src/smpi/colls/allgather-mvapich-smp.c

   1 /* Copyright (c) 2013-2014. The SimGrid Team.
   2  * All rights reserved.                                                     */
   3
   4 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   5  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   6
   7 /*
   8  * Copyright (c) 2004-2005 The Trustees of Indiana University and Indiana
   9  *                         University Research and Technology
  10  *                         Corporation.  All rights reserved.
  11  * Copyright (c) 2004-2009 The University of Tennessee and The University
  12  *                         of Tennessee Research Foundation.  All rights
  13  *                         reserved.
  14  * Copyright (c) 2004-2005 High Performance Computing Center Stuttgart,
  15  *                         University of Stuttgart.  All rights reserved.
  16  * Copyright (c) 2004-2005 The Regents of the University of California.
  17  *                         All rights reserved.
  18  *
  19  * Additional copyrights may follow
  20  */
  21  /* -*- Mode: C; c-basic-offset:4 ; -*- */
  22 /* Copyright (c) 2001-2014, The Ohio State University. All rights
  23  * reserved.
  24  *
  25  * This file is part of the MVAPICH2 software package developed by the
  26  * team members of The Ohio State University's Network-Based Computing
  27  * Laboratory (NBCL), headed by Professor Dhabaleswar K. (DK) Panda.
  28  *
  29  * For detailed copyright and licensing information, please refer to the
  30  * copyright file COPYRIGHT in the top level MVAPICH2 directory.
  31  */
  32 /*
  33  *
  34  *  (C) 2001 by Argonne National Laboratory.
  35  *      See COPYRIGHT in top-level directory.
  36  */
  37  #include "colls_private.h"
  38
  39
  40
  41 int smpi_coll_tuned_allgather_mvapich2_smp(void *sendbuf,int sendcnt, MPI_Datatype sendtype,
  42                             void *recvbuf, int recvcnt,MPI_Datatype recvtype,
  43                             MPI_Comm  comm)
  44 {
  45     int rank, size;
  46     int local_rank, local_size;
  47     int leader_comm_size = 0;
  48     int mpi_errno = MPI_SUCCESS;
  49     MPI_Aint recvtype_extent = 0;  /* Datatype extent */
  50     MPI_Comm shmem_comm, leader_comm;
  51
  52   if(smpi_comm_get_leaders_comm(comm)==MPI_COMM_NULL){
  53     smpi_comm_init_smp(comm);
  54   }
  55
  56     if(!smpi_comm_is_uniform(comm) || !smpi_comm_is_blocked(comm))
  57     THROWF(arg_error,0, "allgather MVAPICH2 smp algorithm can't be used with irregular deployment. Please insure that processes deployed on the same node are contiguous and that each node has the same number of processes");
  58
  59     if (recvcnt == 0) {
  60         return MPI_SUCCESS;
  61     }
  62
  63     rank = smpi_comm_rank(comm);
  64     size = smpi_comm_size(comm);
  65
  66     /* extract the rank,size information for the intra-node communicator */
  67     recvtype_extent=smpi_datatype_get_extent(recvtype);
  68
  69     shmem_comm = smpi_comm_get_intra_comm(comm);
  70     local_rank = smpi_comm_rank(shmem_comm);
  71     local_size = smpi_comm_size(shmem_comm);
  72
  73     if (local_rank == 0) {
  74         /* Node leader. Extract the rank, size information for the leader communicator */
  75         leader_comm = smpi_comm_get_leaders_comm(comm);
  76         if(leader_comm==MPI_COMM_NULL){
  77           leader_comm = MPI_COMM_WORLD;
  78         }
  79         leader_comm_size = smpi_comm_size(leader_comm);
  80     }
  81
  82     /*If there is just one node, after gather itself,
  83      * root has all the data and it can do bcast*/
  84     if(local_rank == 0) {
  85         mpi_errno = mpi_coll_gather_fun(sendbuf, sendcnt,sendtype,
  86                                     (void*)((char*)recvbuf + (rank * recvcnt * recvtype_extent)),
  87                                      recvcnt, recvtype,
  88                                      0, shmem_comm);
  89     } else {
  90         /*Since in allgather all the processes could have
  91          * its own data in place*/
  92         if(sendbuf == MPI_IN_PLACE) {
  93             mpi_errno = mpi_coll_gather_fun((void*)((char*)recvbuf + (rank * recvcnt * recvtype_extent)),
  94                                          recvcnt , recvtype,
  95                                          recvbuf, recvcnt, recvtype,
  96                                          0, shmem_comm);
  97         } else {
  98             mpi_errno = mpi_coll_gather_fun(sendbuf, sendcnt,sendtype,
  99                                          recvbuf, recvcnt, recvtype,
 100                                          0, shmem_comm);
 101         }
 102     }
 103     /* Exchange the data between the node leaders*/
 104     if (local_rank == 0 && (leader_comm_size > 1)) {
 105         /*When data in each socket is different*/
 106         if (smpi_comm_is_uniform(comm) != 1) {
 107
 108             int *displs = NULL;
 109             int *recvcnts = NULL;
 110             int *node_sizes = NULL;
 111             int i = 0;
 112
 113             node_sizes = smpi_comm_get_non_uniform_map(comm);
 114
 115             displs = xbt_malloc(sizeof (int) * leader_comm_size);
 116             recvcnts = xbt_malloc(sizeof (int) * leader_comm_size);
 117             if (!displs || !recvcnts) {
 118                 return MPI_ERR_OTHER;
 119             }
 120             recvcnts[0] = node_sizes[0] * recvcnt;
 121             displs[0] = 0;
 122
 123             for (i = 1; i < leader_comm_size; i++) {
 124                 displs[i] = displs[i - 1] + node_sizes[i - 1] * recvcnt;
 125                 recvcnts[i] = node_sizes[i] * recvcnt;
 126             }
 127
 128
 129             void* sendbuf=((char*)recvbuf)+smpi_datatype_get_extent(recvtype)*displs[smpi_comm_rank(leader_comm)];
 130
 131             mpi_errno = mpi_coll_allgatherv_fun(sendbuf,
 132                                        (recvcnt*local_size),
 133                                        recvtype,
 134                                        recvbuf, recvcnts,
 135                                        displs, recvtype,
 136                                        leader_comm);
 137             xbt_free(displs);
 138             xbt_free(recvcnts);
 139         } else {
 140         void* sendtmpbuf=((char*)recvbuf)+smpi_datatype_get_extent(recvtype)*(recvcnt*local_size)*smpi_comm_rank(leader_comm);
 141
 142
 143
 144             mpi_errno = smpi_coll_tuned_allgather_mpich(sendtmpbuf,
 145                                                (recvcnt*local_size),
 146                                                recvtype,
 147                                                recvbuf, (recvcnt*local_size), recvtype,
 148                                              leader_comm);
 149
 150         }
 151     }
 152
 153     /*Bcast the entire data from node leaders to all other cores*/
 154     mpi_errno = mpi_coll_bcast_fun (recvbuf, recvcnt * size, recvtype, 0, shmem_comm);
 155     return mpi_errno;
 156 }