src/smpi/internals/smpi_global.cpp

   1 /* Copyright (c) 2007-2019. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
   2
   3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   5
   6 #include "mc/mc.h"
   7 #include "simgrid/s4u/Engine.hpp"
   8 #include "simgrid/plugins/file_system.h"
   9 #include "smpi_coll.hpp"
  10 #include "smpi_f2c.hpp"
  11 #include "smpi_host.hpp"
  12 #include "src/kernel/activity/CommImpl.hpp"
  13 #include "src/simix/smx_private.hpp"
  14 #include "src/smpi/include/smpi_actor.hpp"
  15 #include "xbt/config.hpp"
  16
  17 #include <algorithm>
  18 #include <boost/algorithm/string.hpp> /* trim_right / trim_left */
  19 #include <boost/tokenizer.hpp>
  20 #include <cfloat> /* DBL_MAX */
  21 #include <cinttypes>
  22 #include <cstdint> /* intmax_t */
  23 #include <dlfcn.h>
  24 #include <fcntl.h>
  25 #include <fstream>
  26 #include <sys/stat.h>
  27
  28 #if SG_HAVE_SENDFILE
  29 #include <sys/sendfile.h>
  30 #endif
  31
  32 #if HAVE_PAPI
  33 #include "papi.h"
  34 #endif
  35
  36 #if not defined(__APPLE__) && not defined(__HAIKU__)
  37 #include <link.h>
  38 #endif
  39
  40 #if defined(__APPLE__)
  41 # include <AvailabilityMacros.h>
  42 # ifndef MAC_OS_X_VERSION_10_12
  43 #   define MAC_OS_X_VERSION_10_12 101200
  44 # endif
  45 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = (MAC_OS_X_VERSION_MIN_REQUIRED >= MAC_OS_X_VERSION_10_12);
  46 #elif defined(__FreeBSD__) || defined(__FreeBSD_kernel__) || defined(__sun) || defined(__HAIKU__)
  47 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = false;
  48 #else
  49 constexpr bool HAVE_WORKING_MMAP = true;
  50 #endif
  51
  52 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_kernel, smpi, "Logging specific to SMPI (kernel)");
  53
  54 #if SMPI_IFORT
  55   extern "C" void for_rtl_init_ (int *, char **);
  56   extern "C" void for_rtl_finish_ ();
  57 #elif SMPI_FLANG
  58   extern "C" void __io_set_argc(int);
  59   extern "C" void __io_set_argv(char **);
  60 #elif SMPI_GFORTRAN
  61   extern "C" void _gfortran_set_args(int, char **);
  62 #endif
  63
  64 /* RTLD_DEEPBIND is a bad idea of GNU ld that obviously does not exist on other platforms
  65  * See https://www.akkadia.org/drepper/dsohowto.pdf
  66  * and https://lists.freebsd.org/pipermail/freebsd-current/2016-March/060284.html
  67 */
  68 #if !RTLD_DEEPBIND || HAVE_SANITIZER_ADDRESS || HAVE_SANITIZER_THREAD
  69 #define WANT_RTLD_DEEPBIND 0
  70 #else
  71 #define WANT_RTLD_DEEPBIND RTLD_DEEPBIND
  72 #endif
  73
  74 #if HAVE_PAPI
  75 std::string papi_default_config_name = "default";
  76 std::map</* computation unit name */ std::string, papi_process_data> units2papi_setup;
  77 #endif
  78
  79 std::unordered_map<std::string, double> location2speedup;
  80
  81 static std::map</*process_id*/ simgrid::s4u::Actor const*, simgrid::smpi::ActorExt*> process_data;
  82 int process_count = 0;
  83 static int smpi_exit_status = 0;
  84 int smpi_universe_size = 0;
  85 extern double smpi_total_benched_time;
  86 xbt_os_timer_t global_timer;
  87 static std::vector<std::string> privatize_libs_paths;
  88 /**
  89  * Setting MPI_COMM_WORLD to MPI_COMM_UNINITIALIZED (it's a variable)
  90  * is important because the implementation of MPI_Comm checks
  91  * "this == MPI_COMM_UNINITIALIZED"? If yes, it uses smpi_process()->comm_world()
  92  * instead of "this".
  93  * This is basically how we only have one global variable but all processes have
  94  * different communicators (the one their SMPI instance uses).
  95  *
  96  * See smpi_comm.cpp and the functions therein for details.
  97  */
  98 MPI_Comm MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  99 MPI_Errhandler *MPI_ERRORS_RETURN = nullptr;
 100 MPI_Errhandler *MPI_ERRORS_ARE_FATAL = nullptr;
 101 MPI_Errhandler *MPI_ERRHANDLER_NULL = nullptr;
 102 // No instance gets manually created; check also the smpirun.in script as
 103 // this default name is used there as well (when the <actor> tag is generated).
 104 static const std::string smpi_default_instance_name("smpirun");
 105 static simgrid::config::Flag<double> smpi_init_sleep(
 106   "smpi/init", "Time to inject inside a call to MPI_Init", 0.0);
 107
 108 void (*smpi_comm_copy_data_callback)(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*,
 109                                      size_t) = &smpi_comm_copy_buffer_callback;
 110
 111 int smpi_process_count()
 112 {
 113   return process_count;
 114 }
 115
 116 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process()
 117 {
 118   simgrid::s4u::ActorPtr me = simgrid::s4u::Actor::self();
 119
 120   if (me == nullptr) // This happens sometimes (eg, when linking against NS3 because it pulls openMPI...)
 121     return nullptr;
 122
 123   return process_data.at(me.get());
 124 }
 125
 126 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process_remote(simgrid::s4u::ActorPtr actor)
 127 {
 128   return process_data.at(actor.get());
 129 }
 130
 131 MPI_Comm smpi_process_comm_self(){
 132   return smpi_process()->comm_self();
 133 }
 134
 135 MPI_Info smpi_process_info_env(){
 136   return smpi_process()->info_env();
 137 }
 138
 139 void smpi_process_init(int*, char***)
 140 {
 141   simgrid::smpi::ActorExt::init();
 142 }
 143
 144 void * smpi_process_get_user_data(){
 145   return simgrid::s4u::Actor::self()->get_impl()->get_user_data();
 146 }
 147
 148 void smpi_process_set_user_data(void *data){
 149   simgrid::s4u::Actor::self()->get_impl()->set_user_data(data);
 150 }
 151
 152 void smpi_comm_set_copy_data_callback(void (*callback) (smx_activity_t, void*, size_t))
 153 {
 154   static void (*saved_callback)(smx_activity_t, void*, size_t);
 155   saved_callback               = callback;
 156   smpi_comm_copy_data_callback = [](simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t size) {
 157     saved_callback(smx_activity_t(comm), buff, size);
 158   };
 159 }
 160
 161 static void memcpy_private(void* dest, const void* src, std::vector<std::pair<size_t, size_t>>& private_blocks)
 162 {
 163   for (auto const& block : private_blocks)
 164     memcpy((uint8_t*)dest+block.first, (uint8_t*)src+block.first, block.second-block.first);
 165 }
 166
 167 static void check_blocks(std::vector<std::pair<size_t, size_t>> &private_blocks, size_t buff_size) {
 168   for (auto const& block : private_blocks)
 169     xbt_assert(block.first <= block.second && block.second <= buff_size, "Oops, bug in shared malloc.");
 170 }
 171
 172 void smpi_comm_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t buff_size)
 173 {
 174   size_t src_offset                     = 0;
 175   size_t dst_offset                     = 0;
 176   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> src_private_blocks;
 177   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> dst_private_blocks;
 178   XBT_DEBUG("Copy the data over");
 179   if(smpi_is_shared(buff, src_private_blocks, &src_offset)) {
 180     XBT_DEBUG("Sender %p is shared. Let's ignore it.", buff);
 181     src_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(src_private_blocks, src_offset, buff_size);
 182   }
 183   else {
 184     src_private_blocks.clear();
 185     src_private_blocks.push_back(std::make_pair(0, buff_size));
 186   }
 187   if (smpi_is_shared((char*)comm->dst_buff_, dst_private_blocks, &dst_offset)) {
 188     XBT_DEBUG("Receiver %p is shared. Let's ignore it.", (char*)comm->dst_buff_);
 189     dst_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(dst_private_blocks, dst_offset, buff_size);
 190   }
 191   else {
 192     dst_private_blocks.clear();
 193     dst_private_blocks.push_back(std::make_pair(0, buff_size));
 194   }
 195   check_blocks(src_private_blocks, buff_size);
 196   check_blocks(dst_private_blocks, buff_size);
 197   auto private_blocks = merge_private_blocks(src_private_blocks, dst_private_blocks);
 198   check_blocks(private_blocks, buff_size);
 199   void* tmpbuff=buff;
 200   if ((smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) &&
 201       (static_cast<char*>(buff) >= smpi_data_exe_start) &&
 202       (static_cast<char*>(buff) < smpi_data_exe_start + smpi_data_exe_size)) {
 203     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying from a zone inside global memory... Saving data to temp buffer !");
 204     smpi_switch_data_segment(comm->src_actor_->iface());
 205     tmpbuff = static_cast<void*>(xbt_malloc(buff_size));
 206     memcpy_private(tmpbuff, buff, private_blocks);
 207   }
 208
 209   if ((smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) &&
 210       ((char*)comm->dst_buff_ >= smpi_data_exe_start) &&
 211       ((char*)comm->dst_buff_ < smpi_data_exe_start + smpi_data_exe_size)) {
 212     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying to a zone inside global memory - Switch data segment");
 213     smpi_switch_data_segment(comm->dst_actor_->iface());
 214   }
 215   XBT_DEBUG("Copying %zu bytes from %p to %p", buff_size, tmpbuff, comm->dst_buff_);
 216   memcpy_private(comm->dst_buff_, tmpbuff, private_blocks);
 217
 218   if (comm->detached()) {
 219     // if this is a detached send, the source buffer was duplicated by SMPI
 220     // sender to make the original buffer available to the application ASAP
 221     xbt_free(buff);
 222     //It seems that the request is used after the call there this should be free somewhere else but where???
 223     //xbt_free(comm->comm.src_data);// inside SMPI the request is kept inside the user data and should be free
 224     comm->src_buff_ = nullptr;
 225   }
 226   if (tmpbuff != buff)
 227     xbt_free(tmpbuff);
 228 }
 229
 230 void smpi_comm_null_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*, size_t)
 231 {
 232   /* nothing done in this version */
 233 }
 234
 235 static void smpi_check_options()
 236 {
 237   //check correctness of MPI parameters
 238
 239   xbt_assert(simgrid::config::get_value<int>("smpi/async-small-thresh") <=
 240              simgrid::config::get_value<int>("smpi/send-is-detached-thresh"));
 241
 242   if (simgrid::config::is_default("smpi/host-speed")) {
 243     XBT_INFO("You did not set the power of the host running the simulation.  "
 244              "The timings will certainly not be accurate.  "
 245              "Use the option \"--cfg=smpi/host-speed:<flops>\" to set its value.  "
 246              "Check "
 247              "https://simgrid.org/doc/latest/Configuring_SimGrid.html#automatic-benchmarking-of-smpi-code for more "
 248              "information.");
 249   }
 250
 251   xbt_assert(simgrid::config::get_value<double>("smpi/cpu-threshold") >= 0,
 252              "The 'smpi/cpu-threshold' option cannot have negative values [anymore]. If you want to discard "
 253              "the simulation of any computation, please use 'smpi/simulate-computation:no' instead.");
 254 }
 255
 256 int smpi_enabled() {
 257   return not process_data.empty();
 258 }
 259
 260 void smpi_global_init()
 261 {
 262   if (not MC_is_active()) {
 263     global_timer = xbt_os_timer_new();
 264     xbt_os_walltimer_start(global_timer);
 265   }
 266
 267   std::string filename = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/comp-adjustment-file");
 268   if (not filename.empty()) {
 269     std::ifstream fstream(filename);
 270     if (not fstream.is_open()) {
 271       xbt_die("Could not open file %s. Does it exist?", filename.c_str());
 272     }
 273
 274     std::string line;
 275     typedef boost::tokenizer< boost::escaped_list_separator<char>> Tokenizer;
 276     std::getline(fstream, line); // Skip the header line
 277     while (std::getline(fstream, line)) {
 278       Tokenizer tok(line);
 279       Tokenizer::iterator it  = tok.begin();
 280       Tokenizer::iterator end = std::next(tok.begin());
 281
 282       std::string location = *it;
 283       boost::trim(location);
 284       location2speedup.insert(std::pair<std::string, double>(location, std::stod(*end)));
 285     }
 286   }
 287
 288 #if HAVE_PAPI
 289   // This map holds for each computation unit (such as "default" or "process1" etc.)
 290   // the configuration as given by the user (counter data as a pair of (counter_name, counter_counter))
 291   // and the (computed) event_set.
 292
 293   if (not simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/papi-events").empty()) {
 294     if (PAPI_library_init(PAPI_VER_CURRENT) != PAPI_VER_CURRENT)
 295       XBT_ERROR("Could not initialize PAPI library; is it correctly installed and linked?"
 296                 " Expected version is %u", PAPI_VER_CURRENT);
 297
 298     typedef boost::tokenizer<boost::char_separator<char>> Tokenizer;
 299     boost::char_separator<char> separator_units(";");
 300     std::string str = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/papi-events");
 301     Tokenizer tokens(str, separator_units);
 302
 303     // Iterate over all the computational units. This could be processes, hosts, threads, ranks... You name it.
 304     // I'm not exactly sure what we will support eventually, so I'll leave it at the general term "units".
 305     for (auto const& unit_it : tokens) {
 306       boost::char_separator<char> separator_events(":");
 307       Tokenizer event_tokens(unit_it, separator_events);
 308
 309       int event_set = PAPI_NULL;
 310       if (PAPI_create_eventset(&event_set) != PAPI_OK) {
 311         // TODO: Should this let the whole simulation die?
 312         XBT_CRITICAL("Could not create PAPI event set during init.");
 313       }
 314
 315       // NOTE: We cannot use a map here, as we must obey the order of the counters
 316       // This is important for PAPI: We need to map the values of counters back
 317       // to the event_names (so, when PAPI_read() has finished)!
 318       papi_counter_t counters2values;
 319
 320       // Iterate over all counters that were specified for this specific
 321       // unit.
 322       // Note that we need to remove the name of the unit
 323       // (that could also be the "default" value), which always comes first.
 324       // Hence, we start at ++(events.begin())!
 325       for (Tokenizer::iterator events_it = ++(event_tokens.begin()); events_it != event_tokens.end(); ++events_it) {
 326
 327         int event_code   = PAPI_NULL;
 328         char* event_name = const_cast<char*>((*events_it).c_str());
 329         if (PAPI_event_name_to_code(event_name, &event_code) != PAPI_OK) {
 330           XBT_CRITICAL("Could not find PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
 331           continue;
 332         }
 333         if (PAPI_add_event(event_set, event_code) != PAPI_OK) {
 334           XBT_ERROR("Could not add PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
 335           continue;
 336         }
 337         XBT_DEBUG("Successfully added PAPI event '%s' to the event set.", event_name);
 338
 339         counters2values.push_back(
 340             // We cannot just pass *events_it, as this is of type const basic_string
 341             std::make_pair<std::string, long long>(std::string(*events_it), 0));
 342       }
 343
 344       std::string unit_name    = *(event_tokens.begin());
 345       papi_process_data config = {.counter_data = std::move(counters2values), .event_set = event_set};
 346
 347       units2papi_setup.insert(std::make_pair(unit_name, std::move(config)));
 348     }
 349   }
 350 #endif
 351 }
 352
 353 void smpi_global_destroy()
 354 {
 355   smpi_bench_destroy();
 356   smpi_shared_destroy();
 357   smpi_deployment_cleanup_instances();
 358
 359   if (simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback != nullptr)
 360     simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback();
 361
 362   MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_NULL;
 363
 364   if (not MC_is_active()) {
 365     xbt_os_timer_free(global_timer);
 366   }
 367
 368   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 369     smpi_destroy_global_memory_segments();
 370   if(simgrid::smpi::F2C::lookup() != nullptr)
 371     simgrid::smpi::F2C::delete_lookup();
 372 }
 373
 374 static void smpi_init_options(){
 375   // return if already called
 376   if (smpi_cpu_threshold > -1)
 377     return;
 378   simgrid::smpi::Colls::set_collectives();
 379   simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback = nullptr;
 380   smpi_cpu_threshold                               = simgrid::config::get_value<double>("smpi/cpu-threshold");
 381   smpi_host_speed                                  = simgrid::config::get_value<double>("smpi/host-speed");
 382   xbt_assert(smpi_host_speed > 0.0, "You're trying to set the host_speed to a non-positive value (given: %f)", smpi_host_speed);
 383   std::string smpi_privatize_option = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatization");
 384   if (smpi_privatize_option == "no" || smpi_privatize_option == "0")
 385     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::NONE;
 386   else if (smpi_privatize_option == "yes" || smpi_privatize_option == "1")
 387     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DEFAULT;
 388   else if (smpi_privatize_option == "mmap")
 389     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::MMAP;
 390   else if (smpi_privatize_option == "dlopen")
 391     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DLOPEN;
 392   else
 393     xbt_die("Invalid value for smpi/privatization: '%s'", smpi_privatize_option.c_str());
 394
 395   if (not SMPI_switch_data_segment) {
 396     XBT_DEBUG("Running without smpi_main(); disable smpi/privatization.");
 397     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::NONE;
 398   }
 399   if (not HAVE_WORKING_MMAP && smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 400     XBT_INFO("mmap privatization is broken on this platform, switching to dlopen privatization instead.");
 401     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DLOPEN;
 402   }
 403
 404   if (smpi_cpu_threshold < 0)
 405     smpi_cpu_threshold = DBL_MAX;
 406
 407   std::string val = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/shared-malloc");
 408   if ((val == "yes") || (val == "1") || (val == "on") || (val == "global")) {
 409     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::GLOBAL;
 410   } else if (val == "local") {
 411     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::LOCAL;
 412   } else if ((val == "no") || (val == "0") || (val == "off")) {
 413     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::NONE;
 414   } else {
 415     xbt_die("Invalid value '%s' for option smpi/shared-malloc. Possible values: 'on' or 'global', 'local', 'off'",
 416             val.c_str());
 417   }
 418 }
 419
 420 typedef std::function<int(int argc, char *argv[])> smpi_entry_point_type;
 421 typedef int (* smpi_c_entry_point_type)(int argc, char **argv);
 422 typedef void (*smpi_fortran_entry_point_type)();
 423
 424 template <typename F>
 425 static int smpi_run_entry_point(const F& entry_point, const std::string& executable_path, std::vector<std::string> args)
 426 {
 427   // copy C strings, we need them writable
 428   std::vector<char*>* args4argv = new std::vector<char*>(args.size());
 429   std::transform(begin(args), end(args), begin(*args4argv), [](const std::string& s) { return xbt_strdup(s.c_str()); });
 430
 431   // set argv[0] to executable_path
 432   xbt_free((*args4argv)[0]);
 433   (*args4argv)[0] = xbt_strdup(executable_path.c_str());
 434
 435 #if !SMPI_IFORT
 436   // take a copy of args4argv to keep reference of the allocated strings
 437   const std::vector<char*> args2str(*args4argv);
 438 #endif
 439   int argc = args4argv->size();
 440   args4argv->push_back(nullptr);
 441   char** argv = args4argv->data();
 442
 443   simgrid::smpi::ActorExt::init();
 444 #if SMPI_IFORT
 445   for_rtl_init_ (&argc, argv);
 446 #elif SMPI_FLANG
 447   __io_set_argc(argc);
 448   __io_set_argv(argv);
 449 #elif SMPI_GFORTRAN
 450   _gfortran_set_args(argc, argv);
 451 #endif
 452   int res = entry_point(argc, argv);
 453
 454 #if SMPI_IFORT
 455   for_rtl_finish_ ();
 456 #else
 457   for (char* s : args2str)
 458     xbt_free(s);
 459   delete args4argv;
 460 #endif
 461
 462   if (res != 0){
 463     XBT_WARN("SMPI process did not return 0. Return value : %d", res);
 464     if (smpi_exit_status == 0)
 465       smpi_exit_status = res;
 466   }
 467   return 0;
 468 }
 469
 470
 471 // TODO, remove the number of functions involved here
 472 static smpi_entry_point_type smpi_resolve_function(void* handle)
 473 {
 474   smpi_fortran_entry_point_type entry_point_fortran = (smpi_fortran_entry_point_type)dlsym(handle, "user_main_");
 475   if (entry_point_fortran != nullptr) {
 476     return [entry_point_fortran](int, char**) {
 477       entry_point_fortran();
 478       return 0;
 479     };
 480   }
 481
 482   smpi_c_entry_point_type entry_point = (smpi_c_entry_point_type)dlsym(handle, "main");
 483   if (entry_point != nullptr) {
 484     return entry_point;
 485   }
 486
 487   return smpi_entry_point_type();
 488 }
 489
 490 static void smpi_copy_file(const std::string& src, const std::string& target, off_t fdin_size)
 491 {
 492   int fdin = open(src.c_str(), O_RDONLY);
 493   xbt_assert(fdin >= 0, "Cannot read from %s. Please make sure that the file exists and is executable.", src.c_str());
 494   int fdout = open(target.c_str(), O_CREAT | O_RDWR, S_IRWXU);
 495   xbt_assert(fdout >= 0, "Cannot write into %s", target.c_str());
 496
 497   XBT_DEBUG("Copy %" PRIdMAX " bytes into %s", static_cast<intmax_t>(fdin_size), target.c_str());
 498 #if SG_HAVE_SENDFILE
 499   ssize_t sent_size = sendfile(fdout, fdin, NULL, fdin_size);
 500   if (sent_size == fdin_size) {
 501     close(fdin);
 502     close(fdout);
 503     return;
 504   } else if (sent_size != -1 || errno != ENOSYS) {
 505     xbt_die("Error while copying %s: only %zd bytes copied instead of %" PRIdMAX " (errno: %d -- %s)", target.c_str(),
 506             sent_size, static_cast<intmax_t>(fdin_size), errno, strerror(errno));
 507   }
 508 #endif
 509   // If this point is reached, sendfile() actually is not available.  Copy file by hand.
 510   const int bufsize = 1024 * 1024 * 4;
 511   char* buf         = new char[bufsize];
 512   while (int got = read(fdin, buf, bufsize)) {
 513     if (got == -1) {
 514       xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot read from %s", src.c_str());
 515     } else {
 516       char* p  = buf;
 517       int todo = got;
 518       while (int done = write(fdout, p, todo)) {
 519         if (done == -1) {
 520           xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot write into %s", target.c_str());
 521         } else {
 522           p += done;
 523           todo -= done;
 524         }
 525       }
 526     }
 527   }
 528   delete[] buf;
 529   close(fdin);
 530   close(fdout);
 531 }
 532
 533 #if not defined(__APPLE__) && not defined(__HAIKU__)
 534 static int visit_libs(struct dl_phdr_info* info, size_t, void* data)
 535 {
 536   char* libname = (char*)(data);
 537   const char *path = info->dlpi_name;
 538   if(strstr(path, libname)){
 539     strncpy(libname, path, 512);
 540     return 1;
 541   }
 542
 543   return 0;
 544 }
 545 #endif
 546
 547 static void smpi_init_privatization_dlopen(const std::string& executable)
 548 {
 549   // Prepare the copy of the binary (get its size)
 550   struct stat fdin_stat;
 551   stat(executable.c_str(), &fdin_stat);
 552   off_t fdin_size         = fdin_stat.st_size;
 553
 554   std::string libnames = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatize-libs");
 555   if (not libnames.empty()) {
 556     // split option
 557     std::vector<std::string> privatize_libs;
 558     boost::split(privatize_libs, libnames, boost::is_any_of(";"));
 559
 560     for (auto const& libname : privatize_libs) {
 561       // load the library once to add it to the local libs, to get the absolute path
 562       void* libhandle = dlopen(libname.c_str(), RTLD_LAZY);
 563       // get library name from path
 564       char fullpath[512] = {'\0'};
 565       strncpy(fullpath, libname.c_str(), 511);
 566 #if not defined(__APPLE__) && not defined(__HAIKU__)
 567       int ret = dl_iterate_phdr(visit_libs, fullpath);
 568       if (ret == 0)
 569         xbt_die("Can't find a linked %s - check the setting you gave to smpi/privatize-libs", fullpath);
 570       else
 571         XBT_DEBUG("Extra lib to privatize found : %s", fullpath);
 572 #else
 573       xbt_die("smpi/privatize-libs is not (yet) compatible with OSX");
 574 #endif
 575       privatize_libs_paths.push_back(fullpath);
 576       dlclose(libhandle);
 577     }
 578   }
 579
 580   simix_global->default_function = [executable, fdin_size](std::vector<std::string> args) {
 581     return std::function<void()>([executable, fdin_size, args] {
 582       static std::size_t rank = 0;
 583       // Copy the dynamic library:
 584       std::string target_executable =
 585           executable + "_" + std::to_string(getpid()) + "_" + std::to_string(rank) + ".so";
 586
 587       smpi_copy_file(executable, target_executable, fdin_size);
 588       // if smpi/privatize-libs is set, duplicate pointed lib and link each executable copy to a different one.
 589       std::vector<std::string> target_libs;
 590       for (auto const& libpath : privatize_libs_paths) {
 591         // if we were given a full path, strip it
 592         size_t index = libpath.find_last_of("/\\");
 593         std::string libname;
 594         if (index != std::string::npos)
 595           libname = libpath.substr(index + 1);
 596
 597         if (not libname.empty()) {
 598           // load the library to add it to the local libs, to get the absolute path
 599           struct stat fdin_stat2;
 600           stat(libpath.c_str(), &fdin_stat2);
 601           off_t fdin_size2 = fdin_stat2.st_size;
 602
 603           // Copy the dynamic library, the new name must be the same length as the old one
 604           // just replace the name with 7 digits for the rank and the rest of the name.
 605           unsigned int pad = 7;
 606           if (libname.length() < pad)
 607             pad = libname.length();
 608           std::string target_lib =
 609               std::string(pad - std::to_string(rank).length(), '0') + std::to_string(rank) + libname.substr(pad);
 610           target_libs.push_back(target_lib);
 611           XBT_DEBUG("copy lib %s to %s, with size %lld", libpath.c_str(), target_lib.c_str(), (long long)fdin_size2);
 612           smpi_copy_file(libpath, target_lib, fdin_size2);
 613
 614           std::string sedcommand = "sed -i -e 's/" + libname + "/" + target_lib + "/g' " + target_executable;
 615           int ret                = system(sedcommand.c_str());
 616           if (ret != 0)
 617             xbt_die("error while applying sed command %s \n", sedcommand.c_str());
 618         }
 619       }
 620
 621       rank++;
 622       // Load the copy and resolve the entry point:
 623       void* handle    = dlopen(target_executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL | WANT_RTLD_DEEPBIND);
 624       int saved_errno = errno;
 625       if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/keep-temps") == false) {
 626         unlink(target_executable.c_str());
 627         for (const std::string& target_lib : target_libs)
 628           unlink(target_lib.c_str());
 629       }
 630       if (handle == nullptr)
 631         xbt_die("dlopen failed: %s (errno: %d -- %s)", dlerror(), saved_errno, strerror(saved_errno));
 632       smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
 633       if (not entry_point)
 634         xbt_die("Could not resolve entry point");
 635       smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args);
 636     });
 637   };
 638 }
 639
 640 static void smpi_init_privatization_no_dlopen(const std::string& executable)
 641 {
 642   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 643     smpi_prepare_global_memory_segment();
 644   // Load the dynamic library and resolve the entry point:
 645   void* handle = dlopen(executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL);
 646   if (handle == nullptr)
 647     xbt_die("dlopen failed for %s: %s (errno: %d -- %s)", executable.c_str(), dlerror(), errno, strerror(errno));
 648   smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
 649   if (not entry_point)
 650     xbt_die("main not found in %s", executable.c_str());
 651   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 652     smpi_backup_global_memory_segment();
 653
 654   // Execute the same entry point for each simulated process:
 655   simix_global->default_function = [entry_point, executable](std::vector<std::string> args) {
 656     return std::function<void()>(
 657         [entry_point, executable, args] { smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args); });
 658   };
 659 }
 660
 661 int smpi_main(const char* executable, int argc, char* argv[])
 662 {
 663   if (getenv("SMPI_PRETEND_CC") != nullptr) {
 664     /* Hack to ensure that smpicc can pretend to be a simple compiler. Particularly handy to pass it to the
 665      * configuration tools */
 666     return 0;
 667   }
 668
 669   TRACE_global_init();
 670   SIMIX_global_init(&argc, argv);
 671
 672   SMPI_switch_data_segment = &smpi_switch_data_segment;
 673   sg_storage_file_system_init();
 674   // parse the platform file: get the host list
 675   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->load_platform(argv[1]);
 676   SIMIX_comm_set_copy_data_callback(smpi_comm_copy_buffer_callback);
 677
 678   smpi_init_options();
 679   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::DLOPEN)
 680     smpi_init_privatization_dlopen(executable);
 681   else
 682     smpi_init_privatization_no_dlopen(executable);
 683
 684   SMPI_init();
 685   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->load_deployment(argv[2]);
 686   SMPI_app_instance_register(smpi_default_instance_name.c_str(), nullptr,
 687                              process_data.size()); // This call has a side effect on process_count...
 688   MPI_COMM_WORLD = *smpi_deployment_comm_world(smpi_default_instance_name);
 689   smpi_universe_size = process_count;
 690
 691
 692   /* Clean IO before the run */
 693   fflush(stdout);
 694   fflush(stderr);
 695
 696   if (MC_is_active()) {
 697     MC_run();
 698   } else {
 699
 700     SIMIX_run();
 701
 702     xbt_os_walltimer_stop(global_timer);
 703     if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/display-timing")) {
 704       double global_time = xbt_os_timer_elapsed(global_timer);
 705       XBT_INFO("Simulated time: %g seconds. \n\n"
 706           "The simulation took %g seconds (after parsing and platform setup)\n"
 707           "%g seconds were actual computation of the application",
 708           SIMIX_get_clock(), global_time , smpi_total_benched_time);
 709
 710       if (smpi_total_benched_time/global_time>=0.75)
 711       XBT_INFO("More than 75%% of the time was spent inside the application code.\n"
 712       "You may want to use sampling functions or trace replay to reduce this.");
 713     }
 714   }
 715   smpi_global_destroy();
 716
 717   return smpi_exit_status;
 718 }
 719
 720 // Called either directly from the user code, or from the code called by smpirun
 721 void SMPI_init(){
 722   simgrid::s4u::Actor::on_creation.connect([](simgrid::s4u::Actor& actor) {
 723     if (not actor.is_daemon()) {
 724       process_data.insert({&actor, new simgrid::smpi::ActorExt(&actor, nullptr)});
 725     }
 726   });
 727   simgrid::s4u::Actor::on_destruction.connect([](simgrid::s4u::Actor const& actor) {
 728     auto it = process_data.find(&actor);
 729     if (it != process_data.end()) {
 730       delete it->second;
 731       process_data.erase(it);
 732     }
 733   });
 734   simgrid::s4u::Host::on_creation.connect(
 735       [](simgrid::s4u::Host& host) { host.extension_set(new simgrid::smpi::Host(&host)); });
 736
 737   smpi_init_options();
 738   smpi_global_init();
 739   smpi_check_options();
 740 }
 741
 742 void SMPI_finalize(){
 743   smpi_global_destroy();
 744 }
 745
 746 void smpi_mpi_init() {
 747   smpi_init_fortran_types();
 748   if(smpi_init_sleep > 0)
 749     simcall_process_sleep(smpi_init_sleep);
 750 }