src/xbt/graph.c

   1 /* a generic graph library.                                                 */
   2
   3 /* Copyright (c) 2006, 2007, 2008, 2009, 2010. The SimGrid Team.
   4  * All rights reserved.                                                     */
   5
   6 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   7  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   8
   9 #include "simgrid_config.h" /* getline */
  10 #include <errno.h>
  11 #include <stdlib.h>
  12 #include "xbt/sysdep.h"
  13 #include "xbt/log.h"
  14 #include "xbt/graph.h"
  15 #include "graph_private.h"
  16 #include "xbt/graphxml_parse.h"
  17 #include "xbt/dict.h"
  18 #include "xbt/heap.h"
  19 #include "xbt/str.h"
  20
  21
  22
  23
  24 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(xbt_graph, xbt, "Graph");
  25
  26
  27
  28 /** @brief Constructor
  29  *  @return a new graph
  30  */
  31 xbt_graph_t xbt_graph_new_graph(unsigned short int directed, void *data)
  32 {
  33   xbt_graph_t graph = NULL;
  34   graph = xbt_new0(struct xbt_graph, 1);
  35   graph->directed = directed;
  36   graph->data = data;
  37   graph->nodes = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_node_t), NULL);
  38   graph->edges = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  39
  40   return graph;
  41 }
  42
  43 /** @brief add a node to the given graph */
  44 xbt_node_t xbt_graph_new_node(xbt_graph_t g, void *data)
  45 {
  46   xbt_node_t node = NULL;
  47   node = xbt_new0(struct xbt_node, 1);
  48   node->data = data;
  49   if (g->directed)
  50     /* only the "out" field is used */
  51     node->in = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  52
  53   node->out = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  54   node->position_x = -1.0;
  55   node->position_y = -1.0;
  56
  57   xbt_dynar_push(g->nodes, &node);
  58
  59   return node;
  60 }
  61
  62 /** @brief add an edge to the given graph */
  63 xbt_edge_t xbt_graph_new_edge(xbt_graph_t g,
  64                               xbt_node_t src, xbt_node_t dst, void *data)
  65 {
  66   xbt_edge_t edge = NULL;
  67
  68   edge = xbt_new0(struct xbt_edge, 1);
  69   xbt_dynar_push(src->out, &edge);
  70   if (g->directed)
  71     xbt_dynar_push(dst->in, &edge);
  72   else                          /* only the "out" field is used */
  73     xbt_dynar_push(dst->out, &edge);
  74
  75   edge->data = data;
  76   edge->src = src;
  77   edge->dst = dst;
  78
  79   xbt_dynar_push(g->edges, &edge);
  80
  81   return edge;
  82 }
  83
  84 xbt_edge_t xbt_graph_get_edge(xbt_graph_t g, xbt_node_t src,
  85                               xbt_node_t dst)
  86 {
  87   xbt_edge_t edge;
  88   unsigned int cursor;
  89
  90   xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  91     XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  92     if ((edge->src == src) && (edge->dst == dst))
  93       return edge;
  94   }
  95   if (!g->directed) {
  96     xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  97       XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  98       if ((edge->dst == src) && (edge->src == dst))
  99         return edge;
 100     }
 101   }
 102   return NULL;
 103 }
 104
 105 void *xbt_graph_node_get_data(xbt_node_t node)
 106 {
 107   return node->data;
 108 }
 109
 110 void xbt_graph_node_set_data(xbt_node_t node, void *data)
 111 {
 112   node->data = data;
 113 }
 114
 115 void *xbt_graph_edge_get_data(xbt_edge_t edge)
 116 {
 117   return edge->data;
 118 }
 119
 120 void xbt_graph_edge_set_data(xbt_edge_t edge, void *data)
 121 {
 122   edge->data = data;
 123 }
 124
 125 /** @brief Destructor
 126  *  @param g: poor victim
 127  *  @param node_free_function: function to use to free data associated to each node
 128  *  @param edge_free_function: function to use to free data associated to each edge
 129  *  @param graph_free_function: function to use to free data associated to g
 130  *
 131  * Free the graph structure.
 132  */
 133 void xbt_graph_free_graph(xbt_graph_t g,
 134                           void_f_pvoid_t node_free_function,
 135                           void_f_pvoid_t edge_free_function,
 136                           void_f_pvoid_t graph_free_function)
 137 {
 138   unsigned int cursor = 0;
 139   xbt_node_t node = NULL;
 140   xbt_edge_t edge = NULL;
 141
 142
 143   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 144     xbt_dynar_free(&(node->out));
 145     xbt_dynar_free(&(node->in));
 146     if (node_free_function)
 147       (*node_free_function) (node->data);
 148   }
 149
 150   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 151     if (edge_free_function)
 152       (*edge_free_function) (edge->data);
 153   }
 154
 155   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 156       free(node);
 157   xbt_dynar_free(&(g->nodes));
 158
 159   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge)
 160       free(edge);
 161   xbt_dynar_free(&(g->edges));
 162   if (graph_free_function)
 163     (*graph_free_function) (g->data);
 164   free(g);
 165   xbt_graph_parse_lex_destroy();
 166   return;
 167 }
 168
 169
 170 /** @brief remove the given node from the given graph */
 171 void xbt_graph_free_node(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 172                          void_f_pvoid_t node_free_function,
 173                          void_f_pvoid_t edge_free_function)
 174 {
 175   unsigned long nbr;
 176   unsigned long i;
 177   unsigned int cursor = 0;
 178   xbt_node_t node = NULL;
 179   xbt_edge_t edge = NULL;
 180
 181   nbr = xbt_dynar_length(g->edges);
 182   cursor = 0;
 183   for (i = 0; i < nbr; i++) {
 184     xbt_dynar_get_cpy(g->edges, cursor, &edge);
 185
 186     if ((edge->dst == n) || (edge->src == n)) {
 187       xbt_graph_free_edge(g, edge, edge_free_function);
 188     } else
 189       cursor++;
 190   }
 191
 192   if ((node_free_function) && (n->data))
 193     (*node_free_function) (n->data);
 194
 195   cursor = 0;
 196   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 197       if (node == n)
 198     xbt_dynar_cursor_rm(g->nodes, &cursor);
 199
 200   xbt_dynar_free(&(n->in));
 201   xbt_dynar_free(&(n->out));
 202
 203   free(n);
 204
 205   return;
 206 }
 207
 208 /** @brief remove the given edge from the given graph */
 209 void xbt_graph_free_edge(xbt_graph_t g, xbt_edge_t e,
 210                          void_f_pvoid_t free_function)
 211 {
 212   int idx;
 213   unsigned int cursor = 0;
 214   xbt_edge_t edge = NULL;
 215
 216   if ((free_function) && (e->data))
 217     (*free_function) (e->data);
 218
 219   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 220     if (edge == e) {
 221       if (g->directed) {
 222         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->in, edge);
 223         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->in, idx, NULL);
 224       } else {                  /* only the out field is used */
 225         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->out, edge);
 226         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->out, idx, NULL);
 227       }
 228
 229       idx = __xbt_find_in_dynar(edge->src->out, edge);
 230       xbt_dynar_remove_at(edge->src->out, idx, NULL);
 231
 232       xbt_dynar_cursor_rm(g->edges, &cursor);
 233       free(edge);
 234       break;
 235     }
 236   }
 237 }
 238
 239 int __xbt_find_in_dynar(xbt_dynar_t dynar, void *p)
 240 {
 241
 242   unsigned int cursor = 0;
 243   void *tmp = NULL;
 244
 245   xbt_dynar_foreach(dynar, cursor, tmp) {
 246     if (tmp == p)
 247       return cursor;
 248   }
 249   return -1;
 250 }
 251
 252 /** @brief Retrieve the graph's nodes as a dynar */
 253 xbt_dynar_t xbt_graph_get_nodes(xbt_graph_t g)
 254 {
 255   return g->nodes;
 256 }
 257
 258 /** @brief Retrieve the graph's edges as a dynar */
 259 xbt_dynar_t xbt_graph_get_edges(xbt_graph_t g)
 260 {
 261   return g->edges;
 262 }
 263
 264 /** @brief Retrieve the node at the source of the given edge */
 265 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_source(xbt_edge_t e)
 266 {
 267   return e->src;
 268 }
 269
 270 /** @brief Retrieve the node being the target of the given edge */
 271 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_target(xbt_edge_t e)
 272 {
 273   return e->dst;
 274 }
 275
 276 /** @brief Retrieve the outgoing edges of the given node */
 277 xbt_dynar_t xbt_graph_node_get_outedges(xbt_node_t n)
 278 {
 279   return n->out;
 280 }
 281
 282 /** @brief Set the weight of the given edge */
 283 void xbt_graph_edge_set_length(xbt_edge_t e, double length)
 284 {
 285   e->length = length;
 286
 287 }
 288
 289 double xbt_graph_edge_get_length(xbt_edge_t e)
 290 {
 291   return e->length;
 292 }
 293
 294
 295 /** @brief construct the adjacency matrix corresponding to the given graph
 296  *
 297  * The weights are the distances between nodes
 298  */
 299 double *xbt_graph_get_length_matrix(xbt_graph_t g)
 300 {
 301   unsigned int cursor = 0;
 302   unsigned int in_cursor = 0;
 303   unsigned long idx, i;
 304   unsigned long n;
 305   xbt_edge_t edge = NULL;
 306   xbt_node_t node = NULL;
 307   double *d = NULL;
 308
 309 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 310   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 311
 312   d = (double *) xbt_new0(double, n * n);
 313
 314   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 315     d[i] = -1.0;
 316   }
 317
 318   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 319     in_cursor = 0;
 320     D(cursor, cursor) = 0;
 321
 322     xbt_dynar_foreach(node->out, in_cursor, edge) {
 323       if (edge->dst == node)
 324         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->src);
 325       else                      /*case of  undirected graphs */
 326         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->dst);
 327       D(cursor, idx) = edge->length;
 328     }
 329   }
 330
 331 # undef D
 332
 333   return d;
 334 }
 335
 336 /** @brief Floyd-Warshall algorithm for shortest path finding
 337  *
 338  * From wikipedia:
 339  *
 340  * The Floyd–Warshall algorithm takes as input an adjacency matrix
 341  * representation of a weighted, directed graph (V, E). The weight of a
 342  * path between two vertices is the sum of the weights of the edges along
 343  * that path. The edges E of the graph may have negative weights, but the
 344  * graph must not have any negative weight cycles. The algorithm computes,
 345  * for each pair of vertices, the minimum weight among all paths between
 346  * the two vertices. The running time complexity is Θ(|V|3).
 347  */
 348 void xbt_floyd_algorithm(xbt_graph_t g, double *adj, double *d,
 349                          xbt_node_t * p)
 350 {
 351   unsigned long i, j, k;
 352   unsigned long n;
 353   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 354
 355 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 356 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 357
 358   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 359     d[i] = adj[i];
 360   }
 361
 362
 363   for (i = 0; i < n; i++) {
 364     for (j = 0; j < n; j++) {
 365       if (D(i, j) != -1) {
 366         P(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, i));
 367       }
 368     }
 369   }
 370
 371   for (k = 0; k < n; k++) {
 372     for (i = 0; i < n; i++) {
 373       for (j = 0; j < n; j++) {
 374         if ((D(i, k) != -1) && (D(k, j) != -1)) {
 375           if ((D(i, j) == -1) || (D(i, j) > D(i, k) + D(k, j))) {
 376             D(i, j) = D(i, k) + D(k, j);
 377             P(i, j) = P(k, j);
 378           }
 379         }
 380       }
 381     }
 382   }
 383
 384
 385
 386 # undef P
 387 # undef D
 388 }
 389
 390 /** @brief computes all-pairs shortest paths */
 391 xbt_node_t *xbt_graph_shortest_paths(xbt_graph_t g)
 392 {
 393   xbt_node_t *p;
 394   xbt_node_t *r;
 395   unsigned long i, j, k;
 396   unsigned long n;
 397
 398   double *adj = NULL;
 399   double *d = NULL;
 400
 401 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 402 # define R(u,v) r[(u)*n+(v)]
 403
 404   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 405   adj = xbt_graph_get_length_matrix(g);
 406   d = xbt_new0(double, n * n);
 407   p = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 408   r = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 409
 410   xbt_floyd_algorithm(g, adj, d, p);
 411
 412   for (i = 0; i < n; i++) {
 413     for (j = 0; j < n; j++) {
 414       k = j;
 415
 416       while ((P(i, k)) && (__xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k)) != i)) {
 417         k = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k));
 418       }
 419
 420       if (P(i, j)) {
 421         R(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, k));
 422       }
 423     }
 424   }
 425 # undef R
 426 # undef P
 427
 428   free(d);
 429   free(p);
 430   free(adj);
 431   return r;
 432 }
 433
 434 /** @brief Extract a spanning tree of the given graph */
 435 xbt_edge_t *xbt_graph_spanning_tree_prim(xbt_graph_t g)
 436 {
 437   int tree_size = 0;
 438   int tree_size_max = xbt_dynar_length(g->nodes) - 1;
 439   xbt_edge_t *tree = xbt_new0(xbt_edge_t, tree_size_max);
 440   xbt_edge_t e, edge;
 441   xbt_node_t node = NULL;
 442   xbt_dynar_t edge_list = NULL;
 443   xbt_heap_t heap = xbt_heap_new(10, NULL);
 444   unsigned int cursor;
 445
 446   xbt_assert(!(g->directed),
 447               "Spanning trees do not make sense on directed graphs");
 448
 449   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 450     node->xbtdata = NULL;
 451   }
 452
 453   node = xbt_dynar_getfirst_as(g->nodes, xbt_node_t);
 454   node->xbtdata = (void *) 1;
 455   edge_list = node->out;
 456   xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e)
 457       xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 458
 459   while ((edge = xbt_heap_pop(heap))) {
 460     if ((edge->src->xbtdata) && (edge->dst->xbtdata))
 461       continue;
 462     tree[tree_size++] = edge;
 463     if (!(edge->src->xbtdata)) {
 464       edge->src->xbtdata = (void *) 1;
 465       edge_list = edge->src->out;
 466       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 467         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 468       }
 469     } else {
 470       edge->dst->xbtdata = (void *) 1;
 471       edge_list = edge->dst->out;
 472       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 473         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 474       }
 475     }
 476     if (tree_size == tree_size_max)
 477       break;
 478   }
 479
 480   xbt_heap_free(heap);
 481
 482   return tree;
 483 }
 484
 485 /** @brief Topological sort on the given graph
 486  *
 487  *  From wikipedia:
 488  *
 489  * In graph theory, a topological sort of a directed acyclic graph (DAG) is
 490  * a linear ordering of its nodes which is compatible with the partial
 491  * order R induced on the nodes where x comes before y (xRy) if there's a
 492  * directed path from x to y in the DAG. An equivalent definition is that
 493  * each node comes before all nodes to which it has edges. Every DAG has at
 494  * least one topological sort, and may have many.
 495  */
 496 xbt_node_t *xbt_graph_topo_sort(xbt_graph_t g)
 497 {
 498
 499   xbt_node_t *sorted;
 500   unsigned int cursor;
 501   int idx;
 502   xbt_node_t node;
 503   unsigned long n;
 504
 505   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 506   idx = n - 1;
 507
 508   sorted = xbt_malloc(n * sizeof(xbt_node_t));
 509
 510   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 511       node->xbtdata = xbt_new0(int, 1);
 512
 513   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 514       xbt_graph_depth_visit(g, node, sorted, &idx);
 515
 516   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 517     free(node->xbtdata);
 518     node->xbtdata = NULL;
 519   }
 520
 521   return sorted;
 522 }
 523
 524 /** @brief First-depth graph traversal */
 525 void xbt_graph_depth_visit(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 526                            xbt_node_t * sorted, int *idx)
 527 {
 528   unsigned int cursor;
 529   xbt_edge_t edge;
 530
 531   if (*((int *) (n->xbtdata)) == ALREADY_EXPLORED)
 532     return;
 533   else if (*((int *) (n->xbtdata)) == CURRENTLY_EXPLORING)
 534     THROWF(0, 0, "There is a cycle");
 535   else {
 536     *((int *) (n->xbtdata)) = CURRENTLY_EXPLORING;
 537
 538     xbt_dynar_foreach(n->out, cursor, edge) {
 539       xbt_graph_depth_visit(g, edge->dst, sorted, idx);
 540     }
 541
 542     *((int *) (n->xbtdata)) = ALREADY_EXPLORED;
 543     sorted[(*idx)--] = n;
 544   }
 545 }
 546
 547 /********************* Import and Export ******************/
 548 static xbt_graph_t parsed_graph = NULL;
 549 static xbt_dict_t parsed_nodes = NULL;
 550
 551 static void *(*__parse_node_label_and_data) (xbt_node_t, const char *,
 552                                              const char *) = NULL;
 553 static void *(*__parse_edge_label_and_data) (xbt_edge_t, const char *,
 554                                              const char *) = NULL;
 555
 556 static void __parse_graph_begin(void)
 557 {
 558   XBT_DEBUG("<graph>");
 559   if (A_graphxml_graph_isDirected == A_graphxml_graph_isDirected_true)
 560     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(1, NULL);
 561   else
 562     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(0, NULL);
 563
 564   parsed_nodes = xbt_dict_new();
 565 }
 566
 567 static void __parse_graph_end(void)
 568 {
 569   xbt_dict_free(&parsed_nodes);
 570   XBT_DEBUG("</graph>");
 571 }
 572
 573 static void __parse_node(void)
 574 {
 575   xbt_node_t node = xbt_graph_new_node(parsed_graph, NULL);
 576
 577   XBT_DEBUG("<node name=\"%s\"/>", A_graphxml_node_name);
 578   if (__parse_node_label_and_data)
 579     node->data = __parse_node_label_and_data(node, A_graphxml_node_label,
 580                                              A_graphxml_node_data);
 581   xbt_graph_parse_get_double(&(node->position_x),
 582                              A_graphxml_node_position_x);
 583   xbt_graph_parse_get_double(&(node->position_y),
 584                              A_graphxml_node_position_y);
 585
 586   xbt_dict_set(parsed_nodes, A_graphxml_node_name, (void *) node, NULL);
 587 }
 588
 589 static void __parse_edge(void)
 590 {
 591   xbt_edge_t edge = xbt_graph_new_edge(parsed_graph,
 592                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 593                                                     A_graphxml_edge_source),
 594                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 595                                                     A_graphxml_edge_target),
 596                                        NULL);
 597
 598   if (__parse_edge_label_and_data)
 599     edge->data = __parse_edge_label_and_data(edge, A_graphxml_edge_label,
 600                                              A_graphxml_edge_data);
 601
 602   xbt_graph_parse_get_double(&(edge->length), A_graphxml_edge_length);
 603
 604   XBT_DEBUG("<edge  source=\"%s\" target=\"%s\" length=\"%f\"/>",
 605          (char *) (edge->src)->data,
 606          (char *) (edge->dst)->data, xbt_graph_edge_get_length(edge));
 607 }
 608
 609 /** @brief Import a graph from a file following the GraphXML format */
 610 xbt_graph_t xbt_graph_read(const char *filename,
 611                            void *(*node_label_and_data) (xbt_node_t,
 612                                                          const char *,
 613                                                          const char *),
 614                            void *(*edge_label_and_data) (xbt_edge_t,
 615                                                          const char *,
 616                                                          const char *))
 617 {
 618
 619   xbt_graph_t graph = NULL;
 620
 621   __parse_node_label_and_data = node_label_and_data;
 622   __parse_edge_label_and_data = edge_label_and_data;
 623
 624   xbt_graph_parse_reset_parser();
 625
 626   STag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_begin;
 627   ETag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_end;
 628   ETag_graphxml_node_fun = __parse_node;
 629   ETag_graphxml_edge_fun = __parse_edge;
 630
 631   xbt_graph_parse_open(filename);
 632   int res;
 633   res = (*xbt_graph_parse) ();
 634   xbt_assert(!res, "Parse error in %s", filename);
 635   xbt_graph_parse_close();
 636
 637   graph = parsed_graph;
 638   parsed_graph = NULL;
 639
 640   return graph;
 641 }
 642
 643 /** @brief Export the given graph in the GraphViz formatting for visualization */
 644 void xbt_graph_export_graphviz(xbt_graph_t g, const char *filename,
 645                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 646                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t))
 647 {
 648   unsigned int cursor = 0;
 649   xbt_node_t node = NULL;
 650   xbt_edge_t edge = NULL;
 651   FILE *file = NULL;
 652   const char *name = NULL;
 653
 654   file = fopen(filename, "w");
 655   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 656
 657   if (g->directed)
 658     fprintf(file, "digraph test {\n");
 659   else
 660     fprintf(file, "graph test {\n");
 661
 662   fprintf(file, "  graph [overlap=scale]\n");
 663
 664   fprintf(file, "  node [shape=box, style=filled]\n");
 665   fprintf(file,
 666           "  node [width=.3, height=.3, style=filled, color=skyblue]\n\n");
 667
 668   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 669     fprintf(file, "  \"%p\" ", node);
 670     if ((node_name) && ((name = node_name(node))))
 671       fprintf(file, "[label=\"%s\"]", name);
 672     fprintf(file, ";\n");
 673   }
 674   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 675     if (g->directed)
 676       fprintf(file, "  \"%p\" -> \"%p\"", edge->src, edge->dst);
 677     else
 678       fprintf(file, "  \"%p\" -- \"%p\"", edge->src, edge->dst);
 679     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 680       fprintf(file, "[label=\"%s\"]", name);
 681     fprintf(file, ";\n");
 682   }
 683   fprintf(file, "}\n");
 684   fclose(file);
 685 }
 686
 687 /** @brief Export the given graph in the GraphXML format */
 688 void xbt_graph_export_graphxml(xbt_graph_t g, const char *filename,
 689                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 690                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t),
 691                                const char *(node_data_print) (void *),
 692                                const char *(edge_data_print) (void *))
 693 {
 694   unsigned int cursor = 0;
 695   xbt_node_t node = NULL;
 696   xbt_edge_t edge = NULL;
 697   FILE *file = NULL;
 698   const char *name = NULL;
 699
 700   file = fopen(filename, "w");
 701   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 702
 703   fprintf(file, "<?xml version='1.0'?>\n");
 704   fprintf(file, "<!DOCTYPE graph SYSTEM \"graphxml.dtd\">\n");
 705   if (g->directed)
 706     fprintf(file, "<graph isDirected=\"true\">\n");
 707   else
 708     fprintf(file, "<graph isDirected=\"false\">\n");
 709   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 710     fprintf(file, "  <node name=\"%p\" ", node);
 711     if ((node_name) && ((name = node_name(node))))
 712       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 713     if ((node_data_print) && ((name = node_data_print(node->data))))
 714       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 715     fprintf(file, ">\n");
 716   }
 717   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 718     fprintf(file, "  <edge source=\"%p\" target =\"%p\" ",
 719             edge->src, edge->dst);
 720     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 721       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 722     if (edge->length >= 0.0)
 723       fprintf(file, "length=\"%g\" ", edge->length);
 724     if ((edge_data_print) && ((name = edge_data_print(edge->data))))
 725       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 726     fprintf(file, ">\n");
 727   }
 728   fprintf(file, "</graph>\n");
 729   fclose(file);
 730 }
 731
 732 /** @brief Load a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 733 xbt_graph_t xbt_graph_load (const char *filename)
 734 {
 735   FILE *file = NULL;
 736   ssize_t read;
 737   file = fopen (filename, "r");
 738   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 739
 740   xbt_dict_t nodes_dict = xbt_dict_new ();
 741   xbt_graph_t ret = xbt_graph_new_graph (0, NULL);
 742
 743   //read the number of nodes
 744   size_t size;
 745   char *nnodes_str = NULL;
 746   read = getline (&nnodes_str, &size, file);
 747   if (read == -1)
 748     THROWF(system_error, 0, "getline failed to read the number of nodes (errno = %d)", errno);
 749   int i, nnodes = atoi (nnodes_str);
 750   free (nnodes_str);
 751
 752   //read all nodes
 753   for (i = 0; i < nnodes; i++){
 754     char *node_str = NULL;
 755     read = getline (&node_str, &size, file);
 756     if (read == -1)
 757       THROWF(system_error, 0, "getline failed to read all nodes (errno = %d)", errno);
 758     xbt_node_t n;
 759     char *name = xbt_strdup (node_str);
 760     xbt_str_subst (name, '\n', '\0', 0);
 761     n = xbt_graph_new_node (ret, name);
 762     xbt_dict_set (nodes_dict, name, n, NULL);
 763     free (node_str);
 764   }
 765
 766   //read the number of edges
 767   char *nedges_str = NULL;
 768   read = getline (&nedges_str, &size, file);
 769   if (read == -1)
 770     THROWF(system_error, 0, "getline failed to read the number of edges (errno = %d)", errno);
 771   int nedges = atoi (nedges_str);
 772   free (nedges_str);
 773
 774   //read all edges
 775   for (i = 0; i < nedges; i++){
 776     char *edge_str = NULL, edge_id[200], node_source[200], node_target[200];
 777     read = getline (&edge_str, &size, file);
 778     if (read == -1)
 779       THROWF(system_error, 0, "getline failed to read all edges (errno = %d)", errno);
 780     sscanf (edge_str, "%s %s %s", edge_id, node_source, node_target);
 781     free (edge_str);
 782     xbt_str_subst (edge_id, '\n', '\0', 0);
 783     xbt_str_subst (node_source, '\n', '\0', 0);
 784     xbt_str_subst (node_target, '\n', '\0', 0);
 785
 786     xbt_node_t source = xbt_dict_get (nodes_dict, node_source);
 787     xbt_node_t target = xbt_dict_get (nodes_dict, node_target);
 788     xbt_graph_new_edge (ret, source, target, xbt_strdup(edge_id));
 789   }
 790   xbt_dict_free (&nodes_dict);
 791   return ret;
 792 }
 793
 794 /** @brief Save a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 795 void xbt_graph_save (xbt_graph_t span,
 796                      const char *filename,
 797                      const char *(nname) (xbt_node_t),
 798                      const char *(ename) (xbt_edge_t))
 799 {
 800   FILE *file = NULL;
 801   file = fopen(filename, "w");
 802   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 803
 804   xbt_dynar_t nodes = xbt_graph_get_nodes (span);
 805   xbt_dynar_t edges = xbt_graph_get_edges (span);
 806   unsigned int cpt;
 807   xbt_node_t node;
 808   fprintf (file, "%ld\n", xbt_dynar_length (nodes));
 809   xbt_dynar_foreach (nodes, cpt, node) {
 810     if (nname){
 811       fprintf (file, "%s\n", nname(node));
 812     }else{
 813       fprintf (file, "%p\n", node);
 814     }
 815   }
 816   fprintf (file, "%ld\n", xbt_dynar_length (edges));
 817   xbt_edge_t edge;
 818   xbt_dynar_foreach (edges, cpt, edge) {
 819     xbt_node_t source = xbt_graph_edge_get_source (edge);
 820     xbt_node_t target = xbt_graph_edge_get_target (edge);
 821     if (ename){
 822       if (nname){
 823         fprintf (file, "%s %s %s\n", ename(edge), nname(source), nname(target));
 824       }else{
 825         fprintf (file, "%s %p %p\n", ename(edge), source, target);
 826       }
 827     }else{
 828       if (nname){
 829         fprintf (file, "%p %s %s\n", edge, nname(source), nname(target));
 830       }else{
 831         fprintf (file, "%p %p %p\n", edge, source, target);
 832       }
 833     }
 834   }
 835   fclose (file);
 836 }