
   6 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   7  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   8
   9 #include "xbt/sysdep.h"
  10 #include "xbt/log.h"
  11 #include "xbt/graph.h"
  12 #include "graph_private.h"
  13 #include "xbt/graphxml_parse.h"
  14 #include "xbt/dict.h"
  15 #include "xbt/heap.h"
  16 #include "xbt/str.h"
  17 #include "xbt/file.h"
  18
  19 #include <errno.h>
  20 #include <stdlib.h>
  21
  22
  23 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(xbt_graph, xbt, "Graph");
  24
  25
  26
  27 /** @brief Constructor
  28  *  @return a new graph
  29  */
  30 xbt_graph_t xbt_graph_new_graph(unsigned short int directed, void *data)
  31 {
  32   xbt_graph_t graph = NULL;
  33   graph = xbt_new0(struct xbt_graph, 1);
  34   graph->directed = directed;
  35   graph->data = data;
  36   graph->nodes = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_node_t), NULL);
  37   graph->edges = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  38
  39   return graph;
  40 }
  41
  42 /** @brief add a node to the given graph */
  43 xbt_node_t xbt_graph_new_node(xbt_graph_t g, void *data)
  44 {
  45   xbt_node_t node = NULL;
  46   node = xbt_new0(struct xbt_node, 1);
  47   node->data = data;
  48   if (g->directed)
  49     /* only the "out" field is used */
  50     node->in = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  51
  52   node->out = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  53   node->position_x = -1.0;
  54   node->position_y = -1.0;
  55
  56   xbt_dynar_push(g->nodes, &node);
  57
  58   return node;
  59 }
  60
  61 /** @brief add an edge to the given graph */
  62 xbt_edge_t xbt_graph_new_edge(xbt_graph_t g,
  63                               xbt_node_t src, xbt_node_t dst, void *data)
  64 {
  65   xbt_edge_t edge = NULL;
  66
  67   edge = xbt_new0(struct xbt_edge, 1);
  68   xbt_dynar_push(src->out, &edge);
  69   if (g->directed)
  70     xbt_dynar_push(dst->in, &edge);
  71   else                          /* only the "out" field is used */
  72     xbt_dynar_push(dst->out, &edge);
  73
  74   edge->data = data;
  75   edge->src = src;
  76   edge->dst = dst;
  77
  78   xbt_dynar_push(g->edges, &edge);
  79
  80   return edge;
  81 }
  82
  83 /** @brief Get the edge connecting src and dst */
  84 xbt_edge_t xbt_graph_get_edge(xbt_graph_t g, xbt_node_t src,
  85                               xbt_node_t dst)
  86 {
  87   xbt_edge_t edge;
  88   unsigned int cursor;
  89
  90   xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  91     XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  92     if ((edge->src == src) && (edge->dst == dst))
  93       return edge;
  94   }
  95   if (!g->directed) {
  96     xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  97       XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  98       if ((edge->dst == src) && (edge->src == dst))
  99         return edge;
 100     }
 101   }
 102   return NULL;
 103 }
 104
 105 /** @brief Get the user data associated to a node */
 106 void *xbt_graph_node_get_data(xbt_node_t node)
 107 {
 108   return node->data;
 109 }
 110
 111 /** @brief Set the user data associated to a node */
 112 void xbt_graph_node_set_data(xbt_node_t node, void *data)
 113 {
 114   node->data = data;
 115 }
 116
 117 /** @brief Get the user data associated to a edge */
 118 void *xbt_graph_edge_get_data(xbt_edge_t edge)
 119 {
 120   return edge->data;
 121 }
 122
 123 /** @brief Set the user data associated to a edge */
 124 void xbt_graph_edge_set_data(xbt_edge_t edge, void *data)
 125 {
 126   edge->data = data;
 127 }
 128
 129 /** @brief Destructor
 130  *  @param g: poor victim
 131  *  @param node_free_function: function to use to free data associated to each node
 132  *  @param edge_free_function: function to use to free data associated to each edge
 133  *  @param graph_free_function: function to use to free data associated to g
 134  *
 135  * Free the graph structure.
 136  */
 137 void xbt_graph_free_graph(xbt_graph_t g,
 138                           void_f_pvoid_t node_free_function,
 139                           void_f_pvoid_t edge_free_function,
 140                           void_f_pvoid_t graph_free_function)
 141 {
 142   unsigned int cursor;
 143   xbt_node_t node;
 144   xbt_edge_t edge;
 145
 146   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 147     if (edge_free_function)
 148       edge_free_function(edge->data);
 149     free(edge);
 150   }
 151   xbt_dynar_free(&(g->edges));
 152
 153   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 154     xbt_dynar_free(&(node->out));
 155     xbt_dynar_free(&(node->in));
 156     if (node_free_function)
 157       node_free_function(node->data);
 158     free(node);
 159   }
 160   xbt_dynar_free(&(g->nodes));
 161
 162   if (graph_free_function)
 163     graph_free_function(g->data);
 164   free(g);
 165   xbt_graph_parse_lex_destroy();
 166 }
 167
 168
 169 /** @brief remove the given node from the given graph */
 170 void xbt_graph_free_node(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 171                          void_f_pvoid_t node_free_function,
 172                          void_f_pvoid_t edge_free_function)
 173 {
 174   unsigned long nbr;
 175   unsigned long i;
 176   unsigned int cursor = 0;
 177   xbt_node_t node = NULL;
 178   xbt_edge_t edge = NULL;
 179
 180   nbr = xbt_dynar_length(g->edges);
 181   cursor = 0;
 182   for (i = 0; i < nbr; i++) {
 183     xbt_dynar_get_cpy(g->edges, cursor, &edge);
 184
 185     if ((edge->dst == n) || (edge->src == n)) {
 186       xbt_graph_free_edge(g, edge, edge_free_function);
 187     } else
 188       cursor++;
 189   }
 190
 191   if ((node_free_function) && (n->data))
 192     node_free_function(n->data);
 193
 194   cursor = 0;
 195   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 196       if (node == n)
 197     xbt_dynar_cursor_rm(g->nodes, &cursor);
 198
 199   xbt_dynar_free(&(n->in));
 200   xbt_dynar_free(&(n->out));
 201
 202   free(n);
 203
 204   return;
 205 }
 206
 207 /** @brief remove the given edge from the given graph */
 208 void xbt_graph_free_edge(xbt_graph_t g, xbt_edge_t e,
 209                          void_f_pvoid_t free_function)
 210 {
 211   int idx;
 212   unsigned int cursor = 0;
 213   xbt_edge_t edge = NULL;
 214
 215   if ((free_function) && (e->data))
 216     free_function(e->data);
 217
 218   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 219     if (edge == e) {
 220       if (g->directed) {
 221         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->in, edge);
 222         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->in, idx, NULL);
 223       } else {                  /* only the out field is used */
 224         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->out, edge);
 225         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->out, idx, NULL);
 226       }
 227
 228       idx = __xbt_find_in_dynar(edge->src->out, edge);
 229       xbt_dynar_remove_at(edge->src->out, idx, NULL);
 230
 231       xbt_dynar_cursor_rm(g->edges, &cursor);
 232       free(edge);
 233       break;
 234     }
 235   }
 236 }
 237
 238 int __xbt_find_in_dynar(xbt_dynar_t dynar, void *p)
 239 {
 240
 241   unsigned int cursor = 0;
 242   void *tmp = NULL;
 243
 244   xbt_dynar_foreach(dynar, cursor, tmp) {
 245     if (tmp == p)
 246       return cursor;
 247   }
 248   return -1;
 249 }
 250
 251 /** @brief Retrieve the graph's nodes as a dynar */
 252 xbt_dynar_t xbt_graph_get_nodes(xbt_graph_t g)
 253 {
 254   return g->nodes;
 255 }
 256
 257 /** @brief Retrieve the graph's edges as a dynar */
 258 xbt_dynar_t xbt_graph_get_edges(xbt_graph_t g)
 259 {
 260   return g->edges;
 261 }
 262
 263 /** @brief Retrieve the node at the source of the given edge */
 264 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_source(xbt_edge_t e)
 265 {
 266   return e->src;
 267 }
 268
 269 /** @brief Retrieve the node being the target of the given edge */
 270 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_target(xbt_edge_t e)
 271 {
 272   return e->dst;
 273 }
 274
 275 /** @brief Retrieve the outgoing edges of the given node */
 276 xbt_dynar_t xbt_graph_node_get_outedges(xbt_node_t n)
 277 {
 278   return n->out;
 279 }
 280
 281 /** @brief Set the weight of the given edge */
 282 void xbt_graph_edge_set_length(xbt_edge_t e, double length)
 283 {
 284   e->length = length;
 285
 286 }
 287
 288 /** @brief Get the length of a edge */
 289 double xbt_graph_edge_get_length(xbt_edge_t edge)
 290 {
 291   return edge->length;
 292 }
 293
 294
 295 /** @brief construct the adjacency matrix corresponding to the given graph
 296  *
 297  * The weights are the distances between nodes
 298  */
 299 double *xbt_graph_get_length_matrix(xbt_graph_t g)
 300 {
 301   unsigned int cursor = 0;
 302   unsigned int in_cursor = 0;
 303   unsigned long idx, i;
 304   unsigned long n;
 305   xbt_edge_t edge = NULL;
 306   xbt_node_t node = NULL;
 307   double *d = NULL;
 308
 309 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 310   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 311
 312   d = (double *) xbt_new0(double, n * n);
 313
 314   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 315     d[i] = -1.0;
 316   }
 317
 318   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 319     D(cursor, cursor) = 0;
 320
 321     xbt_dynar_foreach(node->out, in_cursor, edge) {
 322       if (edge->dst == node)
 323         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->src);
 324       else                      /*case of  undirected graphs */
 325         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->dst);
 326       D(cursor, idx) = edge->length;
 327     }
 328   }
 329
 330 # undef D
 331
 332   return d;
 333 }
 334
 335 /** @brief Floyd-Warshall algorithm for shortest path finding
 336  *
 337  * From wikipedia:
 338  *
 339  * The Floyd–Warshall algorithm takes as input an adjacency matrix
 340  * representation of a weighted, directed graph (V, E). The weight of a
 341  * path between two vertices is the sum of the weights of the edges along
 342  * that path. The edges E of the graph may have negative weights, but the
 343  * graph must not have any negative weight cycles. The algorithm computes,
 344  * for each pair of vertices, the minimum weight among all paths between
 345  * the two vertices. The running time complexity is Θ(|V|3).
 346  */
 347 void xbt_floyd_algorithm(xbt_graph_t g, double *adj, double *d,
 348                          xbt_node_t * p)
 349 {
 350   unsigned long i, j, k;
 351   unsigned long n;
 352   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 353
 354 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 355 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 356
 357   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 358     d[i] = adj[i];
 359   }
 360
 361
 362   for (i = 0; i < n; i++) {
 363     for (j = 0; j < n; j++) {
 364       if (D(i, j) != -1) {
 365         P(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, i));
 366       }
 367     }
 368   }
 369
 370   for (k = 0; k < n; k++) {
 371     for (i = 0; i < n; i++) {
 372       for (j = 0; j < n; j++) {
 373         if ((D(i, k) != -1) && (D(k, j) != -1)) {
 374           if ((D(i, j) == -1) || (D(i, j) > D(i, k) + D(k, j))) {
 375             D(i, j) = D(i, k) + D(k, j);
 376             P(i, j) = P(k, j);
 377           }
 378         }
 379       }
 380     }
 381   }
 382
 383
 384
 385 # undef P
 386 # undef D
 387 }
 388
 389 /** @brief computes all-pairs shortest paths */
 390 xbt_node_t *xbt_graph_shortest_paths(xbt_graph_t g)
 391 {
 392   xbt_node_t *p;
 393   xbt_node_t *r;
 394   unsigned long i, j, k;
 395   unsigned long n;
 396
 397   double *adj = NULL;
 398   double *d = NULL;
 399
 400 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 401 # define R(u,v) r[(u)*n+(v)]
 402
 403   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 404   adj = xbt_graph_get_length_matrix(g);
 405   d = xbt_new0(double, n * n);
 406   p = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 407   r = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 408
 409   xbt_floyd_algorithm(g, adj, d, p);
 410
 411   for (i = 0; i < n; i++) {
 412     for (j = 0; j < n; j++) {
 413       k = j;
 414
 415       while ((P(i, k)) && (__xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k)) != i)) {
 416         k = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k));
 417       }
 418
 419       if (P(i, j)) {
 420         R(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, k));
 421       }
 422     }
 423   }
 424 # undef R
 425 # undef P
 426
 427   free(d);
 428   free(p);
 429   free(adj);
 430   return r;
 431 }
 432
 433 /** @brief Extract a spanning tree of the given graph */
 434 xbt_edge_t *xbt_graph_spanning_tree_prim(xbt_graph_t g)
 435 {
 436   int tree_size = 0;
 437   int tree_size_max = xbt_dynar_length(g->nodes) - 1;
 438   xbt_edge_t *tree = xbt_new0(xbt_edge_t, tree_size_max);
 439   xbt_edge_t e, edge;
 440   xbt_node_t node = NULL;
 441   xbt_dynar_t edge_list = NULL;
 442   xbt_heap_t heap = xbt_heap_new(10, NULL);
 443   unsigned int cursor;
 444
 445   xbt_assert(!(g->directed),
 446               "Spanning trees do not make sense on directed graphs");
 447
 448   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 449     node->xbtdata = NULL;
 450   }
 451
 452   node = xbt_dynar_getfirst_as(g->nodes, xbt_node_t);
 453   node->xbtdata = (void *) 1;
 454   edge_list = node->out;
 455   xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e)
 456       xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 457
 458   while ((edge = xbt_heap_pop(heap))) {
 459     if ((edge->src->xbtdata) && (edge->dst->xbtdata))
 460       continue;
 461     tree[tree_size++] = edge;
 462     if (!(edge->src->xbtdata)) {
 463       edge->src->xbtdata = (void *) 1;
 464       edge_list = edge->src->out;
 465       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 466         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 467       }
 468     } else {
 469       edge->dst->xbtdata = (void *) 1;
 470       edge_list = edge->dst->out;
 471       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 472         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 473       }
 474     }
 475     if (tree_size == tree_size_max)
 476       break;
 477   }
 478
 479   xbt_heap_free(heap);
 480
 481   return tree;
 482 }
 483
 484 /** @brief Topological sort on the given graph
 485  *
 486  *  From wikipedia:
 487  *
 488  * In graph theory, a topological sort of a directed acyclic graph (DAG) is
 489  * a linear ordering of its nodes which is compatible with the partial
 490  * order R induced on the nodes where x comes before y (xRy) if there's a
 491  * directed path from x to y in the DAG. An equivalent definition is that
 492  * each node comes before all nodes to which it has edges. Every DAG has at
 493  * least one topological sort, and may have many.
 494  */
 495 xbt_node_t *xbt_graph_topo_sort(xbt_graph_t g)
 496 {
 497
 498   xbt_node_t *sorted;
 499   unsigned int cursor;
 500   int idx;
 501   xbt_node_t node;
 502   unsigned long n;
 503
 504   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 505   idx = n - 1;
 506
 507   sorted = xbt_malloc(n * sizeof(xbt_node_t));
 508
 509   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 510       node->xbtdata = xbt_new0(int, 1);
 511
 512   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 513       xbt_graph_depth_visit(g, node, sorted, &idx);
 514
 515   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 516     free(node->xbtdata);
 517     node->xbtdata = NULL;
 518   }
 519
 520   return sorted;
 521 }
 522
 523 /** @brief First-depth graph traversal */
 524 void xbt_graph_depth_visit(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 525                            xbt_node_t * sorted, int *idx)
 526 {
 527   unsigned int cursor;
 528   xbt_edge_t edge;
 529
 530   if (*((int *) (n->xbtdata)) == ALREADY_EXPLORED)
 531     return;
 532   else if (*((int *) (n->xbtdata)) == CURRENTLY_EXPLORING)
 533     THROWF(0, 0, "There is a cycle");
 534   else {
 535     *((int *) (n->xbtdata)) = CURRENTLY_EXPLORING;
 536
 537     xbt_dynar_foreach(n->out, cursor, edge) {
 538       xbt_graph_depth_visit(g, edge->dst, sorted, idx);
 539     }
 540
 541     *((int *) (n->xbtdata)) = ALREADY_EXPLORED;
 542     sorted[(*idx)--] = n;
 543   }
 544 }
 545
 546 /********************* Import and Export ******************/
 547 static xbt_graph_t parsed_graph = NULL;
 548 static xbt_dict_t parsed_nodes = NULL;
 549
 550 static void *(*__parse_node_label_and_data) (xbt_node_t, const char *,
 551                                              const char *) = NULL;
 552 static void *(*__parse_edge_label_and_data) (xbt_edge_t, const char *,
 553                                              const char *) = NULL;
 554
 555 static void __parse_graph_begin(void)
 556 {
 557   XBT_DEBUG("<graph>");
 558   if (A_graphxml_graph_isDirected == A_graphxml_graph_isDirected_true)
 559     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(1, NULL);
 560   else
 561     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(0, NULL);
 562
 563   parsed_nodes = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 564 }
 565
 566 static void __parse_graph_end(void)
 567 {
 568   xbt_dict_free(&parsed_nodes);
 569   XBT_DEBUG("</graph>");
 570 }
 571
 572 static void __parse_node(void)
 573 {
 574   xbt_node_t node = xbt_graph_new_node(parsed_graph, NULL);
 575
 576   XBT_DEBUG("<node name=\"%s\"/>", A_graphxml_node_name);
 577   if (__parse_node_label_and_data)
 578     node->data = __parse_node_label_and_data(node, A_graphxml_node_label,
 579                                              A_graphxml_node_data);
 580   node->position_x = xbt_graph_parse_get_double(A_graphxml_node_position___x);
 581   node->position_y = xbt_graph_parse_get_double(A_graphxml_node_position___y);
 582
 583   xbt_dict_set(parsed_nodes, A_graphxml_node_name, (void *) node, NULL);
 584 }
 585
 586 static void __parse_edge(void)
 587 {
 588   xbt_edge_t edge = xbt_graph_new_edge(parsed_graph,
 589                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 590                                                     A_graphxml_edge_source),
 591                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 592                                                     A_graphxml_edge_target),
 593                                        NULL);
 594
 595   if (__parse_edge_label_and_data)
 596     edge->data = __parse_edge_label_and_data(edge, A_graphxml_edge_label,
 597                                              A_graphxml_edge_data);
 598
 599   edge->length = xbt_graph_parse_get_double(A_graphxml_edge_length);
 600
 601   XBT_DEBUG("<edge  source=\"%s\" target=\"%s\" length=\"%f\"/>",
 602          (char *) (edge->src)->data,
 603          (char *) (edge->dst)->data, xbt_graph_edge_get_length(edge));
 604 }
 605
 606 /** @brief Import a graph from a file following the GraphXML format */
 607 xbt_graph_t xbt_graph_read(const char *filename,
 608                            void *(*node_label_and_data) (xbt_node_t,
 609                                                          const char *,
 610                                                          const char *),
 611                            void *(*edge_label_and_data) (xbt_edge_t,
 612                                                          const char *,
 613                                                          const char *))
 614 {
 615
 616   xbt_graph_t graph = NULL;
 617
 618   __parse_node_label_and_data = node_label_and_data;
 619   __parse_edge_label_and_data = edge_label_and_data;
 620
 621   xbt_graph_parse_reset_parser();
 622
 623   STag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_begin;
 624   ETag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_end;
 625   ETag_graphxml_node_fun = __parse_node;
 626   ETag_graphxml_edge_fun = __parse_edge;
 627
 628   xbt_graph_parse_open(filename);
 629   XBT_ATTRIB_UNUSED int res;
 630   res = xbt_graph_parse();
 631   xbt_assert(!res, "Parse error in %s", filename);
 632   xbt_graph_parse_close();
 633
 634   graph = parsed_graph;
 635   parsed_graph = NULL;
 636
 637   return graph;
 638 }
 639
 640 /** @brief Export the given graph in the GraphViz formatting for visualization */
 641 void xbt_graph_export_graphviz(xbt_graph_t g, const char *filename,
 642                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 643                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t))
 644 {
 645   unsigned int cursor = 0;
 646   xbt_node_t node = NULL;
 647   xbt_edge_t edge = NULL;
 648   FILE *file = NULL;
 649   const char *name = NULL;
 650
 651   file = fopen(filename, "w");
 652   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 653
 654   if (g->directed)
 655     fprintf(file, "digraph test {\n");
 656   else
 657     fprintf(file, "graph test {\n");
 658
 659   fprintf(file, "  graph [overlap=scale]\n");
 660
 661   fprintf(file, "  node [shape=box, style=filled]\n");
 662   fprintf(file,
 663           "  node [width=.3, height=.3, style=filled, color=skyblue]\n\n");
 664
 665   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 666     if (node_name){
 667       fprintf(file, "  \"%s\";\n", node_name(node));
 668     }else{
 669       fprintf(file, "  \"%p\";\n", node);
 670     }
 671   }
 672   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 673     const char *c;
 674     const char *c_dir = "->";
 675     const char *c_ndir = "--";
 676     if (g->directed){
 677       c = c_dir;
 678     }else{
 679       c = c_ndir;
 680     }
 681     const char *src_name, *dst_name;
 682     if (node_name){
 683       src_name = node_name(edge->src);
 684       dst_name = node_name(edge->dst);
 685       fprintf(file, "  \"%s\" %s \"%s\"", src_name, c, dst_name);
 686     }else{
 687       fprintf(file, "  \"%p\" %s \"%p\"", edge->src, c, edge->dst);
 688     }
 689
 690     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 691       fprintf(file, "[label=\"%s\"]", name);
 692     fprintf(file, ";\n");
 693   }
 694   fprintf(file, "}\n");
 695   fclose(file);
 696 }
 697
 698 /** @brief Export the given graph in the GraphXML format */
 699 void xbt_graph_export_graphxml(xbt_graph_t g, const char *filename,
 700                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 701                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t),
 702                                const char *(node_data_print) (void *),
 703                                const char *(edge_data_print) (void *))
 704 {
 705   unsigned int cursor = 0;
 706   xbt_node_t node = NULL;
 707   xbt_edge_t edge = NULL;
 708   FILE *file = NULL;
 709   const char *name = NULL;
 710
 711   file = fopen(filename, "w");
 712   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 713
 714   fprintf(file, "<?xml version='1.0'?>\n");
 715   fprintf(file, "<!DOCTYPE graph SYSTEM \"graphxml.dtd\">\n");
 716   if (g->directed)
 717     fprintf(file, "<graph isDirected=\"true\">\n");
 718   else
 719     fprintf(file, "<graph isDirected=\"false\">\n");
 720   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 721     fprintf(file, "  <node name=\"%p\" ", node);
 722     if ((node_name) && ((name = node_name(node))))
 723       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 724     if ((node_data_print) && ((name = node_data_print(node->data))))
 725       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 726     fprintf(file, "/>\n");
 727   }
 728   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 729     fprintf(file, "  <edge source=\"%p\" target =\"%p\" ",
 730             edge->src, edge->dst);
 731     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 732       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 733     if (edge->length >= 0.0)
 734       fprintf(file, "length=\"%g\" ", edge->length);
 735     if ((edge_data_print) && ((name = edge_data_print(edge->data))))
 736       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 737     fprintf(file, "/>\n");
 738   }
 739   fprintf(file, "</graph>\n");
 740   fclose(file);
 741 }
 742
 743 /** @brief Load a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 744 xbt_graph_t xbt_graph_load (const char *filename)
 745 {
 746   FILE *file = NULL;
 747   ssize_t read;
 748   file = fopen (filename, "r");
 749   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 750
 751   xbt_dict_t nodes_dict = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 752   xbt_graph_t ret = xbt_graph_new_graph (0, NULL);
 753
 754   //read the number of nodes
 755   size_t size;
 756   char *nnodes_str = NULL;
 757   read = xbt_getline (&nnodes_str, &size, file);
 758   if (read == -1)
 759     THROWF(system_error, 0, "xbt_getline failed to read the number of nodes (errno = %d)", errno);
 760   int i, nnodes = atoi (nnodes_str);
 761   free (nnodes_str);
 762
 763   //read all nodes
 764   for (i = 0; i < nnodes; i++){
 765     char *node_str = NULL;
 766     read = xbt_getline (&node_str, &size, file);
 767     if (read == -1)
 768       THROWF(system_error, 0, "xbt_getline failed to read all nodes (errno = %d)", errno);
 769     xbt_node_t n;
 770     char *name = xbt_strdup (node_str);
 771     xbt_str_subst (name, '\n', '\0', 0);
 772     n = xbt_graph_new_node (ret, name);
 773     xbt_dict_set (nodes_dict, name, n, NULL);
 774     free (node_str);
 775   }
 776
 777   //read the number of edges
 778   char *nedges_str = NULL;
 779   read = xbt_getline (&nedges_str, &size, file);
 780   if (read == -1)
 781     THROWF(system_error, 0, "xbt_getline failed to read the number of edges (errno = %d)", errno);
 782   int nedges = atoi (nedges_str);
 783   free (nedges_str);
 784
 785   //read all edges
 786   for (i = 0; i < nedges; i++){
 787     char *edge_str = NULL, edge_id[200], node_source[200], node_target[200];
 788     read = xbt_getline (&edge_str, &size, file);
 789     if (read == -1)
 790       THROWF(system_error, 0, "xbt_getline failed to read all edges (errno = %d)", errno);
 791     sscanf (edge_str, "%s %s %s", edge_id, node_source, node_target);
 792     free (edge_str);
 793     xbt_str_subst (edge_id, '\n', '\0', 0);
 794     xbt_str_subst (node_source, '\n', '\0', 0);
 795     xbt_str_subst (node_target, '\n', '\0', 0);
 796
 797     xbt_node_t source = xbt_dict_get (nodes_dict, node_source);
 798     xbt_node_t target = xbt_dict_get (nodes_dict, node_target);
 799     xbt_graph_new_edge (ret, source, target, xbt_strdup(edge_id));
 800   }
 801   xbt_dict_free (&nodes_dict);
 802   return ret;
 803 }
 804
 805 /** @brief Save a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 806 void xbt_graph_save (xbt_graph_t span,
 807                      const char *filename,
 808                      const char *(nname) (xbt_node_t),
 809                      const char *(ename) (xbt_edge_t))
 810 {
 811   FILE *file = NULL;
 812   file = fopen(filename, "w");
 813   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 814
 815   xbt_dynar_t nodes = xbt_graph_get_nodes (span);
 816   xbt_dynar_t edges = xbt_graph_get_edges (span);
 817   unsigned int cpt;
 818   xbt_node_t node;
 819   fprintf (file, "%lu\n", xbt_dynar_length (nodes));
 820   xbt_dynar_foreach (nodes, cpt, node) {
 821     if (nname){
 822       fprintf (file, "%s\n", nname(node));
 823     }else{
 824       fprintf (file, "%p\n", node);
 825     }
 826   }
 827   fprintf (file, "%lu\n", xbt_dynar_length (edges));
 828   xbt_edge_t edge;
 829   xbt_dynar_foreach (edges, cpt, edge) {
 830     xbt_node_t source = xbt_graph_edge_get_source (edge);
 831     xbt_node_t target = xbt_graph_edge_get_target (edge);
 832     if (ename){
 833       if (nname){
 834         fprintf (file, "%s %s %s\n", ename(edge), nname(source), nname(target));
 835       }else{
 836         fprintf (file, "%s %p %p\n", ename(edge), source, target);
 837       }
 838     }else{
 839       if (nname){
 840         fprintf (file, "%p %s %s\n", edge, nname(source), nname(target));
 841       }else{
 842         fprintf (file, "%p %p %p\n", edge, source, target);
 843       }
 844     }
 845   }
 846   fclose (file);
 847 }