src/smpi/smpi_base.c

   1 /* Copyright (c) 2007-2013. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 #include "private.h"
   8 #include "xbt/virtu.h"
   9 #include "mc/mc.h"
  10 #include "xbt/replay.h"
  11 #include <errno.h>
  12 #include "simix/smx_private.h"
  13 #include "surf/surf.h"
  14 #include "simgrid/sg_config.h"
  15 #include "colls/colls.h"
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_base, smpi, "Logging specific to SMPI (base)");
  18
  19
  20 static int match_recv(void* a, void* b, smx_action_t ignored) {
  21    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  22    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  23    XBT_DEBUG("Trying to match a recv of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  24
  25   xbt_assert(ref, "Cannot match recv against null reference");
  26   xbt_assert(req, "Cannot match recv against null request");
  27   if((ref->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  28     && ((ref->tag == MPI_ANY_TAG && req->tag >=0) || req->tag == ref->tag)){
  29     //we match, we can transfer some values
  30     // FIXME : move this to the copy function ?
  31     if(ref->src == MPI_ANY_SOURCE)ref->real_src = req->src;
  32     if(ref->tag == MPI_ANY_TAG)ref->real_tag = req->tag;
  33     if(ref->real_size < req->real_size) ref->truncated = 1;
  34     if(req->detached==1){
  35         ref->detached_sender=req; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  36     }
  37     XBT_DEBUG("match succeeded");
  38     return 1;
  39   }else return 0;
  40 }
  41
  42 static int match_send(void* a, void* b,smx_action_t ignored) {
  43    MPI_Request ref = (MPI_Request)a;
  44    MPI_Request req = (MPI_Request)b;
  45    XBT_DEBUG("Trying to match a send of src %d against %d, tag %d against %d",ref->src,req->src, ref->tag, req->tag);
  46    xbt_assert(ref, "Cannot match send against null reference");
  47    xbt_assert(req, "Cannot match send against null request");
  48
  49    if((req->src == MPI_ANY_SOURCE || req->src == ref->src)
  50              && ((req->tag == MPI_ANY_TAG && ref->tag >=0)|| req->tag == ref->tag))
  51    {
  52      if(req->src == MPI_ANY_SOURCE)req->real_src = ref->src;
  53      if(req->tag == MPI_ANY_TAG)req->real_tag = ref->tag;
  54      if(req->real_size < ref->real_size) req->truncated = 1;
  55      if(ref->detached==1){
  56          req->detached_sender=ref; //tie the sender to the receiver, as it is detached and has to be freed in the receiver
  57      }
  58     XBT_DEBUG("match succeeded");
  59      return 1;
  60    } else return 0;
  61 }
  62
  63
  64 typedef struct s_smpi_factor *smpi_factor_t;
  65 typedef struct s_smpi_factor {
  66   long factor;
  67   int nb_values;
  68   double values[4];//arbitrary set to 4
  69 } s_smpi_factor_t;
  70 xbt_dynar_t smpi_os_values = NULL;
  71 xbt_dynar_t smpi_or_values = NULL;
  72 xbt_dynar_t smpi_ois_values = NULL;
  73
  74 // Methods used to parse and store the values for timing injections in smpi
  75 // These are taken from surf/network.c and generalized to have more factors
  76 // These methods should be merged with those in surf/network.c (moved somewhere in xbt ?)
  77
  78 static int factor_cmp(const void *pa, const void *pb)
  79 {
  80   return (((s_smpi_factor_t*)pa)->factor > ((s_smpi_factor_t*)pb)->factor);
  81 }
  82
  83
  84 static xbt_dynar_t parse_factor(const char *smpi_coef_string)
  85 {
  86   char *value = NULL;
  87   unsigned int iter = 0;
  88   s_smpi_factor_t fact;
  89   int i=0;
  90   xbt_dynar_t smpi_factor, radical_elements, radical_elements2 = NULL;
  91
  92   smpi_factor = xbt_dynar_new(sizeof(s_smpi_factor_t), NULL);
  93   radical_elements = xbt_str_split(smpi_coef_string, ";");
  94   xbt_dynar_foreach(radical_elements, iter, value) {
  95     fact.nb_values=0;
  96     radical_elements2 = xbt_str_split(value, ":");
  97     if (xbt_dynar_length(radical_elements2) <2 || xbt_dynar_length(radical_elements2) > 5)
  98       xbt_die("Malformed radical for smpi factor!");
  99     for(i =0; i<xbt_dynar_length(radical_elements2);i++ ){
 100         if (i==0){
 101            fact.factor = atol(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 102         }else{
 103            fact.values[fact.nb_values] = atof(xbt_dynar_get_as(radical_elements2, i, char *));
 104            fact.nb_values++;
 105         }
 106     }
 107
 108     xbt_dynar_push_as(smpi_factor, s_smpi_factor_t, fact);
 109     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 110     xbt_dynar_free(&radical_elements2);
 111   }
 112   xbt_dynar_free(&radical_elements);
 113   iter=0;
 114   xbt_dynar_sort(smpi_factor, &factor_cmp);
 115   xbt_dynar_foreach(smpi_factor, iter, fact) {
 116     XBT_DEBUG("smpi_factor:\t%ld : %d values, first: %f", fact.factor, fact.nb_values ,fact.values[0]);
 117   }
 118   return smpi_factor;
 119 }
 120
 121 static double smpi_os(double size)
 122 {
 123   if (!smpi_os_values) {
 124     smpi_os_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/os"));
 125     smpi_register_static(smpi_os_values, xbt_dynar_free_voidp);
 126   }
 127   unsigned int iter = 0;
 128   s_smpi_factor_t fact;
 129   double current=0.0;
 130   xbt_dynar_foreach(smpi_os_values, iter, fact) {
 131     if (size <= fact.factor) {
 132         XBT_DEBUG("os : %lf <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 133       return current;
 134     }else{
 135       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 136     }
 137   }
 138   XBT_DEBUG("os : %lf > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 139
 140   return current;
 141 }
 142
 143 static double smpi_ois(double size)
 144 {
 145   if (!smpi_ois_values) {
 146     smpi_ois_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/ois"));
 147     smpi_register_static(smpi_ois_values, xbt_dynar_free_voidp);
 148   }
 149   unsigned int iter = 0;
 150   s_smpi_factor_t fact;
 151   double current=0.0;
 152   xbt_dynar_foreach(smpi_ois_values, iter, fact) {
 153     if (size <= fact.factor) {
 154         XBT_DEBUG("ois : %lf <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 155       return current;
 156     }else{
 157       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 158     }
 159   }
 160   XBT_DEBUG("ois : %lf > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 161
 162   return current;
 163 }
 164
 165 static double smpi_or(double size)
 166 {
 167   if (!smpi_or_values) {
 168     smpi_or_values = parse_factor(sg_cfg_get_string("smpi/or"));
 169     smpi_register_static(smpi_or_values, xbt_dynar_free_voidp);
 170   }
 171   unsigned int iter = 0;
 172   s_smpi_factor_t fact;
 173   double current=0.0;
 174   xbt_dynar_foreach(smpi_or_values, iter, fact) {
 175     if (size <= fact.factor) {
 176         XBT_DEBUG("or : %lf <= %ld return %f", size, fact.factor, current);
 177       return current;
 178     }else
 179       current=fact.values[0]+fact.values[1]*size;
 180   }
 181   XBT_DEBUG("or : %lf > %ld return %f", size, fact.factor, current);
 182
 183   return current;
 184 }
 185
 186 static MPI_Request build_request(void *buf, int count,
 187                                  MPI_Datatype datatype, int src, int dst,
 188                                  int tag, MPI_Comm comm, unsigned flags)
 189 {
 190   MPI_Request request = NULL;
 191
 192   void *old_buf = NULL;
 193
 194   request = xbt_new(s_smpi_mpi_request_t, 1);
 195
 196   s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 197
 198   if(datatype->has_subtype == 1){
 199     // This part handles the problem of non-contiguous memory
 200     old_buf = buf;
 201     buf = count==0 ? NULL : xbt_malloc(count*smpi_datatype_size(datatype));
 202     if (flags & SEND) {
 203       subtype->serialize(old_buf, buf, count, datatype->substruct);
 204     }
 205   }
 206
 207   request->buf = buf;
 208   // This part handles the problem of non-contiguous memory (for the
 209   // unserialisation at the reception)
 210   request->old_buf = old_buf;
 211   request->old_type = datatype;
 212
 213   request->size = smpi_datatype_size(datatype) * count;
 214   request->src = src;
 215   request->dst = dst;
 216   request->tag = tag;
 217   request->comm = comm;
 218   request->action = NULL;
 219   request->flags = flags;
 220   request->detached = 0;
 221   request->detached_sender = NULL;
 222   request->real_src = 0;
 223
 224   request->truncated = 0;
 225   request->real_size = 0;
 226   request->real_tag = 0;
 227
 228   request->refcount=1;
 229 #ifdef HAVE_TRACING
 230   request->send = 0;
 231   request->recv = 0;
 232 #endif
 233   if (flags & SEND) smpi_datatype_unuse(datatype);
 234
 235   return request;
 236 }
 237
 238
 239 void smpi_empty_status(MPI_Status * status)
 240 {
 241   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 242     status->MPI_SOURCE = MPI_ANY_SOURCE;
 243     status->MPI_TAG = MPI_ANY_TAG;
 244     status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 245     status->count=0;
 246   }
 247 }
 248
 249 void smpi_action_trace_run(char *path)
 250 {
 251   char *name;
 252   xbt_dynar_t todo;
 253   xbt_dict_cursor_t cursor;
 254
 255   action_fp=NULL;
 256   if (path) {
 257     action_fp = fopen(path, "r");
 258     xbt_assert(action_fp != NULL, "Cannot open %s: %s", path,
 259                strerror(errno));
 260   }
 261
 262   if (!xbt_dict_is_empty(action_queues)) {
 263     XBT_WARN
 264       ("Not all actions got consumed. If the simulation ended successfully (without deadlock), you may want to add new processes to your deployment file.");
 265
 266
 267     xbt_dict_foreach(action_queues, cursor, name, todo) {
 268       XBT_WARN("Still %lu actions for %s", xbt_dynar_length(todo), name);
 269     }
 270   }
 271
 272   if (path)
 273     fclose(action_fp);
 274   xbt_dict_free(&action_queues);
 275   action_queues = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 276 }
 277
 278 static void smpi_mpi_request_free_voidp(void* request)
 279 {
 280   MPI_Request req = request;
 281   smpi_mpi_request_free(&req);
 282 }
 283
 284 /* MPI Low level calls */
 285 MPI_Request smpi_mpi_send_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 286                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 287 {
 288   MPI_Request request = NULL;
 289   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 290                           comm, PERSISTENT | SEND | PREPARED);
 291   request->refcount++;
 292   return request;
 293 }
 294
 295 MPI_Request smpi_mpi_ssend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 296                                int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 297 {
 298   MPI_Request request = NULL;
 299   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 300                           comm, PERSISTENT | SSEND | SEND | PREPARED);
 301   request->refcount++;
 302   return request;
 303 }
 304
 305 MPI_Request smpi_mpi_recv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 306                                int src, int tag, MPI_Comm comm)
 307 {
 308   MPI_Request request = NULL;
 309   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 310                           comm, PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 311   request->refcount++;
 312   return request;
 313 }
 314
 315 void smpi_mpi_start(MPI_Request request)
 316 {
 317   smx_rdv_t mailbox;
 318
 319   xbt_assert(!request->action,
 320              "Cannot (re)start a non-finished communication");
 321   if(request->flags & PREPARED)request->flags &= ~PREPARED;
 322   if(request->flags & RECV) {
 323     print_request("New recv", request);
 324     //FIXME: if receive is posted with a large size, but send is smaller, mailboxes may not match !
 325     if (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres"))
 326       mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 327     else
 328       mailbox = smpi_process_mailbox();
 329     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 330     request->real_size=request->size;
 331     smpi_datatype_use(request->old_type);
 332     smpi_comm_use(request->comm);
 333     request->action = simcall_comm_irecv(mailbox, request->buf, &request->real_size, &match_recv, request);
 334
 335     //integrate pseudo-timing for buffering of small messages, do not bother to execute the simcall if 0
 336     double sleeptime = request->detached ? smpi_or(request->size) : 0.0;
 337     if(sleeptime!=0.0){
 338         simcall_process_sleep(sleeptime);
 339         XBT_DEBUG("receiving size of %zu : sleep %lf ", request->size, smpi_or(request->size));
 340     }
 341
 342   } else {
 343
 344
 345     int receiver = request->dst;//smpi_group_index(smpi_comm_group(request->comm), request->dst);
 346
 347     #ifdef HAVE_TRACING
 348       int rank = smpi_process_index();
 349       if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 350         TRACE_smpi_send(rank, rank, receiver,request->size);
 351       }
 352     #endif
 353 /*    if(receiver == MPI_UNDEFINED) {*/
 354 /*      XBT_WARN("Trying to send a message to a wrong rank");*/
 355 /*      return;*/
 356 /*    }*/
 357     print_request("New send", request);
 358     if (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")) { // eager mode
 359       mailbox = smpi_process_remote_mailbox_small(receiver);
 360     }else{
 361       XBT_DEBUG("Send request %p is not in the permanent receive mailbox (buf: %p)",request,request->buf);
 362       mailbox = smpi_process_remote_mailbox(receiver);
 363     }
 364     if ( (! (request->flags & SSEND)) && (request->size < sg_cfg_get_int("smpi/send_is_detached_thres"))) {
 365       void *oldbuf = NULL;
 366       request->detached = 1;
 367       request->refcount++;
 368       if(request->old_type->has_subtype == 0){
 369         oldbuf = request->buf;
 370         if (oldbuf && request->size!=0){
 371           request->buf = xbt_malloc(request->size);
 372           memcpy(request->buf,oldbuf,request->size);
 373         }
 374       }
 375       XBT_DEBUG("Send request %p is detached; buf %p copied into %p",request,oldbuf,request->buf);
 376     }
 377
 378     // we make a copy here, as the size is modified by simix, and we may reuse the request in another receive later
 379     request->real_size=request->size;
 380     smpi_datatype_use(request->old_type);
 381     smpi_comm_use(request->comm);
 382
 383     //if we are giving back the control to the user without waiting for completion, we have to inject timings
 384     double sleeptime =0.0;
 385     if(request->detached || (request->flags & (ISEND|SSEND))){// issend should be treated as isend
 386       //isend and send timings may be different
 387       sleeptime = (request->flags & ISEND)? smpi_ois(request->size) : smpi_os(request->size);
 388     }
 389
 390     if(sleeptime!=0.0){
 391         simcall_process_sleep(sleeptime);
 392         XBT_DEBUG("sending size of %zu : sleep %lf ", request->size, smpi_os(request->size));
 393     }
 394
 395     request->action =
 396       simcall_comm_isend(mailbox, request->size, -1.0,
 397                          request->buf, request->real_size,
 398                          &match_send,
 399                          &smpi_mpi_request_free_voidp, // how to free the userdata if a detached send fails
 400                          request,
 401                          // detach if msg size < eager/rdv switch limit
 402                          request->detached);
 403
 404 #ifdef HAVE_TRACING
 405     /* FIXME: detached sends are not traceable (request->action == NULL) */
 406     if (request->action)
 407       simcall_set_category(request->action, TRACE_internal_smpi_get_category());
 408
 409 #endif
 410
 411   }
 412
 413 }
 414
 415 void smpi_mpi_startall(int count, MPI_Request * requests)
 416 {
 417   int i;
 418
 419   for(i = 0; i < count; i++) {
 420     smpi_mpi_start(requests[i]);
 421   }
 422 }
 423
 424 void smpi_mpi_request_free(MPI_Request * request)
 425 {
 426   if((*request) != MPI_REQUEST_NULL){
 427     (*request)->refcount--;
 428     if((*request)->refcount<0) xbt_die("wrong refcount");
 429
 430     if((*request)->refcount==0){
 431         print_request("Destroying", (*request));
 432         xbt_free(*request);
 433         *request = MPI_REQUEST_NULL;
 434     }else{
 435         print_request("Decrementing", (*request));
 436
 437     }
 438   }else{
 439       xbt_die("freeing an already free request");
 440   }
 441 }
 442
 443 MPI_Request smpi_isend_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 444                             int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 445 {
 446   MPI_Request request = NULL;
 447   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf , count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 448                           comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND | PREPARED);
 449   return request;
 450 }
 451
 452 MPI_Request smpi_mpi_isend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 453                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 454 {
 455   MPI_Request request = NULL;
 456   request =  build_request(buf==MPI_BOTTOM?(void*)0:buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 457                            comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SEND);
 458   smpi_mpi_start(request);
 459   return request;
 460 }
 461
 462 MPI_Request smpi_mpi_issend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 463                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 464 {
 465   MPI_Request request = NULL;
 466   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 467                           comm, NON_PERSISTENT | ISEND | SSEND | SEND);
 468   smpi_mpi_start(request);
 469   return request;
 470 }
 471
 472
 473
 474 MPI_Request smpi_irecv_init(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 475                             int src, int tag, MPI_Comm comm)
 476 {
 477   MPI_Request request = NULL;
 478   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 479                           comm, NON_PERSISTENT | RECV | PREPARED);
 480   return request;
 481 }
 482
 483 MPI_Request smpi_mpi_irecv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 484                            int src, int tag, MPI_Comm comm)
 485 {
 486   MPI_Request request = NULL;
 487   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, src == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src), smpi_process_index(), tag,
 488                           comm, NON_PERSISTENT | RECV);
 489   smpi_mpi_start(request);
 490   return request;
 491 }
 492
 493 void smpi_mpi_recv(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int src,
 494                    int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 495 {
 496   MPI_Request request = NULL;
 497   request = smpi_mpi_irecv(buf, count, datatype, src, tag, comm);
 498   smpi_mpi_wait(&request, status);
 499   request = NULL;
 500 }
 501
 502
 503
 504 void smpi_mpi_send(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int dst,
 505                    int tag, MPI_Comm comm)
 506 {
 507   MPI_Request request = NULL;
 508   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 509                           comm, NON_PERSISTENT | SEND);
 510
 511   smpi_mpi_start(request);
 512   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 513   request = NULL;
 514 }
 515
 516 void smpi_mpi_ssend(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype,
 517                            int dst, int tag, MPI_Comm comm)
 518 {
 519   MPI_Request request = NULL;
 520   request = build_request(buf==MPI_BOTTOM ? (void*)0 : buf, count, datatype, smpi_process_index(), smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst), tag,
 521                 comm, NON_PERSISTENT | SSEND | SEND);
 522
 523   smpi_mpi_start(request);
 524   smpi_mpi_wait(&request, MPI_STATUS_IGNORE);
 525   request = NULL;
 526 }
 527
 528 void smpi_mpi_sendrecv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 529                        int dst, int sendtag, void *recvbuf, int recvcount,
 530                        MPI_Datatype recvtype, int src, int recvtag,
 531                        MPI_Comm comm, MPI_Status * status)
 532 {
 533   MPI_Request requests[2];
 534   MPI_Status stats[2];
 535   int myid=smpi_process_index();
 536   if ((smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), dst) == myid) && (smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), src) == myid)) {
 537       smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 538                                      recvbuf, recvcount, recvtype);
 539       return;
 540   }
 541   requests[0] =
 542     smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, dst, sendtag, comm);
 543   requests[1] =
 544     smpi_irecv_init(recvbuf, recvcount, recvtype, src, recvtag, comm);
 545   smpi_mpi_startall(2, requests);
 546   smpi_mpi_waitall(2, requests, stats);
 547   if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 548     // Copy receive status
 549     *status = stats[1];
 550   }
 551 }
 552
 553 int smpi_mpi_get_count(MPI_Status * status, MPI_Datatype datatype)
 554 {
 555   return status->count / smpi_datatype_size(datatype);
 556 }
 557
 558 static void finish_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 559 {
 560   MPI_Request req = *request;
 561   smpi_empty_status(status);
 562
 563   if(!(req->detached && req->flags & SEND) && !(req->flags & PREPARED)){
 564     if(status != MPI_STATUS_IGNORE) {
 565       int src = req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src;
 566       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(req->comm), src);
 567       status->MPI_TAG = req->tag == MPI_ANY_TAG ? req->real_tag : req->tag;
 568       status->MPI_ERROR = req->truncated ? MPI_ERR_TRUNCATE : MPI_SUCCESS;
 569       // this handles the case were size in receive differs from size in send
 570       // FIXME: really this should just contain the count of receive-type blocks,
 571       // right?
 572       status->count = req->real_size;
 573     }
 574
 575     print_request("Finishing", req);
 576     MPI_Datatype datatype = req->old_type;
 577
 578     if(datatype->has_subtype == 1){
 579       // This part handles the problem of non-contignous memory
 580       // the unserialization at the reception
 581       s_smpi_subtype_t *subtype = datatype->substruct;
 582       if(req->flags & RECV) {
 583         subtype->unserialize(req->buf, req->old_buf, req->real_size/smpi_datatype_size(datatype) , datatype->substruct);
 584       }
 585       if(req->detached == 0) free(req->buf);
 586     }
 587     smpi_comm_unuse(req->comm);
 588     smpi_datatype_unuse(datatype);
 589
 590   }
 591
 592 #ifdef HAVE_TRACING
 593   if (TRACE_smpi_view_internals()) {
 594     if(req->flags & RECV){
 595       int rank = smpi_process_index();
 596       int src_traced = (req->src == MPI_ANY_SOURCE ? req->real_src : req->src);
 597       TRACE_smpi_recv(rank, src_traced, rank);
 598     }
 599   }
 600 #endif
 601
 602   if(req->detached_sender!=NULL){
 603     smpi_mpi_request_free(&(req->detached_sender));
 604   }
 605
 606   if(req->flags & NON_PERSISTENT) {
 607     smpi_mpi_request_free(request);
 608   } else {
 609     req->action = NULL;
 610   }
 611 }
 612
 613 int smpi_mpi_test(MPI_Request * request, MPI_Status * status) {
 614   int flag;
 615
 616   //assume that request is not MPI_REQUEST_NULL (filtered in PMPI_Test or smpi_mpi_testall before)
 617   if ((*request)->action == NULL)
 618     flag = 1;
 619   else
 620     flag = simcall_comm_test((*request)->action);
 621   if(flag) {
 622     finish_wait(request, status);
 623     *request = MPI_REQUEST_NULL;
 624   }else{
 625     smpi_empty_status(status);
 626   }
 627   return flag;
 628 }
 629
 630 int smpi_mpi_testany(int count, MPI_Request requests[], int *index,
 631                      MPI_Status * status)
 632 {
 633   xbt_dynar_t comms;
 634   int i, flag, size;
 635   int* map;
 636
 637   *index = MPI_UNDEFINED;
 638   flag = 0;
 639   comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
 640   map = xbt_new(int, count);
 641   size = 0;
 642   for(i = 0; i < count; i++) {
 643     if((requests[i]!=MPI_REQUEST_NULL) && requests[i]->action) {
 644        xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 645        map[size] = i;
 646        size++;
 647     }
 648   }
 649   if(size > 0) {
 650     i = simcall_comm_testany(comms);
 651     // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 652     if(i != -1) {
 653       *index = map[i];
 654       finish_wait(&requests[*index], status);
 655       flag = 1;
 656     }
 657   }else{
 658       //all requests are null or inactive, return true
 659       flag=1;
 660       smpi_empty_status(status);
 661   }
 662   xbt_free(map);
 663   xbt_dynar_free(&comms);
 664
 665   return flag;
 666 }
 667
 668
 669 int smpi_mpi_testall(int count, MPI_Request requests[],
 670                      MPI_Status status[])
 671 {
 672   MPI_Status stat;
 673   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 674   int flag=1;
 675   int i;
 676   for(i=0; i<count; i++){
 677     if(requests[i]!= MPI_REQUEST_NULL){
 678       if (smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)!=1){
 679         flag=0;
 680       }else{
 681           requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 682       }
 683     }else{
 684       smpi_empty_status(pstat);
 685     }
 686     if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 687       status[i] = *pstat;
 688     }
 689   }
 690   return flag;
 691 }
 692
 693 void smpi_mpi_probe(int source, int tag, MPI_Comm comm, MPI_Status* status){
 694   int flag=0;
 695   //FIXME find another wait to avoid busy waiting ?
 696   // the issue here is that we have to wait on a nonexistent comm
 697   while(flag==0){
 698     smpi_mpi_iprobe(source, tag, comm, &flag, status);
 699     XBT_DEBUG("Busy Waiting on probing : %d", flag);
 700   }
 701 }
 702
 703 void smpi_mpi_iprobe(int source, int tag, MPI_Comm comm, int* flag, MPI_Status* status){
 704
 705   MPI_Request request =build_request(NULL, 0, MPI_CHAR, source == MPI_ANY_SOURCE ? MPI_ANY_SOURCE : smpi_group_index(smpi_comm_group(comm), source), smpi_comm_rank(comm), tag,
 706             comm, NON_PERSISTENT | RECV);
 707
 708   //to avoid deadlock, we have to sleep some time here, or the timer won't advance and we will only do iprobe simcalls
 709   double sleeptime= sg_cfg_get_double("smpi/iprobe");
 710   //multiplier to the sleeptime, to increase speed of execution, each failed iprobe will increase it
 711   static int nsleeps = 1;
 712
 713   simcall_process_sleep(sleeptime);
 714
 715   // behave like a receive, but don't do it
 716   smx_rdv_t mailbox;
 717
 718   print_request("New iprobe", request);
 719   // We have to test both mailboxes as we don't know if we will receive one one or another
 720     if (sg_cfg_get_int("smpi/async_small_thres")>0){
 721         mailbox = smpi_process_mailbox_small();
 722         XBT_DEBUG("trying to probe the perm recv mailbox");
 723         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 724     }
 725     if (request->action==NULL){
 726         mailbox = smpi_process_mailbox();
 727         XBT_DEBUG("trying to probe the other mailbox");
 728         request->action = simcall_comm_iprobe(mailbox, request->src, request->tag, &match_recv, (void*)request);
 729     }
 730
 731   if(request->action){
 732     MPI_Request req = (MPI_Request)SIMIX_comm_get_src_data(request->action);
 733     *flag = 1;
 734     if(status != MPI_STATUS_IGNORE && !(req->flags & PREPARED)) {
 735       status->MPI_SOURCE = smpi_group_rank(smpi_comm_group(comm), req->src);
 736       status->MPI_TAG = req->tag;
 737       status->MPI_ERROR = MPI_SUCCESS;
 738       status->count = req->real_size;
 739     }
 740     nsleeps=1;//reset the number of sleeps we will do next time
 741   }
 742   else {
 743       *flag = 0;
 744       nsleeps++;
 745   }
 746   smpi_mpi_request_free(&request);
 747
 748   return;
 749 }
 750
 751 void smpi_mpi_wait(MPI_Request * request, MPI_Status * status)
 752 {
 753   print_request("Waiting", *request);
 754   if ((*request)->action != NULL) { // this is not a detached send
 755     simcall_comm_wait((*request)->action, -1.0);
 756   }
 757
 758 #ifdef HAVE_MC
 759   if(MC_is_active())
 760     (*request)->action->comm.dst_data = NULL; // dangling pointer : dst_data is freed with a wait, need to set it to NULL for system state comparison
 761 #endif
 762
 763   finish_wait(request, status);
 764   *request = MPI_REQUEST_NULL;
 765   // FIXME for a detached send, finish_wait is not called:
 766 }
 767
 768 int smpi_mpi_waitany(int count, MPI_Request requests[],
 769                      MPI_Status * status)
 770 {
 771   xbt_dynar_t comms;
 772   int i, size, index;
 773   int *map;
 774
 775   index = MPI_UNDEFINED;
 776   if(count > 0) {
 777     // Wait for a request to complete
 778     comms = xbt_dynar_new(sizeof(smx_action_t), NULL);
 779     map = xbt_new(int, count);
 780     size = 0;
 781     XBT_DEBUG("Wait for one of %d", count);
 782     for(i = 0; i < count; i++) {
 783       if(requests[i] != MPI_REQUEST_NULL) {
 784         if (requests[i]->action != NULL) {
 785           XBT_DEBUG("Waiting any %p ", requests[i]);
 786           xbt_dynar_push(comms, &requests[i]->action);
 787           map[size] = i;
 788           size++;
 789         }else{
 790          //This is a finished detached request, let's return this one
 791          size=0;//so we free the dynar but don't do the waitany call
 792          index=i;
 793          finish_wait(&requests[i], status);//cleanup if refcount = 0
 794          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;//set to null
 795          break;
 796          }
 797       }
 798     }
 799     if(size > 0) {
 800       i = simcall_comm_waitany(comms);
 801
 802       // not MPI_UNDEFINED, as this is a simix return code
 803       if (i != -1) {
 804         index = map[i];
 805         finish_wait(&requests[index], status);
 806       }
 807     }
 808     xbt_free(map);
 809     xbt_dynar_free(&comms);
 810   }
 811
 812   if (index==MPI_UNDEFINED)
 813     smpi_empty_status(status);
 814
 815   return index;
 816 }
 817
 818 int smpi_mpi_waitall(int count, MPI_Request requests[],
 819                       MPI_Status status[])
 820 {
 821   int  index, c;
 822   MPI_Status stat;
 823   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 824   int retvalue = MPI_SUCCESS;
 825   //tag invalid requests in the set
 826   if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 827     for (c = 0; c < count; c++) {
 828       if (requests[c] == MPI_REQUEST_NULL || requests[c]->dst == MPI_PROC_NULL) {
 829         smpi_empty_status(&status[c]);
 830       } else if (requests[c]->src == MPI_PROC_NULL) {
 831         smpi_empty_status(&status[c]);
 832         status[c].MPI_SOURCE = MPI_PROC_NULL;
 833       }
 834     }
 835   }
 836   for(c = 0; c < count; c++) {
 837     if (MC_is_active()) {
 838       smpi_mpi_wait(&requests[c], pstat);
 839       index = c;
 840     } else {
 841       index = smpi_mpi_waitany(count, requests, pstat);
 842       if (index == MPI_UNDEFINED)
 843         break;
 844       requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
 845     }
 846     if (status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 847       status[index] = *pstat;
 848       if (status[index].MPI_ERROR == MPI_ERR_TRUNCATE)
 849         retvalue = MPI_ERR_IN_STATUS;
 850     }
 851   }
 852
 853   return retvalue;
 854 }
 855
 856 int smpi_mpi_waitsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
 857                       MPI_Status status[])
 858 {
 859   int i, count, index;
 860   MPI_Status stat;
 861   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 862
 863   count = 0;
 864   for(i = 0; i < incount; i++)
 865   {
 866     index=smpi_mpi_waitany(incount, requests, pstat);
 867     if(index!=MPI_UNDEFINED){
 868       indices[count] = index;
 869       count++;
 870       if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 871         status[index] = *pstat;
 872       }
 873      requests[index]=MPI_REQUEST_NULL;
 874     }else{
 875       return MPI_UNDEFINED;
 876     }
 877   }
 878   return count;
 879 }
 880
 881 int smpi_mpi_testsome(int incount, MPI_Request requests[], int *indices,
 882                       MPI_Status status[])
 883 {
 884   int i, count, count_dead;
 885   MPI_Status stat;
 886   MPI_Status *pstat = status == MPI_STATUSES_IGNORE ? MPI_STATUS_IGNORE : &stat;
 887
 888   count = 0;
 889   count_dead = 0;
 890   for(i = 0; i < incount; i++) {
 891     if((requests[i] != MPI_REQUEST_NULL)) {
 892       if(smpi_mpi_test(&requests[i], pstat)) {
 893          indices[i] = 1;
 894          count++;
 895          if(status != MPI_STATUSES_IGNORE) {
 896            status[i] = *pstat;
 897          }
 898          requests[i]=MPI_REQUEST_NULL;
 899
 900       }
 901     }else{
 902       count_dead++;
 903     }
 904   }
 905   if(count_dead==incount)return MPI_UNDEFINED;
 906   else return count;
 907 }
 908
 909 void smpi_mpi_bcast(void *buf, int count, MPI_Datatype datatype, int root,
 910                     MPI_Comm comm)
 911 {
 912   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
 913   nary_tree_bcast(buf, count, datatype, root, comm, 4);
 914 }
 915
 916 void smpi_mpi_barrier(MPI_Comm comm)
 917 {
 918   // arity=2: a binary tree, arity=4 seem to be a good setting (see P2P-MPI))
 919   nary_tree_barrier(comm, 4);
 920 }
 921
 922 void smpi_mpi_gather(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 923                      void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
 924                      int root, MPI_Comm comm)
 925 {
 926   int system_tag = COLL_TAG_GATHER;
 927   int rank, size, src, index;
 928   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
 929   MPI_Request *requests;
 930
 931   rank = smpi_comm_rank(comm);
 932   size = smpi_comm_size(comm);
 933   if(rank != root) {
 934     // Send buffer to root
 935     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
 936   } else {
 937     // FIXME: check for errors
 938     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
 939     // Local copy from root
 940     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
 941                        (char *)recvbuf + root * recvcount * recvext, recvcount, recvtype);
 942     // Receive buffers from senders
 943     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
 944     index = 0;
 945     for(src = 0; src < size; src++) {
 946       if(src != root) {
 947         requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + src * recvcount * recvext,
 948                                           recvcount, recvtype,
 949                                           src, system_tag, comm);
 950         index++;
 951       }
 952     }
 953     // Wait for completion of irecv's.
 954     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
 955     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 956     xbt_free(requests);
 957   }
 958 }
 959
 960
 961 void smpi_mpi_reduce_scatter(void *sendbuf, void *recvbuf, int *recvcounts,
 962                        MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
 963 {
 964     int i, size, count;
 965     int *displs;
 966     int rank = smpi_process_index();
 967     void *tmpbuf;
 968
 969     /* arbitrarily choose root as rank 0 */
 970     size = smpi_comm_size(comm);
 971     count = 0;
 972     displs = xbt_new(int, size);
 973     for (i = 0; i < size; i++) {
 974       displs[i] = count;
 975       count += recvcounts[i];
 976     }
 977     tmpbuf=(void*)xbt_malloc(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
 978     mpi_coll_reduce_fun(sendbuf, tmpbuf, count, datatype, op, 0, comm);
 979     smpi_mpi_scatterv(tmpbuf, recvcounts, displs, datatype, recvbuf,
 980                       recvcounts[rank], datatype, 0, comm);
 981     xbt_free(displs);
 982     xbt_free(tmpbuf);
 983 }
 984
 985 void smpi_mpi_gatherv(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
 986                       void *recvbuf, int *recvcounts, int *displs,
 987                       MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
 988 {
 989   int system_tag = COLL_TAG_GATHERV;
 990   int rank, size, src, index;
 991   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
 992   MPI_Request *requests;
 993
 994   rank = smpi_comm_rank(comm);
 995   size = smpi_comm_size(comm);
 996   if(rank != root) {
 997     // Send buffer to root
 998     smpi_mpi_send(sendbuf, sendcount, sendtype, root, system_tag, comm);
 999   } else {
1000     // FIXME: check for errors
1001     smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1002     // Local copy from root
1003     smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1004                        (char *)recvbuf + displs[root] * recvext,
1005                        recvcounts[root], recvtype);
1006     // Receive buffers from senders
1007     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1008     index = 0;
1009     for(src = 0; src < size; src++) {
1010       if(src != root) {
1011         requests[index] =
1012           smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[src] * recvext,
1013                           recvcounts[src], recvtype, src, system_tag, comm);
1014         index++;
1015       }
1016     }
1017     // Wait for completion of irecv's.
1018     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1019     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1020     xbt_free(requests);
1021   }
1022 }
1023
1024 void smpi_mpi_allgather(void *sendbuf, int sendcount,
1025                         MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1026                         int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1027                         MPI_Comm comm)
1028 {
1029   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHER;
1030   int rank, size, other, index;
1031   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1032   MPI_Request *requests;
1033
1034   rank = smpi_comm_rank(comm);
1035   size = smpi_comm_size(comm);
1036   // FIXME: check for errors
1037   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1038   // Local copy from self
1039   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1040                      (char *)recvbuf + rank * recvcount * recvext, recvcount,
1041                      recvtype);
1042   // Send/Recv buffers to/from others;
1043   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1044   index = 0;
1045   for(other = 0; other < size; other++) {
1046     if(other != rank) {
1047       requests[index] =
1048         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1049                         comm);
1050       index++;
1051       requests[index] = smpi_irecv_init((char *)recvbuf + other * recvcount * recvext,
1052                                         recvcount, recvtype, other,
1053                                         system_tag, comm);
1054       index++;
1055     }
1056   }
1057   // Wait for completion of all comms.
1058   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1059   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1060   xbt_free(requests);
1061 }
1062
1063 void smpi_mpi_allgatherv(void *sendbuf, int sendcount,
1064                          MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf,
1065                          int *recvcounts, int *displs,
1066                          MPI_Datatype recvtype, MPI_Comm comm)
1067 {
1068   int system_tag = COLL_TAG_ALLGATHERV;
1069   int rank, size, other, index;
1070   MPI_Aint lb = 0, recvext = 0;
1071   MPI_Request *requests;
1072
1073   rank = smpi_comm_rank(comm);
1074   size = smpi_comm_size(comm);
1075   // FIXME: check for errors
1076   smpi_datatype_extent(recvtype, &lb, &recvext);
1077   // Local copy from self
1078   smpi_datatype_copy(sendbuf, sendcount, sendtype,
1079                      (char *)recvbuf + displs[rank] * recvext,
1080                      recvcounts[rank], recvtype);
1081   // Send buffers to others;
1082   requests = xbt_new(MPI_Request, 2 * (size - 1));
1083   index = 0;
1084   for(other = 0; other < size; other++) {
1085     if(other != rank) {
1086       requests[index] =
1087         smpi_isend_init(sendbuf, sendcount, sendtype, other, system_tag,
1088                         comm);
1089       index++;
1090       requests[index] =
1091         smpi_irecv_init((char *)recvbuf + displs[other] * recvext, recvcounts[other],
1092                         recvtype, other, system_tag, comm);
1093       index++;
1094     }
1095   }
1096   // Wait for completion of all comms.
1097   smpi_mpi_startall(2 * (size - 1), requests);
1098   smpi_mpi_waitall(2 * (size - 1), requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1099   xbt_free(requests);
1100 }
1101
1102 void smpi_mpi_scatter(void *sendbuf, int sendcount, MPI_Datatype sendtype,
1103                       void *recvbuf, int recvcount, MPI_Datatype recvtype,
1104                       int root, MPI_Comm comm)
1105 {
1106   int system_tag = COLL_TAG_SCATTER;
1107   int rank, size, dst, index;
1108   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1109   MPI_Request *requests;
1110
1111   rank = smpi_comm_rank(comm);
1112   size = smpi_comm_size(comm);
1113   if(rank != root) {
1114     // Recv buffer from root
1115     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1116                   MPI_STATUS_IGNORE);
1117   } else {
1118     // FIXME: check for errors
1119     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1120     // Local copy from root
1121     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1122         smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + root * sendcount * sendext,
1123                            sendcount, sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1124     }
1125     // Send buffers to receivers
1126     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1127     index = 0;
1128     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1129       if(dst != root) {
1130         requests[index] = smpi_isend_init((char *)sendbuf + dst * sendcount * sendext,
1131                                           sendcount, sendtype, dst,
1132                                           system_tag, comm);
1133         index++;
1134       }
1135     }
1136     // Wait for completion of isend's.
1137     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1138     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1139     xbt_free(requests);
1140   }
1141 }
1142
1143 void smpi_mpi_scatterv(void *sendbuf, int *sendcounts, int *displs,
1144                        MPI_Datatype sendtype, void *recvbuf, int recvcount,
1145                        MPI_Datatype recvtype, int root, MPI_Comm comm)
1146 {
1147   int system_tag = COLL_TAG_SCATTERV;
1148   int rank, size, dst, index;
1149   MPI_Aint lb = 0, sendext = 0;
1150   MPI_Request *requests;
1151
1152   rank = smpi_comm_rank(comm);
1153   size = smpi_comm_size(comm);
1154   if(rank != root) {
1155     // Recv buffer from root
1156     smpi_mpi_recv(recvbuf, recvcount, recvtype, root, system_tag, comm,
1157                   MPI_STATUS_IGNORE);
1158   } else {
1159     // FIXME: check for errors
1160     smpi_datatype_extent(sendtype, &lb, &sendext);
1161     // Local copy from root
1162     if(recvbuf!=MPI_IN_PLACE){
1163       smpi_datatype_copy((char *)sendbuf + displs[root] * sendext, sendcounts[root],
1164                        sendtype, recvbuf, recvcount, recvtype);
1165     }
1166     // Send buffers to receivers
1167     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1168     index = 0;
1169     for(dst = 0; dst < size; dst++) {
1170       if(dst != root) {
1171         requests[index] =
1172           smpi_isend_init((char *)sendbuf + displs[dst] * sendext, sendcounts[dst],
1173                           sendtype, dst, system_tag, comm);
1174         index++;
1175       }
1176     }
1177     // Wait for completion of isend's.
1178     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1179     smpi_mpi_waitall(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1180     xbt_free(requests);
1181   }
1182 }
1183
1184 void smpi_mpi_reduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1185                      MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, int root,
1186                      MPI_Comm comm)
1187 {
1188   int system_tag = COLL_TAG_REDUCE;
1189   int rank, size, src, index;
1190   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1191   MPI_Request *requests;
1192   void **tmpbufs;
1193
1194
1195   char* sendtmpbuf = (char*) sendbuf;
1196   if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1197     sendtmpbuf = (char *)xbt_malloc(count*smpi_datatype_get_extent(datatype));
1198     smpi_datatype_copy(recvbuf, count, datatype,sendtmpbuf, count, datatype);
1199   }
1200
1201   rank = smpi_comm_rank(comm);
1202   size = smpi_comm_size(comm);
1203   //non commutative case, use a working algo from openmpi
1204   if(!smpi_op_is_commute(op)){
1205     smpi_coll_tuned_reduce_ompi_basic_linear(sendtmpbuf, recvbuf, count,
1206                      datatype, op, root, comm);
1207     return;
1208   }
1209
1210   if(rank != root) {
1211     // Send buffer to root
1212     smpi_mpi_send(sendtmpbuf, count, datatype, root, system_tag, comm);
1213   } else {
1214     // FIXME: check for errors
1215     smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1216     // Local copy from root
1217     if (sendtmpbuf && recvbuf)
1218       smpi_datatype_copy(sendtmpbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1219     // Receive buffers from senders
1220     //TODO: make a MPI_barrier here ?
1221     requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1222     tmpbufs = xbt_new(void *, size - 1);
1223     index = 0;
1224     for(src = 0; src < size; src++) {
1225       if(src != root) {
1226         // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1227         //  mapping...
1228         tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1229         requests[index] =
1230           smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, src,
1231                           system_tag, comm);
1232         index++;
1233       }
1234     }
1235     // Wait for completion of irecv's.
1236     smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1237     for(src = 0; src < size - 1; src++) {
1238       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1239       XBT_DEBUG("finished waiting any request with index %d", index);
1240       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1241         break;
1242       }
1243       if(op) /* op can be MPI_OP_NULL that does nothing */
1244         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1245     }
1246     for(index = 0; index < size - 1; index++) {
1247       xbt_free(tmpbufs[index]);
1248     }
1249     xbt_free(tmpbufs);
1250     xbt_free(requests);
1251
1252     if( sendbuf == MPI_IN_PLACE ) {
1253       xbt_free(sendtmpbuf);
1254     }
1255   }
1256 }
1257
1258 void smpi_mpi_allreduce(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1259                         MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1260 {
1261   smpi_mpi_reduce(sendbuf, recvbuf, count, datatype, op, 0, comm);
1262   smpi_mpi_bcast(recvbuf, count, datatype, 0, comm);
1263 }
1264
1265 void smpi_mpi_scan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1266                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1267 {
1268   int system_tag = -888;
1269   int rank, size, other, index;
1270   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1271   MPI_Request *requests;
1272   void **tmpbufs;
1273
1274   rank = smpi_comm_rank(comm);
1275   size = smpi_comm_size(comm);
1276
1277   // FIXME: check for errors
1278   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1279
1280   // Local copy from self
1281   smpi_datatype_copy(sendbuf, count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1282
1283   // Send/Recv buffers to/from others;
1284   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1285   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1286   index = 0;
1287   for(other = 0; other < rank; other++) {
1288     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1289     // mapping...
1290     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1291     requests[index] =
1292       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1293                       comm);
1294     index++;
1295   }
1296   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1297     requests[index] =
1298       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1299     index++;
1300   }
1301   // Wait for completion of all comms.
1302   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1303
1304   if(smpi_op_is_commute(op)){
1305     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1306       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1307       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1308         break;
1309       }
1310       if(index < rank) {
1311         // #Request is below rank: it's a irecv
1312         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1313       }
1314     }
1315   }else{
1316     //non commutative case, wait in order
1317     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1318       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1319       if(index < rank) {
1320         smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1321       }
1322     }
1323   }
1324   for(index = 0; index < rank; index++) {
1325     xbt_free(tmpbufs[index]);
1326   }
1327   xbt_free(tmpbufs);
1328   xbt_free(requests);
1329 }
1330
1331 void smpi_mpi_exscan(void *sendbuf, void *recvbuf, int count,
1332                    MPI_Datatype datatype, MPI_Op op, MPI_Comm comm)
1333 {
1334   int system_tag = -888;
1335   int rank, size, other, index;
1336   MPI_Aint lb = 0, dataext = 0;
1337   MPI_Request *requests;
1338   void **tmpbufs;
1339   int recvbuf_is_empty=1;
1340   rank = smpi_comm_rank(comm);
1341   size = smpi_comm_size(comm);
1342
1343   // FIXME: check for errors
1344   smpi_datatype_extent(datatype, &lb, &dataext);
1345
1346   // Send/Recv buffers to/from others;
1347   requests = xbt_new(MPI_Request, size - 1);
1348   tmpbufs = xbt_new(void *, rank);
1349   index = 0;
1350   for(other = 0; other < rank; other++) {
1351     // FIXME: possibly overkill we we have contiguous/noncontiguous data
1352     // mapping...
1353     tmpbufs[index] = xbt_malloc(count * dataext);
1354     requests[index] =
1355       smpi_irecv_init(tmpbufs[index], count, datatype, other, system_tag,
1356                       comm);
1357     index++;
1358   }
1359   for(other = rank + 1; other < size; other++) {
1360     requests[index] =
1361       smpi_isend_init(sendbuf, count, datatype, other, system_tag, comm);
1362     index++;
1363   }
1364   // Wait for completion of all comms.
1365   smpi_mpi_startall(size - 1, requests);
1366   if(smpi_op_is_commute(op)){
1367     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1368       index = smpi_mpi_waitany(size - 1, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
1369       if(index == MPI_UNDEFINED) {
1370         break;
1371       }
1372       if(index < rank) {
1373         if(recvbuf_is_empty){
1374           smpi_datatype_copy(tmpbufs[index], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1375           recvbuf_is_empty=0;
1376         }else
1377         // #Request is below rank: it's a irecv
1378         smpi_op_apply(op, tmpbufs[index], recvbuf, &count, &datatype);
1379       }
1380     }
1381   }else{
1382     //non commutative case, wait in order
1383     for(other = 0; other < size - 1; other++) {
1384       smpi_mpi_wait(&(requests[other]), MPI_STATUS_IGNORE);
1385       if(index < rank) {
1386           if(recvbuf_is_empty){
1387             smpi_datatype_copy(tmpbufs[other], count, datatype, recvbuf, count, datatype);
1388             recvbuf_is_empty=0;
1389           }else smpi_op_apply(op, tmpbufs[other], recvbuf, &count, &datatype);
1390       }
1391     }
1392   }
1393   for(index = 0; index < rank; index++) {
1394     xbt_free(tmpbufs[index]);
1395   }
1396   xbt_free(tmpbufs);
1397   xbt_free(requests);
1398 }