src/smpi/mpi/smpi_comm.cpp

   1 /* Copyright (c) 2010-2019. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
   2
   3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   5
   6 #include "smpi_comm.hpp"
   7 #include "smpi_coll.hpp"
   8 #include "smpi_datatype.hpp"
   9 #include "smpi_request.hpp"
  10 #include "smpi_win.hpp"
  11 #include "smpi_info.hpp"
  12 #include "src/smpi/include/smpi_actor.hpp"
  13 #include "src/surf/HostImpl.hpp"
  14
  15 #include <climits>
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_comm, smpi, "Logging specific to SMPI (comm)");
  18
  19 simgrid::smpi::Comm mpi_MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  20 MPI_Comm MPI_COMM_UNINITIALIZED=&mpi_MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  21
  22 /* Support for cartesian topology was added, but there are 2 other types of topology, graph et dist graph. In order to
  23  * support them, we have to add a field SMPI_Topo_type, and replace the MPI_Topology field by an union. */
  24
  25 namespace simgrid{
  26 namespace smpi{
  27
  28 std::unordered_map<int, smpi_key_elem> Comm::keyvals_;
  29 int Comm::keyval_id_=0;
  30
  31 Comm::Comm(MPI_Group group, MPI_Topology topo, bool smp, int in_id)
  32     : group_(group), topo_(topo), is_smp_comm_(smp), id_(in_id)
  33 {
  34   errhandler_->ref();
  35   //First creation of comm is done before SIMIX_run, so only do comms for others
  36   if(in_id==MPI_UNDEFINED && smp==0 && this->rank()!=MPI_UNDEFINED ){
  37     int id;
  38     if(this->rank()==0){
  39       static int global_id_ = 0;
  40       id=global_id_;
  41       global_id_++;
  42     }
  43     colls::bcast(&id, 1, MPI_INT, 0, this);
  44     XBT_DEBUG("Communicator %p has id %d", this, id);
  45     id_=id;//only set here, as we don't want to change it in the middle of the bcast
  46     colls::barrier(this);
  47   }
  48 }
  49
  50 void Comm::destroy(Comm* comm)
  51 {
  52   if (comm == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
  53     Comm::destroy(smpi_process()->comm_world());
  54     return;
  55   }
  56   Comm::unref(comm);
  57 }
  58
  59 int Comm::dup(MPI_Comm* newcomm){
  60   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
  61     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
  62     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
  63   }
  64   MPI_Group cp = new  Group(this->group());
  65   (*newcomm)   = new  Comm(cp, this->topo());
  66   int ret      = MPI_SUCCESS;
  67
  68   if (not attributes()->empty()) {
  69     int flag=0;
  70     void* value_out=nullptr;
  71     for (auto const& it : *attributes()) {
  72       smpi_key_elem elem = keyvals_.at(it.first);
  73       if (elem != nullptr){
  74         if( elem->copy_fn.comm_copy_fn != MPI_NULL_COPY_FN &&
  75             elem->copy_fn.comm_copy_fn != MPI_COMM_DUP_FN)
  76           ret = elem->copy_fn.comm_copy_fn(this, it.first, elem->extra_state, it.second, &value_out, &flag);
  77         else if ( elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != MPI_NULL_COPY_FN &&
  78                   *(int*)*elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != 1){
  79           value_out=(int*)xbt_malloc(sizeof(int));
  80           elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort(this, it.first, elem->extra_state, it.second, value_out, &flag,&ret);
  81         }
  82         if (ret != MPI_SUCCESS) {
  83           Comm::destroy(*newcomm);
  84           *newcomm = MPI_COMM_NULL;
  85           return ret;
  86         }
  87         if (elem->copy_fn.comm_copy_fn == MPI_COMM_DUP_FN ||
  88            ((elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != MPI_NULL_COPY_FN) && *(int*)*elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort == 1)){
  89           elem->refcount++;
  90           (*newcomm)->attributes()->insert({it.first, it.second});
  91         }else if (flag){
  92           elem->refcount++;
  93           (*newcomm)->attributes()->insert({it.first, value_out});
  94         }
  95       }
  96     }
  97   }
  98   //duplicate info if present
  99   if(info_!=MPI_INFO_NULL)
 100     (*newcomm)->info_ = new simgrid::smpi::Info(info_);
 101   //duplicate errhandler
 102   (*newcomm)->set_errhandler(errhandler_);
 103   return ret;
 104 }
 105
 106 int Comm::dup_with_info(MPI_Info info, MPI_Comm* newcomm){
 107   int ret = dup(newcomm);
 108   if(ret != MPI_SUCCESS)
 109     return ret;
 110   if((*newcomm)->info_!=MPI_INFO_NULL){
 111     simgrid::smpi::Info::unref((*newcomm)->info_);
 112     (*newcomm)->info_=MPI_INFO_NULL;
 113   }
 114   if(info != MPI_INFO_NULL){
 115     info->ref();
 116     (*newcomm)->info_=info;
 117   }
 118   return ret;
 119 }
 120
 121 MPI_Group Comm::group()
 122 {
 123   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 124     return smpi_process()->comm_world()->group();
 125   return group_;
 126 }
 127
 128 int Comm::size()
 129 {
 130   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 131     return smpi_process()->comm_world()->size();
 132   return group_->size();
 133 }
 134
 135 int Comm::rank()
 136 {
 137   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 138     return smpi_process()->comm_world()->rank();
 139   return group_->rank(s4u::Actor::self());
 140 }
 141
 142 int Comm::id()
 143 {
 144   return id_;
 145 }
 146
 147 void Comm::get_name (char* name, int* len)
 148 {
 149   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 150     smpi_process()->comm_world()->get_name(name, len);
 151     return;
 152   }
 153   if(this == MPI_COMM_WORLD && name_.empty()) {
 154     strncpy(name, "MPI_COMM_WORLD", 15);
 155     *len = 14;
 156   } else if(this == MPI_COMM_SELF && name_.empty()) {
 157     strncpy(name, "MPI_COMM_SELF", 14);
 158     *len = 13;
 159   } else {
 160     *len = snprintf(name, MPI_MAX_NAME_STRING+1, "%s", name_.c_str());
 161   }
 162 }
 163
 164 void Comm::set_name (const char* name)
 165 {
 166   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 167     smpi_process()->comm_world()->set_name(name);
 168     return;
 169   }
 170   name_.replace (0, MPI_MAX_NAME_STRING+1, name);
 171 }
 172
 173
 174 void Comm::set_leaders_comm(MPI_Comm leaders){
 175   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 176     smpi_process()->comm_world()->set_leaders_comm(leaders);
 177     return;
 178   }
 179   leaders_comm_=leaders;
 180 }
 181
 182 int* Comm::get_non_uniform_map(){
 183   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 184     return smpi_process()->comm_world()->get_non_uniform_map();
 185   return non_uniform_map_;
 186 }
 187
 188 int* Comm::get_leaders_map(){
 189   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 190     return smpi_process()->comm_world()->get_leaders_map();
 191   return leaders_map_;
 192 }
 193
 194 MPI_Comm Comm::get_leaders_comm(){
 195   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 196     return smpi_process()->comm_world()->get_leaders_comm();
 197   return leaders_comm_;
 198 }
 199
 200 MPI_Comm Comm::get_intra_comm(){
 201   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED || this==MPI_COMM_WORLD)
 202     return smpi_process()->comm_intra();
 203   else return intra_comm_;
 204 }
 205
 206 bool Comm::is_uniform()
 207 {
 208   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 209     return smpi_process()->comm_world()->is_uniform();
 210   return is_uniform_ != 0;
 211 }
 212
 213 bool Comm::is_blocked()
 214 {
 215   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 216     return smpi_process()->comm_world()->is_blocked();
 217   return is_blocked_ != 0;
 218 }
 219
 220 bool Comm::is_smp_comm()
 221 {
 222   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 223     return smpi_process()->comm_world()->is_smp_comm();
 224   return is_smp_comm_;
 225 }
 226
 227 MPI_Comm Comm::split(int color, int key)
 228 {
 229   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 230     return smpi_process()->comm_world()->split(color, key);
 231   int system_tag = -123;
 232   int* recvbuf;
 233
 234   MPI_Group group_root = nullptr;
 235   MPI_Group group_out  = nullptr;
 236   MPI_Group group      = this->group();
 237   int myrank           = this->rank();
 238   int size             = this->size();
 239   /* Gather all colors and keys on rank 0 */
 240   int* sendbuf = xbt_new(int, 2);
 241   sendbuf[0] = color;
 242   sendbuf[1] = key;
 243   if (myrank == 0) {
 244     recvbuf = xbt_new(int, 2 * size);
 245   } else {
 246     recvbuf = nullptr;
 247   }
 248   gather__default(sendbuf, 2, MPI_INT, recvbuf, 2, MPI_INT, 0, this);
 249   xbt_free(sendbuf);
 250   /* Do the actual job */
 251   if (myrank == 0) {
 252     MPI_Group* group_snd = xbt_new(MPI_Group, size);
 253     std::vector<std::pair<int, int>> rankmap;
 254     rankmap.reserve(size);
 255     for (int i = 0; i < size; i++) {
 256       if (recvbuf[2 * i] != MPI_UNDEFINED) {
 257         rankmap.clear();
 258         for (int j = i + 1; j < size; j++) {
 259           if(recvbuf[2 * i] == recvbuf[2 * j]) {
 260             recvbuf[2 * j] = MPI_UNDEFINED;
 261             rankmap.push_back({recvbuf[2 * j + 1], j});
 262           }
 263         }
 264         /* Add self in the group */
 265         recvbuf[2 * i] = MPI_UNDEFINED;
 266         rankmap.push_back({recvbuf[2 * i + 1], i});
 267         std::sort(begin(rankmap), end(rankmap));
 268         group_out = new Group(rankmap.size());
 269         if (i == 0) {
 270           group_root = group_out; /* Save root's group */
 271         }
 272         for (unsigned j = 0; j < rankmap.size(); j++) {
 273           s4u::Actor* actor = group->actor(rankmap[j].second);
 274           group_out->set_mapping(actor, j);
 275         }
 276         MPI_Request* requests = xbt_new(MPI_Request, rankmap.size());
 277         int reqs              = 0;
 278         for (auto const& rank : rankmap) {
 279           if (rank.second != 0) {
 280             group_snd[reqs]=new  Group(group_out);
 281             requests[reqs] = Request::isend(&(group_snd[reqs]), 1, MPI_PTR, rank.second, system_tag, this);
 282             reqs++;
 283           }
 284         }
 285         if(i != 0 && group_out != MPI_COMM_WORLD->group() && group_out != MPI_GROUP_EMPTY)
 286           Group::unref(group_out);
 287
 288         Request::waitall(reqs, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 289         xbt_free(requests);
 290       }
 291     }
 292     xbt_free(recvbuf);
 293     xbt_free(group_snd);
 294     group_out = group_root; /* exit with root's group */
 295   } else {
 296     if(color != MPI_UNDEFINED) {
 297       Request::recv(&group_out, 1, MPI_PTR, 0, system_tag, this, MPI_STATUS_IGNORE);
 298     } /* otherwise, exit with group_out == nullptr */
 299   }
 300   return group_out!=nullptr ? new  Comm(group_out, nullptr) : MPI_COMM_NULL;
 301 }
 302
 303 void Comm::ref(){
 304   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 305     smpi_process()->comm_world()->ref();
 306     return;
 307   }
 308   group_->ref();
 309   refcount_++;
 310 }
 311
 312 void Comm::cleanup_smp(){
 313   if (intra_comm_ != MPI_COMM_NULL)
 314     Comm::unref(intra_comm_);
 315   if (leaders_comm_ != MPI_COMM_NULL)
 316     Comm::unref(leaders_comm_);
 317   xbt_free(non_uniform_map_);
 318   delete[] leaders_map_;
 319 }
 320
 321 void Comm::unref(Comm* comm){
 322   if (comm == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 323     Comm::unref(smpi_process()->comm_world());
 324     return;
 325   }
 326   comm->refcount_--;
 327   Group::unref(comm->group_);
 328
 329   if(comm->refcount_==0){
 330     comm->cleanup_smp();
 331     comm->cleanup_attr<Comm>();
 332     if (comm->info_ != MPI_INFO_NULL)
 333       simgrid::smpi::Info::unref(comm->info_);
 334     if (comm->errhandler_ != MPI_ERRHANDLER_NULL)
 335       simgrid::smpi::Errhandler::unref(comm->errhandler_);
 336     delete comm->topo_; // there's no use count on topos
 337     delete comm;
 338   }
 339 }
 340
 341 MPI_Comm Comm::find_intra_comm(int * leader){
 342   //get the indices of all processes sharing the same simix host
 343   auto& actor_list        = sg_host_self()->pimpl_->actor_list_;
 344   int intra_comm_size     = 0;
 345   int min_index           = INT_MAX; // the minimum index will be the leader
 346   for (auto& actor : actor_list) {
 347     int index = actor.get_pid();
 348     if (this->group()->rank(actor.ciface()) != MPI_UNDEFINED) { // Is this process in the current group?
 349       intra_comm_size++;
 350       if (index < min_index)
 351         min_index = index;
 352     }
 353   }
 354   XBT_DEBUG("number of processes deployed on my node : %d", intra_comm_size);
 355   MPI_Group group_intra = new  Group(intra_comm_size);
 356   int i = 0;
 357   for (auto& actor : actor_list) {
 358     if (this->group()->rank(actor.ciface()) != MPI_UNDEFINED) {
 359       group_intra->set_mapping(actor.ciface(), i);
 360       i++;
 361     }
 362   }
 363   *leader=min_index;
 364   return new  Comm(group_intra, nullptr, 1);
 365 }
 366
 367 void Comm::init_smp(){
 368   int leader = -1;
 369   int i = 0;
 370   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 371     smpi_process()->comm_world()->init_smp();
 372
 373   int comm_size = this->size();
 374
 375   // If we are in replay - perform an ugly hack
 376   // tell SimGrid we are not in replay for a while, because we need the buffers to be copied for the following calls
 377   bool replaying = false; //cache data to set it back again after
 378   if(smpi_process()->replaying()){
 379     replaying = true;
 380     smpi_process()->set_replaying(false);
 381   }
 382
 383   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 384     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 385     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 386   }
 387   // identify neighbors in comm
 388   MPI_Comm comm_intra = find_intra_comm(&leader);
 389
 390
 391   int* leaders_map = new int[comm_size];
 392   int* leader_list = new int[comm_size];
 393   std::fill_n(leaders_map, comm_size, 0);
 394   std::fill_n(leader_list, comm_size, -1);
 395
 396   allgather__ring(&leader, 1, MPI_INT , leaders_map, 1, MPI_INT, this);
 397
 398   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 399     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 400     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 401   }
 402
 403   if(leaders_map_==nullptr){
 404     leaders_map_= leaders_map;
 405   }else{
 406     delete[] leaders_map;
 407   }
 408   int leader_group_size = 0;
 409   for(i=0; i<comm_size; i++){
 410     int already_done = 0;
 411     for (int j = 0; j < leader_group_size; j++) {
 412       if (leaders_map_[i] == leader_list[j]) {
 413         already_done = 1;
 414       }
 415     }
 416     if (already_done == 0) {
 417       leader_list[leader_group_size] = leaders_map_[i];
 418       leader_group_size++;
 419     }
 420   }
 421   xbt_assert(leader_group_size > 0);
 422   std::sort(leader_list, leader_list + leader_group_size);
 423
 424   MPI_Group leaders_group = new  Group(leader_group_size);
 425
 426   MPI_Comm leader_comm = MPI_COMM_NULL;
 427   if(MPI_COMM_WORLD!=MPI_COMM_UNINITIALIZED && this!=MPI_COMM_WORLD){
 428     //create leader_communicator
 429     for (i=0; i< leader_group_size;i++)
 430       leaders_group->set_mapping(s4u::Actor::by_pid(leader_list[i]).get(), i);
 431     leader_comm = new  Comm(leaders_group, nullptr,1);
 432     this->set_leaders_comm(leader_comm);
 433     this->set_intra_comm(comm_intra);
 434
 435     // create intracommunicator
 436   }else{
 437     for (i=0; i< leader_group_size;i++)
 438       leaders_group->set_mapping(s4u::Actor::by_pid(leader_list[i]).get(), i);
 439
 440     if(this->get_leaders_comm()==MPI_COMM_NULL){
 441       leader_comm = new  Comm(leaders_group, nullptr,1);
 442       this->set_leaders_comm(leader_comm);
 443     }else{
 444       leader_comm=this->get_leaders_comm();
 445       Group::unref(leaders_group);
 446     }
 447     smpi_process()->set_comm_intra(comm_intra);
 448   }
 449
 450   // Are the nodes uniform ? = same number of process/node
 451   int my_local_size=comm_intra->size();
 452   if(comm_intra->rank()==0) {
 453     int is_uniform       = 1;
 454     int* non_uniform_map = xbt_new0(int,leader_group_size);
 455     allgather__ring(&my_local_size, 1, MPI_INT,
 456         non_uniform_map, 1, MPI_INT, leader_comm);
 457     for(i=0; i < leader_group_size; i++) {
 458       if(non_uniform_map[0] != non_uniform_map[i]) {
 459         is_uniform = 0;
 460         break;
 461       }
 462     }
 463     if (is_uniform == 0 && this->is_uniform()) {
 464       non_uniform_map_ = non_uniform_map;
 465     }else{
 466       xbt_free(non_uniform_map);
 467     }
 468     is_uniform_=is_uniform;
 469   }
 470   bcast__scatter_LR_allgather(&(is_uniform_),1, MPI_INT, 0, comm_intra );
 471
 472   if (smpi_cfg_privatization() == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 473     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 474     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 475   }
 476   // Are the ranks blocked ? = allocated contiguously on the SMP nodes
 477   int is_blocked=1;
 478   int prev=this->group()->rank(comm_intra->group()->actor(0));
 479   for (i = 1; i < my_local_size; i++) {
 480     int that = this->group()->rank(comm_intra->group()->actor(i));
 481     if (that != prev + 1) {
 482       is_blocked = 0;
 483       break;
 484     }
 485     prev = that;
 486   }
 487
 488   int global_blocked;
 489   allreduce__default(&is_blocked, &(global_blocked), 1, MPI_INT, MPI_LAND, this);
 490
 491   if(MPI_COMM_WORLD==MPI_COMM_UNINITIALIZED || this==MPI_COMM_WORLD){
 492     if(this->rank()==0){
 493       is_blocked_ = global_blocked;
 494     }
 495   }else{
 496     is_blocked_=global_blocked;
 497   }
 498   delete[] leader_list;
 499
 500   if(replaying)
 501     smpi_process()->set_replaying(true);
 502 }
 503
 504 MPI_Comm Comm::f2c(int id) {
 505   if(id == -2) {
 506     return MPI_COMM_SELF;
 507   } else if(id==0){
 508     return MPI_COMM_WORLD;
 509   } else if(F2C::f2c_lookup() != nullptr && id >= 0) {
 510     char key[KEY_SIZE];
 511     const auto& lookup = F2C::f2c_lookup();
 512     auto comm          = lookup->find(get_key(key, id));
 513     return comm == lookup->end() ? MPI_COMM_NULL : static_cast<MPI_Comm>(comm->second);
 514   } else {
 515     return MPI_COMM_NULL;
 516   }
 517 }
 518
 519 void Comm::free_f(int id) {
 520   char key[KEY_SIZE];
 521   F2C::f2c_lookup()->erase(get_key(key, id));
 522 }
 523
 524 void Comm::add_rma_win(MPI_Win win){
 525   rma_wins_.push_back(win);
 526 }
 527
 528 void Comm::remove_rma_win(MPI_Win win){
 529   rma_wins_.remove(win);
 530 }
 531
 532 void Comm::finish_rma_calls(){
 533   for (auto const& it : rma_wins_) {
 534     if(it->rank()==this->rank()){//is it ours (for MPI_COMM_WORLD)?
 535       int finished = it->finish_comms();
 536       XBT_DEBUG("Barrier for rank %d - Finished %d RMA calls",this->rank(), finished);
 537     }
 538   }
 539 }
 540
 541 MPI_Info Comm::info()
 542 {
 543   if (info_ == MPI_INFO_NULL)
 544     info_ = new Info();
 545   info_->ref();
 546   return info_;
 547 }
 548
 549 void Comm::set_info(MPI_Info info)
 550 {
 551   if (info_ != MPI_INFO_NULL)
 552     simgrid::smpi::Info::unref(info);
 553   info_ = info;
 554   if (info_ != MPI_INFO_NULL)
 555     info->ref();
 556 }
 557
 558 MPI_Errhandler Comm::errhandler()
 559 {
 560   if (errhandler_ != MPI_ERRHANDLER_NULL)
 561     errhandler_->ref();
 562   return errhandler_;
 563 }
 564
 565 void Comm::set_errhandler(MPI_Errhandler errhandler)
 566 {
 567   if (errhandler_ != MPI_ERRHANDLER_NULL)
 568     simgrid::smpi::Errhandler::unref(errhandler_);
 569   errhandler_ = errhandler;
 570   if (errhandler_ != MPI_ERRHANDLER_NULL)
 571     errhandler_->ref();
 572 }
 573
 574 MPI_Comm Comm::split_type(int type, int /*key*/, const Info*)
 575 {
 576   //MPI_UNDEFINED can be given to some nodes... but we need them to still perform the smp part which is collective
 577   if(type != MPI_COMM_TYPE_SHARED && type != MPI_UNDEFINED){
 578     return MPI_COMM_NULL;
 579   }
 580   int leader=0;
 581   MPI_Comm res= this->find_intra_comm(&leader);
 582   if(type != MPI_UNDEFINED)
 583     return res;
 584   else{
 585     xbt_assert(res->refcount_ == 1); // ensure the next call to Comm::destroy really frees the comm
 586     Comm::destroy(res);
 587     return MPI_COMM_NULL;
 588   }
 589 }
 590
 591 } // namespace smpi
 592 } // namespace simgrid