src/smpi/mpi/smpi_comm.cpp

   1 /* Copyright (c) 2010-2019. The SimGrid Team. All rights reserved.          */
   2
   3 /* This program is free software; you can redistribute it and/or modify it
   4  * under the terms of the license (GNU LGPL) which comes with this package. */
   5
   6 #include "smpi_comm.hpp"
   7 #include "smpi_coll.hpp"
   8 #include "smpi_datatype.hpp"
   9 #include "smpi_request.hpp"
  10 #include "smpi_win.hpp"
  11 #include "smpi_info.hpp"
  12 #include "src/smpi/include/smpi_actor.hpp"
  13 #include "src/surf/HostImpl.hpp"
  14
  15 #include <climits>
  16
  17 XBT_LOG_NEW_DEFAULT_SUBCATEGORY(smpi_comm, smpi, "Logging specific to SMPI (comm)");
  18
  19 simgrid::smpi::Comm mpi_MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  20 MPI_Comm MPI_COMM_UNINITIALIZED=&mpi_MPI_COMM_UNINITIALIZED;
  21
  22 /* Support for cartesian topology was added, but there are 2 other types of topology, graph et dist graph. In order to
  23  * support them, we have to add a field SMPI_Topo_type, and replace the MPI_Topology field by an union. */
  24
  25 namespace simgrid{
  26 namespace smpi{
  27
  28 std::unordered_map<int, smpi_key_elem> Comm::keyvals_;
  29 int Comm::keyval_id_=0;
  30
  31 Comm::Comm(MPI_Group group, MPI_Topology topo, int smp, int in_id) : group_(group), topo_(topo),is_smp_comm_(smp), id_(in_id)
  32 {
  33   refcount_        = 1;
  34   topoType_        = MPI_INVALID_TOPO;
  35   intra_comm_      = MPI_COMM_NULL;
  36   leaders_comm_    = MPI_COMM_NULL;
  37   is_uniform_      = 1;
  38   non_uniform_map_ = nullptr;
  39   leaders_map_     = nullptr;
  40   is_blocked_      = 0;
  41   info_            = MPI_INFO_NULL;
  42   errhandler_      = MPI_ERRORS_ARE_FATAL;
  43   static int global_id_=0;
  44   //First creation of comm is done before SIMIX_run, so only do comms for others
  45   if(in_id==MPI_UNDEFINED && smp==0 && this->rank()!=MPI_UNDEFINED ){
  46     int id;
  47     if(this->rank()==0){
  48       id=global_id_;
  49       global_id_++;
  50     }
  51     Colls::bcast(&id, 1, MPI_INT, 0, this);
  52     XBT_DEBUG("Communicator %p has id %d", this, id);
  53     id_=id;//only set here, as we don't want to change it in the middle of the bcast
  54     Colls::barrier(this);
  55   }
  56 }
  57
  58 void Comm::destroy(Comm* comm)
  59 {
  60   if (comm == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
  61     Comm::destroy(smpi_process()->comm_world());
  62     return;
  63   }
  64   delete comm->topo_; // there's no use count on topos
  65   Comm::unref(comm);
  66 }
  67
  68 int Comm::dup(MPI_Comm* newcomm){
  69   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
  70     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
  71     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
  72   }
  73   MPI_Group cp = new  Group(this->group());
  74   (*newcomm)   = new  Comm(cp, this->topo());
  75   int ret      = MPI_SUCCESS;
  76
  77   if (not attributes()->empty()) {
  78     int flag=0;
  79     void* value_out=nullptr;
  80     for (auto const& it : *attributes()) {
  81       smpi_key_elem elem = keyvals_.at(it.first);
  82       if (elem != nullptr){
  83         if( elem->copy_fn.comm_copy_fn != MPI_NULL_COPY_FN &&
  84             elem->copy_fn.comm_copy_fn != MPI_COMM_DUP_FN)
  85           ret = elem->copy_fn.comm_copy_fn(this, it.first, elem->extra_state, it.second, &value_out, &flag);
  86         else if ( elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != MPI_NULL_COPY_FN &&
  87                   *(int*)*elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != 1){
  88           value_out=(int*)xbt_malloc(sizeof(int));
  89           elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort(this, it.first, elem->extra_state, it.second, value_out, &flag,&ret);
  90         }
  91         if (ret != MPI_SUCCESS) {
  92           Comm::destroy(*newcomm);
  93           *newcomm = MPI_COMM_NULL;
  94           return ret;
  95         }
  96         if (elem->copy_fn.comm_copy_fn == MPI_COMM_DUP_FN ||
  97            ((elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort != MPI_NULL_COPY_FN) && *(int*)*elem->copy_fn.comm_copy_fn_fort == 1)){
  98           elem->refcount++;
  99           (*newcomm)->attributes()->insert({it.first, it.second});
 100         }else if (flag){
 101           elem->refcount++;
 102           (*newcomm)->attributes()->insert({it.first, value_out});
 103         }
 104       }
 105     }
 106   }
 107   //duplicate info if present
 108   if(info_!=MPI_INFO_NULL)
 109     (*newcomm)->info_ = new simgrid::smpi::Info(info_);
 110   //duplicate errhandler
 111   (*newcomm)->set_errhandler(errhandler_);
 112   return ret;
 113 }
 114
 115 int Comm::dup_with_info(MPI_Info info, MPI_Comm* newcomm){
 116   int ret = dup(newcomm);
 117   if(ret != MPI_SUCCESS)
 118     return ret;
 119   if((*newcomm)->info_!=MPI_INFO_NULL){
 120     simgrid::smpi::Info::unref((*newcomm)->info_);
 121     (*newcomm)->info_=MPI_INFO_NULL;
 122   }
 123   if(info != MPI_INFO_NULL){
 124     (*newcomm)->info_=info;
 125   }
 126   return ret;
 127 }
 128
 129 MPI_Group Comm::group()
 130 {
 131   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 132     return smpi_process()->comm_world()->group();
 133   return group_;
 134 }
 135
 136 int Comm::size()
 137 {
 138   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 139     return smpi_process()->comm_world()->size();
 140   return group_->size();
 141 }
 142
 143 int Comm::rank()
 144 {
 145   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 146     return smpi_process()->comm_world()->rank();
 147   return group_->rank(s4u::Actor::self());
 148 }
 149
 150 int Comm::id()
 151 {
 152   return id_;
 153 }
 154
 155 void Comm::get_name (char* name, int* len)
 156 {
 157   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 158     smpi_process()->comm_world()->get_name(name, len);
 159     return;
 160   }
 161   if(this == MPI_COMM_WORLD && name_.empty()) {
 162     strncpy(name, "MPI_COMM_WORLD", 15);
 163     *len = 14;
 164   } else if(this == MPI_COMM_SELF && name_.empty()) {
 165     strncpy(name, "MPI_COMM_SELF", 14);
 166     *len = 13;
 167   } else {
 168     *len = snprintf(name, MPI_MAX_NAME_STRING+1, "%s", name_.c_str());
 169   }
 170 }
 171
 172 void Comm::set_name (const char* name)
 173 {
 174   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 175     smpi_process()->comm_world()->set_name(name);
 176     return;
 177   }
 178   name_.replace (0, MPI_MAX_NAME_STRING+1, name);
 179 }
 180
 181
 182 void Comm::set_leaders_comm(MPI_Comm leaders){
 183   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 184     smpi_process()->comm_world()->set_leaders_comm(leaders);
 185     return;
 186   }
 187   leaders_comm_=leaders;
 188 }
 189
 190 int* Comm::get_non_uniform_map(){
 191   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 192     return smpi_process()->comm_world()->get_non_uniform_map();
 193   return non_uniform_map_;
 194 }
 195
 196 int* Comm::get_leaders_map(){
 197   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 198     return smpi_process()->comm_world()->get_leaders_map();
 199   return leaders_map_;
 200 }
 201
 202 MPI_Comm Comm::get_leaders_comm(){
 203   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 204     return smpi_process()->comm_world()->get_leaders_comm();
 205   return leaders_comm_;
 206 }
 207
 208 MPI_Comm Comm::get_intra_comm(){
 209   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED || this==MPI_COMM_WORLD)
 210     return smpi_process()->comm_intra();
 211   else return intra_comm_;
 212 }
 213
 214 int Comm::is_uniform(){
 215   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 216     return smpi_process()->comm_world()->is_uniform();
 217   return is_uniform_;
 218 }
 219
 220 int Comm::is_blocked(){
 221   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 222     return smpi_process()->comm_world()->is_blocked();
 223   return is_blocked_;
 224 }
 225
 226 int Comm::is_smp_comm(){
 227   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 228     return smpi_process()->comm_world()->is_smp_comm();
 229   return is_smp_comm_;
 230 }
 231
 232 MPI_Comm Comm::split(int color, int key)
 233 {
 234   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 235     return smpi_process()->comm_world()->split(color, key);
 236   int system_tag = -123;
 237   int* recvbuf;
 238
 239   MPI_Group group_root = nullptr;
 240   MPI_Group group_out  = nullptr;
 241   MPI_Group group      = this->group();
 242   int myrank           = this->rank();
 243   int size             = this->size();
 244   /* Gather all colors and keys on rank 0 */
 245   int* sendbuf = xbt_new(int, 2);
 246   sendbuf[0] = color;
 247   sendbuf[1] = key;
 248   if (myrank == 0) {
 249     recvbuf = xbt_new(int, 2 * size);
 250   } else {
 251     recvbuf = nullptr;
 252   }
 253   Coll_gather_default::gather(sendbuf, 2, MPI_INT, recvbuf, 2, MPI_INT, 0, this);
 254   xbt_free(sendbuf);
 255   /* Do the actual job */
 256   if (myrank == 0) {
 257     MPI_Group* group_snd = xbt_new(MPI_Group, size);
 258     std::vector<std::pair<int, int>> rankmap;
 259     rankmap.reserve(size);
 260     for (int i = 0; i < size; i++) {
 261       if (recvbuf[2 * i] != MPI_UNDEFINED) {
 262         rankmap.clear();
 263         for (int j = i + 1; j < size; j++) {
 264           if(recvbuf[2 * i] == recvbuf[2 * j]) {
 265             recvbuf[2 * j] = MPI_UNDEFINED;
 266             rankmap.push_back({recvbuf[2 * j + 1], j});
 267           }
 268         }
 269         /* Add self in the group */
 270         recvbuf[2 * i] = MPI_UNDEFINED;
 271         rankmap.push_back({recvbuf[2 * i + 1], i});
 272         std::sort(begin(rankmap), end(rankmap));
 273         group_out = new Group(rankmap.size());
 274         if (i == 0) {
 275           group_root = group_out; /* Save root's group */
 276         }
 277         for (unsigned j = 0; j < rankmap.size(); j++) {
 278           s4u::ActorPtr actor = group->actor(rankmap[j].second);
 279           group_out->set_mapping(actor, j);
 280         }
 281         MPI_Request* requests = xbt_new(MPI_Request, rankmap.size());
 282         int reqs              = 0;
 283         for (auto const& rank : rankmap) {
 284           if (rank.second != 0) {
 285             group_snd[reqs]=new  Group(group_out);
 286             requests[reqs] = Request::isend(&(group_snd[reqs]), 1, MPI_PTR, rank.second, system_tag, this);
 287             reqs++;
 288           }
 289         }
 290         if(i != 0 && group_out != MPI_COMM_WORLD->group() && group_out != MPI_GROUP_EMPTY)
 291           Group::unref(group_out);
 292
 293         Request::waitall(reqs, requests, MPI_STATUS_IGNORE);
 294         xbt_free(requests);
 295       }
 296     }
 297     xbt_free(recvbuf);
 298     xbt_free(group_snd);
 299     group_out = group_root; /* exit with root's group */
 300   } else {
 301     if(color != MPI_UNDEFINED) {
 302       Request::recv(&group_out, 1, MPI_PTR, 0, system_tag, this, MPI_STATUS_IGNORE);
 303     } /* otherwise, exit with group_out == nullptr */
 304   }
 305   return group_out!=nullptr ? new  Comm(group_out, nullptr) : MPI_COMM_NULL;
 306 }
 307
 308 void Comm::ref(){
 309   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 310     smpi_process()->comm_world()->ref();
 311     return;
 312   }
 313   group_->ref();
 314   refcount_++;
 315 }
 316
 317 void Comm::cleanup_smp(){
 318   if (intra_comm_ != MPI_COMM_NULL)
 319     Comm::unref(intra_comm_);
 320   if (leaders_comm_ != MPI_COMM_NULL)
 321     Comm::unref(leaders_comm_);
 322   xbt_free(non_uniform_map_);
 323   delete[] leaders_map_;
 324 }
 325
 326 void Comm::unref(Comm* comm){
 327   if (comm == MPI_COMM_UNINITIALIZED){
 328     Comm::unref(smpi_process()->comm_world());
 329     return;
 330   }
 331   comm->refcount_--;
 332   Group::unref(comm->group_);
 333
 334   if(comm->refcount_==0){
 335     comm->cleanup_smp();
 336     comm->cleanup_attr<Comm>();
 337     delete comm;
 338   }
 339 }
 340
 341 MPI_Comm Comm::find_intra_comm(int * leader){
 342   //get the indices of all processes sharing the same simix host
 343   auto& process_list      = sg_host_self()->pimpl_->process_list_;
 344   int intra_comm_size     = 0;
 345   int min_index           = INT_MAX; // the minimum index will be the leader
 346   for (auto& actor : process_list) {
 347     int index = actor.get_pid();
 348     if (this->group()->rank(actor.iface()) != MPI_UNDEFINED) { // Is this process in the current group?
 349       intra_comm_size++;
 350       if (index < min_index)
 351         min_index = index;
 352     }
 353   }
 354   XBT_DEBUG("number of processes deployed on my node : %d", intra_comm_size);
 355   MPI_Group group_intra = new  Group(intra_comm_size);
 356   int i = 0;
 357   for (auto& actor : process_list) {
 358     if (this->group()->rank(actor.iface()) != MPI_UNDEFINED) {
 359       group_intra->set_mapping(actor.iface(), i);
 360       i++;
 361     }
 362   }
 363   *leader=min_index;
 364   return new  Comm(group_intra, nullptr, 1);
 365 }
 366
 367 void Comm::init_smp(){
 368   int leader = -1;
 369   int i = 0;
 370   if (this == MPI_COMM_UNINITIALIZED)
 371     smpi_process()->comm_world()->init_smp();
 372
 373   int comm_size = this->size();
 374
 375   // If we are in replay - perform an ugly hack
 376   // tell SimGrid we are not in replay for a while, because we need the buffers to be copied for the following calls
 377   bool replaying = false; //cache data to set it back again after
 378   if(smpi_process()->replaying()){
 379     replaying = true;
 380     smpi_process()->set_replaying(false);
 381   }
 382
 383   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 384     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 385     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 386   }
 387   //identify neighbours in comm
 388   MPI_Comm comm_intra = find_intra_comm(&leader);
 389
 390
 391   int* leaders_map = new int[comm_size];
 392   int* leader_list = new int[comm_size];
 393   std::fill_n(leaders_map, comm_size, 0);
 394   std::fill_n(leader_list, comm_size, -1);
 395
 396   Coll_allgather_ring::allgather(&leader, 1, MPI_INT , leaders_map, 1, MPI_INT, this);
 397
 398   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 399     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 400     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 401   }
 402
 403   if(leaders_map_==nullptr){
 404     leaders_map_= leaders_map;
 405   }else{
 406     delete[] leaders_map;
 407   }
 408   int leader_group_size = 0;
 409   for(i=0; i<comm_size; i++){
 410     int already_done = 0;
 411     for (int j = 0; j < leader_group_size; j++) {
 412       if (leaders_map_[i] == leader_list[j]) {
 413         already_done = 1;
 414       }
 415     }
 416     if (already_done == 0) {
 417       leader_list[leader_group_size] = leaders_map_[i];
 418       leader_group_size++;
 419     }
 420   }
 421   std::sort(leader_list, leader_list + leader_group_size);
 422
 423   MPI_Group leaders_group = new  Group(leader_group_size);
 424
 425   MPI_Comm leader_comm = MPI_COMM_NULL;
 426   if(MPI_COMM_WORLD!=MPI_COMM_UNINITIALIZED && this!=MPI_COMM_WORLD){
 427     //create leader_communicator
 428     for (i=0; i< leader_group_size;i++)
 429       leaders_group->set_mapping(s4u::Actor::by_pid(leader_list[i]), i);
 430     leader_comm = new  Comm(leaders_group, nullptr,1);
 431     this->set_leaders_comm(leader_comm);
 432     this->set_intra_comm(comm_intra);
 433
 434     // create intracommunicator
 435   }else{
 436     for (i=0; i< leader_group_size;i++)
 437       leaders_group->set_mapping(s4u::Actor::by_pid(leader_list[i]), i);
 438
 439     if(this->get_leaders_comm()==MPI_COMM_NULL){
 440       leader_comm = new  Comm(leaders_group, nullptr,1);
 441       this->set_leaders_comm(leader_comm);
 442     }else{
 443       leader_comm=this->get_leaders_comm();
 444       Group::unref(leaders_group);
 445     }
 446     smpi_process()->set_comm_intra(comm_intra);
 447   }
 448
 449   // Are the nodes uniform ? = same number of process/node
 450   int my_local_size=comm_intra->size();
 451   if(comm_intra->rank()==0) {
 452     int is_uniform       = 1;
 453     int* non_uniform_map = xbt_new0(int,leader_group_size);
 454     Coll_allgather_ring::allgather(&my_local_size, 1, MPI_INT,
 455         non_uniform_map, 1, MPI_INT, leader_comm);
 456     for(i=0; i < leader_group_size; i++) {
 457       if(non_uniform_map[0] != non_uniform_map[i]) {
 458         is_uniform = 0;
 459         break;
 460       }
 461     }
 462     if(is_uniform==0 && this->is_uniform()!=0){
 463       non_uniform_map_ = non_uniform_map;
 464     }else{
 465       xbt_free(non_uniform_map);
 466     }
 467     is_uniform_=is_uniform;
 468   }
 469   Coll_bcast_scatter_LR_allgather::bcast(&(is_uniform_),1, MPI_INT, 0, comm_intra );
 470
 471   if (smpi_privatize_global_variables == SmpiPrivStrategies::MMAP) {
 472     // we need to switch as the called function may silently touch global variables
 473     smpi_switch_data_segment(s4u::Actor::self());
 474   }
 475   // Are the ranks blocked ? = allocated contiguously on the SMP nodes
 476   int is_blocked=1;
 477   int prev=this->group()->rank(comm_intra->group()->actor(0));
 478   for (i = 1; i < my_local_size; i++) {
 479     int that = this->group()->rank(comm_intra->group()->actor(i));
 480     if (that != prev + 1) {
 481       is_blocked = 0;
 482       break;
 483     }
 484     prev = that;
 485   }
 486
 487   int global_blocked;
 488   Coll_allreduce_default::allreduce(&is_blocked, &(global_blocked), 1, MPI_INT, MPI_LAND, this);
 489
 490   if(MPI_COMM_WORLD==MPI_COMM_UNINITIALIZED || this==MPI_COMM_WORLD){
 491     if(this->rank()==0){
 492       is_blocked_ = global_blocked;
 493     }
 494   }else{
 495     is_blocked_=global_blocked;
 496   }
 497   delete[] leader_list;
 498
 499   if(replaying)
 500     smpi_process()->set_replaying(true);
 501 }
 502
 503 MPI_Comm Comm::f2c(int id) {
 504   if(id == -2) {
 505     return MPI_COMM_SELF;
 506   } else if(id==0){
 507     return MPI_COMM_WORLD;
 508   } else if(F2C::f2c_lookup() != nullptr && id >= 0) {
 509     char key[KEY_SIZE];
 510     const auto& lookup = F2C::f2c_lookup();
 511     auto comm          = lookup->find(get_key(key, id));
 512     return comm == lookup->end() ? MPI_COMM_NULL : static_cast<MPI_Comm>(comm->second);
 513   } else {
 514     return MPI_COMM_NULL;
 515   }
 516 }
 517
 518 void Comm::free_f(int id) {
 519   char key[KEY_SIZE];
 520   F2C::f2c_lookup()->erase(get_key(key, id));
 521 }
 522
 523 void Comm::add_rma_win(MPI_Win win){
 524   rma_wins_.push_back(win);
 525 }
 526
 527 void Comm::remove_rma_win(MPI_Win win){
 528   rma_wins_.remove(win);
 529 }
 530
 531 void Comm::finish_rma_calls(){
 532   for (auto const& it : rma_wins_) {
 533     if(it->rank()==this->rank()){//is it ours (for MPI_COMM_WORLD)?
 534       int finished = it->finish_comms();
 535       XBT_DEBUG("Barrier for rank %d - Finished %d RMA calls",this->rank(), finished);
 536     }
 537   }
 538 }
 539
 540 MPI_Info Comm::info(){
 541   if(info_== MPI_INFO_NULL)
 542     info_ = new Info();
 543   info_->ref();
 544   return info_;
 545 }
 546
 547 void Comm::set_info(MPI_Info info){
 548   if(info_!= MPI_INFO_NULL)
 549     info->ref();
 550   info_=info;
 551 }
 552
 553 MPI_Errhandler Comm::errhandler(){
 554   return errhandler_;
 555 }
 556
 557 void Comm::set_errhandler(MPI_Errhandler errhandler){
 558   errhandler_=errhandler;
 559   if(errhandler_!= MPI_ERRHANDLER_NULL)
 560     errhandler->ref();
 561 }
 562
 563 MPI_Comm Comm::split_type(int type, int /*key*/, MPI_Info)
 564 {
 565   //MPI_UNDEFINED can be given to some nodes... but we need them to still perform the smp part which is collective
 566   if(type != MPI_COMM_TYPE_SHARED && type != MPI_UNDEFINED){
 567     return MPI_COMM_NULL;
 568   }
 569   int leader=0;
 570   MPI_Comm res= this->find_intra_comm(&leader);
 571   if(type != MPI_UNDEFINED)
 572     return res;
 573   else{
 574     Comm::destroy(res);
 575     return MPI_COMM_NULL;
 576   }
 577 }
 578
 579 } // namespace smpi
 580 } // namespace simgrid