Logo AND Algorithmique Numérique Distribuée

Public GIT Repository
Implement partial shared_malloc.
[simgrid.git] / src / smpi / smpi_shared.cpp
1 /* Copyright (c) 2007, 2009-2017. The SimGrid Team. All rights reserved.    */
2
3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
5
6 /* Shared allocations are handled through shared memory segments.
7  * Associated data and metadata are used as follows:
8  *
9  *                                                                    mmap #1
10  *    `allocs' dict                                                     ---- -.
11  *    ----------      shared_data_t               shared_metadata_t   / |  |  |
12  * .->| <name> | ---> -------------------- <--.   -----------------   | |  |  |
13  * |  ----------      | fd of <name>     |    |   | size of mmap  | --| |  |  |
14  * |                  | count (2)        |    |-- | data          |   \ |  |  |
15  * `----------------- | <name>           |    |   -----------------     ----  |
16  *                    --------------------    |   ^                           |
17  *                                            |   |                           |
18  *                                            |   |   `allocs_metadata' dict  |
19  *                                            |   |   ----------------------  |
20  *                                            |   `-- | <addr of mmap #1>  |<-'
21  *                                            |   .-- | <addr of mmap #2>  |<-.
22  *                                            |   |   ----------------------  |
23  *                                            |   |                           |
24  *                                            |   |                           |
25  *                                            |   |                           |
26  *                                            |   |                   mmap #2 |
27  *                                            |   v                     ---- -'
28  *                                            |   shared_metadata_t   / |  |
29  *                                            |   -----------------   | |  |
30  *                                            |   | size of mmap  | --| |  |
31  *                                            `-- | data          |   | |  |
32  *                                                -----------------   | |  |
33  *                                                                    \ |  |
34  *                                                                      ----
35  */
36 #include <map>
37
38 #include "private.h"
39 #include "private.hpp"
40 #include "xbt/dict.h"
41 #include <errno.h>
42
43 #include <sys/types.h>
44 #ifndef WIN32
45 #include <sys/mman.h>
46 #endif
47 #include <sys/stat.h>
48 #include <fcntl.h>
49 #include <string.h>
50 #include <stdio.h>
51
52 #ifndef MAP_ANONYMOUS
53 #define MAP_ANONYMOUS MAP_ANON
54 #endif
55
56 #ifndef MAP_POPULATE
57 #define MAP_POPULATE 0
58 #endif
59
60 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_shared, smpi, "Logging specific to SMPI (shared memory macros)");
61
62 #define PTR_STRLEN (2 + 2 * sizeof(void*) + 1)
63
64 namespace{
65 /** Some location in the source code
66  *
67  *  This information is used by SMPI_SHARED_MALLOC to allocate  some shared memory for all simulated processes.
68  */
69
70 class smpi_source_location {
71 public:
72   smpi_source_location(const char* filename, int line)
73       : filename(xbt_strdup(filename)), filename_length(strlen(filename)), line(line)
74   {
75   }
76
77   /** Pointer to a static string containing the file name */
78   char* filename      = nullptr;
79   int filename_length = 0;
80   int line            = 0;
81
82   bool operator==(smpi_source_location const& that) const
83   {
84     return filename_length == that.filename_length && line == that.line &&
85            std::memcmp(filename, that.filename, filename_length) == 0;
86   }
87   bool operator!=(smpi_source_location const& that) const { return !(*this == that); }
88 };
89 }
90
91 namespace std {
92
93 template <> class hash<smpi_source_location> {
94 public:
95   typedef smpi_source_location argument_type;
96   typedef std::size_t result_type;
97   result_type operator()(smpi_source_location const& loc) const
98   {
99     return xbt_str_hash_ext(loc.filename, loc.filename_length) ^
100            xbt_str_hash_ext((const char*)&loc.line, sizeof(loc.line));
101   }
102 };
103 }
104
105 namespace{
106
107 typedef struct {
108   int fd    = -1;
109   int count = 0;
110 } shared_data_t;
111
112 std::unordered_map<smpi_source_location, shared_data_t> allocs;
113 typedef std::unordered_map<smpi_source_location, shared_data_t>::value_type shared_data_key_type;
114
115 typedef struct {
116   size_t size;
117   shared_data_key_type* data;
118 } shared_metadata_t;
119
120 std::map<void*, shared_metadata_t> allocs_metadata;
121 xbt_dict_t calls = nullptr;           /* Allocated on first use */
122 #ifndef WIN32
123 static int smpi_shared_malloc_bogusfile           = -1;
124 static unsigned long smpi_shared_malloc_blocksize = 1UL << 20;
125 #endif
126 }
127
128
129 void smpi_shared_destroy()
130 {
131   allocs.clear();
132   allocs_metadata.clear();
133   xbt_dict_free(&calls);
134 }
135
136 static size_t shm_size(int fd) {
137   struct stat st;
138
139   if(fstat(fd, &st) < 0) {
140     xbt_die("Could not stat fd %d: %s", fd, strerror(errno));
141   }
142   return static_cast<size_t>(st.st_size);
143 }
144
145 #ifndef WIN32
146 static void* shm_map(int fd, size_t size, shared_data_key_type* data) {
147   char loc[PTR_STRLEN];
148   shared_metadata_t meta;
149
150   if(size > shm_size(fd) && (ftruncate(fd, static_cast<off_t>(size)) < 0)) {
151     xbt_die("Could not truncate fd %d to %zu: %s", fd, size, strerror(errno));
152   }
153
154   void* mem = mmap(nullptr, size, PROT_READ | PROT_WRITE, MAP_SHARED, fd, 0);
155   if(mem == MAP_FAILED) {
156     xbt_die(
157         "Failed to map fd %d with size %zu: %s\n"
158         "If you are running a lot of ranks, you may be exceeding the amount of mappings allowed per process.\n"
159         "On Linux systems, change this value with sudo sysctl -w vm.max_map_count=newvalue (default value: 65536)\n"
160         "Please see http://simgrid.gforge.inria.fr/simgrid/latest/doc/html/options.html#options_virt for more info.",
161         fd, size, strerror(errno));
162   }
163   snprintf(loc, PTR_STRLEN, "%p", mem);
164   meta.size = size;
165   meta.data = data;
166   allocs_metadata[mem] = meta;
167   XBT_DEBUG("MMAP %zu to %p", size, mem);
168   return mem;
169 }
170
171 void *smpi_shared_malloc_local(size_t size, const char *file, int line)
172 {
173   void* mem;
174   smpi_source_location loc(file, line);
175   auto res = allocs.insert(std::make_pair(loc, shared_data_t()));
176   auto data = res.first;
177   if (res.second) {
178     // The insertion did not take place.
179     // Generate a shared memory name from the address of the shared_data:
180     char shmname[32]; // cannot be longer than PSHMNAMLEN = 31 on Mac OS X (shm_open raises ENAMETOOLONG otherwise)
181     snprintf(shmname, 31, "/shmalloc%p", &*data);
182     int fd = shm_open(shmname, O_RDWR | O_CREAT | O_EXCL, S_IRUSR | S_IWUSR | S_IRGRP | S_IROTH);
183     if (fd < 0) {
184       if (errno == EEXIST)
185         xbt_die("Please cleanup /dev/shm/%s", shmname);
186       else
187         xbt_die("An unhandled error occurred while opening %s. shm_open: %s", shmname, strerror(errno));
188     }
189     data->second.fd = fd;
190     data->second.count = 1;
191     mem = shm_map(fd, size, &*data);
192     if (shm_unlink(shmname) < 0) {
193       XBT_WARN("Could not early unlink %s. shm_unlink: %s", shmname, strerror(errno));
194     }
195     XBT_DEBUG("Mapping %s at %p through %d", shmname, mem, fd);
196   } else {
197     mem = shm_map(data->second.fd, size, &*data);
198     data->second.count++;
199   }
200   XBT_DEBUG("Shared malloc %zu in %p (metadata at %p)", size, mem, &*data);
201   return mem;
202 }
203
204 // Align functions, from http://stackoverflow.com/questions/4840410/how-to-align-a-pointer-in-c
205 #define ALIGN_UP(n, align) (((n) + (align)-1) & -(align))
206 #define ALIGN_DOWN(n, align) ((n) & -(align))
207
208 void *smpi_shared_malloc_global__(size_t size, const char *file, int line, int *shared_block_offsets, int nb_shared_blocks) {
209   void *mem;
210   /* First reserve memory area */
211   mem = mmap(NULL, size, PROT_READ | PROT_WRITE, MAP_ANONYMOUS | MAP_PRIVATE, -1, 0);
212
213   xbt_assert(mem != MAP_FAILED, "Failed to allocate %luMiB of memory. Run \"sysctl vm.overcommit_memory=1\" as root "
214                                 "to allow big allocations.\n",
215              (unsigned long)(size >> 20));
216
217   /* Create bogus file if not done already */
218   if (smpi_shared_malloc_bogusfile == -1) {
219     /* Create a fd to a new file on disk, make it smpi_shared_malloc_blocksize big, and unlink it.
220      * It still exists in memory but not in the file system (thus it cannot be leaked). */
221     smpi_shared_malloc_blocksize = static_cast<unsigned long>(xbt_cfg_get_double("smpi/shared-malloc-blocksize"));
222     XBT_DEBUG("global shared allocation. Blocksize %lu", smpi_shared_malloc_blocksize);
223     char* name                   = xbt_strdup("/tmp/simgrid-shmalloc-XXXXXX");
224     smpi_shared_malloc_bogusfile = mkstemp(name);
225     unlink(name);
226     xbt_free(name);
227     char* dumb = (char*)calloc(1, smpi_shared_malloc_blocksize);
228     ssize_t err = write(smpi_shared_malloc_bogusfile, dumb, smpi_shared_malloc_blocksize);
229     if(err<0)
230       xbt_die("Could not write bogus file for shared malloc");
231     xbt_free(dumb);
232   }
233
234   /* Map the bogus file in place of the anonymous memory */
235   for(int i_block = 0; i_block < nb_shared_blocks; i_block ++) {
236     int start_offset = ALIGN_UP(shared_block_offsets[2*i_block], smpi_shared_malloc_blocksize);
237     int stop_offset = ALIGN_DOWN(shared_block_offsets[2*i_block+1], smpi_shared_malloc_blocksize);
238     unsigned int i;
239     for (i = start_offset; i < stop_offset / smpi_shared_malloc_blocksize; i++) {
240       void* pos = (void*)((unsigned long)mem + i * smpi_shared_malloc_blocksize);
241       void* res = mmap(pos, smpi_shared_malloc_blocksize, PROT_READ | PROT_WRITE, MAP_FIXED | MAP_SHARED | MAP_POPULATE,
242                        smpi_shared_malloc_bogusfile, 0);
243       xbt_assert(res == pos, "Could not map folded virtual memory (%s). Do you perhaps need to increase the "
244                              "size of the mapped file using --cfg=smpi/shared-malloc-blocksize=newvalue (default 1048576) ?"
245                              "You can also try using  the sysctl vm.max_map_count",
246                  strerror(errno));
247     }
248   }
249
250   if(nb_shared_blocks == 1 && shared_block_offsets[0] == 0 && shared_block_offsets[1] == size) {
251     shared_metadata_t newmeta;
252     //register metadata for memcpy avoidance
253     shared_data_key_type* data = (shared_data_key_type*)xbt_malloc(sizeof(shared_data_key_type));
254     data->second.fd = -1;
255     data->second.count = 1;
256     newmeta.size = size;
257     newmeta.data = data;
258     allocs_metadata[mem] = newmeta;
259   }
260
261   return mem;
262 }
263
264 /*
265  * When nb_shared_blocks == -1, default behavior of smpi_shared_malloc: everything is shared.
266  * Otherwise, only the blocks described by shared_block_offsets are shared.
267  * This array contains the offsets (in bytes) of the block to share.
268  * Even indices are the start offsets (included), odd indices are the stop offsets (excluded).
269  * For instance, if shared_block_offsets == {27, 42}, then the elements mem[27], mem[28], ..., mem[41] are shared. The others are not.
270  */
271 void *smpi_shared_malloc_global(size_t size, const char *file, int line, int *shared_block_offsets=NULL, int nb_shared_blocks=-1) {
272   int tmp_shared_block_offsets[2];
273   if(nb_shared_blocks == -1) {
274     nb_shared_blocks = 1;
275     shared_block_offsets = tmp_shared_block_offsets;
276     shared_block_offsets[0] = 0;
277     shared_block_offsets[1] = size;
278   }
279   return smpi_shared_malloc_global__(size, file, line, shared_block_offsets, nb_shared_blocks);
280 }
281
282 void *smpi_shared_malloc(size_t size, const char *file, int line) {
283   void *mem;
284   if (size > 0 && smpi_cfg_shared_malloc == shmalloc_local) {
285     mem = smpi_shared_malloc_local(size, file, line);
286   } else if (smpi_cfg_shared_malloc == shmalloc_global) {
287     mem = smpi_shared_malloc_global(size, file, line);
288   } else {
289     mem = xbt_malloc(size);
290     XBT_DEBUG("Classic malloc %zu in %p", size, mem);
291   }
292   return mem;
293 }
294
295 int smpi_is_shared(void* ptr){
296   if (allocs_metadata.empty())
297     return 0;
298   if ( smpi_cfg_shared_malloc == shmalloc_local || smpi_cfg_shared_malloc == shmalloc_global) {
299     auto low = allocs_metadata.lower_bound(ptr);
300     if (low->first==ptr)
301       return 1;
302     if (low == allocs_metadata.begin())
303       return 0;
304     low --;
305     if (ptr < (char*)low->first + low->second.size)
306       return 1;
307     return 0;
308   } else {
309     return 0;
310   }
311 }
312
313 void smpi_shared_free(void *ptr)
314 {
315   if (smpi_cfg_shared_malloc == shmalloc_local) {
316     char loc[PTR_STRLEN];
317     snprintf(loc, PTR_STRLEN, "%p", ptr);
318     auto meta = allocs_metadata.find(ptr);
319     if (meta == allocs_metadata.end()) {
320       XBT_WARN("Cannot free: %p was not shared-allocated by SMPI - maybe its size was 0?", ptr);
321       return;
322     }
323     shared_data_t* data = &meta->second.data->second;
324     if (munmap(ptr, meta->second.size) < 0) {
325       XBT_WARN("Unmapping of fd %d failed: %s", data->fd, strerror(errno));
326     }
327     data->count--;
328     if (data->count <= 0) {
329       close(data->fd);
330       allocs.erase(allocs.find(meta->second.data->first));
331       allocs_metadata.erase(ptr);
332       XBT_DEBUG("Shared free - with removal - of %p", ptr);
333     } else {
334       XBT_DEBUG("Shared free - no removal - of %p, count = %d", ptr, data->count);
335     }
336
337   } else if (smpi_cfg_shared_malloc == shmalloc_global) {
338     auto meta = allocs_metadata.find(ptr);
339     if (meta != allocs_metadata.end()){
340       meta->second.data->second.count--;
341       if(meta->second.data->second.count==0)
342         xbt_free(meta->second.data);
343     }
344
345     munmap(ptr, 0); // the POSIX says that I should not give 0 as a length, but it seems to work OK
346   } else {
347     XBT_DEBUG("Classic free of %p", ptr);
348     xbt_free(ptr);
349   }
350 }
351 #endif
352
353 int smpi_shared_known_call(const char* func, const char* input)
354 {
355   char* loc = bprintf("%s:%s", func, input);
356   int known = 0;
357
358   if (calls==nullptr) {
359     calls = xbt_dict_new_homogeneous(nullptr);
360   }
361   try {
362     xbt_dict_get(calls, loc); /* Succeed or throw */
363     known = 1;
364     xbt_free(loc);
365   }
366   catch (xbt_ex& ex) {
367     xbt_free(loc);
368     if (ex.category != not_found_error)
369       throw;
370   }
371   catch(...) {
372     xbt_free(loc);
373     throw;
374   }
375   return known;
376 }
377
378 void* smpi_shared_get_call(const char* func, const char* input) {
379   char* loc = bprintf("%s:%s", func, input);
380
381   if (calls == nullptr)
382     calls    = xbt_dict_new_homogeneous(nullptr);
383   void* data = xbt_dict_get(calls, loc);
384   xbt_free(loc);
385   return data;
386 }
387
388 void* smpi_shared_set_call(const char* func, const char* input, void* data) {
389   char* loc = bprintf("%s:%s", func, input);
390
391   if (calls == nullptr)
392     calls = xbt_dict_new_homogeneous(nullptr);
393   xbt_dict_set(calls, loc, data, nullptr);
394   xbt_free(loc);
395   return data;
396 }
397