src/xbt/graph.c

   1 /* a generic graph library.                                                 */
   2
   3 /* Copyright (c) 2006-2013. The SimGrid Team.
   4  * All rights reserved.                                                     */
   5
   6 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   7  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   8
   9 #include <errno.h>
  10 #include <stdlib.h>
  11 #include "xbt/sysdep.h"
  12 #include "xbt/log.h"
  13 #include "xbt/graph.h"
  14 #include "graph_private.h"
  15 #include "xbt/graphxml_parse.h"
  16 #include "xbt/dict.h"
  17 #include "xbt/heap.h"
  18 #include "xbt/str.h"
  19
  20
  21
  22
  23 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(xbt_graph, xbt, "Graph");
  24
  25
  26
  27 /** @brief Constructor
  28  *  @return a new graph
  29  */
  30 xbt_graph_t xbt_graph_new_graph(unsigned short int directed, void *data)
  31 {
  32   xbt_graph_t graph = NULL;
  33   graph = xbt_new0(struct xbt_graph, 1);
  34   graph->directed = directed;
  35   graph->data = data;
  36   graph->nodes = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_node_t), NULL);
  37   graph->edges = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  38
  39   return graph;
  40 }
  41
  42 /** @brief add a node to the given graph */
  43 xbt_node_t xbt_graph_new_node(xbt_graph_t g, void *data)
  44 {
  45   xbt_node_t node = NULL;
  46   node = xbt_new0(struct xbt_node, 1);
  47   node->data = data;
  48   if (g->directed)
  49     /* only the "out" field is used */
  50     node->in = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  51
  52   node->out = xbt_dynar_new(sizeof(xbt_edge_t), NULL);
  53   node->position_x = -1.0;
  54   node->position_y = -1.0;
  55
  56   xbt_dynar_push(g->nodes, &node);
  57
  58   return node;
  59 }
  60
  61 /** @brief add an edge to the given graph */
  62 xbt_edge_t xbt_graph_new_edge(xbt_graph_t g,
  63                               xbt_node_t src, xbt_node_t dst, void *data)
  64 {
  65   xbt_edge_t edge = NULL;
  66
  67   edge = xbt_new0(struct xbt_edge, 1);
  68   xbt_dynar_push(src->out, &edge);
  69   if (g->directed)
  70     xbt_dynar_push(dst->in, &edge);
  71   else                          /* only the "out" field is used */
  72     xbt_dynar_push(dst->out, &edge);
  73
  74   edge->data = data;
  75   edge->src = src;
  76   edge->dst = dst;
  77
  78   xbt_dynar_push(g->edges, &edge);
  79
  80   return edge;
  81 }
  82
  83 /** @brief Get the edge connecting src and dst */
  84 xbt_edge_t xbt_graph_get_edge(xbt_graph_t g, xbt_node_t src,
  85                               xbt_node_t dst)
  86 {
  87   xbt_edge_t edge;
  88   unsigned int cursor;
  89
  90   xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  91     XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  92     if ((edge->src == src) && (edge->dst == dst))
  93       return edge;
  94   }
  95   if (!g->directed) {
  96     xbt_dynar_foreach(src->out, cursor, edge) {
  97       XBT_DEBUG("%p = %p--%p", edge, edge->src, edge->dst);
  98       if ((edge->dst == src) && (edge->src == dst))
  99         return edge;
 100     }
 101   }
 102   return NULL;
 103 }
 104
 105 /** @brief Get the user data associated to a node */
 106 void *xbt_graph_node_get_data(xbt_node_t node)
 107 {
 108   return node->data;
 109 }
 110
 111 /** @brief Set the user data associated to a node */
 112 void xbt_graph_node_set_data(xbt_node_t node, void *data)
 113 {
 114   node->data = data;
 115 }
 116
 117 /** @brief Get the user data associated to a edge */
 118 void *xbt_graph_edge_get_data(xbt_edge_t edge)
 119 {
 120   return edge->data;
 121 }
 122
 123 /** @brief Set the user data associated to a edge */
 124 void xbt_graph_edge_set_data(xbt_edge_t edge, void *data)
 125 {
 126   edge->data = data;
 127 }
 128
 129 /** @brief Destructor
 130  *  @param g: poor victim
 131  *  @param node_free_function: function to use to free data associated to each node
 132  *  @param edge_free_function: function to use to free data associated to each edge
 133  *  @param graph_free_function: function to use to free data associated to g
 134  *
 135  * Free the graph structure.
 136  */
 137 void xbt_graph_free_graph(xbt_graph_t g,
 138                           void_f_pvoid_t node_free_function,
 139                           void_f_pvoid_t edge_free_function,
 140                           void_f_pvoid_t graph_free_function)
 141 {
 142   unsigned int cursor;
 143   xbt_node_t node;
 144   xbt_edge_t edge;
 145
 146   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 147     if (edge_free_function)
 148       edge_free_function(edge->data);
 149     free(edge);
 150   }
 151   xbt_dynar_free(&(g->edges));
 152
 153   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 154     xbt_dynar_free(&(node->out));
 155     xbt_dynar_free(&(node->in));
 156     if (node_free_function)
 157       node_free_function(node->data);
 158     free(node);
 159   }
 160   xbt_dynar_free(&(g->nodes));
 161
 162   if (graph_free_function)
 163     graph_free_function(g->data);
 164   free(g);
 165   xbt_graph_parse_lex_destroy();
 166 }
 167
 168
 169 /** @brief remove the given node from the given graph */
 170 void xbt_graph_free_node(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 171                          void_f_pvoid_t node_free_function,
 172                          void_f_pvoid_t edge_free_function)
 173 {
 174   unsigned long nbr;
 175   unsigned long i;
 176   unsigned int cursor = 0;
 177   xbt_node_t node = NULL;
 178   xbt_edge_t edge = NULL;
 179
 180   nbr = xbt_dynar_length(g->edges);
 181   cursor = 0;
 182   for (i = 0; i < nbr; i++) {
 183     xbt_dynar_get_cpy(g->edges, cursor, &edge);
 184
 185     if ((edge->dst == n) || (edge->src == n)) {
 186       xbt_graph_free_edge(g, edge, edge_free_function);
 187     } else
 188       cursor++;
 189   }
 190
 191   if ((node_free_function) && (n->data))
 192     node_free_function(n->data);
 193
 194   cursor = 0;
 195   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 196       if (node == n)
 197     xbt_dynar_cursor_rm(g->nodes, &cursor);
 198
 199   xbt_dynar_free(&(n->in));
 200   xbt_dynar_free(&(n->out));
 201
 202   free(n);
 203
 204   return;
 205 }
 206
 207 /** @brief remove the given edge from the given graph */
 208 void xbt_graph_free_edge(xbt_graph_t g, xbt_edge_t e,
 209                          void_f_pvoid_t free_function)
 210 {
 211   int idx;
 212   unsigned int cursor = 0;
 213   xbt_edge_t edge = NULL;
 214
 215   if ((free_function) && (e->data))
 216     free_function(e->data);
 217
 218   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 219     if (edge == e) {
 220       if (g->directed) {
 221         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->in, edge);
 222         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->in, idx, NULL);
 223       } else {                  /* only the out field is used */
 224         idx = __xbt_find_in_dynar(edge->dst->out, edge);
 225         xbt_dynar_remove_at(edge->dst->out, idx, NULL);
 226       }
 227
 228       idx = __xbt_find_in_dynar(edge->src->out, edge);
 229       xbt_dynar_remove_at(edge->src->out, idx, NULL);
 230
 231       xbt_dynar_cursor_rm(g->edges, &cursor);
 232       free(edge);
 233       break;
 234     }
 235   }
 236 }
 237
 238 int __xbt_find_in_dynar(xbt_dynar_t dynar, void *p)
 239 {
 240
 241   unsigned int cursor = 0;
 242   void *tmp = NULL;
 243
 244   xbt_dynar_foreach(dynar, cursor, tmp) {
 245     if (tmp == p)
 246       return cursor;
 247   }
 248   return -1;
 249 }
 250
 251 /** @brief Retrieve the graph's nodes as a dynar */
 252 xbt_dynar_t xbt_graph_get_nodes(xbt_graph_t g)
 253 {
 254   return g->nodes;
 255 }
 256
 257 /** @brief Retrieve the graph's edges as a dynar */
 258 xbt_dynar_t xbt_graph_get_edges(xbt_graph_t g)
 259 {
 260   return g->edges;
 261 }
 262
 263 /** @brief Retrieve the node at the source of the given edge */
 264 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_source(xbt_edge_t e)
 265 {
 266   return e->src;
 267 }
 268
 269 /** @brief Retrieve the node being the target of the given edge */
 270 xbt_node_t xbt_graph_edge_get_target(xbt_edge_t e)
 271 {
 272   return e->dst;
 273 }
 274
 275 /** @brief Retrieve the outgoing edges of the given node */
 276 xbt_dynar_t xbt_graph_node_get_outedges(xbt_node_t n)
 277 {
 278   return n->out;
 279 }
 280
 281 /** @brief Set the weight of the given edge */
 282 void xbt_graph_edge_set_length(xbt_edge_t e, double length)
 283 {
 284   e->length = length;
 285
 286 }
 287
 288 /** @brief Get the length of a edge */
 289 double xbt_graph_edge_get_length(xbt_edge_t edge)
 290 {
 291   return edge->length;
 292 }
 293
 294
 295 /** @brief construct the adjacency matrix corresponding to the given graph
 296  *
 297  * The weights are the distances between nodes
 298  */
 299 double *xbt_graph_get_length_matrix(xbt_graph_t g)
 300 {
 301   unsigned int cursor = 0;
 302   unsigned int in_cursor = 0;
 303   unsigned long idx, i;
 304   unsigned long n;
 305   xbt_edge_t edge = NULL;
 306   xbt_node_t node = NULL;
 307   double *d = NULL;
 308
 309 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 310   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 311
 312   d = (double *) xbt_new0(double, n * n);
 313
 314   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 315     d[i] = -1.0;
 316   }
 317
 318   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 319     in_cursor = 0;
 320     D(cursor, cursor) = 0;
 321
 322     xbt_dynar_foreach(node->out, in_cursor, edge) {
 323       if (edge->dst == node)
 324         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->src);
 325       else                      /*case of  undirected graphs */
 326         idx = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, edge->dst);
 327       D(cursor, idx) = edge->length;
 328     }
 329   }
 330
 331 # undef D
 332
 333   return d;
 334 }
 335
 336 /** @brief Floyd-Warshall algorithm for shortest path finding
 337  *
 338  * From wikipedia:
 339  *
 340  * The Floyd–Warshall algorithm takes as input an adjacency matrix
 341  * representation of a weighted, directed graph (V, E). The weight of a
 342  * path between two vertices is the sum of the weights of the edges along
 343  * that path. The edges E of the graph may have negative weights, but the
 344  * graph must not have any negative weight cycles. The algorithm computes,
 345  * for each pair of vertices, the minimum weight among all paths between
 346  * the two vertices. The running time complexity is Θ(|V|3).
 347  */
 348 void xbt_floyd_algorithm(xbt_graph_t g, double *adj, double *d,
 349                          xbt_node_t * p)
 350 {
 351   unsigned long i, j, k;
 352   unsigned long n;
 353   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 354
 355 # define D(u,v) d[(u)*n+(v)]
 356 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 357
 358   for (i = 0; i < n * n; i++) {
 359     d[i] = adj[i];
 360   }
 361
 362
 363   for (i = 0; i < n; i++) {
 364     for (j = 0; j < n; j++) {
 365       if (D(i, j) != -1) {
 366         P(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, i));
 367       }
 368     }
 369   }
 370
 371   for (k = 0; k < n; k++) {
 372     for (i = 0; i < n; i++) {
 373       for (j = 0; j < n; j++) {
 374         if ((D(i, k) != -1) && (D(k, j) != -1)) {
 375           if ((D(i, j) == -1) || (D(i, j) > D(i, k) + D(k, j))) {
 376             D(i, j) = D(i, k) + D(k, j);
 377             P(i, j) = P(k, j);
 378           }
 379         }
 380       }
 381     }
 382   }
 383
 384
 385
 386 # undef P
 387 # undef D
 388 }
 389
 390 /** @brief computes all-pairs shortest paths */
 391 xbt_node_t *xbt_graph_shortest_paths(xbt_graph_t g)
 392 {
 393   xbt_node_t *p;
 394   xbt_node_t *r;
 395   unsigned long i, j, k;
 396   unsigned long n;
 397
 398   double *adj = NULL;
 399   double *d = NULL;
 400
 401 # define P(u,v) p[(u)*n+(v)]
 402 # define R(u,v) r[(u)*n+(v)]
 403
 404   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 405   adj = xbt_graph_get_length_matrix(g);
 406   d = xbt_new0(double, n * n);
 407   p = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 408   r = xbt_new0(xbt_node_t, n * n);
 409
 410   xbt_floyd_algorithm(g, adj, d, p);
 411
 412   for (i = 0; i < n; i++) {
 413     for (j = 0; j < n; j++) {
 414       k = j;
 415
 416       while ((P(i, k)) && (__xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k)) != i)) {
 417         k = __xbt_find_in_dynar(g->nodes, P(i, k));
 418       }
 419
 420       if (P(i, j)) {
 421         R(i, j) = *((xbt_node_t *) xbt_dynar_get_ptr(g->nodes, k));
 422       }
 423     }
 424   }
 425 # undef R
 426 # undef P
 427
 428   free(d);
 429   free(p);
 430   free(adj);
 431   return r;
 432 }
 433
 434 /** @brief Extract a spanning tree of the given graph */
 435 xbt_edge_t *xbt_graph_spanning_tree_prim(xbt_graph_t g)
 436 {
 437   int tree_size = 0;
 438   int tree_size_max = xbt_dynar_length(g->nodes) - 1;
 439   xbt_edge_t *tree = xbt_new0(xbt_edge_t, tree_size_max);
 440   xbt_edge_t e, edge;
 441   xbt_node_t node = NULL;
 442   xbt_dynar_t edge_list = NULL;
 443   xbt_heap_t heap = xbt_heap_new(10, NULL);
 444   unsigned int cursor;
 445
 446   xbt_assert(!(g->directed),
 447               "Spanning trees do not make sense on directed graphs");
 448
 449   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 450     node->xbtdata = NULL;
 451   }
 452
 453   node = xbt_dynar_getfirst_as(g->nodes, xbt_node_t);
 454   node->xbtdata = (void *) 1;
 455   edge_list = node->out;
 456   xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e)
 457       xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 458
 459   while ((edge = xbt_heap_pop(heap))) {
 460     if ((edge->src->xbtdata) && (edge->dst->xbtdata))
 461       continue;
 462     tree[tree_size++] = edge;
 463     if (!(edge->src->xbtdata)) {
 464       edge->src->xbtdata = (void *) 1;
 465       edge_list = edge->src->out;
 466       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 467         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 468       }
 469     } else {
 470       edge->dst->xbtdata = (void *) 1;
 471       edge_list = edge->dst->out;
 472       xbt_dynar_foreach(edge_list, cursor, e) {
 473         xbt_heap_push(heap, e, -(e->length));
 474       }
 475     }
 476     if (tree_size == tree_size_max)
 477       break;
 478   }
 479
 480   xbt_heap_free(heap);
 481
 482   return tree;
 483 }
 484
 485 /** @brief Topological sort on the given graph
 486  *
 487  *  From wikipedia:
 488  *
 489  * In graph theory, a topological sort of a directed acyclic graph (DAG) is
 490  * a linear ordering of its nodes which is compatible with the partial
 491  * order R induced on the nodes where x comes before y (xRy) if there's a
 492  * directed path from x to y in the DAG. An equivalent definition is that
 493  * each node comes before all nodes to which it has edges. Every DAG has at
 494  * least one topological sort, and may have many.
 495  */
 496 xbt_node_t *xbt_graph_topo_sort(xbt_graph_t g)
 497 {
 498
 499   xbt_node_t *sorted;
 500   unsigned int cursor;
 501   int idx;
 502   xbt_node_t node;
 503   unsigned long n;
 504
 505   n = xbt_dynar_length(g->nodes);
 506   idx = n - 1;
 507
 508   sorted = xbt_malloc(n * sizeof(xbt_node_t));
 509
 510   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 511       node->xbtdata = xbt_new0(int, 1);
 512
 513   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node)
 514       xbt_graph_depth_visit(g, node, sorted, &idx);
 515
 516   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 517     free(node->xbtdata);
 518     node->xbtdata = NULL;
 519   }
 520
 521   return sorted;
 522 }
 523
 524 /** @brief First-depth graph traversal */
 525 void xbt_graph_depth_visit(xbt_graph_t g, xbt_node_t n,
 526                            xbt_node_t * sorted, int *idx)
 527 {
 528   unsigned int cursor;
 529   xbt_edge_t edge;
 530
 531   if (*((int *) (n->xbtdata)) == ALREADY_EXPLORED)
 532     return;
 533   else if (*((int *) (n->xbtdata)) == CURRENTLY_EXPLORING)
 534     THROWF(0, 0, "There is a cycle");
 535   else {
 536     *((int *) (n->xbtdata)) = CURRENTLY_EXPLORING;
 537
 538     xbt_dynar_foreach(n->out, cursor, edge) {
 539       xbt_graph_depth_visit(g, edge->dst, sorted, idx);
 540     }
 541
 542     *((int *) (n->xbtdata)) = ALREADY_EXPLORED;
 543     sorted[(*idx)--] = n;
 544   }
 545 }
 546
 547 /********************* Import and Export ******************/
 548 static xbt_graph_t parsed_graph = NULL;
 549 static xbt_dict_t parsed_nodes = NULL;
 550
 551 static void *(*__parse_node_label_and_data) (xbt_node_t, const char *,
 552                                              const char *) = NULL;
 553 static void *(*__parse_edge_label_and_data) (xbt_edge_t, const char *,
 554                                              const char *) = NULL;
 555
 556 static void __parse_graph_begin(void)
 557 {
 558   XBT_DEBUG("<graph>");
 559   if (A_graphxml_graph_isDirected == A_graphxml_graph_isDirected_true)
 560     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(1, NULL);
 561   else
 562     parsed_graph = xbt_graph_new_graph(0, NULL);
 563
 564   parsed_nodes = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 565 }
 566
 567 static void __parse_graph_end(void)
 568 {
 569   xbt_dict_free(&parsed_nodes);
 570   XBT_DEBUG("</graph>");
 571 }
 572
 573 static void __parse_node(void)
 574 {
 575   xbt_node_t node = xbt_graph_new_node(parsed_graph, NULL);
 576
 577   XBT_DEBUG("<node name=\"%s\"/>", A_graphxml_node_name);
 578   if (__parse_node_label_and_data)
 579     node->data = __parse_node_label_and_data(node, A_graphxml_node_label,
 580                                              A_graphxml_node_data);
 581   node->position_x = xbt_graph_parse_get_double(A_graphxml_node_position___x);
 582   node->position_y = xbt_graph_parse_get_double(A_graphxml_node_position___y);
 583
 584   xbt_dict_set(parsed_nodes, A_graphxml_node_name, (void *) node, NULL);
 585 }
 586
 587 static void __parse_edge(void)
 588 {
 589   xbt_edge_t edge = xbt_graph_new_edge(parsed_graph,
 590                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 591                                                     A_graphxml_edge_source),
 592                                        xbt_dict_get(parsed_nodes,
 593                                                     A_graphxml_edge_target),
 594                                        NULL);
 595
 596   if (__parse_edge_label_and_data)
 597     edge->data = __parse_edge_label_and_data(edge, A_graphxml_edge_label,
 598                                              A_graphxml_edge_data);
 599
 600   edge->length = xbt_graph_parse_get_double(A_graphxml_edge_length);
 601
 602   XBT_DEBUG("<edge  source=\"%s\" target=\"%s\" length=\"%f\"/>",
 603          (char *) (edge->src)->data,
 604          (char *) (edge->dst)->data, xbt_graph_edge_get_length(edge));
 605 }
 606
 607 /** @brief Import a graph from a file following the GraphXML format */
 608 xbt_graph_t xbt_graph_read(const char *filename,
 609                            void *(*node_label_and_data) (xbt_node_t,
 610                                                          const char *,
 611                                                          const char *),
 612                            void *(*edge_label_and_data) (xbt_edge_t,
 613                                                          const char *,
 614                                                          const char *))
 615 {
 616
 617   xbt_graph_t graph = NULL;
 618
 619   __parse_node_label_and_data = node_label_and_data;
 620   __parse_edge_label_and_data = edge_label_and_data;
 621
 622   xbt_graph_parse_reset_parser();
 623
 624   STag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_begin;
 625   ETag_graphxml_graph_fun = __parse_graph_end;
 626   ETag_graphxml_node_fun = __parse_node;
 627   ETag_graphxml_edge_fun = __parse_edge;
 628
 629   xbt_graph_parse_open(filename);
 630   _XBT_GNUC_UNUSED int res;
 631   res = xbt_graph_parse();
 632   xbt_assert(!res, "Parse error in %s", filename);
 633   xbt_graph_parse_close();
 634
 635   graph = parsed_graph;
 636   parsed_graph = NULL;
 637
 638   return graph;
 639 }
 640
 641 /** @brief Export the given graph in the GraphViz formatting for visualization */
 642 void xbt_graph_export_graphviz(xbt_graph_t g, const char *filename,
 643                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 644                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t))
 645 {
 646   unsigned int cursor = 0;
 647   xbt_node_t node = NULL;
 648   xbt_edge_t edge = NULL;
 649   FILE *file = NULL;
 650   const char *name = NULL;
 651
 652   file = fopen(filename, "w");
 653   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 654
 655   if (g->directed)
 656     fprintf(file, "digraph test {\n");
 657   else
 658     fprintf(file, "graph test {\n");
 659
 660   fprintf(file, "  graph [overlap=scale]\n");
 661
 662   fprintf(file, "  node [shape=box, style=filled]\n");
 663   fprintf(file,
 664           "  node [width=.3, height=.3, style=filled, color=skyblue]\n\n");
 665
 666   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 667     if (node_name){
 668       fprintf(file, "  \"%s\";\n", node_name(node));
 669     }else{
 670       fprintf(file, "  \"%p\";\n", node);
 671     }
 672   }
 673   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 674     const char *c;
 675     const char *c_dir = "->";
 676     const char *c_ndir = "--";
 677     if (g->directed){
 678       c = c_dir;
 679     }else{
 680       c = c_ndir;
 681     }
 682     const char *src_name, *dst_name;
 683     if (node_name){
 684       src_name = node_name(edge->src);
 685       dst_name = node_name(edge->dst);
 686       fprintf(file, "  \"%s\" %s \"%s\"", src_name, c, dst_name);
 687     }else{
 688       fprintf(file, "  \"%p\" %s \"%p\"", edge->src, c, edge->dst);
 689     }
 690
 691     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 692       fprintf(file, "[label=\"%s\"]", name);
 693     fprintf(file, ";\n");
 694   }
 695   fprintf(file, "}\n");
 696   fclose(file);
 697 }
 698
 699 /** @brief Export the given graph in the GraphXML format */
 700 void xbt_graph_export_graphxml(xbt_graph_t g, const char *filename,
 701                                const char *(node_name) (xbt_node_t),
 702                                const char *(edge_name) (xbt_edge_t),
 703                                const char *(node_data_print) (void *),
 704                                const char *(edge_data_print) (void *))
 705 {
 706   unsigned int cursor = 0;
 707   xbt_node_t node = NULL;
 708   xbt_edge_t edge = NULL;
 709   FILE *file = NULL;
 710   const char *name = NULL;
 711
 712   file = fopen(filename, "w");
 713   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 714
 715   fprintf(file, "<?xml version='1.0'?>\n");
 716   fprintf(file, "<!DOCTYPE graph SYSTEM \"graphxml.dtd\">\n");
 717   if (g->directed)
 718     fprintf(file, "<graph isDirected=\"true\">\n");
 719   else
 720     fprintf(file, "<graph isDirected=\"false\">\n");
 721   xbt_dynar_foreach(g->nodes, cursor, node) {
 722     fprintf(file, "  <node name=\"%p\" ", node);
 723     if ((node_name) && ((name = node_name(node))))
 724       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 725     if ((node_data_print) && ((name = node_data_print(node->data))))
 726       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 727     fprintf(file, "/>\n");
 728   }
 729   xbt_dynar_foreach(g->edges, cursor, edge) {
 730     fprintf(file, "  <edge source=\"%p\" target =\"%p\" ",
 731             edge->src, edge->dst);
 732     if ((edge_name) && ((name = edge_name(edge))))
 733       fprintf(file, "label=\"%s\" ", name);
 734     if (edge->length >= 0.0)
 735       fprintf(file, "length=\"%g\" ", edge->length);
 736     if ((edge_data_print) && ((name = edge_data_print(edge->data))))
 737       fprintf(file, "data=\"%s\" ", name);
 738     fprintf(file, "/>\n");
 739   }
 740   fprintf(file, "</graph>\n");
 741   fclose(file);
 742 }
 743
 744 /** @brief Load a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 745 xbt_graph_t xbt_graph_load (const char *filename)
 746 {
 747   FILE *file = NULL;
 748   ssize_t read;
 749   file = fopen (filename, "r");
 750   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 751
 752   xbt_dict_t nodes_dict = xbt_dict_new_homogeneous(NULL);
 753   xbt_graph_t ret = xbt_graph_new_graph (0, NULL);
 754
 755   //read the number of nodes
 756   size_t size;
 757   char *nnodes_str = NULL;
 758   read = xbt_getline (&nnodes_str, &size, file);
 759   if (read == -1)
 760     THROWF(system_error, 0, "xbt_getline failed to read the number of nodes (errno = %d)", errno);
 761   int i, nnodes = atoi (nnodes_str);
 762   free (nnodes_str);
 763
 764   //read all nodes
 765   for (i = 0; i < nnodes; i++){
 766     char *node_str = NULL;
 767     read = xbt_getline (&node_str, &size, file);
 768     if (read == -1)
 769       THROWF(system_error, 0, "xbt_getline failed to read all nodes (errno = %d)", errno);
 770     xbt_node_t n;
 771     char *name = xbt_strdup (node_str);
 772     xbt_str_subst (name, '\n', '\0', 0);
 773     n = xbt_graph_new_node (ret, name);
 774     xbt_dict_set (nodes_dict, name, n, NULL);
 775     free (node_str);
 776   }
 777
 778   //read the number of edges
 779   char *nedges_str = NULL;
 780   read = xbt_getline (&nedges_str, &size, file);
 781   if (read == -1)
 782     THROWF(system_error, 0, "xbt_getline failed to read the number of edges (errno = %d)", errno);
 783   int nedges = atoi (nedges_str);
 784   free (nedges_str);
 785
 786   //read all edges
 787   for (i = 0; i < nedges; i++){
 788     char *edge_str = NULL, edge_id[200], node_source[200], node_target[200];
 789     read = xbt_getline (&edge_str, &size, file);
 790     if (read == -1)
 791       THROWF(system_error, 0, "xbt_getline failed to read all edges (errno = %d)", errno);
 792     sscanf (edge_str, "%s %s %s", edge_id, node_source, node_target);
 793     free (edge_str);
 794     xbt_str_subst (edge_id, '\n', '\0', 0);
 795     xbt_str_subst (node_source, '\n', '\0', 0);
 796     xbt_str_subst (node_target, '\n', '\0', 0);
 797
 798     xbt_node_t source = xbt_dict_get (nodes_dict, node_source);
 799     xbt_node_t target = xbt_dict_get (nodes_dict, node_target);
 800     xbt_graph_new_edge (ret, source, target, xbt_strdup(edge_id));
 801   }
 802   xbt_dict_free (&nodes_dict);
 803   return ret;
 804 }
 805
 806 /** @brief Save a graph from a file (in the SimGrid Graph format) */
 807 void xbt_graph_save (xbt_graph_t span,
 808                      const char *filename,
 809                      const char *(nname) (xbt_node_t),
 810                      const char *(ename) (xbt_edge_t))
 811 {
 812   FILE *file = NULL;
 813   file = fopen(filename, "w");
 814   xbt_assert(file, "Failed to open %s \n", filename);
 815
 816   xbt_dynar_t nodes = xbt_graph_get_nodes (span);
 817   xbt_dynar_t edges = xbt_graph_get_edges (span);
 818   unsigned int cpt;
 819   xbt_node_t node;
 820   fprintf (file, "%lu\n", xbt_dynar_length (nodes));
 821   xbt_dynar_foreach (nodes, cpt, node) {
 822     if (nname){
 823       fprintf (file, "%s\n", nname(node));
 824     }else{
 825       fprintf (file, "%p\n", node);
 826     }
 827   }
 828   fprintf (file, "%lu\n", xbt_dynar_length (edges));
 829   xbt_edge_t edge;
 830   xbt_dynar_foreach (edges, cpt, edge) {
 831     xbt_node_t source = xbt_graph_edge_get_source (edge);
 832     xbt_node_t target = xbt_graph_edge_get_target (edge);
 833     if (ename){
 834       if (nname){
 835         fprintf (file, "%s %s %s\n", ename(edge), nname(source), nname(target));
 836       }else{
 837         fprintf (file, "%s %p %p\n", ename(edge), source, target);
 838       }
 839     }else{
 840       if (nname){
 841         fprintf (file, "%p %s %s\n", edge, nname(source), nname(target));
 842       }else{
 843         fprintf (file, "%p %p %p\n", edge, source, target);
 844       }
 845     }
 846   }
 847   fclose (file);
 848 }