src/smpi/internals/smpi_global.cpp

   1 /* Copyright (c) 2007-2019. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
   2
   3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   5
   6 #include "mc/mc.h"
   7 #include "simgrid/s4u/Engine.hpp"
   8 #include "smpi_coll.hpp"
   9 #include "smpi_f2c.hpp"
  10 #include "smpi_host.hpp"
  11 #include "src/kernel/activity/CommImpl.hpp"
  12 #include "src/simix/smx_private.hpp"
  13 #include "src/smpi/include/smpi_actor.hpp"
  14 #include "xbt/config.hpp"
  15
  16 #include <algorithm>
  17 #include <cfloat> /* DBL_MAX */
  18 #include <cinttypes>
  19 #include <cstdint> /* intmax_t */
  20 #include <dlfcn.h>
  21 #include <fcntl.h>
  22 #include <fstream>
  23
  24 #if not defined(__APPLE__)
  25 #include <link.h>
  26 #endif
  27
  28 #if defined(__APPLE__)
  29 # include <AvailabilityMacros.h>
  30 # ifndef MAC_OS_X_VERSION_10_12
  31 #   define MAC_OS_X_VERSION_10_12 101200
  32 # endif
  33 # define HAVE_WORKING_MMAP (MAC_OS_X_VERSION_MIN_REQUIRED >= MAC_OS_X_VERSION_10_12)
  34 #elif defined(__FreeBSD__) || defined(__FreeBSD_kernel__)
  35 # define HAVE_WORKING_MMAP 0
  36 #else
  37 # define HAVE_WORKING_MMAP 1
  38 #endif
  39
  40 #if SG_HAVE_SENDFILE
  41 #include <sys/sendfile.h>
  42 #endif
  43
  44 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_kernel, smpi, "Logging specific to SMPI (kernel)");
  45 #include <boost/tokenizer.hpp>
  46 #include <boost/algorithm/string.hpp> /* trim_right / trim_left */
  47
  48 #if SMPI_IFORT
  49   extern "C" void for_rtl_init_ (int *, char **);
  50   extern "C" void for_rtl_finish_ ();
  51 #elif SMPI_FLANG
  52   extern "C" void __io_set_argc(int);
  53   extern "C" void __io_set_argv(char **);
  54 #elif SMPI_GFORTRAN
  55   extern "C" void _gfortran_set_args(int, char **);
  56 #endif
  57
  58 /* RTLD_DEEPBIND is a bad idea of GNU ld that obviously does not exist on other platforms
  59  * See https://www.akkadia.org/drepper/dsohowto.pdf
  60  * and https://lists.freebsd.org/pipermail/freebsd-current/2016-March/060284.html
  61 */
  62 #if !RTLD_DEEPBIND || HAVE_SANITIZER_ADDRESS || HAVE_SANITIZER_THREAD
  63 #define WANT_RTLD_DEEPBIND 0
  64 #else
  65 #define WANT_RTLD_DEEPBIND RTLD_DEEPBIND
  66 #endif
  67
  68 #if HAVE_PAPI
  69 #include "papi.h"
  70 std::string papi_default_config_name = "default";
  71 std::map</* computation unit name */ std::string, papi_process_data> units2papi_setup;
  72 #endif
  73
  74 using simgrid::s4u::Actor;
  75 using simgrid::s4u::ActorPtr;
  76 std::unordered_map<std::string, double> location2speedup;
  77
  78 static std::map</*process_id*/ ActorPtr, simgrid::smpi::ActorExt*> process_data;
  79 int process_count = 0;
  80 static int smpi_exit_status = 0;
  81 int smpi_universe_size = 0;
  82 extern double smpi_total_benched_time;
  83 xbt_os_timer_t global_timer;
  84 static std::vector<std::string> privatize_libs_paths;
  85 /**
  86  * Setting MPI_COMM_WORLD to MPI_COMM_UNINITIALIZED (it's a variable)
  87  * is important because the implementation of MPI_Comm checks
  88  * "this == MPI_COMM_UNINITIALIZED"? If yes, it uses smpi_process()->comm_world()
  89  * instead of "this".
  90  * This is basically how we only have one global variable but all processes have
  91  * different communicators (the one their SMPI instance uses).
  92  *
  93  * See smpi_comm.cpp and the functions therein for details.
  94  */
  95 MPI_Comm MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  96 MPI_Errhandler *MPI_ERRORS_RETURN = nullptr;
  97 MPI_Errhandler *MPI_ERRORS_ARE_FATAL = nullptr;
  98 MPI_Errhandler *MPI_ERRHANDLER_NULL = nullptr;
  99 // No instance gets manually created; check also the smpirun.in script as
 100 // this default name is used there as well (when the <actor> tag is generated).
 101 static const std::string smpi_default_instance_name("smpirun");
 102 static simgrid::config::Flag<double> smpi_init_sleep(
 103   "smpi/init", "Time to inject inside a call to MPI_Init", 0.0);
 104
 105 void (*smpi_comm_copy_data_callback)(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*,
 106                                      size_t) = &smpi_comm_copy_buffer_callback;
 107
 108 int smpi_process_count()
 109 {
 110   return process_count;
 111 }
 112
 113 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process()
 114 {
 115   ActorPtr me = Actor::self();
 116
 117   if (me == nullptr) // This happens sometimes (eg, when linking against NS3 because it pulls openMPI...)
 118     return nullptr;
 119
 120   return process_data.at(me);
 121 }
 122
 123 simgrid::smpi::ActorExt* smpi_process_remote(ActorPtr actor)
 124 {
 125   return process_data.at(actor);
 126 }
 127
 128 MPI_Comm smpi_process_comm_self(){
 129   return smpi_process()->comm_self();
 130 }
 131
 132 void smpi_process_init(int *argc, char ***argv){
 133   simgrid::smpi::ActorExt::init();
 134 }
 135
 136 void * smpi_process_get_user_data(){
 137   return Actor::self()->get_impl()->get_user_data();
 138 }
 139
 140 void smpi_process_set_user_data(void *data){
 141   Actor::self()->get_impl()->set_user_data(data);
 142 }
 143
 144
 145 int smpi_global_size()
 146 {
 147   char *value = getenv("SMPI_GLOBAL_SIZE");
 148   xbt_assert(value,"Please set env var SMPI_GLOBAL_SIZE to the expected number of processes.");
 149
 150   return xbt_str_parse_int(value, "SMPI_GLOBAL_SIZE contains a non-numerical value: %s");
 151 }
 152
 153 void smpi_comm_set_copy_data_callback(void (*callback) (smx_activity_t, void*, size_t))
 154 {
 155   static void (*saved_callback)(smx_activity_t, void*, size_t);
 156   saved_callback               = callback;
 157   smpi_comm_copy_data_callback = [](simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t size) {
 158     saved_callback(smx_activity_t(comm), buff, size);
 159   };
 160 }
 161
 162 static void memcpy_private(void* dest, const void* src, std::vector<std::pair<size_t, size_t>>& private_blocks)
 163 {
 164   for (auto const& block : private_blocks)
 165     memcpy((uint8_t*)dest+block.first, (uint8_t*)src+block.first, block.second-block.first);
 166 }
 167
 168 static void check_blocks(std::vector<std::pair<size_t, size_t>> &private_blocks, size_t buff_size) {
 169   for (auto const& block : private_blocks)
 170     xbt_assert(block.first <= block.second && block.second <= buff_size, "Oops, bug in shared malloc.");
 171 }
 172
 173 void smpi_comm_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl* comm, void* buff, size_t buff_size)
 174 {
 175   int src_shared                        = 0;
 176   int dst_shared                        = 0;
 177   size_t src_offset                     = 0;
 178   size_t dst_offset                     = 0;
 179   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> src_private_blocks;
 180   std::vector<std::pair<size_t, size_t>> dst_private_blocks;
 181   XBT_DEBUG("Copy the data over");
 182   if((src_shared=smpi_is_shared(buff, src_private_blocks, &src_offset))) {
 183     XBT_DEBUG("Sender %p is shared. Let's ignore it.", buff);
 184     src_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(src_private_blocks, src_offset, buff_size);
 185   }
 186   else {
 187     src_private_blocks.clear();
 188     src_private_blocks.push_back(std::make_pair(0, buff_size));
 189   }
 190   if ((dst_shared = smpi_is_shared((char*)comm->dst_buff_, dst_private_blocks, &dst_offset))) {
 191     XBT_DEBUG("Receiver %p is shared. Let's ignore it.", (char*)comm->dst_buff_);
 192     dst_private_blocks = shift_and_frame_private_blocks(dst_private_blocks, dst_offset, buff_size);
 193   }
 194   else {
 195     dst_private_blocks.clear();
 196     dst_private_blocks.push_back(std::make_pair(0, buff_size));
 197   }
 198   check_blocks(src_private_blocks, buff_size);
 199   check_blocks(dst_private_blocks, buff_size);
 200   auto private_blocks = merge_private_blocks(src_private_blocks, dst_private_blocks);
 201   check_blocks(private_blocks, buff_size);
 202   void* tmpbuff=buff;
 203   if ((smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) &&
 204       (static_cast<char*>(buff) >= smpi_data_exe_start) &&
 205       (static_cast<char*>(buff) < smpi_data_exe_start + smpi_data_exe_size)) {
 206     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying from a zone inside global memory... Saving data to temp buffer !");
 207     smpi_switch_data_segment(comm->src_actor_->iface());
 208     tmpbuff = static_cast<void*>(xbt_malloc(buff_size));
 209     memcpy_private(tmpbuff, buff, private_blocks);
 210   }
 211
 212   if ((smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) &&
 213       ((char*)comm->dst_buff_ >= smpi_data_exe_start) &&
 214       ((char*)comm->dst_buff_ < smpi_data_exe_start + smpi_data_exe_size)) {
 215     XBT_DEBUG("Privatization : We are copying to a zone inside global memory - Switch data segment");
 216     smpi_switch_data_segment(comm->dst_actor_->iface());
 217   }
 218   XBT_DEBUG("Copying %zu bytes from %p to %p", buff_size, tmpbuff, comm->dst_buff_);
 219   memcpy_private(comm->dst_buff_, tmpbuff, private_blocks);
 220
 221   if (comm->detached) {
 222     // if this is a detached send, the source buffer was duplicated by SMPI
 223     // sender to make the original buffer available to the application ASAP
 224     xbt_free(buff);
 225     //It seems that the request is used after the call there this should be free somewhere else but where???
 226     //xbt_free(comm->comm.src_data);// inside SMPI the request is kept inside the user data and should be free
 227     comm->src_buff_ = nullptr;
 228   }
 229   if (tmpbuff != buff)
 230     xbt_free(tmpbuff);
 231 }
 232
 233 void smpi_comm_null_copy_buffer_callback(simgrid::kernel::activity::CommImpl*, void*, size_t)
 234 {
 235   /* nothing done in this version */
 236 }
 237
 238 static void smpi_check_options()
 239 {
 240   //check correctness of MPI parameters
 241
 242   xbt_assert(simgrid::config::get_value<int>("smpi/async-small-thresh") <=
 243              simgrid::config::get_value<int>("smpi/send-is-detached-thresh"));
 244
 245   if (simgrid::config::is_default("smpi/host-speed")) {
 246     XBT_INFO("You did not set the power of the host running the simulation.  "
 247              "The timings will certainly not be accurate.  "
 248              "Use the option \"--cfg=smpi/host-speed:<flops>\" to set its value."
 249              "Check http://simgrid.org/simgrid/latest/doc/options.html#options_smpi_bench for more information.");
 250   }
 251
 252   xbt_assert(simgrid::config::get_value<double>("smpi/cpu-threshold") >= 0,
 253              "The 'smpi/cpu-threshold' option cannot have negative values [anymore]. If you want to discard "
 254              "the simulation of any computation, please use 'smpi/simulate-computation:no' instead.");
 255 }
 256
 257 int smpi_enabled() {
 258   return not process_data.empty();
 259 }
 260
 261 void smpi_global_init()
 262 {
 263   if (not MC_is_active()) {
 264     global_timer = xbt_os_timer_new();
 265     xbt_os_walltimer_start(global_timer);
 266   }
 267
 268   std::string filename = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/comp-adjustment-file");
 269   if (not filename.empty()) {
 270     std::ifstream fstream(filename);
 271     if (not fstream.is_open()) {
 272       xbt_die("Could not open file %s. Does it exist?", filename.c_str());
 273     }
 274
 275     std::string line;
 276     typedef boost::tokenizer< boost::escaped_list_separator<char>> Tokenizer;
 277     std::getline(fstream, line); // Skip the header line
 278     while (std::getline(fstream, line)) {
 279       Tokenizer tok(line);
 280       Tokenizer::iterator it  = tok.begin();
 281       Tokenizer::iterator end = std::next(tok.begin());
 282
 283       std::string location = *it;
 284       boost::trim(location);
 285       location2speedup.insert(std::pair<std::string, double>(location, std::stod(*end)));
 286     }
 287   }
 288
 289 #if HAVE_PAPI
 290   // This map holds for each computation unit (such as "default" or "process1" etc.)
 291   // the configuration as given by the user (counter data as a pair of (counter_name, counter_counter))
 292   // and the (computed) event_set.
 293
 294   if (not simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/papi-events").empty()) {
 295     if (PAPI_library_init(PAPI_VER_CURRENT) != PAPI_VER_CURRENT)
 296       XBT_ERROR("Could not initialize PAPI library; is it correctly installed and linked?"
 297                 " Expected version is %u", PAPI_VER_CURRENT);
 298
 299     typedef boost::tokenizer<boost::char_separator<char>> Tokenizer;
 300     boost::char_separator<char> separator_units(";");
 301     std::string str = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/papi-events");
 302     Tokenizer tokens(str, separator_units);
 303
 304     // Iterate over all the computational units. This could be processes, hosts, threads, ranks... You name it.
 305     // I'm not exactly sure what we will support eventually, so I'll leave it at the general term "units".
 306     for (auto const& unit_it : tokens) {
 307       boost::char_separator<char> separator_events(":");
 308       Tokenizer event_tokens(unit_it, separator_events);
 309
 310       int event_set = PAPI_NULL;
 311       if (PAPI_create_eventset(&event_set) != PAPI_OK) {
 312         // TODO: Should this let the whole simulation die?
 313         XBT_CRITICAL("Could not create PAPI event set during init.");
 314       }
 315
 316       // NOTE: We cannot use a map here, as we must obey the order of the counters
 317       // This is important for PAPI: We need to map the values of counters back
 318       // to the event_names (so, when PAPI_read() has finished)!
 319       papi_counter_t counters2values;
 320
 321       // Iterate over all counters that were specified for this specific
 322       // unit.
 323       // Note that we need to remove the name of the unit
 324       // (that could also be the "default" value), which always comes first.
 325       // Hence, we start at ++(events.begin())!
 326       for (Tokenizer::iterator events_it = ++(event_tokens.begin()); events_it != event_tokens.end(); ++events_it) {
 327
 328         int event_code   = PAPI_NULL;
 329         char* event_name = const_cast<char*>((*events_it).c_str());
 330         if (PAPI_event_name_to_code(event_name, &event_code) != PAPI_OK) {
 331           XBT_CRITICAL("Could not find PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
 332           continue;
 333         }
 334         if (PAPI_add_event(event_set, event_code) != PAPI_OK) {
 335           XBT_ERROR("Could not add PAPI event '%s'. Skipping.", event_name);
 336           continue;
 337         }
 338         XBT_DEBUG("Successfully added PAPI event '%s' to the event set.", event_name);
 339
 340         counters2values.push_back(
 341             // We cannot just pass *events_it, as this is of type const basic_string
 342             std::make_pair<std::string, long long>(std::string(*events_it), 0));
 343       }
 344
 345       std::string unit_name    = *(event_tokens.begin());
 346       papi_process_data config = {.counter_data = std::move(counters2values), .event_set = event_set};
 347
 348       units2papi_setup.insert(std::make_pair(unit_name, std::move(config)));
 349     }
 350   }
 351 #endif
 352 }
 353
 354 void smpi_global_destroy()
 355 {
 356   smpi_bench_destroy();
 357   smpi_shared_destroy();
 358   smpi_deployment_cleanup_instances();
 359
 360   if (simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback != nullptr)
 361     simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback();
 362
 363   MPI_COMM_WORLD = MPI_COMM_NULL;
 364
 365   if (not MC_is_active()) {
 366     xbt_os_timer_free(global_timer);
 367   }
 368
 369   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 370     smpi_destroy_global_memory_segments();
 371   smpi_free_static();
 372   if(simgrid::smpi::F2C::lookup() != nullptr)
 373     simgrid::smpi::F2C::delete_lookup();
 374 }
 375
 376 static void smpi_init_options(){
 377   // return if already called
 378   if (smpi_cpu_threshold > -1)
 379     return;
 380   simgrid::smpi::Colls::set_collectives();
 381   simgrid::smpi::Colls::smpi_coll_cleanup_callback = nullptr;
 382   smpi_cpu_threshold                               = simgrid::config::get_value<double>("smpi/cpu-threshold");
 383   smpi_host_speed                                  = simgrid::config::get_value<double>("smpi/host-speed");
 384   xbt_assert(smpi_host_speed > 0.0, "You're trying to set the host_speed to a non-positive value (given: %f)", smpi_host_speed);
 385   std::string smpi_privatize_option = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatization");
 386   if (smpi_privatize_option == "no" || smpi_privatize_option == "0")
 387     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::NONE;
 388   else if (smpi_privatize_option == "yes" || smpi_privatize_option == "1")
 389     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DEFAULT;
 390   else if (smpi_privatize_option == "mmap")
 391     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::MMAP;
 392   else if (smpi_privatize_option == "dlopen")
 393     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DLOPEN;
 394   else
 395     xbt_die("Invalid value for smpi/privatization: '%s'", smpi_privatize_option.c_str());
 396
 397   if (not SMPI_switch_data_segment) {
 398     XBT_DEBUG("Running without smpi_main(); disable smpi/privatization.");
 399     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::NONE;
 400   }
 401 #if !HAVE_WORKING_MMAP
 402   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 403     XBT_INFO("mmap privatization is broken on this platform, switching to dlopen privatization instead.");
 404     smpi_privatize_global_variables = SmpiPrivStrategies::DLOPEN;
 405   }
 406 #endif
 407
 408   if (smpi_cpu_threshold < 0)
 409     smpi_cpu_threshold = DBL_MAX;
 410
 411   std::string val = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/shared-malloc");
 412   if ((val == "yes") || (val == "1") || (val == "on") || (val == "global")) {
 413     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::GLOBAL;
 414   } else if (val == "local") {
 415     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::LOCAL;
 416   } else if ((val == "no") || (val == "0") || (val == "off")) {
 417     smpi_cfg_shared_malloc = SharedMallocType::NONE;
 418   } else {
 419     xbt_die("Invalid value '%s' for option smpi/shared-malloc. Possible values: 'on' or 'global', 'local', 'off'",
 420             val.c_str());
 421   }
 422 }
 423
 424 typedef std::function<int(int argc, char *argv[])> smpi_entry_point_type;
 425 typedef int (* smpi_c_entry_point_type)(int argc, char **argv);
 426 typedef void (*smpi_fortran_entry_point_type)();
 427
 428 static int smpi_run_entry_point(smpi_entry_point_type entry_point, const std::string& executable_path,
 429                                 std::vector<std::string> args)
 430 {
 431   // copy C strings, we need them writable
 432   std::vector<char*>* args4argv = new std::vector<char*>(args.size());
 433   std::transform(begin(args), end(args), begin(*args4argv), [](const std::string& s) { return xbt_strdup(s.c_str()); });
 434
 435   // set argv[0] to executable_path
 436   xbt_free((*args4argv)[0]);
 437   (*args4argv)[0] = xbt_strdup(executable_path.c_str());
 438
 439 #if !SMPI_IFORT
 440   // take a copy of args4argv to keep reference of the allocated strings
 441   const std::vector<char*> args2str(*args4argv);
 442 #endif
 443   int argc = args4argv->size();
 444   args4argv->push_back(nullptr);
 445   char** argv = args4argv->data();
 446
 447   simgrid::smpi::ActorExt::init();
 448 #if SMPI_IFORT
 449   for_rtl_init_ (&argc, argv);
 450 #elif SMPI_FLANG
 451   __io_set_argc(argc);
 452   __io_set_argv(argv);
 453 #elif SMPI_GFORTRAN
 454   _gfortran_set_args(argc, argv);
 455 #endif
 456   int res = entry_point(argc, argv);
 457
 458 #if SMPI_IFORT
 459   for_rtl_finish_ ();
 460 #else
 461   for (char* s : args2str)
 462     xbt_free(s);
 463   delete args4argv;
 464 #endif
 465
 466   if (res != 0){
 467     XBT_WARN("SMPI process did not return 0. Return value : %d", res);
 468     if (smpi_exit_status == 0)
 469       smpi_exit_status = res;
 470   }
 471   return 0;
 472 }
 473
 474
 475 // TODO, remove the number of functions involved here
 476 static smpi_entry_point_type smpi_resolve_function(void* handle)
 477 {
 478   smpi_fortran_entry_point_type entry_point_fortran = (smpi_fortran_entry_point_type)dlsym(handle, "user_main_");
 479   if (entry_point_fortran != nullptr) {
 480     return [entry_point_fortran](int argc, char** argv) {
 481       entry_point_fortran();
 482       return 0;
 483     };
 484   }
 485
 486   smpi_c_entry_point_type entry_point = (smpi_c_entry_point_type)dlsym(handle, "main");
 487   if (entry_point != nullptr) {
 488     return entry_point;
 489   }
 490
 491   return smpi_entry_point_type();
 492 }
 493
 494 static void smpi_copy_file(const std::string& src, const std::string& target, off_t fdin_size)
 495 {
 496   int fdin = open(src.c_str(), O_RDONLY);
 497   xbt_assert(fdin >= 0, "Cannot read from %s. Please make sure that the file exists and is executable.", src.c_str());
 498   int fdout = open(target.c_str(), O_CREAT | O_RDWR, S_IRWXU);
 499   xbt_assert(fdout >= 0, "Cannot write into %s", target.c_str());
 500
 501   XBT_DEBUG("Copy %" PRIdMAX " bytes into %s", static_cast<intmax_t>(fdin_size), target.c_str());
 502 #if SG_HAVE_SENDFILE
 503   ssize_t sent_size = sendfile(fdout, fdin, NULL, fdin_size);
 504   if (sent_size == fdin_size) {
 505     close(fdin);
 506     close(fdout);
 507     return;
 508   } else if (sent_size != -1 || errno != ENOSYS) {
 509     xbt_die("Error while copying %s: only %zd bytes copied instead of %" PRIdMAX " (errno: %d -- %s)", target.c_str(),
 510             sent_size, static_cast<intmax_t>(fdin_size), errno, strerror(errno));
 511   }
 512 #endif
 513   // If this point is reached, sendfile() actually is not available.  Copy file by hand.
 514   const int bufsize = 1024 * 1024 * 4;
 515   char buf[bufsize];
 516   while (int got = read(fdin, buf, bufsize)) {
 517     if (got == -1) {
 518       xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot read from %s", src.c_str());
 519     } else {
 520       char* p  = buf;
 521       int todo = got;
 522       while (int done = write(fdout, p, todo)) {
 523         if (done == -1) {
 524           xbt_assert(errno == EINTR, "Cannot write into %s", target.c_str());
 525         } else {
 526           p += done;
 527           todo -= done;
 528         }
 529       }
 530     }
 531   }
 532   close(fdin);
 533   close(fdout);
 534 }
 535
 536 #if not defined(__APPLE__)
 537 static int visit_libs(struct dl_phdr_info* info, size_t, void* data)
 538 {
 539   char* libname = (char*)(data);
 540   const char *path = info->dlpi_name;
 541   if(strstr(path, libname)){
 542     strncpy(libname, path, 512);
 543     return 1;
 544   }
 545
 546   return 0;
 547 }
 548 #endif
 549
 550 static void smpi_init_privatization_dlopen(const std::string& executable)
 551 {
 552   // Prepare the copy of the binary (get its size)
 553   struct stat fdin_stat;
 554   stat(executable.c_str(), &fdin_stat);
 555   off_t fdin_size         = fdin_stat.st_size;
 556
 557   std::string libnames = simgrid::config::get_value<std::string>("smpi/privatize-libs");
 558   if (not libnames.empty()) {
 559     // split option
 560     std::vector<std::string> privatize_libs;
 561     boost::split(privatize_libs, libnames, boost::is_any_of(";"));
 562
 563     for (auto const& libname : privatize_libs) {
 564       // load the library once to add it to the local libs, to get the absolute path
 565       void* libhandle = dlopen(libname.c_str(), RTLD_LAZY);
 566       // get library name from path
 567       char fullpath[512] = {'\0'};
 568       strncpy(fullpath, libname.c_str(), 511);
 569 #if not defined(__APPLE__)
 570       int ret = dl_iterate_phdr(visit_libs, fullpath);
 571       if (ret == 0)
 572         xbt_die("Can't find a linked %s - check the setting you gave to smpi/privatize-libs", fullpath);
 573       else
 574         XBT_DEBUG("Extra lib to privatize found : %s", fullpath);
 575 #else
 576       xbt_die("smpi/privatize-libs is not (yet) compatible with OSX");
 577 #endif
 578       privatize_libs_paths.push_back(fullpath);
 579       dlclose(libhandle);
 580     }
 581   }
 582
 583   simix_global->default_function = [executable, fdin_size](std::vector<std::string> args) {
 584     return std::function<void()>([executable, fdin_size, args] {
 585       static std::size_t rank = 0;
 586       // Copy the dynamic library:
 587       std::string target_executable =
 588           executable + "_" + std::to_string(getpid()) + "_" + std::to_string(rank) + ".so";
 589
 590       smpi_copy_file(executable, target_executable, fdin_size);
 591       // if smpi/privatize-libs is set, duplicate pointed lib and link each executable copy to a different one.
 592       std::vector<std::string> target_libs;
 593       for (auto const& libpath : privatize_libs_paths) {
 594         // if we were given a full path, strip it
 595         size_t index = libpath.find_last_of("/\\");
 596         std::string libname;
 597         if (index != std::string::npos)
 598           libname = libpath.substr(index + 1);
 599
 600         if (not libname.empty()) {
 601           // load the library to add it to the local libs, to get the absolute path
 602           struct stat fdin_stat2;
 603           stat(libpath.c_str(), &fdin_stat2);
 604           off_t fdin_size2 = fdin_stat2.st_size;
 605
 606           // Copy the dynamic library, the new name must be the same length as the old one
 607           // just replace the name with 7 digits for the rank and the rest of the name.
 608           unsigned int pad = 7;
 609           if (libname.length() < pad)
 610             pad = libname.length();
 611           std::string target_lib =
 612               std::string(pad - std::to_string(rank).length(), '0') + std::to_string(rank) + libname.substr(pad);
 613           target_libs.push_back(target_lib);
 614           XBT_DEBUG("copy lib %s to %s, with size %lld", libpath.c_str(), target_lib.c_str(), (long long)fdin_size2);
 615           smpi_copy_file(libpath, target_lib, fdin_size2);
 616
 617           std::string sedcommand = "sed -i -e 's/" + libname + "/" + target_lib + "/g' " + target_executable;
 618           int ret                = system(sedcommand.c_str());
 619           if (ret != 0)
 620             xbt_die("error while applying sed command %s \n", sedcommand.c_str());
 621         }
 622       }
 623
 624       rank++;
 625       // Load the copy and resolve the entry point:
 626       void* handle    = dlopen(target_executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL | WANT_RTLD_DEEPBIND);
 627       int saved_errno = errno;
 628       if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/keep-temps") == false) {
 629         unlink(target_executable.c_str());
 630         for (const std::string& target_lib : target_libs)
 631           unlink(target_lib.c_str());
 632       }
 633       if (handle == nullptr)
 634         xbt_die("dlopen failed: %s (errno: %d -- %s)", dlerror(), saved_errno, strerror(saved_errno));
 635       smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
 636       if (not entry_point)
 637         xbt_die("Could not resolve entry point");
 638       smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args);
 639     });
 640   };
 641 }
 642
 643 static void smpi_init_privatization_no_dlopen(const std::string& executable)
 644 {
 645   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 646     smpi_prepare_global_memory_segment();
 647   // Load the dynamic library and resolve the entry point:
 648   void* handle = dlopen(executable.c_str(), RTLD_LAZY | RTLD_LOCAL);
 649   if (handle == nullptr)
 650     xbt_die("dlopen failed for %s: %s (errno: %d -- %s)", executable.c_str(), dlerror(), errno, strerror(errno));
 651   smpi_entry_point_type entry_point = smpi_resolve_function(handle);
 652   if (not entry_point)
 653     xbt_die("main not found in %s", executable.c_str());
 654   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP)
 655     smpi_backup_global_memory_segment();
 656
 657   // Execute the same entry point for each simulated process:
 658   simix_global->default_function = [entry_point, executable](std::vector<std::string> args) {
 659     return std::function<void()>(
 660         [entry_point, executable, args] { smpi_run_entry_point(entry_point, executable, args); });
 661   };
 662 }
 663
 664 int smpi_main(const char* executable, int argc, char* argv[])
 665 {
 666   srand(SMPI_RAND_SEED);
 667
 668   if (getenv("SMPI_PRETEND_CC") != nullptr) {
 669     /* Hack to ensure that smpicc can pretend to be a simple compiler. Particularly handy to pass it to the
 670      * configuration tools */
 671     return 0;
 672   }
 673
 674   TRACE_global_init();
 675   SIMIX_global_init(&argc, argv);
 676
 677   SMPI_switch_data_segment = &smpi_switch_data_segment;
 678
 679   // parse the platform file: get the host list
 680   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->load_platform(argv[1]);
 681   SIMIX_comm_set_copy_data_callback(smpi_comm_copy_buffer_callback);
 682
 683   smpi_init_options();
 684   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::DLOPEN)
 685     smpi_init_privatization_dlopen(executable);
 686   else
 687     smpi_init_privatization_no_dlopen(executable);
 688
 689   SMPI_init();
 690   simgrid::s4u::Engine::get_instance()->load_deployment(argv[2]);
 691   SMPI_app_instance_register(smpi_default_instance_name.c_str(), nullptr,
 692                              process_data.size()); // This call has a side effect on process_count...
 693   MPI_COMM_WORLD = *smpi_deployment_comm_world(smpi_default_instance_name);
 694   smpi_universe_size = process_count;
 695
 696
 697   /* Clean IO before the run */
 698   fflush(stdout);
 699   fflush(stderr);
 700
 701   if (MC_is_active()) {
 702     MC_run();
 703   } else {
 704
 705     SIMIX_run();
 706
 707     xbt_os_walltimer_stop(global_timer);
 708     if (simgrid::config::get_value<bool>("smpi/display-timing")) {
 709       double global_time = xbt_os_timer_elapsed(global_timer);
 710       XBT_INFO("Simulated time: %g seconds. \n\n"
 711           "The simulation took %g seconds (after parsing and platform setup)\n"
 712           "%g seconds were actual computation of the application",
 713           SIMIX_get_clock(), global_time , smpi_total_benched_time);
 714
 715       if (smpi_total_benched_time/global_time>=0.75)
 716       XBT_INFO("More than 75%% of the time was spent inside the application code.\n"
 717       "You may want to use sampling functions or trace replay to reduce this.");
 718     }
 719   }
 720   smpi_global_destroy();
 721
 722   return smpi_exit_status;
 723 }
 724
 725 // Called either directly from the user code, or from the code called by smpirun
 726 void SMPI_init(){
 727   simgrid::s4u::Actor::on_creation.connect([](simgrid::s4u::ActorPtr actor) {
 728     if (not actor->is_daemon()) {
 729       process_data.insert({actor, new simgrid::smpi::ActorExt(actor, nullptr)});
 730     }
 731   });
 732   simgrid::s4u::Actor::on_destruction.connect([](simgrid::s4u::ActorPtr actor) {
 733     auto it = process_data.find(actor);
 734     if (it != process_data.end()) {
 735       delete it->second;
 736       process_data.erase(it);
 737     }
 738   });
 739   simgrid::s4u::Host::on_creation.connect(
 740       [](simgrid::s4u::Host& host) { host.extension_set(new simgrid::smpi::Host(&host)); });
 741
 742   smpi_init_options();
 743   smpi_global_init();
 744   smpi_check_options();
 745 }
 746
 747 void SMPI_finalize(){
 748   smpi_global_destroy();
 749 }
 750
 751 void smpi_mpi_init() {
 752   smpi_init_fortran_types();
 753   if(smpi_init_sleep > 0)
 754     simcall_process_sleep(smpi_init_sleep);
 755 }