src/smpi/smpi_base.cpp

   1 /* Copyright (c) 2007-2015. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include <xbt/config.hpp>
   8 #include <algorithm>
   9
  10 #include "private.h"
  11 #include "xbt/virtu.h"
  12 #include "mc/mc.h"
  13 #include "src/mc/mc_replay.h"
  14 #include "xbt/replay.h"
  15 #include <errno.h>
  16 #include "src/simix/smx_private.h"
  17 #include "surf/surf.h"
  18 #include "simgrid/sg_config.h"
  19 #include "smpi/smpi_utils.hpp"
  20 #include "colls/colls.h"
  21
  22 #include "src/kernel/activity/SynchroComm.hpp"
  23
  24 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
  25
  26 static int match_recv(void* a, void* b, smx_activity_t ignored) {
  27   MPI_Request ref = static_cast<MPI_Request>(a);
  28   MPI_Request req = static_cast<MPI_Request>(b);
  29   XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  30
  31   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
  32   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
  33   if((ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  34     && ((ref->tag == MPI_ANY_TAG && req->tag >=0) || req->tag == ref->tag)){
  35     //we match, we can transfer some values
  36     if(ref->src == MPI_ANY_SOURCE)
  37       ref->real_src = req->src;
  38     if(ref->tag == MPI_ANY_TAG)
  39       ref->real_tag = req->tag;
  40     if(ref->real_size < req->real_size)
  41       ref->truncated = 1;
  42     if(req->detached==1)
  43       ref->detached_sender=req; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  44     XBT_DEBUG("match succeeded");
  45     return 1;
  46   }else return 0;
  47 }
  48
  49 static int match_send(void* a, void* b,smx_activity_t ignored) {
  50   MPI_Request ref = static_cast<MPI_Request>(a);
  51   MPI_Request req = static_cast<MPI_Request>(b);
  52   XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  53   xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
  54   xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
  55
  56   if((req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  57       && ((req->tag == MPI_ANY_TAG && ref->tag >=0)|| req->tag == ref->tag)){
  58     if(req->src == MPI_ANY_SOURCE)
  59       req->real_src = ref->src;
  60     if(req->tag == MPI_ANY_TAG)
  61       req->real_tag = ref->tag;
  62     if(req->real_size < ref->real_size)
  63       req->truncated = 1;
  64     if(ref->detached==1)
  65       req->detached_sender=ref; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  66     XBT_DEBUG("match succeeded");
  67     return 1;
  68   } else
  69     return 0;
  70 }
  71
  72 std::vector<s_smpi_factor_t> smpi_os_values;
  73 std::vector<s_smpi_factor_t> smpi_or_values;
  74 std::vector<s_smpi_factor_t> smpi_ois_values;
  75
  76 static simgrid::config::Flag<double> smpi_wtime_sleep(
  77   "smpi/wtime", "Minimum time to inject inside a call to MPI_Wtime", 0.0);
  78 static simgrid::config::Flag<double> smpi_init_sleep(
  79   "smpi/init", "Time to inject inside a call to MPI_Init", 0.0);
  80 static simgrid::config::Flag<double> smpi_iprobe_sleep(
  81   "smpi/iprobe", "Minimum time to inject inside a call to MPI_Iprobe", 1e-4);
  82 static simgrid::config::Flag<double> smpi_test_sleep(
  83   "smpi/test", "Minimum time to inject inside a call to MPI_Test", 1e-4);
  84
  85
  86 static double smpi_os(size_t size)
  87 {
  88   if (smpi_os_values.empty()) {
  89     smpi_os_values = parse_factor(xbt_cfg_get_string("smpi/os"));
  90   }
  91   double current=smpi_os_values.empty()?0.0:smpi_os_values[0].values[0]+smpi_os_values[0].values[1]*size;
  92   // Iterate over all the sections that were specified and find the right
  93   // value. (fact.factor represents the interval sizes; we want to find the
  94   // section that has fact.factor <= size and no other such fact.factor <= size)
  95   // Note: parse_factor() (used before) already sorts the vector we iterate over!
  96   for (auto& fact : smpi_os_values) {
  97     if (size <= fact.factor) { // Values already too large, use the previously computed value of current!
  98       XBT_DEBUG("os : %zu <= %zu return %.10f", size, fact.factor, current);
  99       return current;
 100     }else{
 101       // If the next section is too large, the current section must be used.
 102       // Hence, save the cost, as we might have to use it.
 103       current = fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 104     }
 105   }
 106   XBT_DEBUG("Searching for smpi/os: %zu is larger than the largest boundary, return %.10f", size, current);
 107
 108   return current;
 109 }
 110
 111 static double smpi_ois(size_t size)
 112 {
 113   if (smpi_ois_values.empty()) {
 114     smpi_ois_values = parse_factor(xbt_cfg_get_string("smpi/ois"));
 115   }
 116   double current=smpi_ois_values.empty()?0.0:smpi_ois_values[0].values[0]+smpi_ois_values[0].values[1]*size;
 117   // Iterate over all the sections that were specified and find the right value. (fact.factor represents the interval
 118   // sizes; we want to find the section that has fact.factor <= size and no other such fact.factor <= size)
 119   // Note: parse_factor() (used before) already sorts the vector we iterate over!
 120   for (auto& fact : smpi_ois_values) {
 121     if (size <= fact.factor) { // Values already too large, use the previously  computed value of current!
 122       XBT_DEBUG("ois : %zu <= %zu return %.10f", size, fact.factor, current);
 123       return current;
 124     }else{
 125       // If the next section is too large, the current section must be used.
 126       // Hence, save the cost, as we might have to use it.
 127       current = fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 128     }
 129   }
 130   XBT_DEBUG("Searching for smpi/ois: %zu is larger than the largest boundary, return %.10f", size, current);
 131
 132   return current;
 133 }
 134
 135 static double smpi_or(size_t size)
 136 {
 137   if (smpi_or_values.empty()) {
 138     smpi_or_values = parse_factor(xbt_cfg_get_string("smpi/or"));
 139   }
 140
 141   double current=smpi_or_values.empty()?0.0:smpi_or_values.front().values[0]+smpi_or_values.front().values[1]*size;
 142
 143   // Iterate over all the sections that were specified and find the right value. (fact.factor represents the interval
 144   // sizes; we want to find the section that has fact.factor <= size and no other such fact.factor <= size)
 145   // Note: parse_factor() (used before) already sorts the vector we iterate over!
 146   for (auto fact : smpi_or_values) {
 147     if (size <= fact.factor) { // Values already too large, use the previously computed value of current!
 148       XBT_DEBUG("or : %zu <= %zu return %.10f", size, fact.factor, current);
 149       return current;
 150     } else {
 151       // If the next section is too large, the current section must be used.
 152       // Hence, save the cost, as we might have to use it.
 153       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 154     }
 155   }
 156   XBT_DEBUG("smpi_or: %zu is larger than largest boundary, return %.10f", size, current);
 157
 158   return current;
 159 }
 160
 161 void smpi_mpi_init() {
 162   if(smpi_init_sleep > 0)
 163     simcall_process_sleep(smpi_init_sleep);
 164 }
 165
 166 double smpi_mpi_wtime(){
 167   double time;
 168   if (smpi_process_initialized() != 0 && smpi_process_finalized() == 0 && smpi_process_get_sampling() == 0) {
 169     smpi_bench_end();
 170     time = SIMIX_get_clock();
 171     // to avoid deadlocks if used as a break condition, such as
 172     //     while (MPI_Wtime(...) < time_limit) {
 173     //       ....
 174     //     }
 175     // because the time will not normally advance when only calls to MPI_Wtime
 176     // are made -> deadlock (MPI_Wtime never reaches the time limit)
 177     if(smpi_wtime_sleep > 0)
 178       simcall_process_sleep(smpi_wtime_sleep);
 179     smpi_bench_begin();
 180   } else {
 181     time = SIMIX_get_clock();
 182   }
 183   return time;
 184 }
 185
 186 static MPI_Request build_request(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm,
 187                                  unsigned flags)
 188 {
 189   MPI_Request request = nullptr;
 190
 191   void *old_buf = nullptr;
 192
 193   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
 194
 195   s_smpi_subtype_t *subtype = static_cast<s_smpi_subtype_t*>(datatype->substruct);
 196
 197   if((((flags & RECV) != 0) && ((flags & ACCUMULATE) !=0)) || (datatype->sizeof_substruct != 0)){
 198     // This part handles the problem of non-contiguous memory
 199     old_buf = buf;
 200     buf = count==0 ? nullptr : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
 201     if ((datatype->sizeof_substruct != 0) && ((flags & SEND) != 0)) {
 202       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
 203     }
 204   }
 205
 206   request->buf      = buf;
 207   // This part handles the problem of non-contiguous memory (for the unserialisation at the reception)
 208   request->old_buf  = old_buf;
 209   request->old_type = datatype;
 210
 211   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
 212   smpi_datatype_use(datatype);
 213   request->src  = src;
 214   request->dst  = dst;
 215   request->tag  = tag;
 216   request->comm = comm;
 217   smpi_comm_use(request->comm);
 218   request->action          = nullptr;
 219   request->flags           = flags;
 220   request->detached        = 0;
 221   request->detached_sender = nullptr;
 222   request->real_src        = 0;
 223   request->truncated       = 0;
 224   request->real_size       = 0;
 225   request->real_tag        = 0;
 226   if (flags & PERSISTENT)
 227     request->refcount = 1;
 228   else
 229     request->refcount = 0;
 230   request->op   = MPI_REPLACE;
 231   request->send = 0;
 232   request->recv = 0;
 233
 234   return request;
 235 }
 236
 237 void smpi_empty_status(MPI_Status * status)
 238 {
 239   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 240     status->MPI_SOURCE = MPI_ANY_SOURCE;
 241     status->MPI_TAG = MPI_ANY_TAG;
 242     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 243     status->count=0;
 244   }
 245 }
 246
 247 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
 248 {
 249   MPI_Request req = static_cast<MPI_Request>(request);
 250   smpi_mpi_request_free(&req);
 251 }
 252
 253 /* MPI Low level calls */
 254 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 255 {
 256   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 257   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 258                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, PERSISTENT | SEND | PREPARED);
 259   return request;
 260 }
 261
 262 MPI_Request smpi_mpi_ssend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 263 {
 264   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 265   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 266                         smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, PERSISTENT | SSEND | SEND | PREPARED);
 267   return request;
 268 }
 269
 270 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int tag, MPI_Comm comm)
 271 {
 272   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 273   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype,
 274                           src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src),
 275                           smpi_process_index(), tag, comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 276   return request;
 277 }
 278
 279 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 280 {
 281   smx_mailbox_t mailbox;
 282
 283   xbt_assert(request->action == nullptr, "Cannot (re-)start unfinished communication");
 284   request->flags &= ~PREPARED;
 285   request->flags &= ~FINISHED;
 286   request->refcount++;
 287
 288   if ((request->flags & RECV) != 0) {
 289     print_request("New recv", request);
 290
 291     int async_small_thresh = xbt_cfg_get_int("smpi/async-small-thresh");
 292
 293     xbt_mutex_t mut = smpi_process_mailboxes_mutex();
 294     if (async_small_thresh != 0 || (request->flags & RMA) != 0)
 295       xbt_mutex_acquire(mut);
 296
 297     if (async_small_thresh == 0 && (request->flags & RMA) == 0 ) {
 298       mailbox = smpi_process_mailbox();
 299     }
 300     else if (((request->flags & RMA) != 0) || static_cast<int>(request->size) < async_small_thresh) {
 301       //We have to check both mailboxes (because SSEND messages are sent to the large mbox).
 302       //begin with the more appropriate one : the small one.
 303       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 304       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted in the small mailbox %p (in case of SSEND)?", mailbox);
 305       smx_activity_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv,
 306                                                   static_cast<void*>(request));
 307
 308       if (action == nullptr) {
 309         mailbox = smpi_process_mailbox();
 310         XBT_DEBUG("No, nothing in the small mailbox test the other one : %p", mailbox);
 311         action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, static_cast<void*>(request));
 312         if (action == nullptr) {
 313           XBT_DEBUG("Still nothing, switch back to the small mailbox : %p", mailbox);
 314           mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 315         }
 316       } else {
 317         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the large mailbox");
 318       }
 319     } else {
 320       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 321       XBT_DEBUG("Is there a corresponding send already posted the small mailbox?");
 322       smx_activity_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv, (void*)request);
 323
 324       if (action == nullptr) {
 325         XBT_DEBUG("No, nothing in the permanent receive mailbox");
 326         mailbox = smpi_process_mailbox();
 327       } else {
 328         XBT_DEBUG("yes there was something for us in the small mailbox");
 329       }
 330     }
 331
 332     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 333     request->real_size=request->size;
 334     request->action = simcall_comm_irecv(SIMIX_process_self(), mailbox, request->buf, &request->real_size, &match_recv,
 335                                          ! smpi_process_get_replaying()? &smpi_comm_copy_buffer_callback
 336                                          : &smpi_comm_null_copy_buffer_callback, request, -1.0);
 337     XBT_DEBUG("recv simcall posted");
 338
 339     if (async_small_thresh != 0 || (request->flags & RMA) != 0 )
 340       xbt_mutex_release(mut);
 341   } else { /* the RECV flag was not set, so this is a send */
 342     int receiver = request->dst;
 343
 344     int rank = request->src;
 345     if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 346       TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver, request->tag, request->size);
 347     }
 348     print_request("New send", request);
 349
 350     void* buf = request->buf;
 351     if ((request->flags & SSEND) == 0 && ( (request->flags & RMA) != 0
 352         || static_cast<int>(request->size) < xbt_cfg_get_int("smpi/send-is-detached-thresh") ) ) {
 353       void *oldbuf = nullptr;
 354       request->detached = 1;
 355       XBT_DEBUG("Send request %p is detached", request);
 356       request->refcount++;
 357       if(request->old_type->sizeof_substruct == 0){
 358         oldbuf = request->buf;
 359         if (!smpi_process_get_replaying() && oldbuf != nullptr && request->size!=0){
 360           if((smpi_privatize_global_variables != 0)
 361             && (static_cast<char*>(request->buf) >= smpi_start_data_exe)
 362             && (static_cast<char*>(request->buf) < smpi_start_data_exe + smpi_size_data_exe )){
 363             XBT_DEBUG("Privatization : We are sending from a zone inside global memory. Switch data segment ");
 364             smpi_switch_data_segment(request->src);
 365           }
 366           buf = xbt_malloc(request->size);
 367           memcpy(buf,oldbuf,request->size);
 368           XBT_DEBUG("buf %p copied into %p",oldbuf,buf);
 369         }
 370       }
 371     }
 372
 373     //if we are giving back the control to the user without waiting for completion, we have to inject timings
 374     double sleeptime = 0.0;
 375     if(request->detached != 0 || ((request->flags & (ISEND|SSEND)) != 0)){// issend should be treated as isend
 376       //isend and send timings may be different
 377       sleeptime = ((request->flags & ISEND) != 0) ? smpi_ois(request->size) : smpi_os(request->size);
 378     }
 379
 380     if(sleeptime > 0.0){
 381       simcall_process_sleep(sleeptime);
 382       XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %f ", request->size, sleeptime);
 383     }
 384
 385     int async_small_thresh = xbt_cfg_get_int("smpi/async-small-thresh");
 386
 387     xbt_mutex_t mut=smpi_process_remote_mailboxes_mutex(receiver);
 388
 389     if (async_small_thresh != 0 || (request->flags & RMA) != 0)
 390       xbt_mutex_acquire(mut);
 391
 392     if (!(async_small_thresh != 0 || (request->flags & RMA) !=0)) {
 393       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 394     } else if (((request->flags & RMA) != 0) || static_cast<int>(request->size) < async_small_thresh) { // eager mode
 395       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 396       XBT_DEBUG("Is there a corresponding recv already posted in the large mailbox %p?", mailbox);
 397       smx_activity_t action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send,
 398                                                   static_cast<void*>(request));
 399       if (action == nullptr) {
 400         if ((request->flags & SSEND) == 0){
 401           mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 402           XBT_DEBUG("No, nothing in the large mailbox, message is to be sent on the small one %p", mailbox);
 403         } else {
 404           mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 405           XBT_DEBUG("SSEND : Is there a corresponding recv already posted in the small mailbox %p?", mailbox);
 406           action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 1,request->dst, request->tag, &match_send, static_cast<void*>(request));
 407           if (action == nullptr) {
 408             XBT_DEBUG("No, we are first, send to large mailbox");
 409             mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 410           }
 411         }
 412       } else {
 413         XBT_DEBUG("Yes there was something for us in the large mailbox");
 414       }
 415     } else {
 416       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 417       XBT_DEBUG("Send request %p is in the large mailbox %p (buf: %p)",mailbox, request,request->buf);
 418     }
 419
 420     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 421     request->real_size=request->size;
 422     request->action = simcall_comm_isend(SIMIX_process_from_PID(request->src+1), mailbox, request->size, -1.0,
 423                                          buf, request->real_size, &match_send,
 424                          &xbt_free_f, // how to free the userdata if a detached send fails
 425                          !smpi_process_get_replaying() ? &smpi_comm_copy_buffer_callback
 426                          : &smpi_comm_null_copy_buffer_callback, request,
 427                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
 428                          request->detached);
 429     XBT_DEBUG("send simcall posted");
 430
 431     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == nullptr) */
 432     if (request->action != nullptr)
 433       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
 434
 435     if (async_small_thresh != 0 || ((request->flags & RMA)!=0))
 436       xbt_mutex_release(mut);
 437   }
 438 }
 439
 440 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
 441 {
 442   if(requests== nullptr)
 443     return;
 444
 445   for(int i = 0; i < count; i++) {
 446     smpi_mpi_start(requests[i]);
 447   }
 448 }
 449
 450 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
 451 {
 452   if((*request) != MPI_REQUEST_NULL){
 453     (*request)->refcount--;
 454     if((*request)->refcount<0) xbt_die("wrong refcount");
 455
 456     if((*request)->refcount==0){
 457         smpi_datatype_unuse((*request)->old_type);
 458         smpi_comm_unuse((*request)->comm);
 459         print_request("Destroying", (*request));
 460         xbt_free(*request);
 461         *request = MPI_REQUEST_NULL;
 462     }else{
 463       print_request("Decrementing", (*request));
 464     }
 465   }else{
 466     xbt_die("freeing an already free request");
 467   }
 468 }
 469
 470 MPI_Request smpi_rma_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm,
 471                                MPI_Op op)
 472 {
 473   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 474   if(op==MPI_OP_NULL){
 475     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf , count, datatype, src, dst, tag,
 476                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 477   }else{
 478     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 479                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED | ACCUMULATE);
 480     request->op = op;
 481   }
 482   return request;
 483 }
 484
 485 MPI_Request smpi_rma_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int dst, int tag, MPI_Comm comm,
 486                                MPI_Op op)
 487 {
 488   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 489   if(op==MPI_OP_NULL){
 490     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 491                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 492   }else{
 493     request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype,  src, dst, tag,
 494                             comm, RMA | NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED | ACCUMULATE);
 495     request->op = op;
 496   }
 497   return request;
 498 }
 499
 500 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 501 {
 502   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 503   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf , count, datatype, smpi_process_index(),
 504                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,comm, PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 505   return request;
 506 }
 507
 508 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 509 {
 510   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 511   request =  build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 512                            smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND);
 513   smpi_mpi_start(request);
 514   return request;
 515 }
 516
 517 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 518 {
 519   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 520   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 521                         smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SSEND | SEND);
 522   smpi_mpi_start(request);
 523   return request;
 524 }
 525
 526 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int tag, MPI_Comm comm)
 527 {
 528   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 529   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE :
 530                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 531                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 532   return request;
 533 }
 534
 535 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int tag, MPI_Comm comm)
 536 {
 537   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 538   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE :
 539                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag, comm,
 540                           NON_PERSISTENT | RECV);
 541   smpi_mpi_start(request);
 542   return request;
 543 }
 544
 545 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 546 {
 547   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 548   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 549   smpi_mpi_wait(&request, status);
 550   request = nullptr;
 551 }
 552
 553 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 554 {
 555   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 556   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 557                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, NON_PERSISTENT | SEND);
 558
 559   smpi_mpi_start(request);
 560   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 561   request = nullptr;
 562 }
 563
 564 void smpi_mpi_ssend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 565 {
 566   MPI_Request request = nullptr; /* MC needs the comm to be set to nullptr during the call */
 567   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? nullptr : buf, count, datatype, smpi_process_index(),
 568                           smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag, comm, NON_PERSISTENT | SSEND | SEND);
 569
 570   smpi_mpi_start(request);
 571   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 572   request = nullptr;
 573 }
 574
 575 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,int dst, int sendtag,
 576                        void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
 577                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 578 {
 579   MPI_Request requests[2];
 580   MPI_Status stats[2];
 581   int myid=smpi_process_index();
 582   if ((smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst) == myid) && (smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src) == myid)){
 583       smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
 584       return;
 585   }
 586   requests[0] = smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
 587   requests[1] = smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
 588   smpi_mpi_startall(2, requests);
 589   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
 590   smpi_mpi_request_free(&requests[0]);
 591   smpi_mpi_request_free(&requests[1]);
 592   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 593     // Copy receive status
 594     *status = stats[1];
 595   }
 596 }
 597
 598 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
 599 {
 600   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
 601 }
 602
 603 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 604 {
 605   MPI_Request req = *request;
 606   smpi_empty_status(status);
 607
 608   if(!((req->detached != 0) && ((req->flags & SEND) != 0)) && ((req->flags & PREPARED) == 0)){
 609     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 610       int src = req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src;
 611       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(req->comm), src);
 612       status->MPI_TAG = req->tag == MPI_ANY_TAG ? req->real_tag : req->tag;
 613       status->MPI_ERROR = req->truncated != 0 ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
 614       // this handles the case were size in receive differs from size in send
 615       status->count = req->real_size;
 616     }
 617
 618     print_request("Finishing", req);
 619     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 620
 621     if(((req->flags & ACCUMULATE) != 0) || (datatype->sizeof_substruct != 0)){
 622       if (!smpi_process_get_replaying()){
 623         if( smpi_privatize_global_variables != 0 && (static_cast<char*>(req->old_buf) >= smpi_start_data_exe)
 624             && ((char*)req->old_buf < smpi_start_data_exe + smpi_size_data_exe )){
 625             XBT_VERB("Privatization : We are unserializing to a zone in global memory - Switch data segment ");
 626             smpi_switch_data_segment(smpi_process_index());
 627         }
 628       }
 629
 630       if(datatype->sizeof_substruct != 0){
 631         // This part handles the problem of non-contignous memory the unserialization at the reception
 632         s_smpi_subtype_t *subtype = static_cast<s_smpi_subtype_t*>(datatype->substruct);
 633         if(req->flags & RECV)
 634           subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) ,
 635                                datatype->substruct, req->op);
 636         xbt_free(req->buf);
 637       }else if(req->flags & RECV){//apply op on contiguous buffer for accumulate
 638           int n =req->real_size/smpi_datatype_size(datatype);
 639           smpi_op_apply(req->op, req->buf, req->old_buf, &n, &datatype);
 640           xbt_free(req->buf);
 641       }
 642     }
 643   }
 644
 645   if (TRACE_smpi_view_internals() && ((req->flags & RECV) != 0)){
 646     int rank = smpi_process_index();
 647     int src_traced = (req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src);
 648     TRACE_smpi_recv(rank, src_traced, rank,req->tag);
 649   }
 650
 651   if(req->detached_sender != nullptr){
 652     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
 653     double sleeptime = smpi_or(req->real_size);
 654     if(sleeptime > 0.0){
 655       simcall_process_sleep(sleeptime);
 656       XBT_DEBUG("receiving size of %zu : sleep %f ", req->real_size, sleeptime);
 657     }
 658     smpi_mpi_request_free(&(req->detached_sender));
 659   }
 660   if(req->flags & PERSISTENT)
 661     req->action = nullptr;
 662   req->flags |= FINISHED;
 663
 664   smpi_mpi_request_free(request);
 665 }
 666
 667 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
 668   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
 669
 670   // to avoid deadlocks if used as a break condition, such as
 671   //     while (MPI_Test(request, flag, status) && flag) {
 672   //     }
 673   // because the time will not normally advance when only calls to MPI_Test are made -> deadlock
 674   // multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed test will increase it
 675   static int nsleeps = 1;
 676   if(smpi_test_sleep > 0)
 677     simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 678
 679   smpi_empty_status(status);
 680   int flag = 1;
 681   if (((*request)->flags & PREPARED) == 0) {
 682     if ((*request)->action != nullptr)
 683       flag = simcall_comm_test((*request)->action);
 684     if (flag) {
 685       finish_wait(request, status);
 686       nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 687       if (*request != MPI_REQUEST_NULL && ((*request)->flags & PERSISTENT)==0)
 688       *request = MPI_REQUEST_NULL;
 689     } else if (xbt_cfg_get_boolean("smpi/grow-injected-times")){
 690       nsleeps++;
 691     }
 692   }
 693   return flag;
 694 }
 695
 696 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index, MPI_Status * status)
 697 {
 698   std::vector<simgrid::kernel::activity::ActivityImpl*> comms;
 699   comms.reserve(count);
 700
 701   int i;
 702   int flag = 0;
 703
 704   *index = MPI_UNDEFINED;
 705
 706   std::vector<int> map; /** Maps all matching comms back to their location in requests **/
 707   for(i = 0; i < count; i++) {
 708     if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 709        comms.push_back(requests[i]->action);
 710        map.push_back(i);
 711     }
 712   }
 713   if(!map.empty()) {
 714     //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed testany will increase it
 715     static int nsleeps = 1;
 716     if(smpi_test_sleep > 0)
 717       simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_test_sleep);
 718
 719     i = simcall_comm_testany(comms.data(), comms.size()); // The i-th element in comms matches!
 720     if (i != -1) { // -1 is not MPI_UNDEFINED but a SIMIX return code. (nothing matches)
 721       *index = map[i];
 722       finish_wait(&requests[*index], status);
 723       flag             = 1;
 724       nsleeps          = 1;
 725       if (requests[*index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[*index]->flags & NON_PERSISTENT)) {
 726         requests[*index] = MPI_REQUEST_NULL;
 727       }
 728     } else {
 729       nsleeps++;
 730     }
 731   } else {
 732       //all requests are null or inactive, return true
 733       flag = 1;
 734       smpi_empty_status(status);
 735   }
 736
 737   return flag;
 738 }
 739
 740 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[], MPI_Status status[])
 741 {
 742   MPI_Status stat;
 743   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 744   int flag=1;
 745   for(int i=0; i<count; i++){
 746     if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED)) {
 747       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
 748         flag=0;
 749       }else{
 750           requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 751       }
 752     }else{
 753       smpi_empty_status(pstat);
 754     }
 755     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 756       status[i] = *pstat;
 757     }
 758   }
 759   return flag;
 760 }
 761
 762 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
 763   int flag=0;
 764   //FIXME find another way to avoid busy waiting ?
 765   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
 766   while(flag==0){
 767     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
 768     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
 769   }
 770 }
 771
 772 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
 773   MPI_Request request = build_request(nullptr, 0, MPI_CHAR, source == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE :
 774                  smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), source), smpi_comm_rank(comm), tag, comm, PERSISTENT | RECV);
 775
 776   // to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
 777   // (especially when used as a break condition, such as while(MPI_Iprobe(...)) ... )
 778   // multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
 779   static int nsleeps = 1;
 780   if(smpi_iprobe_sleep > 0)
 781     simcall_process_sleep(nsleeps*smpi_iprobe_sleep);
 782   // behave like a receive, but don't do it
 783   smx_mailbox_t mailbox;
 784
 785   print_request("New iprobe", request);
 786   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
 787   if (xbt_cfg_get_int("smpi/async-small-thresh") > 0){
 788       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 789       XBT_DEBUG("Trying to probe the perm recv mailbox");
 790       request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src, request->tag, &match_recv,
 791                                             static_cast<void*>(request));
 792   }
 793
 794   if (request->action == nullptr){
 795     mailbox = smpi_process_mailbox();
 796     XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
 797     request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, 0, request->src,request->tag, &match_recv,
 798                                           static_cast<void*>(request));
 799   }
 800
 801   if (request->action != nullptr){
 802     simgrid::kernel::activity::Comm *sync_comm = static_cast<simgrid::kernel::activity::Comm*>(request->action);
 803     MPI_Request req                            = static_cast<MPI_Request>(sync_comm->src_data);
 804     *flag = 1;
 805     if(status != MPI_STATUS_IGNORE && (req->flags & PREPARED) == 0) {
 806       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(comm), req->src);
 807       status->MPI_TAG    = req->tag;
 808       status->MPI_ERROR  = MPI_SUCCESS;
 809       status->count      = req->real_size;
 810     }
 811     nsleeps = 1;//reset the number of sleeps we will do next time
 812   }
 813   else {
 814     *flag = 0;
 815     if (xbt_cfg_get_boolean("smpi/grow-injected-times"))
 816       nsleeps++;
 817   }
 818   smpi_mpi_request_free(&request);
 819 }
 820
 821 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 822 {
 823   print_request("Waiting", *request);
 824   if ((*request)->flags & PREPARED) {
 825     smpi_empty_status(status);
 826     return;
 827   }
 828
 829   if ((*request)->action != nullptr)
 830     // this is not a detached send
 831     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
 832
 833   finish_wait(request, status);
 834   if (*request != MPI_REQUEST_NULL && (((*request)->flags & NON_PERSISTENT)!=0))
 835     *request = MPI_REQUEST_NULL;
 836 }
 837
 838 static int sort_accumulates(const void* pa, const void* pb)
 839 {
 840   return (*static_cast<MPI_Request const*>(pa))->tag>
 841                 (*static_cast<MPI_Request const*>(pb))->tag;
 842 }
 843
 844 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[], MPI_Status * status)
 845 {
 846   s_xbt_dynar_t comms; // Keep it on stack to save some extra mallocs
 847   int i;
 848   int size = 0;
 849   int index = MPI_UNDEFINED;
 850   int *map;
 851
 852   if(count > 0) {
 853     // Wait for a request to complete
 854     xbt_dynar_init(&comms, sizeof(smx_activity_t), nullptr);
 855     map = xbt_new(int, count);
 856     XBT_DEBUG("Wait for one of %d", count);
 857     for(i = 0; i < count; i++) {
 858       if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && !(requests[i]->flags & PREPARED) && !(requests[i]->flags & FINISHED)) {
 859         if (requests[i]->action != nullptr) {
 860           XBT_DEBUG("Waiting any %p ", requests[i]);
 861           xbt_dynar_push(&comms, &requests[i]->action);
 862           map[size] = i;
 863           size++;
 864         }else{
 865          //This is a finished detached request, let's return this one
 866          size=0;//so we free the dynar but don't do the waitany call
 867          index=i;
 868          finish_wait(&requests[i], status);//cleanup if refcount = 0
 869          if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 870          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;//set to null
 871          break;
 872          }
 873       }
 874     }
 875     if(size > 0) {
 876       i = simcall_comm_waitany(&comms, -1);
 877
 878       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 879       if (i != -1) {
 880         index = map[i];
 881         //in case of an accumulate, we have to wait the end of all requests to apply the operation, ordered correctly.
 882         if ((requests[index] == MPI_REQUEST_NULL)
 883              ||  (!((requests[index]->flags & ACCUMULATE) && (requests[index]->flags & RECV)))){
 884           finish_wait(&requests[index], status);
 885           if (requests[i] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[i]->flags & NON_PERSISTENT))
 886             requests[index] = MPI_REQUEST_NULL;
 887         }else{
 888             XBT_WARN("huu?");
 889         }
 890       }
 891     }
 892
 893     xbt_dynar_free_data(&comms);
 894     xbt_free(map);
 895   }
 896
 897   if (index==MPI_UNDEFINED)
 898     smpi_empty_status(status);
 899
 900   return index;
 901 }
 902
 903 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[], MPI_Status status[])
 904 {
 905   s_xbt_dynar_t accumulates;
 906   int index;
 907   MPI_Status stat;
 908   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 909   int retvalue = MPI_SUCCESS;
 910   //tag invalid requests in the set
 911   if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 912     for (int c = 0; c < count; c++) {
 913       if (requests[c] == MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL || (requests[c]->flags & PREPARED)) {
 914         smpi_empty_status(&status[c]);
 915       } else if (requests[c]->src == MPI_PROC_NULL) {
 916         smpi_empty_status(&status[c]);
 917         status[c].MPI_SOURCE = MPI_PROC_NULL;
 918       }
 919     }
 920   }
 921   xbt_dynar_init(&accumulates, sizeof(MPI_Request), nullptr);
 922   for (int c = 0; c < count; c++) {
 923
 924     if (MC_is_active() || MC_record_replay_is_active()) {
 925       smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
 926       index = c;
 927     } else {
 928       index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
 929       if (index == MPI_UNDEFINED)
 930         break;
 931
 932       if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL
 933            && (requests[index]->flags & RECV)
 934            && (requests[index]->flags & ACCUMULATE))
 935         xbt_dynar_push(&accumulates, &requests[index]);
 936       if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
 937       requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
 938
 939     }
 940     if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 941       status[index] = *pstat;
 942       if (status[index].MPI_ERROR == MPI_ERR_TRUNCATE)
 943         retvalue = MPI_ERR_IN_STATUS;
 944     }
 945   }
 946
 947   if(!xbt_dynar_is_empty(&accumulates)){
 948     xbt_dynar_sort(&accumulates, sort_accumulates);
 949     MPI_Request req;
 950     unsigned int cursor;
 951     xbt_dynar_foreach(&accumulates, cursor, req) {
 952       finish_wait(&req, status);
 953     }
 954   }
 955   xbt_dynar_free_data(&accumulates);
 956
 957   return retvalue;
 958 }
 959
 960 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices, MPI_Status status[])
 961 {
 962   int i;
 963   int count = 0;
 964   int index;
 965   MPI_Status stat;
 966   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 967
 968   for(i = 0; i < incount; i++)
 969   {
 970     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
 971     if(index!=MPI_UNDEFINED){
 972       indices[count] = index;
 973       count++;
 974       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 975         status[index] = *pstat;
 976       }
 977      if (requests[index] != MPI_REQUEST_NULL && (requests[index]->flags & NON_PERSISTENT))
 978      requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
 979     }else{
 980       return MPI_UNDEFINED;
 981     }
 982   }
 983   return count;
 984 }
 985
 986 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices, MPI_Status status[])
 987 {
 988   int i;
 989   int count = 0;
 990   int count_dead = 0;
 991   MPI_Status stat;
 992   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 993
 994   for(i = 0; i < incount; i++) {
 995     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
 996       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
 997          indices[i] = 1;
 998          count++;
 999          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
1000            status[i] = *pstat;
1001          }
1002          if ((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->flags & NON_PERSISTENT)
1003          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
1004       }
1005     }else{
1006       count_dead++;
1007     }
1008   }
1009   if(count_dead==incount)
1010     return MPI_UNDEFINED;
1011   else return count;
1012 }
1013
1014 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root, MPI_Comm comm)
1015 {
1016   smpi_coll_tuned_bcast_binomial_tree(buf, count, datatype, root, comm);
1017 }
1018
1019 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
1020 {
1021   smpi_coll_tuned_barrier_ompi_basic_linear(comm);
1022 }
1023
1024 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1025                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1026 {
1027   int system_tag = COLL_TAG_GATHER;
1028   MPI_Aint lb = 0;
1029   MPI_Aint recvext = 0;
1030
1031   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1032   int size = smpi_comm_size(comm);
1033   if(rank != root) {
1034     // Send buffer to root
1035     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1036   } else {
1037     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1038     // Local copy from root
1039     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, static_cast<char*>(recvbuf) + root * recvcount * recvext,
1040                        recvcount, recvtype);
1041     // Receive buffers from senders
1042     MPI_Request *requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1043     int index = 0;
1044     for (int src = 0; src < size; src++) {
1045       if(src != root) {
1046         requests[index] = smpi_irecv_init(static_cast<char*>(recvbuf) + src * recvcount * recvext, recvcount, recvtype,
1047                                           src, system_tag, comm);
1048         index++;
1049       }
1050     }
1051     // Wait for completion of irecv's.
1052     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1053     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1054     for (int src = 0; src < size-1; src++) {
1055       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1056     }
1057     xbt_free(requests);
1058   }
1059 }
1060
1061 void smpi_mpi_reduce_scatter(void *sendbuf, void *recvbuf, int *recvcounts, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op,
1062                              MPI_Comm comm)
1063 {
1064   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1065
1066   /* arbitrarily choose root as rank 0 */
1067   int size = smpi_comm_size(comm);
1068   int count = 0;
1069   int *displs = xbt_new(int, size);
1070   for (int i = 0; i < size; i++) {
1071     displs[i] = count;
1072     count += recvcounts[i];
1073   }
1074   void *tmpbuf = static_cast<void*>(smpi_get_tmp_sendbuffer(count*smpi_datatype_get_extent(datatype)));
1075
1076   mpi_coll_reduce_fun(sendbuf, tmpbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1077   smpi_mpi_scatterv(tmpbuf, recvcounts, displs, datatype, recvbuf, recvcounts[rank], datatype, 0, comm);
1078   xbt_free(displs);
1079   smpi_free_tmp_buffer(tmpbuf);
1080 }
1081
1082 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
1083                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1084 {
1085   int system_tag = COLL_TAG_GATHERV;
1086   MPI_Aint lb = 0;
1087   MPI_Aint recvext = 0;
1088
1089   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1090   int size = smpi_comm_size(comm);
1091   if (rank != root) {
1092     // Send buffer to root
1093     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
1094   } else {
1095     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1096     // Local copy from root
1097     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, static_cast<char*>(recvbuf) + displs[root] * recvext,
1098                        recvcounts[root], recvtype);
1099     // Receive buffers from senders
1100     MPI_Request *requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1101     int index = 0;
1102     for (int src = 0; src < size; src++) {
1103       if(src != root) {
1104         requests[index] = smpi_irecv_init(static_cast<char*>(recvbuf) + displs[src] * recvext,
1105                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
1106         index++;
1107       }
1108     }
1109     // Wait for completion of irecv's.
1110     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1111     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1112     for (int src = 0; src < size-1; src++) {
1113       smpi_mpi_request_free(&requests[src]);
1114     }
1115     xbt_free(requests);
1116   }
1117 }
1118
1119 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1120                         void *recvbuf,int recvcount, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1121 {
1122   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHER;
1123   MPI_Aint lb = 0;
1124   MPI_Aint recvext = 0;
1125   MPI_Request *requests;
1126
1127   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1128   int size = smpi_comm_size(comm);
1129   // FIXME: check for errors
1130   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1131   // Local copy from self
1132   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype, static_cast<char *>(recvbuf) + rank * recvcount * recvext, recvcount,
1133                      recvtype);
1134   // Send/Recv buffers to/from others;
1135   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1136   int index = 0;
1137   for (int other = 0; other < size; other++) {
1138     if(other != rank) {
1139       requests[index] = smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,comm);
1140       index++;
1141       requests[index] = smpi_irecv_init(static_cast<char *>(recvbuf) + other * recvcount * recvext, recvcount, recvtype,
1142                                         other, system_tag, comm);
1143       index++;
1144     }
1145   }
1146   // Wait for completion of all comms.
1147   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1148   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1149   for (int other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1150     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1151   }
1152   xbt_free(requests);
1153 }
1154
1155 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1156                          int *recvcounts, int *displs, MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1157 {
1158   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHERV;
1159   MPI_Aint lb = 0;
1160   MPI_Aint recvext = 0;
1161
1162   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1163   int size = smpi_comm_size(comm);
1164   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1165   // Local copy from self
1166   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1167                      static_cast<char *>(recvbuf) + displs[rank] * recvext,recvcounts[rank], recvtype);
1168   // Send buffers to others;
1169   MPI_Request *requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1170   int index = 0;
1171   for (int other = 0; other < size; other++) {
1172     if(other != rank) {
1173       requests[index] =
1174         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag, comm);
1175       index++;
1176       requests[index] = smpi_irecv_init(static_cast<char *>(recvbuf) + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
1177                           recvtype, other, system_tag, comm);
1178       index++;
1179     }
1180   }
1181   // Wait for completion of all comms.
1182   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1183   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1184   for (int other = 0; other < 2*(size-1); other++) {
1185     smpi_mpi_request_free(&requests[other]);
1186   }
1187   xbt_free(requests);
1188 }
1189
1190 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1191                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1192 {
1193   int system_tag = COLL_TAG_SCATTER;
1194   MPI_Aint lb = 0;
1195   MPI_Aint sendext = 0;
1196   MPI_Request *requests;
1197
1198   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1199   int size = smpi_comm_size(comm);
1200   if(rank != root) {
1201     // Recv buffer from root
1202     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm, MPI_STATUS_IGNORE);
1203   } else {
1204     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1205     // Local copy from root
1206     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1207         smpi_datatype_copy(static_cast<char *>(sendbuf) + root * sendcount * sendext,
1208                            sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1209     }
1210     // Send buffers to receivers
1211     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1212     int index = 0;
1213     for(int dst = 0; dst < size; dst++) {
1214       if(dst != root) {
1215         requests[index] = smpi_isend_init(static_cast<char *>(sendbuf) + dst * sendcount * sendext, sendcount, sendtype,
1216                                           dst, system_tag, comm);
1217         index++;
1218       }
1219     }
1220     // Wait for completion of isend's.
1221     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1222     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1223     for (int dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1224       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1225     }
1226     xbt_free(requests);
1227   }
1228 }
1229
1230 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs, MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
1231                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1232 {
1233   int system_tag = COLL_TAG_SCATTERV;
1234   MPI_Aint lb = 0;
1235   MPI_Aint sendext = 0;
1236
1237   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1238   int size = smpi_comm_size(comm);
1239   if(rank != root) {
1240     // Recv buffer from root
1241     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm, MPI_STATUS_IGNORE);
1242   } else {
1243     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1244     // Local copy from root
1245     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1246       smpi_datatype_copy(static_cast<char *>(sendbuf) + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
1247                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1248     }
1249     // Send buffers to receivers
1250     MPI_Request *requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1251     int index = 0;
1252     for (int dst = 0; dst < size; dst++) {
1253       if (dst != root) {
1254         requests[index] = smpi_isend_init(static_cast<char *>(sendbuf) + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
1255                             sendtype, dst, system_tag, comm);
1256         index++;
1257       }
1258     }
1259     // Wait for completion of isend's.
1260     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1261     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1262     for (int dst = 0; dst < size-1; dst++) {
1263       smpi_mpi_request_free(&requests[dst]);
1264     }
1265     xbt_free(requests);
1266   }
1267 }
1268
1269 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
1270                      MPI_Comm comm)
1271 {
1272   int system_tag = COLL_TAG_REDUCE;
1273   MPI_Aint lb = 0;
1274   MPI_Aint dataext = 0;
1275
1276   char* sendtmpbuf = static_cast<char *>(sendbuf);
1277
1278   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1279   int size = smpi_comm_size(comm);
1280   //non commutative case, use a working algo from openmpi
1281   if(!smpi_op_is_commute(op)){
1282     smpi_coll_tuned_reduce_ompi_basic_linear(sendtmpbuf, recvbuf, count, datatype, op, root, comm);
1283     return;
1284   }
1285
1286   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1287     sendtmpbuf = static_cast<char *>(smpi_get_tmp_sendbuffer(count*smpi_datatype_get_extent(datatype)));
1288     smpi_datatype_copy(recvbuf, count, datatype,sendtmpbuf, count, datatype);
1289   }
1290
1291   if(rank != root) {
1292     // Send buffer to root
1293     smpi_mpi_send(sendtmpbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
1294   } else {
1295     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1296     // Local copy from root
1297     if (sendtmpbuf != nullptr && recvbuf != nullptr)
1298       smpi_datatype_copy(sendtmpbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1299     // Receive buffers from senders
1300     MPI_Request *requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1301     void **tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
1302     int index = 0;
1303     for (int src = 0; src < size; src++) {
1304       if (src != root) {
1305          if (!smpi_process_get_replaying())
1306           tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1307          else
1308            tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1309         requests[index] =
1310           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src, system_tag, comm);
1311         index++;
1312       }
1313     }
1314     // Wait for completion of irecv's.
1315     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1316     for (int src = 0; src < size - 1; src++) {
1317       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1318       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
1319       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1320         break;
1321       }else{
1322         smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1323       }
1324       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
1325         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1326     }
1327       for(index = 0; index < size - 1; index++) {
1328         smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1329       }
1330     xbt_free(tmpbufs);
1331     xbt_free(requests);
1332
1333   }
1334   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1335     smpi_free_tmp_buffer(sendtmpbuf);
1336   }
1337 }
1338
1339 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1340 {
1341   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1342   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
1343 }
1344
1345 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1346 {
1347   int system_tag = -888;
1348   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1349
1350   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1351   int size = smpi_comm_size(comm);
1352
1353   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1354
1355   // Local copy from self
1356   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1357
1358   // Send/Recv buffers to/from others;
1359   MPI_Request *requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1360   void **tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1361   int index = 0;
1362   for (int other = 0; other < rank; other++) {
1363     tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1364     requests[index] = smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag, comm);
1365     index++;
1366   }
1367   for (int other = rank + 1; other < size; other++) {
1368     requests[index] = smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1369     index++;
1370   }
1371   // Wait for completion of all comms.
1372   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1373
1374   if(smpi_op_is_commute(op)){
1375     for (int other = 0; other < size - 1; other++) {
1376       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1377       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1378         break;
1379       }
1380       if(index < rank) {
1381         // #Request is below rank: it's a irecv
1382         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1383       }
1384     }
1385   }else{
1386     //non commutative case, wait in order
1387     for (int other = 0; other < size - 1; other++) {
1388       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1389       if(index < rank) {
1390         smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1391       }
1392     }
1393   }
1394   for(index = 0; index < rank; index++) {
1395     smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1396   }
1397   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1398     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1399   }
1400   xbt_free(tmpbufs);
1401   xbt_free(requests);
1402 }
1403
1404 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count, MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1405 {
1406   int system_tag = -888;
1407   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1408   int recvbuf_is_empty=1;
1409   int rank = smpi_comm_rank(comm);
1410   int size = smpi_comm_size(comm);
1411
1412   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1413
1414   // Send/Recv buffers to/from others;
1415   MPI_Request *requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1416   void **tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1417   int index = 0;
1418   for (int other = 0; other < rank; other++) {
1419     tmpbufs[index] = smpi_get_tmp_sendbuffer(count * dataext);
1420     requests[index] = smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag, comm);
1421     index++;
1422   }
1423   for (int other = rank + 1; other < size; other++) {
1424     requests[index] = smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1425     index++;
1426   }
1427   // Wait for completion of all comms.
1428   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1429   if(smpi_op_is_commute(op)){
1430     for (int other = 0; other < size - 1; other++) {
1431       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1432       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1433         break;
1434       }
1435       if(index < rank) {
1436         if(recvbuf_is_empty){
1437           smpi_datatype_copy(tmpbufs[index], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1438           recvbuf_is_empty=0;
1439         } else
1440           // #Request is below rank: it's a irecv
1441           smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1442       }
1443     }
1444   }else{
1445     //non commutative case, wait in order
1446     for (int other = 0; other < size - 1; other++) {
1447       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1448       if(index < rank) {
1449           if(recvbuf_is_empty){
1450             smpi_datatype_copy(tmpbufs[other], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1451             recvbuf_is_empty=0;
1452           } else
1453             smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1454       }
1455     }
1456   }
1457   for(index = 0; index < rank; index++) {
1458     smpi_free_tmp_buffer(tmpbufs[index]);
1459   }
1460   for(index = 0; index < size-1; index++) {
1461     smpi_mpi_request_free(&requests[index]);
1462   }
1463   xbt_free(tmpbufs);
1464   xbt_free(requests);
1465 }