src/xbt/graph.c

   1 /* a generic graph library.                                                 */
   2
   3 /* Copyright (c) 2006, 2007, 2008, 2009, 2010. The SimGrid Team.
   4  * All rights reserved.                                                     */
   5
   6 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   7  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   8
   9 #include <stdlib.h>
  10 #include "xbt/sysdep.h"
  11 #include "xbt/log.h"
  12 #include "xbt/graph.h"
  13 #include "graph_private.h"
  14 #include "xbt/graphxml_parse.h"
  15 #include "xbt/dict.h"
  16 #include "xbt/heap.h"
  17 #include "xbt/str.h"
  18
  19
  20
  21
  22 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(xbt_graph, xbt, "Graph");
  23
  24
  25
  26 /** @brief Constructor
  27  *  @return a new graph
  28  */
  29 xbt_graph_t xbt_graph_new_graph(unsigned short int directed, void *data)
  30 {
  31   xbt_graph_t graph = NULL;
  32   graph = xbt_new0(struct xbt_graph, 1);
  33   graph->directed = directed;
  34   graph->data = data;
  35   graph->nodes = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_node_t), NULL);
  36   graph->edges = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  37
  38   return graph;
  39 }
  40
  41 /** @brief add a node to the given graph */
  42 xbt_node_t xbt_graph_new_node(xbt_graph_t g, void *data)
  43 {
  44   xbt_node_t node = NULL;
  45   node = xbt_new0(struct xbt_node, 1);
  46   node->data = data;
  47   if (g->directed)
  48     /* only the "out" field is used */
  49     node->in = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  50
  51   node->out = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  52   node->position_x = -1.0;
  53   node->position_y = -1.0;
  54
  55   xbt_dynar_push(g->nodes, &node);
  56
  57   return node;
  58 }
  59
  60 /** @brief add an edge to the given graph */
  61 xbt_edge_t xbt_graph_new_edge(xbt_graph_t g,
  62                               xbt_node_t src, xbt_node_t dst, void *data)
  63 {
  64   xbt_edge_t edge = NULL;
  65
  66   edge = xbt_new0(struct xbt_edge, 1);
  67   xbt_dynar_push(src->out, &edge);
  68   if (g->directed)
  69     xbt_dynar_push(dst->in, &edge);
  70   else                          /* only the "out" field is used */
  71     xbt_dynar_push(dst->out, &edge);
  72
  73   edge->data = data;
  74   edge->src = src;
  75   edge->dst = dst;
  76
  77   xbt_dynar_push(g->edges, &edge);
  78
  79   return edge;
  80 }
  81
  82 xbt_edge_t xbt_graph_get_edge(xbt_graph_t g, xbt_node_t src,
  83                               xbt_node_t dst)
  84 {
  85   xbt_edge_t edge;
  86   unsigned int cursor;
  87
  88   xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  89     XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  90     if ((edge->src == src) && (edge->dst == dst))
  91       return edge;
  92   }
  93   if (!g->directed) {
  94     xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  95       XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  96       if ((edge->dst == src) && (edge->src == dst))
  97         return edge;
  98     }
  99   }
 100   return NULL;
 101 }
 102
 103 void *xbt_graph_node_get_data(xbt_node_t node)
 104 {
 105   return node->data;
 106 }
 107
 108 void xbt_graph_node_set_data(xbt_node_t node, void *data)
 109 {
 110   node->data = data;
 111 }
 112
 113 void *xbt_graph_edge_get_data(xbt_edge_t edge)
 114 {
 115   return edge->data;
 116 }
 117
 118 void xbt_graph_edge_set_data(xbt_edge_t edge, void *data)
 119 {
 120   edge->data = data;
 121 }
 122
 123 /** @brief Destructor
 124  *  @param g: poor victim
 125  *  @param node_free_function: function to use to free data associated to each node
 126  *  @param edge_free_function: function to use to free data associated to each edge
 127  *  @param graph_free_function: function to use to free data associated to g
 128  *
 129  * Free the graph structure.
 130  */
 131 void xbt_graph_free_graph(xbt_graph_t g,
 132                           void_f_pvoid_t node_free_function,
 133                           void_f_pvoid_t edge_free_function,
 134                           void_f_pvoid_t graph_free_function)
 135 {
 136   unsigned int cursor = 0;
 137   xbt_node_t node = NULL;
 138   xbt_edge_t edge = NULL;
 139
 140
 141   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 142     xbt_dynar_free(&(node->out));
 143     xbt_dynar_free(&(node->in));
 144     if (node_free_function)
 145       (*node_free_function) (node->data);
 146   }
 147
 148   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 149     if (edge_free_function)
 150       (*edge_free_function) (edge->data);
 151   }
 152
 153   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 154       free(node);
 155   xbt_dynar_free(&(g->nodes));
 156
 157   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge)
 158       free(edge);
 159   xbt_dynar_free(&(g->edges));
 160   if (graph_free_function)
 161     (*graph_free_function) (g->data);
 162   free(g);
 163   xbt_graph_parse_lex_destroy();
 164   return;
 165 }
 166
 167
 168 /** @brief remove the given node from the given graph */
 169 void xbt_graph_free_node(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 170                          void_f_pvoid_t node_free_function,
 171                          void_f_pvoid_t edge_free_function)
 172 {
 173   unsigned long nbr;
 174   unsigned long i;
 175   unsigned int cursor = 0;
 176   xbt_node_t node = NULL;
 177   xbt_edge_t edge = NULL;
 178
 179   nbr = xbt_dynar_length(g->edges);
 180   cursor = 0;
 181   for (i = 0; i < nbr; i++) {
 182     xbt_dynar_get_cpy(g->edges, cursor, &edge);
 183
 184     if ((edge->dst == n) || (edge->src == n)) {
 185       xbt_graph_free_edge(g, edge, edge_free_function);
 186     } else
 187       cursor++;
 188   }
 189
 190   if ((node_free_function) && (n->data))
 191     (*node_free_function) (n->data);
 192
 193   cursor = 0;
 194   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 195       if (node == n)
 196     xbt_dynar_cursor_rm(g->nodes, &cursor);
 197
 198   xbt_dynar_free(&(n->in));
 199   xbt_dynar_free(&(n->out));
 200
 201   free(n);
 202
 203   return;
 204 }
 205
 206 /** @brief remove the given edge from the given graph */
 207 void xbt_graph_free_edge(xbt_graph_t g, xbt_edge_t e,
 208                          void_f_pvoid_t free_function)
 209 {
 210   int idx;
 211   unsigned int cursor = 0;
 212   xbt_edge_t edge = NULL;
 213
 214   if ((free_function) && (e->data))
 215     (*free_function) (e->data);
 216
 217   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 218     if (edge == e) {
 219       if (g->directed) {
 220         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->in, edge);
 221         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->in, idx, NULL);
 222       } else {                  /* only the out field is used */
 223         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->out, edge);
 224         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->out, idx, NULL);
 225       }
 226
 227       idx = __xbt_find_in_dynar(edge->src->out, edge);
 228       xbt_dynar_remove_at(edge->src->out, idx, NULL);
 229
 230       xbt_dynar_cursor_rm(g->edges, &cursor);
 231       free(edge);
 232       break;
 233     }
 234   }
 235 }
 236
 237 int __xbt_find_in_dynar(xbt_dynar_t dynar, void *p)
 238 {
 239
 240   unsigned int cursor = 0;
 241   void *tmp = NULL;
 242
 243   xbt_dynar_foreach(dynar, cursor, tmp) {
 244     if (tmp == p)
 245       return cursor;
 246   }
 247   return -1;
 248 }
 249
 250 /** @brief Retrieve the graph's nodes as a dynar */
 251 xbt_dynar_t xbt_graph_get_nodes(xbt_graph_t g)
 252 {
 253   return g->nodes;
 254 }
 255
 256 /** @brief Retrieve the graph's edges as a dynar */
 257 xbt_dynar_t xbt_graph_get_edges(xbt_graph_t g)
 258 {
 259   return g->edges;
 260 }
 261
 262 /** @brief Retrieve the node at the source of the given edge */
 263 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_source(xbt_edge_t e)
 264 {
 265   return e->src;
 266 }
 267
 268 /** @brief Retrieve the node being the target of the given edge */
 269 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_target(xbt_edge_t e)
 270 {
 271   return e->dst;
 272 }
 273
 274 /** @brief Retrieve the outgoing edges of the given node */
 275 xbt_dynar_t xbt_graph_node_get_outedges(xbt_node_t n)
 276 {
 277   return n->out;
 278 }
 279
 280 /** @brief Set the weight of the given edge */
 281 void xbt_graph_edge_set_length(xbt_edge_t e, double length)
 282 {
 283   e->length = length;
 284
 285 }
 286
 287 double xbt_graph_edge_get_length(xbt_edge_t e)
 288 {
 289   return e->length;
 290 }
 291
 292
 293 /** @brief construct the adjacency matrix corresponding to the given graph
 294  *
 295  * The weights are the distances between nodes
 296  */
 297 double *xbt_graph_get_length_matrix(xbt_graph_t g)
 298 {
 299   unsigned int cursor = 0;
 300   unsigned int in_cursor = 0;
 301   unsigned long idx, i;
 302   unsigned long n;
 303   xbt_edge_t edge = NULL;
 304   xbt_node_t node = NULL;
 305   double *d = NULL;
 306
 307 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 308   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 309
 310   d = (double *) xbt_new0(double, n * n);
 311
 312   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 313     d[i] = -1.0;
 314   }
 315
 316   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 317     in_cursor = 0;
 318     D(cursor, cursor) = 0;
 319
 320     xbt_dynar_foreach(node->out, in_cursor, edge) {
 321       if (edge->dst == node)
 322         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->src);
 323       else                      /*case of  undirected graphs */
 324         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->dst);
 325       D(cursor, idx) = edge->length;
 326     }
 327   }
 328
 329 # undef D
 330
 331   return d;
 332 }
 333
 334 /** @brief Floyd-Warshall algorithm for shortest path finding
 335  *
 336  * From wikipedia:
 337  *
 338  * The Floyd–Warshall algorithm takes as input an adjacency matrix
 339  * representation of a weighted, directed graph (V, E). The weight of a
 340  * path between two vertices is the sum of the weights of the edges along
 341  * that path. The edges E of the graph may have negative weights, but the
 342  * graph must not have any negative weight cycles. The algorithm computes,
 343  * for each pair of vertices, the minimum weight among all paths between
 344  * the two vertices. The running time complexity is Θ(|V|3).
 345  */
 346 void xbt_floyd_algorithm(xbt_graph_t g, double *adj, double *d,
 347                          xbt_node_t * p)
 348 {
 349   unsigned long i, j, k;
 350   unsigned long n;
 351   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 352
 353 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 354 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 355
 356   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 357     d[i] = adj[i];
 358   }
 359
 360
 361   for (i = 0; i < n; i++) {
 362     for (j = 0; j < n; j++) {
 363       if (D(i, j) != -1) {
 364         P(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, i));
 365       }
 366     }
 367   }
 368
 369   for (k = 0; k < n; k++) {
 370     for (i = 0; i < n; i++) {
 371       for (j = 0; j < n; j++) {
 372         if ((D(i, k) != -1) && (D(k, j) != -1)) {
 373           if ((D(i, j) == -1) || (D(i, j) > D(i, k) + D(k, j))) {
 374             D(i, j) = D(i, k) + D(k, j);
 375             P(i, j) = P(k, j);
 376           }
 377         }
 378       }
 379     }
 380   }
 381
 382
 383
 384 # undef P
 385 # undef D
 386 }
 387
 388 /** @brief computes all-pairs shortest paths */
 389 xbt_node_t *xbt_graph_shortest_paths(xbt_graph_t g)
 390 {
 391   xbt_node_t *p;
 392   xbt_node_t *r;
 393   unsigned long i, j, k;
 394   unsigned long n;
 395
 396   double *adj = NULL;
 397   double *d = NULL;
 398
 399 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 400 # define R(u,v) r[(u)*n+(v)]
 401
 402   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 403   adj = xbt_graph_get_length_matrix(g);
 404   d = xbt_new0(double, n * n);
 405   p = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 406   r = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 407
 408   xbt_floyd_algorithm(g, adj, d, p);
 409
 410   for (i = 0; i < n; i++) {
 411     for (j = 0; j < n; j++) {
 412       k = j;
 413
 414       while ((P(i, k)) && (__xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k)) != i)) {
 415         k = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k));
 416       }
 417
 418       if (P(i, j)) {
 419         R(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, k));
 420       }
 421     }
 422   }
 423 # undef R
 424 # undef P
 425
 426   free(d);
 427   free(p);
 428   free(adj);
 429   return r;
 430 }
 431
 432 /** @brief Extract a spanning tree of the given graph */
 433 xbt_edge_t *xbt_graph_spanning_tree_prim(xbt_graph_t g)
 434 {
 435   int tree_size = 0;
 436   int tree_size_max = xbt_dynar_length(g->nodes) - 1;
 437   xbt_edge_t *tree = xbt_new0(xbt_edge_t, tree_size_max);
 438   xbt_edge_t e, edge;
 439   xbt_node_t node = NULL;
 440   xbt_dynar_t edge_list = NULL;
 441   xbt_heap_t heap = xbt_heap_new(10, NULL);
 442   unsigned int cursor;
 443
 444   xbt_assert(!(g->directed),
 445               "Spanning trees do not make sense on directed graphs");
 446
 447   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 448     node->xbtdata = NULL;
 449   }
 450
 451   node = xbt_dynar_getfirst_as(g->nodes, xbt_node_t);
 452   node->xbtdata = (void *) 1;
 453   edge_list = node->out;
 454   xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e)
 455       xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 456
 457   while ((edge = xbt_heap_pop(heap))) {
 458     if ((edge->src->xbtdata) && (edge->dst->xbtdata))
 459       continue;
 460     tree[tree_size++] = edge;
 461     if (!(edge->src->xbtdata)) {
 462       edge->src->xbtdata = (void *) 1;
 463       edge_list = edge->src->out;
 464       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 465         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 466       }
 467     } else {
 468       edge->dst->xbtdata = (void *) 1;
 469       edge_list = edge->dst->out;
 470       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 471         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 472       }
 473     }
 474     if (tree_size == tree_size_max)
 475       break;
 476   }
 477
 478   xbt_heap_free(heap);
 479
 480   return tree;
 481 }
 482
 483 /** @brief Topological sort on the given graph
 484  *
 485  *  From wikipedia:
 486  *
 487  * In graph theory, a topological sort of a directed acyclic graph (DAG) is
 488  * a linear ordering of its nodes which is compatible with the partial
 489  * order R induced on the nodes where x comes before y (xRy) if there's a
 490  * directed path from x to y in the DAG. An equivalent definition is that
 491  * each node comes before all nodes to which it has edges. Every DAG has at
 492  * least one topological sort, and may have many.
 493  */
 494 xbt_node_t *xbt_graph_topo_sort(xbt_graph_t g)
 495 {
 496
 497   xbt_node_t *sorted;
 498   unsigned int cursor;
 499   int idx;
 500   xbt_node_t node;
 501   unsigned long n;
 502
 503   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 504   idx = n - 1;
 505
 506   sorted = xbt_malloc(n * sizeof(xbt_node_t));
 507
 508   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 509       node->xbtdata = xbt_new0(int, 1);
 510
 511   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 512       xbt_graph_depth_visit(g, node, sorted, &idx);
 513
 514   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 515     free(node->xbtdata);
 516     node->xbtdata = NULL;
 517   }
 518
 519   return sorted;
 520 }
 521
 522 /** @brief First-depth graph traversal */
 523 void xbt_graph_depth_visit(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 524                            xbt_node_t * sorted, int *idx)
 525 {
 526   unsigned int cursor;
 527   xbt_edge_t edge;
 528
 529   if (*((int *) (n->xbtdata)) == ALREADY_EXPLORED)
 530     return;
 531   else if (*((int *) (n->xbtdata)) == CURRENTLY_EXPLORING)
 532     THROWF(0, 0, "There is a cycle");
 533   else {
 534     *((int *) (n->xbtdata)) = CURRENTLY_EXPLORING;
 535
 536     xbt_dynar_foreach(n->out, cursor, edge) {
 537       xbt_graph_depth_visit(g, edge->dst, sorted, idx);
 538     }
 539
 540     *((int *) (n->xbtdata)) = ALREADY_EXPLORED;
 541     sorted[(*idx)--] = n;
 542   }
 543 }
 544
 545 /********************* Import and Export ******************/
 546 static xbt_graph_t parsed_graph = NULL;
 547 static xbt_dict_t parsed_nodes = NULL;
 548
 549 static void *(*__parse_node_label_and_data) (xbt_node_t, const char *,
 550                                              const char *) = NULL;
 551 static void *(*__parse_edge_label_and_data) (xbt_edge_t, const char *,
 552                                              const char *) = NULL;
 553
 554 static void __parse_graph_begin(void)
 555 {
 556   XBT_DEBUG("<graph>");
 557   if (A_graphxml_graph_isDirected == A_graphxml_graph_isDirected_true)
 558     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(1, NULL);
 559   else
 560     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(0, NULL);
 561
 562   parsed_nodes = xbt_dict_new();
 563 }
 564
 565 static void __parse_graph_end(void)
 566 {
 567   xbt_dict_free(&parsed_nodes);
 568   XBT_DEBUG("</graph>");
 569 }
 570
 571 static void __parse_node(void)
 572 {
 573   xbt_node_t node = xbt_graph_new_node(parsed_graph, NULL);
 574
 575   XBT_DEBUG("<node name=\"%s\"/>", A_graphxml_node_name);
 576   if (__parse_node_label_and_data)
 577     node->data = __parse_node_label_and_data(node, A_graphxml_node_label,
 578                                              A_graphxml_node_data);
 579   xbt_graph_parse_get_double(&(node->position_x),
 580                              A_graphxml_node_position_x);
 581   xbt_graph_parse_get_double(&(node->position_y),
 582                              A_graphxml_node_position_y);
 583
 584   xbt_dict_set(parsed_nodes, A_graphxml_node_name, (void *) node, NULL);
 585 }
 586
 587 static void __parse_edge(void)
 588 {
 589   xbt_edge_t edge = xbt_graph_new_edge(parsed_graph,
 590                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 591                                                     A_graphxml_edge_source),
 592                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 593                                                     A_graphxml_edge_target),
 594                                        NULL);
 595
 596   if (__parse_edge_label_and_data)
 597     edge->data = __parse_edge_label_and_data(edge, A_graphxml_edge_label,
 598                                              A_graphxml_edge_data);
 599
 600   xbt_graph_parse_get_double(&(edge->length), A_graphxml_edge_length);
 601
 602   XBT_DEBUG("<edge  source=\"%s\" target=\"%s\" length=\"%f\"/>",
 603          (char *) (edge->src)->data,
 604          (char *) (edge->dst)->data, xbt_graph_edge_get_length(edge));
 605 }
 606
 607 /** @brief Import a graph from a file following the GraphXML format */
 608 xbt_graph_t xbt_graph_read(const char *filename,
 609                            void *(*node_label_and_data) (xbt_node_t,
 610                                                          const char *,
 611                                                          const char *),
 612                            void *(*edge_label_and_data) (xbt_edge_t,
 613                                                          const char *,
 614                                                          const char *))
 615 {
 616
 617   xbt_graph_t graph = NULL;
 618
 619   __parse_node_label_and_data = node_label_and_data;
 620   __parse_edge_label_and_data = edge_label_and_data;
 621
 622   xbt_graph_parse_reset_parser();
 623
 624   STag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_begin;
 625   ETag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_end;
 626   ETag_graphxml_node_fun = __parse_node;
 627   ETag_graphxml_edge_fun = __parse_edge;
 628
 629   xbt_graph_parse_open(filename);
 630   int res;
 631   res = (*xbt_graph_parse) ();
 632   xbt_assert(!res, "Parse error in %s", filename);
 633   xbt_graph_parse_close();
 634
 635   graph = parsed_graph;
 636   parsed_graph = NULL;
 637
 638   return graph;
 639 }
 640
 641 /** @brief Export the given graph in the GraphViz formatting for visualization */
 642 void xbt_graph_export_graphviz(xbt_graph_t g, const char *filename,
 643                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 644                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t))
 645 {
 646   unsigned int cursor = 0;
 647   xbt_node_t node = NULL;
 648   xbt_edge_t edge = NULL;
 649   FILE *file = NULL;
 650   const char *name = NULL;
 651
 652   file = fopen(filename, "w");
 653   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 654
 655   if (g->directed)
 656     fprintf(file, "digraph test {\n");
 657   else
 658     fprintf(file, "graph test {\n");
 659
 660   fprintf(file, "  graph [overlap=scale]\n");
 661
 662   fprintf(file, "  node [shape=box, style=filled]\n");
 663   fprintf(file,
 664           "  node [width=.3, height=.3, style=filled, color=skyblue]\n\n");
 665
 666   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 667     fprintf(file, "  \"%p\" ", node);
 668     if ((node_name) && ((name = node_name(node))))
 669       fprintf(file, "[label=\"%s\"]", name);
 670     fprintf(file, ";\n");
 671   }
 672   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 673     if (g->directed)
 674       fprintf(file, "  \"%p\" -> \"%p\"", edge->src, edge->dst);
 675     else
 676       fprintf(file, "  \"%p\" -- \"%p\"", edge->src, edge->dst);
 677     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 678       fprintf(file, "[label=\"%s\"]", name);
 679     fprintf(file, ";\n");
 680   }
 681   fprintf(file, "}\n");
 682   fclose(file);
 683 }
 684
 685 /** @brief Export the given graph in the GraphXML format */
 686 void xbt_graph_export_graphxml(xbt_graph_t g, const char *filename,
 687                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 688                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t),
 689                                const char *(node_data_print) (void *),
 690                                const char *(edge_data_print) (void *))
 691 {
 692   unsigned int cursor = 0;
 693   xbt_node_t node = NULL;
 694   xbt_edge_t edge = NULL;
 695   FILE *file = NULL;
 696   const char *name = NULL;
 697
 698   file = fopen(filename, "w");
 699   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 700
 701   fprintf(file, "<?xml version='1.0'?>\n");
 702   fprintf(file, "<!DOCTYPE graph SYSTEM \"graphxml.dtd\">\n");
 703   if (g->directed)
 704     fprintf(file, "<graph isDirected=\"true\">\n");
 705   else
 706     fprintf(file, "<graph isDirected=\"false\">\n");
 707   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 708     fprintf(file, "  <node name=\"%p\" ", node);
 709     if ((node_name) && ((name = node_name(node))))
 710       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 711     if ((node_data_print) && ((name = node_data_print(node->data))))
 712       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 713     fprintf(file, ">\n");
 714   }
 715   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 716     fprintf(file, "  <edge source=\"%p\" target =\"%p\" ",
 717             edge->src, edge->dst);
 718     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 719       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 720     if (edge->length >= 0.0)
 721       fprintf(file, "length=\"%g\" ", edge->length);
 722     if ((edge_data_print) && ((name = edge_data_print(edge->data))))
 723       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 724     fprintf(file, ">\n");
 725   }
 726   fprintf(file, "</graph>\n");
 727   fclose(file);
 728 }
 729
 730 /** @brief Load a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 731 xbt_graph_t xbt_graph_load (const char *filename)
 732 {
 733   FILE *file = NULL;
 734   file = fopen (filename, "r");
 735   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 736
 737   xbt_dict_t nodes_dict = xbt_dict_new ();
 738   xbt_graph_t ret = xbt_graph_new_graph (0, NULL);
 739
 740   //read the number of nodes
 741   size_t size;
 742   char *nnodes_str = NULL;
 743   getline (&nnodes_str, &size, file);
 744   int i, nnodes = atoi (nnodes_str);
 745   free (nnodes_str);
 746
 747   //read all nodes
 748   for (i = 0; i < nnodes; i++){
 749     char *node_str = NULL;
 750     getline (&node_str, &size, file);
 751     xbt_node_t n;
 752     char *name = xbt_strdup (node_str);
 753     xbt_str_subst (name, '\n', '\0', 0);
 754     n = xbt_graph_new_node (ret, name);
 755     xbt_dict_set (nodes_dict, name, n, NULL);
 756     free (node_str);
 757   }
 758
 759   //read the number of edges
 760   char *nedges_str = NULL;
 761   getline (&nedges_str, &size, file);
 762   int nedges = atoi (nedges_str);
 763   free (nedges_str);
 764
 765   //read all edges
 766   for (i = 0; i < nedges; i++){
 767     char *edge_str = NULL, edge_id[200], node_source[200], node_target[200];
 768     getline (&edge_str, &size, file);
 769     sscanf (edge_str, "%s %s %s", edge_id, node_source, node_target);
 770     free (edge_str);
 771     xbt_str_subst (edge_id, '\n', '\0', 0);
 772     xbt_str_subst (node_source, '\n', '\0', 0);
 773     xbt_str_subst (node_target, '\n', '\0', 0);
 774
 775     xbt_node_t source = xbt_dict_get (nodes_dict, node_source);
 776     xbt_node_t target = xbt_dict_get (nodes_dict, node_target);
 777     xbt_edge_t e;
 778     e = xbt_graph_new_edge (ret, source, target, xbt_strdup(edge_id));
 779   }
 780   xbt_dict_free (&nodes_dict);
 781   return ret;
 782 }
 783
 784 /** @brief Save a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 785 void xbt_graph_save (xbt_graph_t span,
 786                      const char *filename,
 787                      const char *(nname) (xbt_node_t),
 788                      const char *(ename) (xbt_edge_t))
 789 {
 790   FILE *file = NULL;
 791   file = fopen(filename, "w");
 792   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 793
 794   xbt_dynar_t nodes = xbt_graph_get_nodes (span);
 795   xbt_dynar_t edges = xbt_graph_get_edges (span);
 796   unsigned int cpt;
 797   xbt_node_t node;
 798   fprintf (file, "%ld\n", xbt_dynar_length (nodes));
 799   xbt_dynar_foreach (nodes, cpt, node) {
 800     if (nname){
 801       fprintf (file, "%s\n", nname(node));
 802     }else{
 803       fprintf (file, "%p\n", node);
 804     }
 805   }
 806   fprintf (file, "%ld\n", xbt_dynar_length (edges));
 807   xbt_edge_t edge;
 808   xbt_dynar_foreach (edges, cpt, edge) {
 809     xbt_node_t source = xbt_graph_edge_get_source (edge);
 810     xbt_node_t target = xbt_graph_edge_get_target (edge);
 811     if (ename){
 812       if (nname){
 813         fprintf (file, "%s %s %s\n", ename(edge), nname(source), nname(target));
 814       }else{
 815         fprintf (file, "%s %p %p\n", ename(edge), source, target);
 816       }
 817     }else{
 818       if (nname){
 819         fprintf (file, "%p %s %s\n", edge, nname(source), nname(target));
 820       }else{
 821         fprintf (file, "%p %p %p\n", edge, source, target);
 822       }
 823     }
 824   }
 825   fclose (file);
 826 }